Protein–RNA interactions for Protein: Q3UWL8

Pfdn4, Prefoldin subunit 4, mousemouse

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Length 134 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pfdn4Q3UWL8 Prmt2-202ENSMUST00000099571 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Pfdn4Q3UWL8 Sfrp4-201ENSMUST00000002883 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Pfdn4Q3UWL8 Anapc7-201ENSMUST00000031422 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Pfdn4Q3UWL8 Ets1-206ENSMUST00000184887 2107 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Pfdn4Q3UWL8 Was-201ENSMUST00000033505 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Pfdn4Q3UWL8 Fbxo9-202ENSMUST00000085311 2155 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Pfdn4Q3UWL8 Carmil2-201ENSMUST00000062574 2526 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Pfdn4Q3UWL8 Ndufs2-202ENSMUST00000111318 1545 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Pfdn4Q3UWL8 Sphk1-206ENSMUST00000106388 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Pfdn4Q3UWL8 Stk33-201ENSMUST00000090414 2221 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Pfdn4Q3UWL8 Tex261-201ENSMUST00000014892 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Pfdn4Q3UWL8 Hps6-201ENSMUST00000099393 2696 ntAPPRIS P1 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Pfdn4Q3UWL8 F2rl1-201ENSMUST00000022185 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Pfdn4Q3UWL8 Prmt1-201ENSMUST00000045325 1071 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Pfdn4Q3UWL8 Ube2i-207ENSMUST00000172868 2755 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Pfdn4Q3UWL8 Hspa1b-201ENSMUST00000172753 2803 ntAPPRIS P1 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Pfdn4Q3UWL8 Aim2-204ENSMUST00000166137 2079 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Pfdn4Q3UWL8 Wrb-201ENSMUST00000023913 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Pfdn4Q3UWL8 Chpf-201ENSMUST00000079205 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Pfdn4Q3UWL8 Spout1-201ENSMUST00000100220 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Pfdn4Q3UWL8 I0C0044D17Rik-201ENSMUST00000097964 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Pfdn4Q3UWL8 Gm9917-202ENSMUST00000181099 1499 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Pfdn4Q3UWL8 Wipf1-202ENSMUST00000102679 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Pfdn4Q3UWL8 Chsy3-201ENSMUST00000080721 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Pfdn4Q3UWL8 Casz1-202ENSMUST00000122222 7926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Pfdn4Q3UWL8 Gm10516-201ENSMUST00000180598 2615 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Pfdn4Q3UWL8 Vim-201ENSMUST00000028062 2193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Pfdn4Q3UWL8 Csk-201ENSMUST00000034863 2749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Pfdn4Q3UWL8 Arhgef12-202ENSMUST00000165665 10752 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Pfdn4Q3UWL8 Acot8-202ENSMUST00000103094 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Pfdn4Q3UWL8 Gm10653-202ENSMUST00000139570 835 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Pfdn4Q3UWL8 Serf1-204ENSMUST00000151821 570 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Pfdn4Q3UWL8 Gm17041-201ENSMUST00000163196 479 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Pfdn4Q3UWL8 Acot8-201ENSMUST00000017451 1055 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Pfdn4Q3UWL8 Sae1-203ENSMUST00000210999 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Pfdn4Q3UWL8 Cox4i1-201ENSMUST00000034276 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Pfdn4Q3UWL8 Dnajb2-208ENSMUST00000188346 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Pfdn4Q3UWL8 A230072E10Rik-203ENSMUST00000175942 2940 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Pfdn4Q3UWL8 Fndc3a-201ENSMUST00000089017 6143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Pfdn4Q3UWL8 Mcoln2-202ENSMUST00000098524 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Pfdn4Q3UWL8 Nrros-201ENSMUST00000099991 2548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Pfdn4Q3UWL8 Gabra5-202ENSMUST00000206382 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Pfdn4Q3UWL8 Mon1b-201ENSMUST00000035777 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Pfdn4Q3UWL8 Itpkc-201ENSMUST00000003850 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Pfdn4Q3UWL8 2510009E07Rik-201ENSMUST00000053336 5164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Pfdn4Q3UWL8 Rcc2-202ENSMUST00000071169 3999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Pfdn4Q3UWL8 Dsg2-202ENSMUST00000120102 3590 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Pfdn4Q3UWL8 Rflna-201ENSMUST00000036109 1681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
