Protein–RNA interactions for Protein: Q3USJ8

Fchsd2, F-BAR and double SH3 domains protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 740 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fchsd2Q3USJ8 AC114585.2-202ENSMUST00000228094 426 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
Fchsd2Q3USJ8 1700021F07Rik-201ENSMUST00000029023 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Fchsd2Q3USJ8 Letm1-203ENSMUST00000148451 2478 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Fchsd2Q3USJ8 Ctu1-201ENSMUST00000038332 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Fchsd2Q3USJ8 Nadk2-202ENSMUST00000100789 3578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Fchsd2Q3USJ8 Trim44-201ENSMUST00000102573 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Fchsd2Q3USJ8 Il11ra1-204ENSMUST00000108042 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Fchsd2Q3USJ8 Gm14317-201ENSMUST00000151754 1464 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Fchsd2Q3USJ8 Gm26526-201ENSMUST00000181075 2927 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Fchsd2Q3USJ8 Tuba1c-201ENSMUST00000058914 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Fchsd2Q3USJ8 Cd82-205ENSMUST00000116457 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Fchsd2Q3USJ8 Tbp-201ENSMUST00000014911 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Fchsd2Q3USJ8 Trip10-205ENSMUST00000224885 2136 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Fchsd2Q3USJ8 Glra1-202ENSMUST00000102716 2390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Fchsd2Q3USJ8 Rmnd1-201ENSMUST00000042251 3139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Fchsd2Q3USJ8 Lgals3-203ENSMUST00000146468 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Fchsd2Q3USJ8 Smarca5-ps-202ENSMUST00000171805 1284 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
Fchsd2Q3USJ8 2810030D12Rik-203ENSMUST00000190461 1039 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
Fchsd2Q3USJ8 Gm10576-201ENSMUST00000191927 825 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
Fchsd2Q3USJ8 Fahd2a-201ENSMUST00000028848 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Fchsd2Q3USJ8 Dcps-201ENSMUST00000034539 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Fchsd2Q3USJ8 Lce3b-201ENSMUST00000046234 562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Fchsd2Q3USJ8 Ndufv2-203ENSMUST00000143987 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Fchsd2Q3USJ8 Tmem267-205ENSMUST00000223912 1789 ntAPPRIS P1 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Fchsd2Q3USJ8 Tmtc1-202ENSMUST00000100772 8269 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Fchsd2Q3USJ8 Ece2-202ENSMUST00000122306 2495 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Fchsd2Q3USJ8 Ift74-202ENSMUST00000107104 1713 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Fchsd2Q3USJ8 Bean1-201ENSMUST00000093245 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Fchsd2Q3USJ8 St3gal2-201ENSMUST00000034197 4396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Fchsd2Q3USJ8 Lmo4-202ENSMUST00000121112 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Fchsd2Q3USJ8 Stox1-202ENSMUST00000133371 3510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Fchsd2Q3USJ8 Gm26580-201ENSMUST00000181002 2095 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Fchsd2Q3USJ8 Fkbp14-202ENSMUST00000117375 1830 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Fchsd2Q3USJ8 Tpm1-215ENSMUST00000113705 1759 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Fchsd2Q3USJ8 Nrl-202ENSMUST00000111404 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Fchsd2Q3USJ8 Nisch-208ENSMUST00000165981 2415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Fchsd2Q3USJ8 Sf1-202ENSMUST00000113487 2649 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Fchsd2Q3USJ8 Gm12216-201ENSMUST00000117316 1152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Fchsd2Q3USJ8 Gm11779-201ENSMUST00000118541 368 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
Fchsd2Q3USJ8 AC108846.1-201ENSMUST00000214531 513 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
Fchsd2Q3USJ8 Gm6296-201ENSMUST00000222599 943 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
Fchsd2Q3USJ8 1110038F14Rik-201ENSMUST00000071792 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Fchsd2Q3USJ8 Slbp-202ENSMUST00000075670 1027 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Fchsd2Q3USJ8 Abcd4-201ENSMUST00000021666 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Fchsd2Q3USJ8 Ankrd61-202ENSMUST00000110717 1498 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Fchsd2Q3USJ8 Pld2-203ENSMUST00000108557 3655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Fchsd2Q3USJ8 Sntg2-201ENSMUST00000021004 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Fchsd2Q3USJ8 Aptx-203ENSMUST00000108103 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Fchsd2Q3USJ8 Pisd-201ENSMUST00000061895 2183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Fchsd2Q3USJ8 Fbxl21-201ENSMUST00000045428 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Fchsd2Q3USJ8 Dtd1-201ENSMUST00000028917 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Fchsd2Q3USJ8 Dlg1-202ENSMUST00000064477 4663 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Fchsd2Q3USJ8 Chaf1b-201ENSMUST00000023666 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Fchsd2Q3USJ8 Sh2b1-203ENSMUST00000205440 3089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Fchsd2Q3USJ8 Gm19439-201ENSMUST00000198195 2273 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
