Protein–RNA interactions for Protein: Q3UTD9

Smim15, Small integral membrane protein 15, mousemouse

Predictions only

Length 74 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smim15Q3UTD9 Zscan2-201ENSMUST00000044115 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Smim15Q3UTD9 Phka1-201ENSMUST00000043596 5938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Smim15Q3UTD9 Gm10435-202ENSMUST00000162526 2878 ntTSL 5 BASIC12.66□□□□□ -0.38
Smim15Q3UTD9 Hapln2-201ENSMUST00000005014 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Smim15Q3UTD9 Tmem248-202ENSMUST00000111298 3570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Smim15Q3UTD9 Rpl27-202ENSMUST00000107249 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.66□□□□□ -0.38
Smim15Q3UTD9 Rfc5-202ENSMUST00000111953 772 ntTSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Smim15Q3UTD9 Otud4-203ENSMUST00000173286 7213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Smim15Q3UTD9 Bag1-204ENSMUST00000215842 1068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Smim15Q3UTD9 Nme4-201ENSMUST00000025007 912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Smim15Q3UTD9 Ctsf-201ENSMUST00000119694 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Smim15Q3UTD9 Pnpo-201ENSMUST00000018803 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Smim15Q3UTD9 Srsf10-204ENSMUST00000105853 3058 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Smim15Q3UTD9 Papd4-205ENSMUST00000225868 3081 ntAPPRIS ALT1 BASIC12.66□□□□□ -0.38
Smim15Q3UTD9 Rbpms-201ENSMUST00000033994 2375 ntTSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Smim15Q3UTD9 3110062M04Rik-202ENSMUST00000115006 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Smim15Q3UTD9 Patz1-205ENSMUST00000110043 3702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.66□□□□□ -0.38
Smim15Q3UTD9 Nfasc-201ENSMUST00000043189 5072 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Smim15Q3UTD9 Acsl3-201ENSMUST00000035779 3950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Smim15Q3UTD9 Tmem163-203ENSMUST00000160616 2657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.65□□□□□ -0.38
Smim15Q3UTD9 Evx1os-201ENSMUST00000125305 2916 ntTSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Smim15Q3UTD9 Ext1-201ENSMUST00000077273 7663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Smim15Q3UTD9 Grin2a-202ENSMUST00000115835 5023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.65□□□□□ -0.38
Smim15Q3UTD9 Btbd10-203ENSMUST00000119278 2394 ntTSL 5 BASIC12.65□□□□□ -0.38
Smim15Q3UTD9 P2ry1-203ENSMUST00000193943 2203 ntAPPRIS P1 BASIC12.65□□□□□ -0.38
Smim15Q3UTD9 Dnajb12-201ENSMUST00000020309 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Smim15Q3UTD9 Arhgef16-201ENSMUST00000030898 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Smim15Q3UTD9 Cadps2-204ENSMUST00000115356 3533 ntTSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Smim15Q3UTD9 Plekha1-203ENSMUST00000120441 3777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.65□□□□□ -0.38
Smim15Q3UTD9 Slc25a23-201ENSMUST00000040280 3362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Smim15Q3UTD9 Dcps-202ENSMUST00000119847 1445 ntTSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Smim15Q3UTD9 Med18-201ENSMUST00000102567 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Smim15Q3UTD9 Zbtb4-201ENSMUST00000108638 2552 ntTSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Smim15Q3UTD9 Mios-201ENSMUST00000040017 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Smim15Q3UTD9 Wdr1-201ENSMUST00000005234 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Smim15Q3UTD9 Gm2011-201ENSMUST00000203124 1263 ntBASIC12.65□□□□□ -0.38
Smim15Q3UTD9 4933406B15Rik-201ENSMUST00000220065 1182 ntTSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Smim15Q3UTD9 Hist2h2aa2-201ENSMUST00000074976 528 ntAPPRIS P1 BASIC12.65□□□□□ -0.38
Smim15Q3UTD9 Hist2h2aa1-201ENSMUST00000078756 586 ntAPPRIS P1 BASIC12.65□□□□□ -0.38
Smim15Q3UTD9 Cacna1g-209ENSMUST00000107791 8002 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.65□□□□□ -0.38
Smim15Q3UTD9 Yes1-205ENSMUST00000202543 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Smim15Q3UTD9 Synj2-210ENSMUST00000115791 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Smim15Q3UTD9 Ttc13-203ENSMUST00000118134 3277 ntTSL 5 BASIC12.65□□□□□ -0.38
Smim15Q3UTD9 Caml-201ENSMUST00000021963 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Smim15Q3UTD9 Tnn-201ENSMUST00000039178 5817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Smim15Q3UTD9 Gm16835-201ENSMUST00000140488 2809 ntTSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Smim15Q3UTD9 Scaf4-201ENSMUST00000039280 4165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Smim15Q3UTD9 Tbc1d1-201ENSMUST00000043893 6471 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.65□□□□□ -0.39
