Protein–RNA interactions for Protein: Q3UPE3

Rmi2, RecQ-mediated genome instability protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 149 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rmi2Q3UPE3 Dmxl1-202ENSMUST00000180611 11319 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Rmi2Q3UPE3 Tuba8-201ENSMUST00000032233 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Rmi2Q3UPE3 Nap1l4-201ENSMUST00000072727 2285 ntTSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Rmi2Q3UPE3 Tnfrsf25-201ENSMUST00000025706 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Rmi2Q3UPE3 Thop1-201ENSMUST00000005057 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Rmi2Q3UPE3 Rad54l2-201ENSMUST00000046502 9305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Rmi2Q3UPE3 Fam8a1-201ENSMUST00000099547 3664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Rmi2Q3UPE3 Fhl1-201ENSMUST00000023854 2356 ntTSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Rmi2Q3UPE3 Klhdc4-201ENSMUST00000045884 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Rmi2Q3UPE3 St7l-211ENSMUST00000200132 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Rmi2Q3UPE3 Ube2d3-208ENSMUST00000197134 2493 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.38□□□□□ -0.59
Rmi2Q3UPE3 Kcnn1-207ENSMUST00000212509 1608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.38□□□□□ -0.59
Rmi2Q3UPE3 Snip1-201ENSMUST00000052183 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Rmi2Q3UPE3 Cdc27-202ENSMUST00000106961 1863 ntTSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Rmi2Q3UPE3 Pmpca-201ENSMUST00000076431 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Rmi2Q3UPE3 Hs3st3b1-201ENSMUST00000094103 4911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Rmi2Q3UPE3 Chst10-201ENSMUST00000027249 2975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Rmi2Q3UPE3 Tulp1-202ENSMUST00000114794 1738 ntTSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Rmi2Q3UPE3 Elmsan1-202ENSMUST00000110294 7156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.38□□□□□ -0.59
Rmi2Q3UPE3 Tgfbr3-201ENSMUST00000031224 6087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Rmi2Q3UPE3 Dlat-201ENSMUST00000034567 4035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Rmi2Q3UPE3 Nr1h2-203ENSMUST00000107911 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Rmi2Q3UPE3 B3gnt5-202ENSMUST00000119468 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Rmi2Q3UPE3 Gm2399-201ENSMUST00000104944 225 ntBASIC11.38□□□□□ -0.59
Rmi2Q3UPE3 2700033N17Rik-201ENSMUST00000140185 721 ntTSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Rmi2Q3UPE3 Gm12063-201ENSMUST00000148087 715 ntTSL 2 BASIC11.38□□□□□ -0.59
Rmi2Q3UPE3 Mpig6b-202ENSMUST00000174190 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Rmi2Q3UPE3 Rpl18a-206ENSMUST00000212709 700 ntTSL 2 BASIC11.38□□□□□ -0.59
Rmi2Q3UPE3 Col7a1-201ENSMUST00000026740 9198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Rmi2Q3UPE3 Fam208b-201ENSMUST00000096069 8338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Rmi2Q3UPE3 Phax-201ENSMUST00000008445 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Rmi2Q3UPE3 Aldh2-202ENSMUST00000129753 1799 ntTSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Rmi2Q3UPE3 Poli-203ENSMUST00000159389 2662 ntTSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Rmi2Q3UPE3 Wdr45-201ENSMUST00000043045 1609 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Rmi2Q3UPE3 Adam11-201ENSMUST00000068150 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Rmi2Q3UPE3 Cstf2-203ENSMUST00000113287 3661 ntTSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Rmi2Q3UPE3 Fars2-201ENSMUST00000021857 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Rmi2Q3UPE3 2610301B20Rik-201ENSMUST00000080517 2116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Rmi2Q3UPE3 Klf7-201ENSMUST00000055001 1477 ntTSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Rmi2Q3UPE3 Rgs3-201ENSMUST00000065870 4698 ntTSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Rmi2Q3UPE3 Akp-ps1-202ENSMUST00000212812 1959 ntTSL 5 BASIC11.37□□□□□ -0.59
Rmi2Q3UPE3 Krt6b-201ENSMUST00000023786 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Rmi2Q3UPE3 Eif4g1-206ENSMUST00000115463 5378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Rmi2Q3UPE3 Myh14-202ENSMUST00000107899 6390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Rmi2Q3UPE3 Rnf152-201ENSMUST00000058688 8492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Rmi2Q3UPE3 Rnf217-201ENSMUST00000081989 11013 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.37□□□□□ -0.59
Rmi2Q3UPE3 Mesp2-201ENSMUST00000107394 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Rmi2Q3UPE3 Gm8189-202ENSMUST00000211035 2039 ntTSL 5 BASIC11.37□□□□□ -0.59
