Protein–RNA interactions for Protein: Q3UP44

Nhlrc4, NHL-repeat-containing protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 136 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nhlrc4Q3UP44 Arhgap21-201ENSMUST00000114594 7351 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Nhlrc4Q3UP44 Rasip1-201ENSMUST00000057927 3202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Nhlrc4Q3UP44 Kat2a-202ENSMUST00000103118 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Nhlrc4Q3UP44 Crtac1-201ENSMUST00000048630 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Nhlrc4Q3UP44 Pick1-202ENSMUST00000053926 2415 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Nhlrc4Q3UP44 Homer2-206ENSMUST00000207983 1634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Nhlrc4Q3UP44 Slc15a3-201ENSMUST00000025646 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Nhlrc4Q3UP44 Slc38a10-203ENSMUST00000076697 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Nhlrc4Q3UP44 Shh-201ENSMUST00000002708 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Nhlrc4Q3UP44 Tmsb10-202ENSMUST00000114049 690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Nhlrc4Q3UP44 Gm14464-201ENSMUST00000119658 1254 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Nhlrc4Q3UP44 U2af1-201ENSMUST00000014684 907 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Nhlrc4Q3UP44 U2af1-202ENSMUST00000166526 907 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Nhlrc4Q3UP44 F420014N23Rik-202ENSMUST00000219079 659 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Nhlrc4Q3UP44 Inmt-201ENSMUST00000003569 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Nhlrc4Q3UP44 Map6-207ENSMUST00000208924 2906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Nhlrc4Q3UP44 Mir22hg-202ENSMUST00000149940 1752 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Nhlrc4Q3UP44 Hivep3-201ENSMUST00000084306 2973 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Nhlrc4Q3UP44 Trim37-201ENSMUST00000041282 5632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Nhlrc4Q3UP44 Sphk1-202ENSMUST00000063446 2527 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Nhlrc4Q3UP44 Klf9-201ENSMUST00000036884 3263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Nhlrc4Q3UP44 Ntn1-201ENSMUST00000021284 5738 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Nhlrc4Q3UP44 Klhdc4-201ENSMUST00000045884 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Nhlrc4Q3UP44 Simc1-201ENSMUST00000118072 2116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Nhlrc4Q3UP44 Tmem151b-201ENSMUST00000180252 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Nhlrc4Q3UP44 Snx9-201ENSMUST00000002436 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Nhlrc4Q3UP44 Fgf17-201ENSMUST00000022697 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Nhlrc4Q3UP44 Sh3glb1-205ENSMUST00000199854 1416 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Nhlrc4Q3UP44 4933428G20Rik-201ENSMUST00000056955 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Nhlrc4Q3UP44 Zc3hav1l-201ENSMUST00000058524 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Nhlrc4Q3UP44 4932702P03Rik-201ENSMUST00000138447 1482 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Nhlrc4Q3UP44 E230025N22Rik-201ENSMUST00000115682 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Nhlrc4Q3UP44 Slc5a10-203ENSMUST00000148584 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Nhlrc4Q3UP44 Ptpn5-201ENSMUST00000033142 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Nhlrc4Q3UP44 Kcnq2-204ENSMUST00000103047 2899 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Nhlrc4Q3UP44 Kank3-202ENSMUST00000172649 2652 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Nhlrc4Q3UP44 Apba1-201ENSMUST00000025830 6632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Nhlrc4Q3UP44 Gm16075-201ENSMUST00000135873 361 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Nhlrc4Q3UP44 Tppp3-201ENSMUST00000014990 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Nhlrc4Q3UP44 Gm42477-201ENSMUST00000202427 469 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Nhlrc4Q3UP44 1810010D01Rik-204ENSMUST00000208788 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Nhlrc4Q3UP44 Fam83f-201ENSMUST00000023044 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Nhlrc4Q3UP44 Pdk3-201ENSMUST00000045748 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Nhlrc4Q3UP44 Dmap1-201ENSMUST00000102687 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Nhlrc4Q3UP44 Gm26917-202ENSMUST00000192833 3329 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Nhlrc4Q3UP44 Agtr1a-201ENSMUST00000066412 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Nhlrc4Q3UP44 Tprn-201ENSMUST00000114336 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Nhlrc4Q3UP44 Cfap20-208ENSMUST00000213086 2544 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Nhlrc4Q3UP44 Rab27b-202ENSMUST00000117692 