Protein–RNA interactions for Protein: Q3US17

Znf48, Zinc finger protein 48, mousemouse

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Length 591 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Znf48Q3US17 Sap18-203ENSMUST00000111269 459 ntTSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Znf48Q3US17 Mrps12-204ENSMUST00000171183 883 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Znf48Q3US17 H2afz-207ENSMUST00000174561 810 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Znf48Q3US17 Pagr1a-203ENSMUST00000206416 558 ntTSL 3 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Znf48Q3US17 Cox17-201ENSMUST00000050273 444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Znf48Q3US17 Ttpal-202ENSMUST00000109408 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Znf48Q3US17 3110043O21Rik-203ENSMUST00000108127 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Znf48Q3US17 Mef2d-202ENSMUST00000107558 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Znf48Q3US17 Slc5a10-203ENSMUST00000148584 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Znf48Q3US17 Naa50-204ENSMUST00000161326 4487 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Znf48Q3US17 Atxn7l2-202ENSMUST00000117409 2321 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Znf48Q3US17 A130014A01Rik-201ENSMUST00000183021 2323 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
Znf48Q3US17 Arhgef12-202ENSMUST00000165665 10752 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Znf48Q3US17 Nptn-212ENSMUST00000177292 1390 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Znf48Q3US17 Ano8-201ENSMUST00000093450 3653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Znf48Q3US17 Mib1-201ENSMUST00000052838 10231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Znf48Q3US17 Aig1-201ENSMUST00000019942 1439 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Znf48Q3US17 Cspg5-201ENSMUST00000035058 3870 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Znf48Q3US17 Fbxl12os-202ENSMUST00000136376 2349 ntTSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Znf48Q3US17 Cd5-201ENSMUST00000025571 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Znf48Q3US17 Pkp2-202ENSMUST00000161342 2931 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Znf48Q3US17 Ppp1r2-202ENSMUST00000115233 958 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Znf48Q3US17 Rab3d-202ENSMUST00000119055 694 ntTSL 3 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Znf48Q3US17 Gm13025-201ENSMUST00000141469 1163 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Znf48Q3US17 Gm45609-206ENSMUST00000210176 1023 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Znf48Q3US17 Ndufb8-201ENSMUST00000026222 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Znf48Q3US17 Lce1a2-201ENSMUST00000029530 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Znf48Q3US17 Rb1cc1-201ENSMUST00000027040 7607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Znf48Q3US17 Eif4g1-201ENSMUST00000044783 5444 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Znf48Q3US17 Nat8f3-202ENSMUST00000168531 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Znf48Q3US17 Serbp1-203ENSMUST00000203077 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Znf48Q3US17 Hand1-201ENSMUST00000036917 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Znf48Q3US17 Fiz1-201ENSMUST00000077385 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Znf48Q3US17 Nipal2-201ENSMUST00000040791 4331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Znf48Q3US17 Usp21-202ENSMUST00000111305 2278 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Znf48Q3US17 Rpf1-203ENSMUST00000199079 1978 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Znf48Q3US17 Gata5os-201ENSMUST00000069943 1678 ntTSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Znf48Q3US17 Slc47a1-201ENSMUST00000010267 2639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Znf48Q3US17 Dnajb5-201ENSMUST00000037872 3291 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Znf48Q3US17 Zbtb7c-201ENSMUST00000058997 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Znf48Q3US17 Ube2d1-201ENSMUST00000020085 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Znf48Q3US17 Il6st-206ENSMUST00000183886 3004 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Znf48Q3US17 Gbp5-201ENSMUST00000090127 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Znf48Q3US17 Fbxo31-201ENSMUST00000059018 4358 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Znf48Q3US17 Anapc7-201ENSMUST00000031422 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Znf48Q3US17 Ets1-206ENSMUST00000184887 2107 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Znf48Q3US17 Slc25a31-201ENSMUST00000091184 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Znf48Q3US17 Mllt10-204ENSMUST00000114680 3543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Znf48Q3US17 Plekhf1-201ENSMUST00000098513 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Znf48Q3US17 