Protein–RNA interactions for Protein: Q3V016

Hipk4, Homeodomain-interacting protein kinase 4, mousemouse

Predictions only

Length 616 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hipk4Q3V016 Zfp553-201ENSMUST00000056232 3043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Hipk4Q3V016 Gusb-202ENSMUST00000111307 932 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Hipk4Q3V016 Arpc4-202ENSMUST00000171058 695 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Hipk4Q3V016 Gm45148-201ENSMUST00000208578 513 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Hipk4Q3V016 AC154649.1-201ENSMUST00000227392 384 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Hipk4Q3V016 Aprt-201ENSMUST00000006764 849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Hipk4Q3V016 Olfr1411-201ENSMUST00000073748 972 ntAPPRIS P1 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Hipk4Q3V016 Usp53-201ENSMUST00000090379 6185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Hipk4Q3V016 Il3ra-203ENSMUST00000224163 2315 ntAPPRIS P2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Hipk4Q3V016 A230103J11Rik-202ENSMUST00000156084 2086 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Hipk4Q3V016 Yipf4-201ENSMUST00000024873 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Hipk4Q3V016 Syt3-202ENSMUST00000118962 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Hipk4Q3V016 Bnip2-201ENSMUST00000034754 2464 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Hipk4Q3V016 Nr3c2-203ENSMUST00000109912 5675 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Hipk4Q3V016 Cend1-202ENSMUST00000124444 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Hipk4Q3V016 Pex12-205ENSMUST00000175741 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Hipk4Q3V016 Scamp3-201ENSMUST00000029684 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Hipk4Q3V016 Mis18bp1-208ENSMUST00000222244 2053 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Hipk4Q3V016 Dars-201ENSMUST00000027602 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Hipk4Q3V016 Nkx2-1-201ENSMUST00000001536 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Hipk4Q3V016 Mrps10-204ENSMUST00000120737 1017 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Hipk4Q3V016 Ccnd2-202ENSMUST00000201066 983 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Hipk4Q3V016 Smim15-206ENSMUST00000226042 1092 ntAPPRIS P1 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Hipk4Q3V016 Ly6g6d-201ENSMUST00000007259 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Hipk4Q3V016 H2-Eb1-201ENSMUST00000074557 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Hipk4Q3V016 Kcnq2-204ENSMUST00000103047 2899 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Hipk4Q3V016 Zkscan14-201ENSMUST00000031632 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Hipk4Q3V016 Mid1ip1-202ENSMUST00000115524 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Hipk4Q3V016 Pgm2l1-202ENSMUST00000084935 8834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Hipk4Q3V016 Mcoln2-202ENSMUST00000098524 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Hipk4Q3V016 Prmt1-203ENSMUST00000207370 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Hipk4Q3V016 Rcbtb1-201ENSMUST00000022551 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Hipk4Q3V016 Vim-201ENSMUST00000028062 2193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Hipk4Q3V016 Taf5l-201ENSMUST00000093039 2912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Hipk4Q3V016 Ssfa2-202ENSMUST00000111785 5168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Hipk4Q3V016 Mapt-202ENSMUST00000106988 2202 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Hipk4Q3V016 Cops7b-201ENSMUST00000027446 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Hipk4Q3V016 Vrk2-201ENSMUST00000078362 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Hipk4Q3V016 Ace-201ENSMUST00000001963 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Hipk4Q3V016 Bri3bp-201ENSMUST00000049040 6473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Hipk4Q3V016 Ppp1r37-201ENSMUST00000058444 3816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Hipk4Q3V016 Zfp691-201ENSMUST00000052715 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Hipk4Q3V016 Gcnt4-201ENSMUST00000171324 5087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Hipk4Q3V016 Elf2-202ENSMUST00000091144 2366 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Hipk4Q3V016 St6galnac2-201ENSMUST00000079545 3643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Hipk4Q3V016 Prkra-201ENSMUST00000002808 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Hipk4Q3V016 Agbl3-204ENSMUST00000115016 3734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Hipk4Q3V016 Bclaf3-202ENSMUST00000112464 3366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Hipk4Q3V016 Tmc6-202ENSMUST00000103025 1279 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Hipk4Q3V016 Naa10-205ENSMUST00000114390 