Protein–RNA interactions for Protein: Q3V0G7

Garnl3, GTPase-activating Rap/Ran-GAP domain-like protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 1,038 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Garnl3Q3V0G7 Ctnna2-205ENSMUST00000161846 4018 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Garnl3Q3V0G7 Ndufs2-202ENSMUST00000111318 1545 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Garnl3Q3V0G7 Ankrd63-201ENSMUST00000104937 4861 ntAPPRIS P1 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Garnl3Q3V0G7 Arhgap39-202ENSMUST00000077821 4494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Garnl3Q3V0G7 Tnfaip2-202ENSMUST00000109792 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Garnl3Q3V0G7 Rgs3-203ENSMUST00000098031 2072 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Garnl3Q3V0G7 1700096K18Rik-201ENSMUST00000188465 1454 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
Garnl3Q3V0G7 AC154855.1-201ENSMUST00000227353 1458 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
Garnl3Q3V0G7 Wipf1-202ENSMUST00000102679 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Garnl3Q3V0G7 9530018F02Rik-201ENSMUST00000219513 2599 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
Garnl3Q3V0G7 Ofd1-201ENSMUST00000049501 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Garnl3Q3V0G7 Rilpl1-201ENSMUST00000062153 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Garnl3Q3V0G7 Gm12359-201ENSMUST00000139017 1399 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Garnl3Q3V0G7 Mcoln2-202ENSMUST00000098524 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Garnl3Q3V0G7 Evc-202ENSMUST00000114148 2119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Garnl3Q3V0G7 Cldn7-201ENSMUST00000018713 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Garnl3Q3V0G7 Trappc3-201ENSMUST00000030660 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Garnl3Q3V0G7 Foxp4-202ENSMUST00000113262 3198 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Garnl3Q3V0G7 L3hypdh-201ENSMUST00000019862 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Garnl3Q3V0G7 Slc16a7-205ENSMUST00000210780 2562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Garnl3Q3V0G7 Gm14114-201ENSMUST00000139345 287 ntTSL 3 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Garnl3Q3V0G7 Spata33-206ENSMUST00000212637 569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Garnl3Q3V0G7 Gng11-201ENSMUST00000031670 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Garnl3Q3V0G7 Cnbd2-201ENSMUST00000037096 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Garnl3Q3V0G7 Tmem260-201ENSMUST00000111735 5485 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Garnl3Q3V0G7 Prpf3-207ENSMUST00000161476 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Garnl3Q3V0G7 Pqlc1-202ENSMUST00000091798 1989 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Garnl3Q3V0G7 Sptbn4-203ENSMUST00000108363 4724 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Garnl3Q3V0G7 Sptbn4-204ENSMUST00000108364 4740 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Garnl3Q3V0G7 Klhdc8b-201ENSMUST00000035232 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Garnl3Q3V0G7 Asic4-201ENSMUST00000037708 2464 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Garnl3Q3V0G7 Cep104-201ENSMUST00000047497 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Garnl3Q3V0G7 Tmem267-205ENSMUST00000223912 1789 ntAPPRIS P1 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Garnl3Q3V0G7 4930455H04Rik-201ENSMUST00000117592 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Garnl3Q3V0G7 Ppp1r1b-204ENSMUST00000137634 1343 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Garnl3Q3V0G7 H2-Q10-202ENSMUST00000174525 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Garnl3Q3V0G7 Agpat1-201ENSMUST00000037489 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Garnl3Q3V0G7 Myo5b-201ENSMUST00000074157 6745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Garnl3Q3V0G7 Gm3264-202ENSMUST00000166776 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Garnl3Q3V0G7 Calu-208ENSMUST00000173694 611 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Garnl3Q3V0G7 Snrnp48-202ENSMUST00000178564 847 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Garnl3Q3V0G7 Gm4217-201ENSMUST00000182243 1002 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
Garnl3Q3V0G7 Gm45618-201ENSMUST00000209890 660 ntAPPRIS P1 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Garnl3Q3V0G7 Mgat1-201ENSMUST00000081794 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Garnl3Q3V0G7 Tcf3-207ENSMUST00000105343 2920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Garnl3Q3V0G7 Ttc13-203ENSMUST00000118134 3277 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
Garnl3Q3V0G7 Polr3gl-201ENSMUST00000091924 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Garnl3Q3V0G7 Ptprd-206ENSMUST00000107289 9899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