Pfdn4Q3UWL8 Krt84-201ENSMUST00000023720 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Pfdn4Q3UWL8 Pak2-201ENSMUST00000023467 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Pfdn4Q3UWL8 Pnpt1-201ENSMUST00000020756 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Pfdn4Q3UWL8 Nr1h2-203ENSMUST00000107911 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Pfdn4Q3UWL8 Fbxl21-201ENSMUST00000045428 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Pfdn4Q3UWL8 Inpp5e-202ENSMUST00000114090 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Pfdn4Q3UWL8 Zdhhc1-203ENSMUST00000212303 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Pfdn4Q3UWL8 Gm12669-201ENSMUST00000122162 1009 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Pfdn4Q3UWL8 Tnfaip8-208ENSMUST00000148989 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Pfdn4Q3UWL8 Gm18958-201ENSMUST00000174258 762 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Pfdn4Q3UWL8 Dctn3-201ENSMUST00000030158 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Pfdn4Q3UWL8 Sap30-201ENSMUST00000034022 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Pfdn4Q3UWL8 H2-Eb1-201ENSMUST00000074557 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Pfdn4Q3UWL8 Rbm12b2-202ENSMUST00000095143 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Pfdn4Q3UWL8 Eif4h-201ENSMUST00000036125 2367 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Pfdn4Q3UWL8 Sphk1-202ENSMUST00000063446 2527 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Pfdn4Q3UWL8 Coch-202ENSMUST00000164782 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Pfdn4Q3UWL8 Ythdf3-202ENSMUST00000108346 4929 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Pfdn4Q3UWL8 Pacs2-202ENSMUST00000220541 3101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Pfdn4Q3UWL8 Yipf4-201ENSMUST00000024873 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Pfdn4Q3UWL8 Elf2-202ENSMUST00000091144 2366 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Pfdn4Q3UWL8 Tor1aip2-205ENSMUST00000111757 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Pfdn4Q3UWL8 Megf9-202ENSMUST00000107359 7924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Pfdn4Q3UWL8 Ankrd50-202ENSMUST00000120875 4945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Pfdn4Q3UWL8 5430402O13Rik-201ENSMUST00000126537 869 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Pfdn4Q3UWL8 Gm17098-201ENSMUST00000166507 628 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Pfdn4Q3UWL8 Gm20760-201ENSMUST00000179197 648 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Pfdn4Q3UWL8 Gm27000-201ENSMUST00000182943 842 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Pfdn4Q3UWL8 Guca1a-201ENSMUST00000059348 871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Pfdn4Q3UWL8 Theg-202ENSMUST00000077433 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Pfdn4Q3UWL8 Fam166b-201ENSMUST00000052829 1349 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Pfdn4Q3UWL8 Sncb-201ENSMUST00000036825 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Pfdn4Q3UWL8 Casp3-201ENSMUST00000093517 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Pfdn4Q3UWL8 Ppm1j-201ENSMUST00000002298 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Pfdn4Q3UWL8 Gal3st1-201ENSMUST00000063004 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Pfdn4Q3UWL8 Atp5b-201ENSMUST00000026459 1916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Pfdn4Q3UWL8 Tsnax-201ENSMUST00000075896 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Pfdn4Q3UWL8 Shc1-202ENSMUST00000094378 2617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Pfdn4Q3UWL8 Cpeb3-212ENSMUST00000154376 5671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Pfdn4Q3UWL8 Jph4-201ENSMUST00000022819 4489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Pfdn4Q3UWL8 Dnajb5-201ENSMUST00000037872 3291 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Pfdn4Q3UWL8 B3gnt6-201ENSMUST00000098278 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Pfdn4Q3UWL8 Snip1-201ENSMUST00000052183 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Pfdn4Q3UWL8 Arhgef9-216ENSMUST00000197206 2227 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Pfdn4Q3UWL8 Prkab1-202ENSMUST00000111999 2026 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Pfdn4Q3UWL8 Cdc27-202ENSMUST00000106961 1863 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Pfdn4Q3UWL8 B4galt3-205ENSMUST00000126699 1758 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Pfdn4Q3UWL8 Nisch-221ENSMUST00000171735 1763 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Pfdn4Q3UWL8 Taf6l-213ENSMUST00000189739 1794 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Pfdn4Q3UWL8 Pnck-202ENSMUST00000114472 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Pfdn4Q3UWL8 A330009N23Rik-201ENSMUST00000180639 1392 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Pfdn4Q3UWL8 Rpl36al-202ENSMUST00000110619 1276 ntAPPRIS P1 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22 ms