Protein–RNA interactions for Protein: Q3V079

Bbof1, Basal body-orientation factor 1, mousemouse

Predictions only

Length 533 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Bbof1Q3V079 Fam57b-201ENSMUST00000079423 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Bbof1Q3V079 H6pd-201ENSMUST00000030830 4745 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Bbof1Q3V079 Fbxl21-203ENSMUST00000121871 1963 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Bbof1Q3V079 Thegl-202ENSMUST00000117880 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Bbof1Q3V079 Kif7-201ENSMUST00000059836 4521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Bbof1Q3V079 Gpha2-202ENSMUST00000113526 762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Bbof1Q3V079 Gpha2-201ENSMUST00000025698 609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Bbof1Q3V079 Myoz1-201ENSMUST00000090469 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Bbof1Q3V079 Msl1-201ENSMUST00000037915 4593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Bbof1Q3V079 Phtf1-202ENSMUST00000063717 3327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Bbof1Q3V079 Zbtb45-201ENSMUST00000051390 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Bbof1Q3V079 Sgta-201ENSMUST00000005067 1969 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Bbof1Q3V079 Acvr1c-204ENSMUST00000112608 1497 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Bbof1Q3V079 Farsa-202ENSMUST00000109754 1795 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Bbof1Q3V079 Mtg2-202ENSMUST00000108901 1444 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Bbof1Q3V079 Gm1673-202ENSMUST00000114382 451 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Bbof1Q3V079 Cdc34-202ENSMUST00000166603 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Bbof1Q3V079 Spdef-205ENSMUST00000167489 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Bbof1Q3V079 Sh2b1-203ENSMUST00000205440 3089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Bbof1Q3V079 Prelid3a-201ENSMUST00000025411 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Bbof1Q3V079 Pldi-201ENSMUST00000036304 853 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Bbof1Q3V079 Snx12-201ENSMUST00000077876 1002 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Bbof1Q3V079 Vrk2-201ENSMUST00000078362 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Bbof1Q3V079 0610009B22Rik-201ENSMUST00000007921 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Bbof1Q3V079 Pih1d1-201ENSMUST00000085375 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Bbof1Q3V079 Zfyve19-201ENSMUST00000090174 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Bbof1Q3V079 Prtg-201ENSMUST00000055535 9148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Bbof1Q3V079 Il6st-206ENSMUST00000183886 3004 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Bbof1Q3V079 Gm7008-201ENSMUST00000038121 1366 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Bbof1Q3V079 Lrrtm1-203ENSMUST00000161677 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Bbof1Q3V079 Polr3e-203ENSMUST00000207481 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Bbof1Q3V079 Nes-201ENSMUST00000090973 6126 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Bbof1Q3V079 Txndc11-201ENSMUST00000038424 3095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Bbof1Q3V079 Ifnar1-202ENSMUST00000117748 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Bbof1Q3V079 Gm26781-201ENSMUST00000181385 1477 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Bbof1Q3V079 Spi1-201ENSMUST00000002180 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Bbof1Q3V079 Efr3a-201ENSMUST00000015146 5215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Bbof1Q3V079 Arfip2-202ENSMUST00000084782 2254 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Bbof1Q3V079 Zmynd19-201ENSMUST00000028350 3903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Bbof1Q3V079 Rgs7-203ENSMUST00000192227 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Bbof1Q3V079 Cdipt-201ENSMUST00000032920 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Bbof1Q3V079 Trim54-201ENSMUST00000013771 1434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Bbof1Q3V079 Gm7854-202ENSMUST00000187409 1433 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Bbof1Q3V079 Zxdc-202ENSMUST00000075117 4126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Bbof1Q3V079 Gm10013-201ENSMUST00000106074 672 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
Bbof1Q3V079 Ndufaf8-201ENSMUST00000106223 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Bbof1Q3V079 Psmd13-209ENSMUST00000164681 726 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Bbof1Q3V079 Ccdc125-202ENSMUST00000170347 1216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Bbof1Q3V079 Gm22697-201ENSMUST00000175194 63 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
