Protein–RNA interactions for Protein: Q3UZ01

Rnpc3, RNA-binding protein 40, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 514 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnpc3Q3UZ01 Sbsn-203ENSMUST00000182229 732 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Rnpc3Q3UZ01 Tm4sf5-201ENSMUST00000019063 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Rnpc3Q3UZ01 Smim4-204ENSMUST00000203261 1219 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Rnpc3Q3UZ01 Gm6376-201ENSMUST00000209407 580 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
Rnpc3Q3UZ01 Pts-206ENSMUST00000214873 511 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Rnpc3Q3UZ01 Tmem205-201ENSMUST00000046831 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Rnpc3Q3UZ01 Nudt16l1-201ENSMUST00000050881 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Rnpc3Q3UZ01 Dtnbp1-203ENSMUST00000220555 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Rnpc3Q3UZ01 Sphk1-201ENSMUST00000063396 2659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Rnpc3Q3UZ01 Spi1-201ENSMUST00000002180 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Rnpc3Q3UZ01 Car9-201ENSMUST00000030183 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Rnpc3Q3UZ01 Arrb1-210ENSMUST00000179755 7135 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Rnpc3Q3UZ01 Arrb1-202ENSMUST00000098266 7132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Rnpc3Q3UZ01 Wnt4-201ENSMUST00000045747 4194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Rnpc3Q3UZ01 Lrch3-211ENSMUST00000170899 2752 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Rnpc3Q3UZ01 Nadk2-203ENSMUST00000100790 3665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Rnpc3Q3UZ01 Wdtc1-201ENSMUST00000043305 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Rnpc3Q3UZ01 Dnaaf3-201ENSMUST00000094897 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Rnpc3Q3UZ01 Sox14-201ENSMUST00000054819 2065 ntAPPRIS P1 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Rnpc3Q3UZ01 Clasrp-201ENSMUST00000086041 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Rnpc3Q3UZ01 Gm26803-201ENSMUST00000181705 2011 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Rnpc3Q3UZ01 Ccdc17-201ENSMUST00000051869 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Rnpc3Q3UZ01 Casp9-201ENSMUST00000030747 3897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Rnpc3Q3UZ01 Zbtb24-202ENSMUST00000213797 2734 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Rnpc3Q3UZ01 Nrn1l-202ENSMUST00000118920 603 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Rnpc3Q3UZ01 Mpc1-205ENSMUST00000142594 961 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Rnpc3Q3UZ01 Prss45-202ENSMUST00000146794 1208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Rnpc3Q3UZ01 A230065H16Rik-201ENSMUST00000150384 670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Rnpc3Q3UZ01 Gm27217-201ENSMUST00000183438 882 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Rnpc3Q3UZ01 Cmtm5-203ENSMUST00000227441 610 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
Rnpc3Q3UZ01 Rgp1-201ENSMUST00000030190 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Rnpc3Q3UZ01 Olfr1232-201ENSMUST00000099785 936 ntAPPRIS P1 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Rnpc3Q3UZ01 A930003O13Rik-203ENSMUST00000199056 1955 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Rnpc3Q3UZ01 Runx1t1-201ENSMUST00000006761 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Rnpc3Q3UZ01 Pick1-206ENSMUST00000166155 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Rnpc3Q3UZ01 Tmx1-201ENSMUST00000021471 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Rnpc3Q3UZ01 Utp18-201ENSMUST00000066888 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Rnpc3Q3UZ01 D10Jhu81e-201ENSMUST00000001242 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Rnpc3Q3UZ01 Msmo1-201ENSMUST00000034015 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Rnpc3Q3UZ01 Vps72-201ENSMUST00000009102 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Rnpc3Q3UZ01 Gm42918-201ENSMUST00000199249 1580 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
Rnpc3Q3UZ01 Fkbp14-202ENSMUST00000117375 1830 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Rnpc3Q3UZ01 Pcmt1-202ENSMUST00000159917 2491 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Rnpc3Q3UZ01 Rbm11-201ENSMUST00000046378 1400 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Rnpc3Q3UZ01 Rpf1-201ENSMUST00000029838 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Rnpc3Q3UZ01 Commd6-201ENSMUST00000100339 1090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Rnpc3Q3UZ01 Eapp-203ENSMUST00000160085 676 ntTSL 3 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Rnpc3Q3UZ01 Mir5131-201ENSMUST00000175426 93 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
Rnpc3Q3UZ01 Gm8000-201ENSMUST00000188378 592 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
