Protein–RNA interactions for Protein: Q3UUV5

Skap1, Src kinase-associated phosphoprotein 1, mousemouse

Predictions only

Length 355 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Skap1Q3UUV5 Stxbp3-205ENSMUST00000138552 1789 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Skap1Q3UUV5 Gpsm3-201ENSMUST00000038244 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Skap1Q3UUV5 Ppp1r3f-205ENSMUST00000150787 4760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Skap1Q3UUV5 Gm12940-202ENSMUST00000137236 1970 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Skap1Q3UUV5 Rps6ka1-202ENSMUST00000105894 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Skap1Q3UUV5 Eif2b5-201ENSMUST00000003320 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Skap1Q3UUV5 Pard3-209ENSMUST00000160272 5815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Skap1Q3UUV5 Rbm4-206ENSMUST00000180248 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Skap1Q3UUV5 Gm13884-201ENSMUST00000118103 829 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
Skap1Q3UUV5 Gm14453-201ENSMUST00000139677 553 ntTSL 3 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Skap1Q3UUV5 Cgrrf1-204ENSMUST00000140114 419 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Skap1Q3UUV5 Gm15234-201ENSMUST00000141485 1058 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Skap1Q3UUV5 2410003L11Rik-202ENSMUST00000145262 642 ntTSL 3 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Skap1Q3UUV5 Tnnt2-205ENSMUST00000178204 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Skap1Q3UUV5 Tnnt2-207ENSMUST00000179863 1097 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Skap1Q3UUV5 Tnnt2-209ENSMUST00000188028 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Skap1Q3UUV5 Mrpl37-201ENSMUST00000030365 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Skap1Q3UUV5 Gm7292-201ENSMUST00000194706 2527 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
Skap1Q3UUV5 Parg-208ENSMUST00000170840 2894 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Skap1Q3UUV5 E230025N22Rik-201ENSMUST00000115682 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Skap1Q3UUV5 Evx2-201ENSMUST00000001867 4191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Skap1Q3UUV5 Pacsin3-202ENSMUST00000059566 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Skap1Q3UUV5 Wnt10b-207ENSMUST00000228594 1510 ntAPPRIS P1 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Skap1Q3UUV5 Snx16-201ENSMUST00000029047 2288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Skap1Q3UUV5 Enpp1-202ENSMUST00000105520 6777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Skap1Q3UUV5 Timm44-201ENSMUST00000003029 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Skap1Q3UUV5 Psen2-205ENSMUST00000111108 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Skap1Q3UUV5 Slc46a1-201ENSMUST00000001126 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Skap1Q3UUV5 Tmem254b-201ENSMUST00000022418 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Skap1Q3UUV5 Amacr-201ENSMUST00000070877 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Skap1Q3UUV5 Gm13615-201ENSMUST00000120242 1612 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
Skap1Q3UUV5 Lonp1-201ENSMUST00000047226 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Skap1Q3UUV5 Fezf1-201ENSMUST00000031709 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Skap1Q3UUV5 Adgrb2-204ENSMUST00000106015 4982 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Skap1Q3UUV5 Gm12536-201ENSMUST00000129102 358 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Skap1Q3UUV5 Gm28051-201ENSMUST00000179306 445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Skap1Q3UUV5 Olfr572-203ENSMUST00000215782 1233 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Skap1Q3UUV5 Cda-201ENSMUST00000030535 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Skap1Q3UUV5 Rpl36al-201ENSMUST00000054544 526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Skap1Q3UUV5 Birc2-201ENSMUST00000054878 378 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
Skap1Q3UUV5 Prima1-201ENSMUST00000074416 909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Skap1Q3UUV5 Gm10271-201ENSMUST00000092165 156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Skap1Q3UUV5 Syt12-201ENSMUST00000059295 3581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Skap1Q3UUV5 Hsd3b2-201ENSMUST00000107021 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Skap1Q3UUV5 Eda-203ENSMUST00000113776 5105 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Skap1Q3UUV5 Nectin3-202ENSMUST00000023335 9116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Skap1Q3UUV5 Zc3h14-203ENSMUST00000110104 3146 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Skap1Q3UUV5 Klhl33-201ENSMUST00000164415 1602 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Skap1Q3UUV5 Lhfpl4-201ENSMUST00000162280 4762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Skap1Q3UUV5 Btbd10-203ENSMUST00000119278 2394 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Skap1Q3UUV5 Antxr2-201ENSMUST00000031281 5656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Skap1Q3UUV5 Mir1668-201ENSMUST00000184114 107 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
