Protein–RNA interactions for Protein: Q3UWX6

E330034G19Rik, RIKEN cDNA E330034G19 gene, mousemouse

Predictions only

Length 351 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
E330034G19RikQ3UWX6 Ctnna2-205ENSMUST00000161846 4018 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
E330034G19RikQ3UWX6 Hmga1-206ENSMUST00000119486 1003 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
E330034G19RikQ3UWX6 Spdya-202ENSMUST00000124001 1247 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
E330034G19RikQ3UWX6 Pabpc1l2b-ps-201ENSMUST00000124538 690 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
E330034G19RikQ3UWX6 Gm16127-201ENSMUST00000131619 234 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
E330034G19RikQ3UWX6 Gm15889-201ENSMUST00000159142 1083 ntTSL 3 BASIC16.63■□□□□ 0.25
E330034G19RikQ3UWX6 Ssr2-207ENSMUST00000195014 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
E330034G19RikQ3UWX6 Gm45148-201ENSMUST00000208578 513 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
E330034G19RikQ3UWX6 Arfip2-212ENSMUST00000209550 1141 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
E330034G19RikQ3UWX6 Arfip2-214ENSMUST00000210911 938 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
E330034G19RikQ3UWX6 Gm8909-202ENSMUST00000097335 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
E330034G19RikQ3UWX6 Nadk-203ENSMUST00000105613 3152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
E330034G19RikQ3UWX6 Tubb6-201ENSMUST00000001513 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
E330034G19RikQ3UWX6 Cops6-201ENSMUST00000019638 1787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
E330034G19RikQ3UWX6 Gm13327-201ENSMUST00000133391 2741 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
E330034G19RikQ3UWX6 Raxos1-201ENSMUST00000181100 2547 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
E330034G19RikQ3UWX6 Nrxn1-206ENSMUST00000160800 5683 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
E330034G19RikQ3UWX6 Hmgb3-202ENSMUST00000072699 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
E330034G19RikQ3UWX6 Hira-202ENSMUST00000120532 2063 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
E330034G19RikQ3UWX6 Ptprn-201ENSMUST00000027404 3554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
E330034G19RikQ3UWX6 Nptn-212ENSMUST00000177292 1390 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
E330034G19RikQ3UWX6 Hhatl-201ENSMUST00000035110 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
E330034G19RikQ3UWX6 Kdelc2-201ENSMUST00000037853 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
E330034G19RikQ3UWX6 Sirt6-201ENSMUST00000042923 1891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
E330034G19RikQ3UWX6 Nedd4l-202ENSMUST00000163516 8163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
E330034G19RikQ3UWX6 Urgcp-206ENSMUST00000170116 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
E330034G19RikQ3UWX6 Rptor-201ENSMUST00000026671 6594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
E330034G19RikQ3UWX6 Zpr1-206ENSMUST00000156440 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
E330034G19RikQ3UWX6 Rgl1-202ENSMUST00000111857 3037 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
E330034G19RikQ3UWX6 Zbtb2-201ENSMUST00000100077 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
E330034G19RikQ3UWX6 Ly6e-201ENSMUST00000051698 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
E330034G19RikQ3UWX6 Rwdd2b-201ENSMUST00000039101 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
E330034G19RikQ3UWX6 Zfp786-201ENSMUST00000058844 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
E330034G19RikQ3UWX6 Gramd3-201ENSMUST00000070166 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
E330034G19RikQ3UWX6 Dnajc3-201ENSMUST00000022734 5141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
E330034G19RikQ3UWX6 Bend4-201ENSMUST00000169190 7935 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
E330034G19RikQ3UWX6 Med7-209ENSMUST00000170928 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
E330034G19RikQ3UWX6 Gm11539-201ENSMUST00000119837 557 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
E330034G19RikQ3UWX6 Cenps-207ENSMUST00000177408 689 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
E330034G19RikQ3UWX6 Gm4217-201ENSMUST00000182243 1002 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
E330034G19RikQ3UWX6 Cib1-207ENSMUST00000206084 772 ntTSL 3 BASIC16.62■□□□□ 0.25
E330034G19RikQ3UWX6 Gm18115-201ENSMUST00000221209 621 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
E330034G19RikQ3UWX6 Scin-201ENSMUST00000002640 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
E330034G19RikQ3UWX6 Cib1-202ENSMUST00000071457 702 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
E330034G19RikQ3UWX6 Rgs9-201ENSMUST00000020920 2434 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
E330034G19RikQ3UWX6 Krt27-201ENSMUST00000017732 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
E330034G19RikQ3UWX6 Fam3a-206ENSMUST00000114143 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
E330034G19RikQ3UWX6 Mtmr12-201ENSMUST00000038172 6840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
E330034G19RikQ3UWX6 Kifc3-212ENSMUST00000213004 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