Rnpc3Q3UZ01 Gm37280-201ENSMUST00000194583 375 ntTSL 3 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Rnpc3Q3UZ01 Gm2213-201ENSMUST00000197485 688 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
Rnpc3Q3UZ01 Vsig2-201ENSMUST00000002008 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Rnpc3Q3UZ01 Cda-201ENSMUST00000030535 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Rnpc3Q3UZ01 Eif5a-203ENSMUST00000071026 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Rnpc3Q3UZ01 2810408A11Rik-203ENSMUST00000102580 1640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Rnpc3Q3UZ01 Ap1s1-201ENSMUST00000111080 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Rnpc3Q3UZ01 Pard6g-201ENSMUST00000070219 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Rnpc3Q3UZ01 Rab6a-202ENSMUST00000098252 3110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Rnpc3Q3UZ01 Emd-201ENSMUST00000002029 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Rnpc3Q3UZ01 Nr1h2-213ENSMUST00000167197 1944 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Rnpc3Q3UZ01 Gpd1l-201ENSMUST00000084853 1436 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Rnpc3Q3UZ01 Zfp24-203ENSMUST00000153337 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Rnpc3Q3UZ01 Acads-201ENSMUST00000031524 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Rnpc3Q3UZ01 Mmd-201ENSMUST00000004050 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Rnpc3Q3UZ01 Tmem151b-201ENSMUST00000180252 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Rnpc3Q3UZ01 4930477E14Rik-201ENSMUST00000181412 621 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Rnpc3Q3UZ01 Ppp1r27-201ENSMUST00000026121 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Rnpc3Q3UZ01 Tmem128-201ENSMUST00000087511 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Rnpc3Q3UZ01 Gpr137b-201ENSMUST00000021738 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Rnpc3Q3UZ01 Trim45-202ENSMUST00000094048 1815 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Rnpc3Q3UZ01 Map4k5-210ENSMUST00000171211 4334 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Rnpc3Q3UZ01 Eral1-201ENSMUST00000021183 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Rnpc3Q3UZ01 Rimbp3-201ENSMUST00000169803 5787 ntAPPRIS P1 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Rnpc3Q3UZ01 Gm11696-201ENSMUST00000070956 2765 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Rnpc3Q3UZ01 Tbc1d9-202ENSMUST00000093393 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Rnpc3Q3UZ01 Pcdhac2-201ENSMUST00000047479 5888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Rnpc3Q3UZ01 Arid1a-205ENSMUST00000145664 8187 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Rnpc3Q3UZ01 Krt81-201ENSMUST00000061185 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Rnpc3Q3UZ01 A830073O21Rik-202ENSMUST00000205693 3096 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
Rnpc3Q3UZ01 Shd-201ENSMUST00000044216 1546 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Rnpc3Q3UZ01 Golga7b-201ENSMUST00000087123 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Rnpc3Q3UZ01 Ube2k-201ENSMUST00000142407 4893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Rnpc3Q3UZ01 Shisa2-201ENSMUST00000053949 3119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Rnpc3Q3UZ01 Cnksr1-201ENSMUST00000030645 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Rnpc3Q3UZ01 Nek2-201ENSMUST00000027931 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Rnpc3Q3UZ01 Gm7862-201ENSMUST00000121461 292 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
Rnpc3Q3UZ01 Sardhos-201ENSMUST00000170435 265 ntTSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Rnpc3Q3UZ01 Cbr2-201ENSMUST00000026148 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Rnpc3Q3UZ01 Pla2g12b-201ENSMUST00000009790 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Rnpc3Q3UZ01 Antxr2-202ENSMUST00000199088 2739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Rnpc3Q3UZ01 Arfip2-202ENSMUST00000084782 2254 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Rnpc3Q3UZ01 Letm1-203ENSMUST00000148451 2478 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Rnpc3Q3UZ01 Ppp1r9b-201ENSMUST00000038696 4508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Rnpc3Q3UZ01 Nsmf-203ENSMUST00000100334 2957 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Rnpc3Q3UZ01 Btnl9-201ENSMUST00000046522 5273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Rnpc3Q3UZ01 Mcfd2-201ENSMUST00000024963 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Rnpc3Q3UZ01 Dock9-202ENSMUST00000100299 6476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Rnpc3Q3UZ01 Sh2b3-201ENSMUST00000040308 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Rnpc3Q3UZ01 Whrn-201ENSMUST00000063650 4016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Rnpc3Q3UZ01 Dnajc19-201ENSMUST00000011029 2499 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
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