Bbof1Q3V079 Gm7213-201ENSMUST00000215977 950 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
Bbof1Q3V079 Rpl39l-201ENSMUST00000044103 805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Bbof1Q3V079 Rpf1-201ENSMUST00000029838 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Bbof1Q3V079 Kctd8-201ENSMUST00000054095 2859 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Bbof1Q3V079 Cactin-201ENSMUST00000050867 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Bbof1Q3V079 Dsg2-201ENSMUST00000059787 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Bbof1Q3V079 Brd3os-202ENSMUST00000209765 1898 ntAPPRIS P1 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Bbof1Q3V079 Zcchc17-202ENSMUST00000134159 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Bbof1Q3V079 Taf5-201ENSMUST00000026027 3258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Bbof1Q3V079 Stam2-202ENSMUST00000127316 1928 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Bbof1Q3V079 Gtf3a-201ENSMUST00000132102 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Bbof1Q3V079 Snapc3-201ENSMUST00000030206 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Bbof1Q3V079 Hr-201ENSMUST00000022691 5487 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Bbof1Q3V079 Stambpl1-201ENSMUST00000054956 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Bbof1Q3V079 9430097D07Rik-201ENSMUST00000100190 1501 ntAPPRIS P1 BASIC18■□□□□ 0.47
Bbof1Q3V079 1810012K08Rik-201ENSMUST00000155199 574 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Bbof1Q3V079 Grtp1-204ENSMUST00000209691 1030 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Bbof1Q3V079 Tmem205-201ENSMUST00000046831 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Bbof1Q3V079 Hoxa6-201ENSMUST00000062829 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Bbof1Q3V079 Cap1-202ENSMUST00000106255 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Bbof1Q3V079 P2rx4-201ENSMUST00000031429 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Bbof1Q3V079 Runx2-203ENSMUST00000113572 6463 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Bbof1Q3V079 Sars2-201ENSMUST00000094632 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Bbof1Q3V079 Bloc1s3-201ENSMUST00000077408 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Bbof1Q3V079 Zfp691-201ENSMUST00000052715 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Bbof1Q3V079 Samd4-211ENSMUST00000228404 3039 ntAPPRIS ALT2 BASIC18■□□□□ 0.47
Bbof1Q3V079 Htr3a-201ENSMUST00000003826 2082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Bbof1Q3V079 Rnf128-201ENSMUST00000113026 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Bbof1Q3V079 Gm11748-201ENSMUST00000153825 1498 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
Bbof1Q3V079 Epha10-201ENSMUST00000059343 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Bbof1Q3V079 Atp1a1-201ENSMUST00000036493 3679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Bbof1Q3V079 Eda-205ENSMUST00000113778 4942 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Bbof1Q3V079 Eda-207ENSMUST00000113780 4915 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Bbof1Q3V079 Eda-208ENSMUST00000113781 4915 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Bbof1Q3V079 Eda-209ENSMUST00000113783 4930 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Bbof1Q3V079 Adnp-201ENSMUST00000057793 4917 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Bbof1Q3V079 Plppr5-201ENSMUST00000039564 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Bbof1Q3V079 P2ry1-203ENSMUST00000193943 2203 ntAPPRIS P1 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Bbof1Q3V079 Sybu-202ENSMUST00000110267 3127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Bbof1Q3V079 A130014A01Rik-201ENSMUST00000183021 2323 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
Bbof1Q3V079 Gm11841-201ENSMUST00000117060 1963 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
Bbof1Q3V079 Gtf3a-204ENSMUST00000146511 1298 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Bbof1Q3V079 U2af1-201ENSMUST00000014684 907 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Bbof1Q3V079 U2af1-202ENSMUST00000166526 907 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Bbof1Q3V079 Gm27389-201ENSMUST00000183622 195 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
Bbof1Q3V079 Mir1668-201ENSMUST00000184114 107 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
Bbof1Q3V079 Wdr74-202ENSMUST00000210512 1078 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Bbof1Q3V079 Calml4-206ENSMUST00000215870 803 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Bbof1Q3V079 Kcnn1-201ENSMUST00000110078 4047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Bbof1Q3V079 Kcnn1-202ENSMUST00000110081 4045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Bbof1Q3V079 Mapk8ip3-201ENSMUST00000088345 5543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 55.7 ms