E330034G19RikQ3UWX6 Ppp2r5e-201ENSMUST00000021447 4810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
E330034G19RikQ3UWX6 Klhdc8b-214ENSMUST00000195435 1612 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
E330034G19RikQ3UWX6 Phax-201ENSMUST00000008445 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
E330034G19RikQ3UWX6 Tenm3-204ENSMUST00000110346 2267 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
E330034G19RikQ3UWX6 Pde5a-204ENSMUST00000200389 7603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
E330034G19RikQ3UWX6 Tor1b-201ENSMUST00000028199 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
E330034G19RikQ3UWX6 Olah-203ENSMUST00000194918 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
E330034G19RikQ3UWX6 Stx18-201ENSMUST00000031008 1471 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
E330034G19RikQ3UWX6 Gm28756-202ENSMUST00000209405 2461 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
E330034G19RikQ3UWX6 Neu1-201ENSMUST00000007253 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
E330034G19RikQ3UWX6 Bloc1s3-201ENSMUST00000077408 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
E330034G19RikQ3UWX6 Papolb-201ENSMUST00000099400 4239 ntAPPRIS P1 BASIC16.61■□□□□ 0.25
E330034G19RikQ3UWX6 Mrpl57-201ENSMUST00000022538 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
E330034G19RikQ3UWX6 Psip1-201ENSMUST00000030207 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
E330034G19RikQ3UWX6 Gm20460-201ENSMUST00000168709 1572 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
E330034G19RikQ3UWX6 Pcolce-202ENSMUST00000054564 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
E330034G19RikQ3UWX6 Phf7-203ENSMUST00000226565 1971 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
E330034G19RikQ3UWX6 Apbb1-205ENSMUST00000187057 1630 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
E330034G19RikQ3UWX6 Sct-202ENSMUST00000167790 507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
E330034G19RikQ3UWX6 Anapc13-204ENSMUST00000190279 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
E330034G19RikQ3UWX6 Kcmf1-206ENSMUST00000206378 544 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
E330034G19RikQ3UWX6 Gng11-201ENSMUST00000031670 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
E330034G19RikQ3UWX6 Sct-201ENSMUST00000046156 534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
E330034G19RikQ3UWX6 Nme2-202ENSMUST00000072566 734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
E330034G19RikQ3UWX6 Irf5-205ENSMUST00000167252 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
E330034G19RikQ3UWX6 Htr3a-201ENSMUST00000003826 2082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
E330034G19RikQ3UWX6 Prdm12-201ENSMUST00000113470 2471 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
E330034G19RikQ3UWX6 Mydgf-201ENSMUST00000019723 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
E330034G19RikQ3UWX6 Rgs7-203ENSMUST00000192227 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
E330034G19RikQ3UWX6 Pde8b-202ENSMUST00000067082 2598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
E330034G19RikQ3UWX6 Ttc39b-202ENSMUST00000048274 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
E330034G19RikQ3UWX6 Trim14-201ENSMUST00000046897 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
E330034G19RikQ3UWX6 Tgfb2-201ENSMUST00000045288 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
E330034G19RikQ3UWX6 Slc13a3-202ENSMUST00000109279 3131 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
E330034G19RikQ3UWX6 Tfeb-204ENSMUST00000113288 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
E330034G19RikQ3UWX6 Foxo1-201ENSMUST00000053764 8665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
E330034G19RikQ3UWX6 CT010478.1-201ENSMUST00000220747 2787 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
E330034G19RikQ3UWX6 Eif2ak3-201ENSMUST00000034093 4513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
E330034G19RikQ3UWX6 Zfx-204ENSMUST00000113927 6933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
E330034G19RikQ3UWX6 Degs1-201ENSMUST00000035295 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
E330034G19RikQ3UWX6 9530068E07Rik-201ENSMUST00000036952 2467 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
E330034G19RikQ3UWX6 Apoa5-202ENSMUST00000121598 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
E330034G19RikQ3UWX6 Macrod2-201ENSMUST00000043836 3552 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
E330034G19RikQ3UWX6 Hps5-202ENSMUST00000107653 4702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
E330034G19RikQ3UWX6 Nr2e1-201ENSMUST00000019938 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
E330034G19RikQ3UWX6 Ern1-203ENSMUST00000106800 654 ntTSL 3 BASIC16.6■□□□□ 0.25
E330034G19RikQ3UWX6 Pgap3-205ENSMUST00000128897 1264 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
E330034G19RikQ3UWX6 Gm14453-201ENSMUST00000139677 553 ntTSL 3 BASIC16.6■□□□□ 0.25
E330034G19RikQ3UWX6 Dleu2-210ENSMUST00000183054 722 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
E330034G19RikQ3UWX6 Zfp219-212ENSMUST00000228580 2812 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
E330034G19RikQ3UWX6 Snph-203ENSMUST00000109875 4910 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.7 ms