Protein–RNA interactions for Protein: Q3UUV9

H2-Eb2, Histocompatibility 2, class II antigen E beta2, mousemouse

Predictions only

Length 287 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H2-Eb2Q3UUV9 Rab37-202ENSMUST00000067754 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
H2-Eb2Q3UUV9 Fbxo22-201ENSMUST00000034859 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
H2-Eb2Q3UUV9 Synpo-206ENSMUST00000130360 5159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
H2-Eb2Q3UUV9 H2-DMb1-201ENSMUST00000114232 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
H2-Eb2Q3UUV9 Bnipl-201ENSMUST00000098871 1414 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
H2-Eb2Q3UUV9 Jade2-202ENSMUST00000109090 6230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
H2-Eb2Q3UUV9 Rgp1-203ENSMUST00000117140 1635 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
H2-Eb2Q3UUV9 1700025L06Rik-203ENSMUST00000211477 1623 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
H2-Eb2Q3UUV9 Krt28-201ENSMUST00000006963 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
H2-Eb2Q3UUV9 Slco3a1-201ENSMUST00000026897 4589 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
H2-Eb2Q3UUV9 Dcdc2c-206ENSMUST00000221349 2209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
H2-Eb2Q3UUV9 Zfp281-201ENSMUST00000047734 4933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
H2-Eb2Q3UUV9 Atp6v1b2-201ENSMUST00000006435 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
H2-Eb2Q3UUV9 Slc35b2-202ENSMUST00000223987 1766 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
H2-Eb2Q3UUV9 Magix-201ENSMUST00000115695 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
H2-Eb2Q3UUV9 Mff-211ENSMUST00000161648 1715 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
H2-Eb2Q3UUV9 Rbm12b2-202ENSMUST00000095143 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
H2-Eb2Q3UUV9 Ppfibp1-201ENSMUST00000016631 4851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
H2-Eb2Q3UUV9 Gm26663-201ENSMUST00000181105 1882 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
H2-Eb2Q3UUV9 D3Ertd751e-205ENSMUST00000120167 773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
H2-Eb2Q3UUV9 Ighv6-1-201ENSMUST00000193612 343 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
H2-Eb2Q3UUV9 Gm33142-201ENSMUST00000193913 867 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
H2-Eb2Q3UUV9 Gm42477-201ENSMUST00000202427 469 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
H2-Eb2Q3UUV9 F420014N23Rik-202ENSMUST00000219079 659 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
H2-Eb2Q3UUV9 4930465K10Rik-201ENSMUST00000056675 1238 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
H2-Eb2Q3UUV9 Birc5-201ENSMUST00000081387 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
H2-Eb2Q3UUV9 Pex6-201ENSMUST00000002840 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
H2-Eb2Q3UUV9 Ankra2-204ENSMUST00000150352 2217 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
H2-Eb2Q3UUV9 Mrm2-201ENSMUST00000031536 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
H2-Eb2Q3UUV9 Tuba1c-201ENSMUST00000058914 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
H2-Eb2Q3UUV9 Wt1-205ENSMUST00000143043 3090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
H2-Eb2Q3UUV9 Gm18336-201ENSMUST00000180787 2298 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
H2-Eb2Q3UUV9 Haglr-201ENSMUST00000100000 2085 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
H2-Eb2Q3UUV9 Dhx32-201ENSMUST00000033290 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
H2-Eb2Q3UUV9 Cdk17-201ENSMUST00000069965 3615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
H2-Eb2Q3UUV9 Rbm33-204ENSMUST00000114884 6256 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
H2-Eb2Q3UUV9 Csk-201ENSMUST00000034863 2749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
H2-Eb2Q3UUV9 Xiap-203ENSMUST00000115094 6542 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
H2-Eb2Q3UUV9 Rad23a-202ENSMUST00000109761 1842 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
H2-Eb2Q3UUV9 Plcl2-201ENSMUST00000043938 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
H2-Eb2Q3UUV9 Cdv3-201ENSMUST00000035484 3387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
H2-Eb2Q3UUV9 Jam2-201ENSMUST00000098407 1998 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
H2-Eb2Q3UUV9 Nbea-201ENSMUST00000029374 10986 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
H2-Eb2Q3UUV9 Tmsb10-202ENSMUST00000114049 690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
H2-Eb2Q3UUV9 Gm15295-201ENSMUST00000139874 488 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
H2-Eb2Q3UUV9 Gm10052-201ENSMUST00000168019 960 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
H2-Eb2Q3UUV9 Gm36967-201ENSMUST00000193814 266 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
H2-Eb2Q3UUV9 3110040N11Rik-201ENSMUST00000026092 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
H2-Eb2Q3UUV9 Gm7729-201ENSMUST00000050143 801 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