Rmi2Q3UPE3 Ccdc17-201ENSMUST00000051869 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Rmi2Q3UPE3 Pde6d-203ENSMUST00000146220 879 ntTSL 2 BASIC11.37□□□□□ -0.59
Rmi2Q3UPE3 Psmg4-202ENSMUST00000147632 555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Rmi2Q3UPE3 A4galt-202ENSMUST00000164614 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Rmi2Q3UPE3 Gm42778-201ENSMUST00000199644 553 ntBASIC11.37□□□□□ -0.59
Rmi2Q3UPE3 Gamt-201ENSMUST00000020359 979 ntTSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Rmi2Q3UPE3 Bax-205ENSMUST00000211365 801 ntTSL 3 BASIC11.37□□□□□ -0.59
Rmi2Q3UPE3 a-201ENSMUST00000029123 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Rmi2Q3UPE3 H2-Ab1-201ENSMUST00000040828 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Rmi2Q3UPE3 Zfp783-201ENSMUST00000095946 670 ntBASIC11.37□□□□□ -0.59
Rmi2Q3UPE3 Sh2d4a-201ENSMUST00000066594 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Rmi2Q3UPE3 Rnf170-209ENSMUST00000209300 1881 ntTSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Rmi2Q3UPE3 Kcnj6-202ENSMUST00000099508 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Rmi2Q3UPE3 Mindy4-203ENSMUST00000204842 2211 ntTSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Rmi2Q3UPE3 Ruvbl2-205ENSMUST00000211214 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Rmi2Q3UPE3 Kdm3a-201ENSMUST00000065509 4816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Rmi2Q3UPE3 Foxl2-201ENSMUST00000051312 3256 ntAPPRIS P1 BASIC11.37□□□□□ -0.59
Rmi2Q3UPE3 Wdr13-202ENSMUST00000115623 1749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.37□□□□□ -0.59
Rmi2Q3UPE3 Lat2-202ENSMUST00000077636 1717 ntTSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Rmi2Q3UPE3 9430015G10Rik-208ENSMUST00000169550 2660 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.37□□□□□ -0.59
Rmi2Q3UPE3 Scamp3-201ENSMUST00000029684 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Rmi2Q3UPE3 Itga8-201ENSMUST00000028106 5812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Rmi2Q3UPE3 Disc1-206ENSMUST00000118942 2860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Rmi2Q3UPE3 Nacc2-201ENSMUST00000028300 6378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Rmi2Q3UPE3 Atp5b-201ENSMUST00000026459 1916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Rmi2Q3UPE3 Rrp9-201ENSMUST00000047721 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Rmi2Q3UPE3 Clvs2-201ENSMUST00000019920 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Rmi2Q3UPE3 Rflna-201ENSMUST00000036109 1681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Rmi2Q3UPE3 Sema6d-208ENSMUST00000103241 6157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Rmi2Q3UPE3 Wnk1-223ENSMUST00000177761 11303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Rmi2Q3UPE3 Farsa-202ENSMUST00000109754 1795 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Rmi2Q3UPE3 Col13a1-203ENSMUST00000105452 3037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Rmi2Q3UPE3 Bnip2-202ENSMUST00000085393 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Rmi2Q3UPE3 A830018L16Rik-201ENSMUST00000048613 2779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Rmi2Q3UPE3 Snapc2-201ENSMUST00000011981 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Rmi2Q3UPE3 Pick1-202ENSMUST00000053926 2415 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Rmi2Q3UPE3 Ankrd33b-204ENSMUST00000123325 7466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Rmi2Q3UPE3 Erlec1-201ENSMUST00000073192 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Rmi2Q3UPE3 Acadvl-202ENSMUST00000102574 2168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Rmi2Q3UPE3 Taok3-202ENSMUST00000111975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Rmi2Q3UPE3 Ilk-212ENSMUST00000163389 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Rmi2Q3UPE3 Gm13074-201ENSMUST00000124848 2735 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Rmi2Q3UPE3 Loxl4-205ENSMUST00000171432 2274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Rmi2Q3UPE3 Pfdn4-204ENSMUST00000109148 736 ntTSL 3 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Rmi2Q3UPE3 Tomm6-202ENSMUST00000113302 749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Rmi2Q3UPE3 Gm3331-201ENSMUST00000183423 1017 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Rmi2Q3UPE3 Kiss1-204ENSMUST00000194044 583 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Rmi2Q3UPE3 Gm39115-201ENSMUST00000211350 699 ntAPPRIS P1 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Rmi2Q3UPE3 Gdf15-202ENSMUST00000110103 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Rmi2Q3UPE3 AC154412.1-201ENSMUST00000226540 2786 ntBASIC11.36□□□□□ -0.59
Rmi2Q3UPE3 Trmo-202ENSMUST00000086563 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Rmi2Q3UPE3 Rbfox3-205ENSMUST00000117731 3084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
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