Garnl3Q3V0G7 Rnls-201ENSMUST00000096114 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Garnl3Q3V0G7 Dnajc2-201ENSMUST00000030771 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Garnl3Q3V0G7 Rps6ka1-201ENSMUST00000003741 3085 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Garnl3Q3V0G7 Slc6a1-204ENSMUST00000204074 1740 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Garnl3Q3V0G7 Gm43598-201ENSMUST00000202482 2479 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
Garnl3Q3V0G7 Atp5a1-201ENSMUST00000026495 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Garnl3Q3V0G7 Polr1c-201ENSMUST00000087026 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Garnl3Q3V0G7 Enah-202ENSMUST00000111024 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Garnl3Q3V0G7 Cdc27-202ENSMUST00000106961 1863 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Garnl3Q3V0G7 Zfp879-203ENSMUST00000109134 2414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Garnl3Q3V0G7 Zfp879-201ENSMUST00000049625 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Garnl3Q3V0G7 Faap20-201ENSMUST00000097747 1479 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Garnl3Q3V0G7 Gfy-201ENSMUST00000179443 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Garnl3Q3V0G7 Bad-202ENSMUST00000113423 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Garnl3Q3V0G7 Rpl18-ps2-201ENSMUST00000118863 567 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
Garnl3Q3V0G7 Gm11539-201ENSMUST00000119837 557 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
Garnl3Q3V0G7 Gm13436-201ENSMUST00000120418 567 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
Garnl3Q3V0G7 Gm13559-201ENSMUST00000120476 863 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
Garnl3Q3V0G7 Gm14453-201ENSMUST00000139677 553 ntTSL 3 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Garnl3Q3V0G7 Sema6b-201ENSMUST00000001256 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Garnl3Q3V0G7 Prss53-201ENSMUST00000121394 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Garnl3Q3V0G7 P3h1-203ENSMUST00000102662 2977 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Garnl3Q3V0G7 Cops7b-201ENSMUST00000027446 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Garnl3Q3V0G7 Rflna-201ENSMUST00000036109 1681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Garnl3Q3V0G7 Vim-201ENSMUST00000028062 2193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Garnl3Q3V0G7 Ccdc84-202ENSMUST00000213813 2675 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Garnl3Q3V0G7 Abhd11-206ENSMUST00000154469 1473 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Garnl3Q3V0G7 Dnal4-201ENSMUST00000023055 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Garnl3Q3V0G7 Gm19430-201ENSMUST00000193847 2137 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
Garnl3Q3V0G7 Rundc3b-201ENSMUST00000047485 3677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Garnl3Q3V0G7 Cxxc4-201ENSMUST00000166288 1290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Garnl3Q3V0G7 Mtg2-202ENSMUST00000108901 1444 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Garnl3Q3V0G7 Scrt1-202ENSMUST00000164703 3478 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Garnl3Q3V0G7 Papd4-205ENSMUST00000225868 3081 ntAPPRIS ALT1 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Garnl3Q3V0G7 Nptn-212ENSMUST00000177292 1390 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Garnl3Q3V0G7 Skap1-203ENSMUST00000100521 1539 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Garnl3Q3V0G7 Skap1-204ENSMUST00000103154 1507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Garnl3Q3V0G7 Tmem214-201ENSMUST00000114716 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Garnl3Q3V0G7 Gm26697-201ENSMUST00000180898 1760 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Garnl3Q3V0G7 Hsf4-202ENSMUST00000163734 1630 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Garnl3Q3V0G7 Usp27x-201ENSMUST00000115744 3240 ntAPPRIS P1 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Garnl3Q3V0G7 Il3ra-203ENSMUST00000224163 2315 ntAPPRIS P2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Garnl3Q3V0G7 Emc8-201ENSMUST00000034277 4942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Garnl3Q3V0G7 Klc1-202ENSMUST00000118471 2272 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Garnl3Q3V0G7 Cyp4f41-ps-201ENSMUST00000126790 1077 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
Garnl3Q3V0G7 Gm26643-201ENSMUST00000180854 1274 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Garnl3Q3V0G7 Pdxk-ps-203ENSMUST00000183934 680 ntTSL 3 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Garnl3Q3V0G7 Mir6982-201ENSMUST00000184354 68 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
Garnl3Q3V0G7 Gzme-201ENSMUST00000089549 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Garnl3Q3V0G7 Perp-201ENSMUST00000019998 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Garnl3Q3V0G7 Csnk1e-201ENSMUST00000117786 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Garnl3Q3V0G7 Capn10-201ENSMUST00000027488 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.6 ms