Protein–RNA interactions for Protein: Q3UW22

Defb48, Beta-defensin 42, mousemouse

Predictions only

Length 87 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Defb48Q3UW22 Cux1-206ENSMUST00000176172 4882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Defb48Q3UW22 Ghrhr-201ENSMUST00000063578 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Defb48Q3UW22 Tbx18-201ENSMUST00000034991 4679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Defb48Q3UW22 Epn1-202ENSMUST00000098845 2565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Defb48Q3UW22 Arhgap39-202ENSMUST00000077821 4494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Defb48Q3UW22 Mtcl1-202ENSMUST00000097291 7274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Defb48Q3UW22 Slc16a3-202ENSMUST00000100130 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Defb48Q3UW22 Tekt1-202ENSMUST00000108502 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Defb48Q3UW22 Ube2e1-201ENSMUST00000022296 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Defb48Q3UW22 Mrm2-201ENSMUST00000031536 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Defb48Q3UW22 Anxa2-201ENSMUST00000034756 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Defb48Q3UW22 Eif2b5-201ENSMUST00000003320 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Defb48Q3UW22 Rnf186-201ENSMUST00000116094 1249 ntAPPRIS P1 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Defb48Q3UW22 Gm12973-201ENSMUST00000143967 607 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Defb48Q3UW22 Pafah1b3-207ENSMUST00000155118 679 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Defb48Q3UW22 Sbsn-202ENSMUST00000182227 432 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Defb48Q3UW22 Sbsn-203ENSMUST00000182229 732 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Defb48Q3UW22 Npw-202ENSMUST00000213213 531 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Defb48Q3UW22 Antxr2-202ENSMUST00000199088 2739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Defb48Q3UW22 Shank3-203ENSMUST00000109309 7365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Defb48Q3UW22 Ak5-201ENSMUST00000045262 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Defb48Q3UW22 Fam171a2-201ENSMUST00000049057 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Defb48Q3UW22 Dok7-202ENSMUST00000101298 2443 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Defb48Q3UW22 Klf14-201ENSMUST00000101589 3056 ntAPPRIS P1 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Defb48Q3UW22 Kptn-201ENSMUST00000006178 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Defb48Q3UW22 Efemp2-204ENSMUST00000165485 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Defb48Q3UW22 Ndufs2-202ENSMUST00000111318 1545 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Defb48Q3UW22 Ndufv2-203ENSMUST00000143987 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Defb48Q3UW22 Zfp326-201ENSMUST00000031227 2667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Defb48Q3UW22 Pex6-201ENSMUST00000002840 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Defb48Q3UW22 Letm1-203ENSMUST00000148451 2478 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Defb48Q3UW22 Ube2f-204ENSMUST00000178627 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Defb48Q3UW22 Asic2-201ENSMUST00000021045 3436 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Defb48Q3UW22 Gm13312-201ENSMUST00000119631 718 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Defb48Q3UW22 Gm16272-201ENSMUST00000128218 388 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Defb48Q3UW22 Gm14641-201ENSMUST00000136486 452 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Defb48Q3UW22 Gm14964-202ENSMUST00000149574 716 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Defb48Q3UW22 Gm26644-201ENSMUST00000181365 958 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Defb48Q3UW22 Ank1-201ENSMUST00000033947 1030 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Defb48Q3UW22 Ppib-201ENSMUST00000034947 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Defb48Q3UW22 Polr2f-201ENSMUST00000040077 543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Defb48Q3UW22 Pard6g-201ENSMUST00000070219 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Defb48Q3UW22 Adrb2-201ENSMUST00000053640 2143 ntAPPRIS P1 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Defb48Q3UW22 Ptn-201ENSMUST00000101534 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Defb48Q3UW22 Hmbs-201ENSMUST00000077353 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Defb48Q3UW22 Ephb4-203ENSMUST00000111055 4296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Defb48Q3UW22 Jade1-202ENSMUST00000163764 5584 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Defb48Q3UW22 Baiap2-204ENSMUST00000106231 4005 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Defb48Q3UW22 Nfe2-208ENSMUST00000149111 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Defb48Q3UW22 Rbm12b2-202ENSMUST00000095143 