Smim15Q3UTD9 Fbxo3-201ENSMUST00000028603 4740 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Smim15Q3UTD9 AI593442-203ENSMUST00000213937 5674 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.64□□□□□ -0.39
Smim15Q3UTD9 Clk4-201ENSMUST00000093132 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Smim15Q3UTD9 Atp13a3-202ENSMUST00000100013 7310 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC12.64□□□□□ -0.39
Smim15Q3UTD9 Cacna1g-202ENSMUST00000100561 8125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Smim15Q3UTD9 3110082I17Rik-204ENSMUST00000198474 2030 ntTSL 2 BASIC12.64□□□□□ -0.39
Smim15Q3UTD9 Pacs2-201ENSMUST00000084891 5480 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.64□□□□□ -0.39
Smim15Q3UTD9 Antxr1-205ENSMUST00000205033 3160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Smim15Q3UTD9 Tuba3a-201ENSMUST00000088246 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Smim15Q3UTD9 4930535I16Rik-201ENSMUST00000181410 519 ntAPPRIS P1 BASIC12.64□□□□□ -0.39
Smim15Q3UTD9 Klf13-202ENSMUST00000183817 599 ntTSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Smim15Q3UTD9 A730056A06Rik-202ENSMUST00000206959 526 ntTSL 3 BASIC12.64□□□□□ -0.39
Smim15Q3UTD9 Prmt1-205ENSMUST00000207659 945 ntTSL 5 BASIC12.64□□□□□ -0.39
Smim15Q3UTD9 Arv1-201ENSMUST00000034463 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Smim15Q3UTD9 Gm1673-201ENSMUST00000094869 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Smim15Q3UTD9 Zfp783-201ENSMUST00000095946 670 ntBASIC12.64□□□□□ -0.39
Smim15Q3UTD9 Msi1-208ENSMUST00000150779 3133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Smim15Q3UTD9 Ube2r2-201ENSMUST00000040008 3600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Smim15Q3UTD9 Naa15-205ENSMUST00000193266 7480 ntTSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Smim15Q3UTD9 Dse-201ENSMUST00000048010 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Smim15Q3UTD9 Rnf128-201ENSMUST00000113026 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Smim15Q3UTD9 Lrch3-211ENSMUST00000170899 2752 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Smim15Q3UTD9 Hmga1-204ENSMUST00000118570 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Smim15Q3UTD9 Hoxd3-203ENSMUST00000111983 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Smim15Q3UTD9 Arhgef10l-203ENSMUST00000097820 4382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Smim15Q3UTD9 Itgb1-201ENSMUST00000090006 3815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Smim15Q3UTD9 Cnppd1-208ENSMUST00000190679 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Smim15Q3UTD9 Rnf123-201ENSMUST00000047746 4722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.63□□□□□ -0.39
Smim15Q3UTD9 Leprotl1-201ENSMUST00000033910 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Smim15Q3UTD9 1700081N11Rik-202ENSMUST00000221447 569 ntTSL 3 BASIC12.63□□□□□ -0.39
Smim15Q3UTD9 Lsm2-201ENSMUST00000007266 873 ntTSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Smim15Q3UTD9 Gpat3-203ENSMUST00000112887 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Smim15Q3UTD9 Zdhhc2-201ENSMUST00000049389 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Smim15Q3UTD9 Ssu72-201ENSMUST00000030905 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Smim15Q3UTD9 Usp35-202ENSMUST00000168435 3982 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.63□□□□□ -0.39
Smim15Q3UTD9 Syt6-201ENSMUST00000090697 4416 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.63□□□□□ -0.39
Smim15Q3UTD9 Larp4b-202ENSMUST00000188211 5610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Smim15Q3UTD9 Arf3-201ENSMUST00000053183 3579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Smim15Q3UTD9 Endov-202ENSMUST00000106244 5070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Smim15Q3UTD9 Rubie-203ENSMUST00000227803 2430 ntBASIC12.62□□□□□ -0.39
Smim15Q3UTD9 Polr3e-203ENSMUST00000207481 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Smim15Q3UTD9 Zfp212-201ENSMUST00000009411 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Smim15Q3UTD9 Fgfr2-215ENSMUST00000122054 3323 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Smim15Q3UTD9 Gnaz-201ENSMUST00000037813 3519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Smim15Q3UTD9 Trim2-203ENSMUST00000107691 7428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Smim15Q3UTD9 Pcdhga12-201ENSMUST00000044851 5080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Smim15Q3UTD9 Relt-201ENSMUST00000008462 2851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Smim15Q3UTD9 Ncf1-201ENSMUST00000016094 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Smim15Q3UTD9 Fcgrt-201ENSMUST00000003512 1770 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Smim15Q3UTD9 Eloa-201ENSMUST00000030427 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Smim15Q3UTD9 Klk9-201ENSMUST00000005891 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Smim15Q3UTD9 Tmem54-203ENSMUST00000106064 1066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.1 ms