797 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Hipk4Q3V016 Zfp467-208ENSMUST00000114564 626 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Hipk4Q3V016 Gm17035-201ENSMUST00000170557 419 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Hipk4Q3V016 Gm10517-202ENSMUST00000192970 758 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Hipk4Q3V016 Arhgef33-211ENSMUST00000225658 473 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Hipk4Q3V016 Prss21-201ENSMUST00000024928 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Hipk4Q3V016 Purg-201ENSMUST00000070340 1064 ntAPPRIS P1 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Hipk4Q3V016 Rtl8a-201ENSMUST00000088779 1195 ntAPPRIS P1 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Hipk4Q3V016 Syngr1-202ENSMUST00000009728 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Hipk4Q3V016 Sec14l1-203ENSMUST00000103026 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Hipk4Q3V016 Tmem214-201ENSMUST00000114716 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Hipk4Q3V016 Prtg-201ENSMUST00000055535 9148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Hipk4Q3V016 Osbpl1a-205ENSMUST00000119512 1947 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Hipk4Q3V016 Baz1b-201ENSMUST00000002825 6492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Hipk4Q3V016 Qprt-201ENSMUST00000032912 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Hipk4Q3V016 BC029722-201ENSMUST00000124586 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Hipk4Q3V016 Sipa1l1-202ENSMUST00000166429 8215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Hipk4Q3V016 Cnbd2-201ENSMUST00000037096 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Hipk4Q3V016 Spon1-202ENSMUST00000084696 5201 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Hipk4Q3V016 Rassf1-202ENSMUST00000093786 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Hipk4Q3V016 Ttc39b-202ENSMUST00000048274 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Hipk4Q3V016 Svip-201ENSMUST00000098414 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Hipk4Q3V016 Acads-201ENSMUST00000031524 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Hipk4Q3V016 Prss16-204ENSMUST00000150547 1159 ntTSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Hipk4Q3V016 Gm10698-201ENSMUST00000182663 604 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
Hipk4Q3V016 4930412O13Rik-201ENSMUST00000026889 1187 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Hipk4Q3V016 Vps37d-202ENSMUST00000076203 1286 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Hipk4Q3V016 Trp73-203ENSMUST00000105643 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Hipk4Q3V016 Ino80e-203ENSMUST00000106343 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Hipk4Q3V016 4930461C15Rik-201ENSMUST00000133622 1302 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Hipk4Q3V016 1700034J05Rik-202ENSMUST00000111622 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Hipk4Q3V016 Dnajc1-209ENSMUST00000166495 5497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Hipk4Q3V016 Zfp281-202ENSMUST00000112046 4937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Hipk4Q3V016 Tcf3-207ENSMUST00000105343 2920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Hipk4Q3V016 Plxnc1-201ENSMUST00000099337 7302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Hipk4Q3V016 Zfp995-205ENSMUST00000190066 2221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Hipk4Q3V016 Gm6583-201ENSMUST00000051117 2233 ntAPPRIS P1 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Hipk4Q3V016 Aptx-203ENSMUST00000108103 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Hipk4Q3V016 Rab7-203ENSMUST00000113597 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Hipk4Q3V016 Gpr180-201ENSMUST00000022728 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Hipk4Q3V016 Pald1-201ENSMUST00000020289 4282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Hipk4Q3V016 Dmtn-201ENSMUST00000022694 5418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.21
Hipk4Q3V016 Pola2-202ENSMUST00000165143 2397 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Hipk4Q3V016 Rnf111-201ENSMUST00000034739 4880 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Hipk4Q3V016 Naa50-203ENSMUST00000159514 3756 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Hipk4Q3V016 Cab39-202ENSMUST00000113360 3805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Hipk4Q3V016 Gm11273-201ENSMUST00000044043 390 ntAPPRIS P1 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Hipk4Q3V016 Wdr33-202ENSMUST00000082319 1152 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Hipk4Q3V016 C77080-201ENSMUST00000052602 5187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Hipk4Q3V016 Adamtsl1-201ENSMUST00000048885 1842 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Hipk4Q3V016 C030014I23Rik-201ENSMUST00000080911 1810 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.5 ms