H2-Eb2Q3UUV9 Hexb-201ENSMUST00000022169 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
H2-Eb2Q3UUV9 Eda-202ENSMUST00000113775 5088 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
H2-Eb2Q3UUV9 Dok4-201ENSMUST00000046461 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
H2-Eb2Q3UUV9 Kdf1-201ENSMUST00000042919 1708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
H2-Eb2Q3UUV9 9330151L19Rik-201ENSMUST00000181850 2545 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
H2-Eb2Q3UUV9 Gm7292-201ENSMUST00000194706 2527 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
H2-Eb2Q3UUV9 Gja4-201ENSMUST00000053753 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
H2-Eb2Q3UUV9 Cend1-201ENSMUST00000084436 1672 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
H2-Eb2Q3UUV9 Dbnl-202ENSMUST00000102928 2295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
H2-Eb2Q3UUV9 Slc35e3-201ENSMUST00000079041 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
H2-Eb2Q3UUV9 Abhd16a-201ENSMUST00000007251 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
H2-Eb2Q3UUV9 Zmynd15-203ENSMUST00000108563 2649 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
H2-Eb2Q3UUV9 Fgf8-205ENSMUST00000111927 843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
H2-Eb2Q3UUV9 Kcng4-202ENSMUST00000164382 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
H2-Eb2Q3UUV9 H2-K1-205ENSMUST00000172912 1570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
H2-Eb2Q3UUV9 Mybl2-201ENSMUST00000018005 3651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
H2-Eb2Q3UUV9 Gm28793-201ENSMUST00000190845 413 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
H2-Eb2Q3UUV9 Qdpr-208ENSMUST00000197946 1206 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
H2-Eb2Q3UUV9 Sh3glb1-205ENSMUST00000199854 1416 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
H2-Eb2Q3UUV9 Gm44430-201ENSMUST00000203376 995 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
H2-Eb2Q3UUV9 AC125350.1-201ENSMUST00000225115 903 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
H2-Eb2Q3UUV9 Nkx2-6-201ENSMUST00000062437 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
H2-Eb2Q3UUV9 Tmem128-201ENSMUST00000087511 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
H2-Eb2Q3UUV9 Nfib-205ENSMUST00000107247 3267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
H2-Eb2Q3UUV9 Tacc1-201ENSMUST00000084030 7788 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
H2-Eb2Q3UUV9 Grk6-201ENSMUST00000001115 2994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
H2-Eb2Q3UUV9 Dscr3-201ENSMUST00000023615 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
H2-Eb2Q3UUV9 Cgn-204ENSMUST00000155485 2361 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
H2-Eb2Q3UUV9 Mis18bp1-208ENSMUST00000222244 2053 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
H2-Eb2Q3UUV9 Gm14317-201ENSMUST00000151754 1464 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
H2-Eb2Q3UUV9 Snx11-202ENSMUST00000107661 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
H2-Eb2Q3UUV9 Braf-201ENSMUST00000002487 9728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
H2-Eb2Q3UUV9 Sertad4-204ENSMUST00000155579 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
H2-Eb2Q3UUV9 Susd1-202ENSMUST00000107544 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
H2-Eb2Q3UUV9 Gm26762-201ENSMUST00000180864 5284 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
H2-Eb2Q3UUV9 0610009B22Rik-202ENSMUST00000109098 892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
H2-Eb2Q3UUV9 Sap18-202ENSMUST00000111268 662 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
H2-Eb2Q3UUV9 Srpx-202ENSMUST00000115543 1218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
H2-Eb2Q3UUV9 Calu-207ENSMUST00000173216 673 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
H2-Eb2Q3UUV9 Gm26644-201ENSMUST00000181365 958 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
H2-Eb2Q3UUV9 Rpl18-204ENSMUST00000209693 535 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
H2-Eb2Q3UUV9 1700022H01Rik-201ENSMUST00000219142 387 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
H2-Eb2Q3UUV9 AC130713.1-201ENSMUST00000228853 1096 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
H2-Eb2Q3UUV9 Inmt-201ENSMUST00000003569 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
H2-Eb2Q3UUV9 Lncpint-201ENSMUST00000115107 1676 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
H2-Eb2Q3UUV9 Mif4gd-201ENSMUST00000021087 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
H2-Eb2Q3UUV9 Zfp326-201ENSMUST00000031227 2667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
H2-Eb2Q3UUV9 Zfp668-203ENSMUST00000106262 3169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
H2-Eb2Q3UUV9 Tbp-201ENSMUST00000014911 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
H2-Eb2Q3UUV9 Ptgis-201ENSMUST00000018113 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
H2-Eb2Q3UUV9 Elf2-202ENSMUST00000091144 2366 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 60.8 ms