Fchsd2Q3USJ8 Zxdc-203ENSMUST00000113539 4864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Fchsd2Q3USJ8 Gnb3-201ENSMUST00000024206 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Fchsd2Q3USJ8 Gm11729-201ENSMUST00000124901 713 ntTSL 3 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Fchsd2Q3USJ8 Ccl27a-217ENSMUST00000155240 343 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Fchsd2Q3USJ8 Pla2g12b-201ENSMUST00000009790 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Fchsd2Q3USJ8 Spata6-201ENSMUST00000038868 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Fchsd2Q3USJ8 Kank3-201ENSMUST00000048560 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Fchsd2Q3USJ8 Trim31-201ENSMUST00000078438 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Fchsd2Q3USJ8 AC131586.3-201ENSMUST00000228355 1367 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
Fchsd2Q3USJ8 Pgc-201ENSMUST00000024782 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Fchsd2Q3USJ8 Pofut1-203ENSMUST00000099192 1385 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Fchsd2Q3USJ8 Rab11fip3-202ENSMUST00000120691 5103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Fchsd2Q3USJ8 Shd-201ENSMUST00000044216 1546 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Fchsd2Q3USJ8 Gm13446-201ENSMUST00000124555 2033 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Fchsd2Q3USJ8 Fam221a-202ENSMUST00000121903 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Fchsd2Q3USJ8 Mprip-201ENSMUST00000066330 7765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Fchsd2Q3USJ8 Camsap3-206ENSMUST00000207533 2584 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Fchsd2Q3USJ8 Nrn1l-202ENSMUST00000118920 603 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Fchsd2Q3USJ8 Gm29246-201ENSMUST00000189221 349 ntTSL 3 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Fchsd2Q3USJ8 Tm4sf5-201ENSMUST00000019063 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Fchsd2Q3USJ8 Vsig2-201ENSMUST00000002008 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Fchsd2Q3USJ8 Snrpf-201ENSMUST00000020203 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Fchsd2Q3USJ8 CT943659.1-201ENSMUST00000215459 326 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
Fchsd2Q3USJ8 Sart1-201ENSMUST00000044207 5091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Fchsd2Q3USJ8 Slc16a3-202ENSMUST00000100130 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Fchsd2Q3USJ8 P2rx5-201ENSMUST00000006104 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Fchsd2Q3USJ8 Rab7-203ENSMUST00000113597 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Fchsd2Q3USJ8 Atg7-215ENSMUST00000183165 2012 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Fchsd2Q3USJ8 Pigz-201ENSMUST00000052174 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Fchsd2Q3USJ8 Tspan5-201ENSMUST00000029800 6653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Fchsd2Q3USJ8 D10Jhu81e-201ENSMUST00000001242 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Fchsd2Q3USJ8 Ovol2-202ENSMUST00000103171 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Fchsd2Q3USJ8 Slc39a10-201ENSMUST00000027131 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Fchsd2Q3USJ8 Appl2-201ENSMUST00000020500 3020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Fchsd2Q3USJ8 Glrx2-210ENSMUST00000185362 3337 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Fchsd2Q3USJ8 Col15a1-201ENSMUST00000082303 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Fchsd2Q3USJ8 Myrip-201ENSMUST00000048121 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Fchsd2Q3USJ8 Sema6c-214ENSMUST00000202315 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Fchsd2Q3USJ8 Dcdc2c-206ENSMUST00000221349 2209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Fchsd2Q3USJ8 Slc30a9-204ENSMUST00000162372 5711 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Fchsd2Q3USJ8 Slc47a1-201ENSMUST00000010267 2639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Fchsd2Q3USJ8 Klhl33-202ENSMUST00000170855 1422 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Fchsd2Q3USJ8 Selenoh-201ENSMUST00000102646 783 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Fchsd2Q3USJ8 Dguok-202ENSMUST00000113888 1007 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Fchsd2Q3USJ8 Dguok-201ENSMUST00000014698 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.8 ms