Odf2-211ENSMUST00000113767 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Znf48Q3US17 Pacsin2-203ENSMUST00000171436 3693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Znf48Q3US17 Nubpl-201ENSMUST00000040090 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Znf48Q3US17 Tmem5-205ENSMUST00000140299 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Znf48Q3US17 Cacng6-202ENSMUST00000183200 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Znf48Q3US17 Nr1h2-201ENSMUST00000073488 1999 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Znf48Q3US17 Fam184a-201ENSMUST00000020003 4164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Znf48Q3US17 Gm3331-201ENSMUST00000183423 1017 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Znf48Q3US17 Gm28914-201ENSMUST00000188115 667 ntTSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Znf48Q3US17 Rpl19-ps10-201ENSMUST00000205555 330 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
Znf48Q3US17 Gm7791-201ENSMUST00000219066 539 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
Znf48Q3US17 Tomm22-201ENSMUST00000023062 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Znf48Q3US17 Nudt1-201ENSMUST00000050205 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Znf48Q3US17 Lsm10-201ENSMUST00000055575 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Znf48Q3US17 Gm5867-201ENSMUST00000063197 592 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
Znf48Q3US17 Nudt1-202ENSMUST00000071881 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Znf48Q3US17 Taar2-201ENSMUST00000079134 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Znf48Q3US17 Msl1-201ENSMUST00000037915 4593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Znf48Q3US17 Acadvl-201ENSMUST00000018718 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Znf48Q3US17 Adss-201ENSMUST00000016105 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Znf48Q3US17 Hps5-202ENSMUST00000107653 4702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Znf48Q3US17 Chpf-201ENSMUST00000079205 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Znf48Q3US17 4930448E22Rik-202ENSMUST00000215242 2102 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Znf48Q3US17 Agbl3-205ENSMUST00000115017 3719 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Znf48Q3US17 Cpsf4-207ENSMUST00000162244 1387 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Znf48Q3US17 Fdps-203ENSMUST00000196709 1382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Znf48Q3US17 Gm10516-201ENSMUST00000180598 2615 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Znf48Q3US17 Ppard-201ENSMUST00000002320 3218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Znf48Q3US17 Wnt1-201ENSMUST00000023734 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Znf48Q3US17 St7l-202ENSMUST00000106769 2428 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Znf48Q3US17 Gm16863-201ENSMUST00000181476 2431 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Znf48Q3US17 Taf10-203ENSMUST00000141116 4281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Znf48Q3US17 4930448E22Rik-201ENSMUST00000181712 1581 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Znf48Q3US17 Nid1-201ENSMUST00000005532 6091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Znf48Q3US17 E230001N04Rik-202ENSMUST00000181029 2091 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
Znf48Q3US17 Rab33b-201ENSMUST00000054387 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Znf48Q3US17 Mff-208ENSMUST00000160786 1645 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Znf48Q3US17 Mtx1-201ENSMUST00000073572 1617 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Znf48Q3US17 Vangl2-202ENSMUST00000111263 6528 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Znf48Q3US17 Osbpl1a-208ENSMUST00000121888 2674 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Znf48Q3US17 Hnrnph3-201ENSMUST00000020263 2213 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Znf48Q3US17 Gbe1-206ENSMUST00000170464 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Znf48Q3US17 Gm7638-201ENSMUST00000121348 967 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
Znf48Q3US17 Cenps-207ENSMUST00000177408 689 ntTSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Znf48Q3US17 Gm44711-201ENSMUST00000205414 1264 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
Znf48Q3US17 Flt3l-206ENSMUST00000210197 834 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Znf48Q3US17 Gm7370-201ENSMUST00000219471 767 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
Znf48Q3US17 Snhg10-202ENSMUST00000222812 527 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Znf48Q3US17 Mzt1-203ENSMUST00000227948 952 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
Znf48Q3US17 S100a16-202ENSMUST00000098911 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Znf48Q3US17 Bag4-201ENSMUST00000038498 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
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