Skap1Q3UUV5 Gm5712-201ENSMUST00000199748 1043 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
Skap1Q3UUV5 C530025M09Rik-201ENSMUST00000099264 690 ntAPPRIS P1 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Skap1Q3UUV5 Iqsec1-202ENSMUST00000101153 8036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Skap1Q3UUV5 Gm20517-202ENSMUST00000132397 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Skap1Q3UUV5 Ccdc17-201ENSMUST00000051869 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Skap1Q3UUV5 Magix-201ENSMUST00000115695 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Skap1Q3UUV5 Hes6-201ENSMUST00000086851 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Skap1Q3UUV5 Cldn4-201ENSMUST00000051401 1816 ntAPPRIS P1 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Skap1Q3UUV5 Phtf1-201ENSMUST00000055425 3060 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Skap1Q3UUV5 Ccnd3-202ENSMUST00000171031 2113 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Skap1Q3UUV5 Prss33-201ENSMUST00000059906 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Skap1Q3UUV5 Acd-201ENSMUST00000042608 3154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Skap1Q3UUV5 Ormdl3-201ENSMUST00000052919 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Skap1Q3UUV5 Nipsnap1-201ENSMUST00000038570 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Skap1Q3UUV5 Zmym3-206ENSMUST00000120107 5882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Skap1Q3UUV5 Pex11a-201ENSMUST00000032761 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Skap1Q3UUV5 Gm43509-201ENSMUST00000196551 2594 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
Skap1Q3UUV5 Mis18bp1-208ENSMUST00000222244 2053 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Skap1Q3UUV5 Bex3-202ENSMUST00000113112 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Skap1Q3UUV5 Echdc2-204ENSMUST00000116309 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Skap1Q3UUV5 Gm11755-201ENSMUST00000144096 891 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Skap1Q3UUV5 Ptgis-201ENSMUST00000018113 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Skap1Q3UUV5 Hist1h2bc-201ENSMUST00000018246 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Skap1Q3UUV5 Gm28914-201ENSMUST00000188115 667 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Skap1Q3UUV5 Gm28876-201ENSMUST00000188137 703 ntTSL 3 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Skap1Q3UUV5 1700041M19Rik-202ENSMUST00000190908 1123 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Skap1Q3UUV5 Gm43347-201ENSMUST00000200226 580 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
Skap1Q3UUV5 Mrpl14-201ENSMUST00000024734 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Skap1Q3UUV5 Cltb-201ENSMUST00000049575 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Skap1Q3UUV5 Hist1h2ba-201ENSMUST00000052776 384 ntAPPRIS P1 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Skap1Q3UUV5 Adnp2-201ENSMUST00000066743 5012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Skap1Q3UUV5 Fam126a-201ENSMUST00000030849 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Skap1Q3UUV5 Tmx1-201ENSMUST00000021471 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Skap1Q3UUV5 Cldn7-201ENSMUST00000018713 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Skap1Q3UUV5 Gm45412-201ENSMUST00000210217 2275 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
Skap1Q3UUV5 Nat8l-201ENSMUST00000056355 6529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Skap1Q3UUV5 Rbpms2-201ENSMUST00000055844 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Skap1Q3UUV5 Serac1-201ENSMUST00000024570 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Skap1Q3UUV5 Ube2d1-201ENSMUST00000020085 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Skap1Q3UUV5 Ran-201ENSMUST00000031383 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Skap1Q3UUV5 Prob1-201ENSMUST00000097619 3021 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
Skap1Q3UUV5 Ggnbp2-201ENSMUST00000018547 2478 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.5
Skap1Q3UUV5 Siglecf-201ENSMUST00000012798 2510 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Skap1Q3UUV5 Myo5b-201ENSMUST00000074157 6745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Skap1Q3UUV5 Zmiz1-201ENSMUST00000007961 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Skap1Q3UUV5 Dtnbp1-203ENSMUST00000220555 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Skap1Q3UUV5 C130026I21Rik-201ENSMUST00000064341 1561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Skap1Q3UUV5 Acbd6-201ENSMUST00000035560 5592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.5 ms