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Nhlrc4Q3UP44 Slc25a39-201ENSMUST00000018821 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Nhlrc4Q3UP44 Eva1c-201ENSMUST00000037539 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Nhlrc4Q3UP44 Gm9954-202ENSMUST00000198686 4725 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Nhlrc4Q3UP44 Seh1l-201ENSMUST00000025421 3516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Nhlrc4Q3UP44 Zranb2-203ENSMUST00000106058 2924 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Nhlrc4Q3UP44 Cidec-202ENSMUST00000113089 1720 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Nhlrc4Q3UP44 Klhl33-202ENSMUST00000170855 1422 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Nhlrc4Q3UP44 Ifrd2-201ENSMUST00000010192 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Nhlrc4Q3UP44 Mta1-203ENSMUST00000109723 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
Nhlrc4Q3UP44 Mta1-204ENSMUST00000109726 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Nhlrc4Q3UP44 Mta1-205ENSMUST00000109727 2789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Nhlrc4Q3UP44 Lcorl-202ENSMUST00000045586 5708 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Nhlrc4Q3UP44 Gm13285-201ENSMUST00000179725 1462 ntAPPRIS P1 BASIC15.08■□□□□ 0.01
Nhlrc4Q3UP44 Ikbke-204ENSMUST00000161764 2867 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Nhlrc4Q3UP44 Rab11b-203ENSMUST00000173860 1544 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Nhlrc4Q3UP44 Fam76a-202ENSMUST00000097856 1863 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Nhlrc4Q3UP44 Hnrnpll-205ENSMUST00000184635 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Nhlrc4Q3UP44 Gm15794-201ENSMUST00000120182 631 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Nhlrc4Q3UP44 Srgn-205ENSMUST00000162161 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
Nhlrc4Q3UP44 Mrps12-204ENSMUST00000171183 883 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
Nhlrc4Q3UP44 Stx3-208ENSMUST00000211641 1018 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Nhlrc4Q3UP44 AC125350.1-201ENSMUST00000225115 903 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Nhlrc4Q3UP44 Tesc-201ENSMUST00000031304 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Nhlrc4Q3UP44 Insl3-201ENSMUST00000034261 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Nhlrc4Q3UP44 Dcps-201ENSMUST00000034539 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Nhlrc4Q3UP44 4930465K10Rik-201ENSMUST00000056675 1238 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Nhlrc4Q3UP44 Degs1-201ENSMUST00000035295 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Nhlrc4Q3UP44 Uso1-201ENSMUST00000031355 3898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Nhlrc4Q3UP44 Mal-202ENSMUST00000028854 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Nhlrc4Q3UP44 Nadk-203ENSMUST00000105613 3152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Nhlrc4Q3UP44 Wscd1-203ENSMUST00000108511 2866 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Nhlrc4Q3UP44 Ppt2-205ENSMUST00000169067 1392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Nhlrc4Q3UP44 AC115863.1-201ENSMUST00000214815 1813 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Nhlrc4Q3UP44 Lmo4-202ENSMUST00000121112 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Nhlrc4Q3UP44 Sphk1-206ENSMUST00000106388 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Nhlrc4Q3UP44 Gm13283-201ENSMUST00000191112 1463 ntAPPRIS P1 BASIC15.08■□□□□ 0
Nhlrc4Q3UP44 Tfap2b-202ENSMUST00000064976 1946 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Nhlrc4Q3UP44 Trim8-201ENSMUST00000026008 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Nhlrc4Q3UP44 Gm26752-201ENSMUST00000181086 1537 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Nhlrc4Q3UP44 Chrd-202ENSMUST00000115423 2417 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
Nhlrc4Q3UP44 Syt3-202ENSMUST00000118962 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Nhlrc4Q3UP44 Guf1-202ENSMUST00000087228 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Nhlrc4Q3UP44 Wscd1-202ENSMUST00000108510 2956 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Nhlrc4Q3UP44 Mff-212ENSMUST00000162003 2087 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Nhlrc4Q3UP44 Ush1c-208ENSMUST00000177212 1696 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Nhlrc4Q3UP44 Poli-203ENSMUST00000159389 2662 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Nhlrc4Q3UP44 Foxp4-203ENSMUST00000113263 3156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Nhlrc4Q3UP44 Gss-203ENSMUST00000130881 1724 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Nhlrc4Q3UP44 Mfsd10-203ENSMUST00000114331 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Nhlrc4Q3UP44 0610009B22Rik-202ENSMUST00000109098 892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
Nhlrc4Q3UP44 Apopt1-204ENSMUST00000163220 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.2 ms