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Defb48Q3UW22 Adgrb2-204ENSMUST00000106015 4982 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Defb48Q3UW22 E330011M16Rik-201ENSMUST00000193614 1794 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Defb48Q3UW22 Fxyd6-201ENSMUST00000085939 1788 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Defb48Q3UW22 Eif6-202ENSMUST00000109638 1382 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Defb48Q3UW22 Trip10-205ENSMUST00000224885 2136 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Defb48Q3UW22 Gopc-202ENSMUST00000105475 4317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Defb48Q3UW22 Git2-215ENSMUST00000178440 4944 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Defb48Q3UW22 Git2-201ENSMUST00000043283 4938 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Defb48Q3UW22 Cldn7-203ENSMUST00000108596 664 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Defb48Q3UW22 Zscan10-204ENSMUST00000118369 1006 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Defb48Q3UW22 Gm12895-201ENSMUST00000122214 226 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Defb48Q3UW22 Erdr1-203ENSMUST00000179077 887 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Defb48Q3UW22 Rnf13-209ENSMUST00000199041 1062 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Defb48Q3UW22 4930451I11Rik-201ENSMUST00000061695 481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Defb48Q3UW22 Sult2b1-201ENSMUST00000075571 1193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Defb48Q3UW22 Olfr601-201ENSMUST00000080474 990 ntAPPRIS P1 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Defb48Q3UW22 Serf2-201ENSMUST00000099475 525 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Defb48Q3UW22 Slc29a1-202ENSMUST00000064889 1988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Defb48Q3UW22 Appl2-201ENSMUST00000020500 3020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Defb48Q3UW22 Gm9889-202ENSMUST00000206983 1577 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Defb48Q3UW22 Pbx4-201ENSMUST00000081503 1560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Defb48Q3UW22 Rhof-201ENSMUST00000031401 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Defb48Q3UW22 Rbpj-203ENSMUST00000113865 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Defb48Q3UW22 Dohh-201ENSMUST00000072751 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Defb48Q3UW22 Ctdsp2-202ENSMUST00000105256 4817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Defb48Q3UW22 Mif4gd-201ENSMUST00000021087 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Defb48Q3UW22 Dcdc2c-206ENSMUST00000221349 2209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Defb48Q3UW22 Zcchc4-203ENSMUST00000113904 2485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Defb48Q3UW22 Ddhd1-201ENSMUST00000051310 5012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Defb48Q3UW22 Tmem178b-203ENSMUST00000180886 712 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Defb48Q3UW22 Gm27741-201ENSMUST00000185060 237 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Defb48Q3UW22 Lmo1-203ENSMUST00000208136 772 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Defb48Q3UW22 Rpl18-204ENSMUST00000209693 535 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Defb48Q3UW22 Slc25a43-201ENSMUST00000047655 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Defb48Q3UW22 Spr-ps1-201ENSMUST00000089584 605 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Defb48Q3UW22 Ldb1-205ENSMUST00000137771 2014 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Defb48Q3UW22 Ccdc30-201ENSMUST00000044781 1464 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Defb48Q3UW22 Ttc13-201ENSMUST00000041614 3038 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Defb48Q3UW22 Bcl7b-203ENSMUST00000111188 1434 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Defb48Q3UW22 Mier2-212ENSMUST00000172158 1400 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Defb48Q3UW22 Sntg2-201ENSMUST00000021004 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Defb48Q3UW22 Bpifb4-203ENSMUST00000109759 2115 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Defb48Q3UW22 Cep135-202ENSMUST00000121979 5537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Defb48Q3UW22 Kdm2a-202ENSMUST00000075856 7242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Defb48Q3UW22 Elk4-202ENSMUST00000086556 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Defb48Q3UW22 Nat9-203ENSMUST00000103040 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Defb48Q3UW22 Nat9-204ENSMUST00000103041 953 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Defb48Q3UW22 Gm14464-201ENSMUST00000119658 1254 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Defb48Q3UW22 Hint3-203ENSMUST00000161074 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Defb48Q3UW22 Syngr2-206ENSMUST00000177131 935 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.1 ms