Protein–RNA interactions for Protein: Q3UND0

Skap2, Src kinase-associated phosphoprotein 2, mousemouse

Predictions only

Length 358 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Skap2Q3UND0 AC158538.1-201ENSMUST00000225870 294 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
Skap2Q3UND0 Col13a1-205ENSMUST00000105454 3162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Skap2Q3UND0 Tbrg4-212ENSMUST00000189268 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Skap2Q3UND0 Dlgap3-202ENSMUST00000106092 2901 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Skap2Q3UND0 Gpr180-201ENSMUST00000022728 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Skap2Q3UND0 Stxbp6-201ENSMUST00000053768 4553 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Skap2Q3UND0 Zkscan6-202ENSMUST00000071465 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Skap2Q3UND0 Tnfsf13-201ENSMUST00000018896 1407 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Skap2Q3UND0 Tnfrsf25-202ENSMUST00000035275 1603 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Skap2Q3UND0 Nhs-201ENSMUST00000081569 4881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Skap2Q3UND0 L3hypdh-201ENSMUST00000019862 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Skap2Q3UND0 Papd4-201ENSMUST00000048702 2990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Skap2Q3UND0 Fhl1-201ENSMUST00000023854 2356 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Skap2Q3UND0 Dnajc2-204ENSMUST00000115195 1994 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Skap2Q3UND0 Aig1-205ENSMUST00000162610 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Skap2Q3UND0 Lrrc73-201ENSMUST00000095262 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Skap2Q3UND0 Npas3-201ENSMUST00000101432 5879 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Skap2Q3UND0 Mau2-204ENSMUST00000212308 2887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Skap2Q3UND0 1700066M21Rik-201ENSMUST00000042734 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Skap2Q3UND0 Arhgef11-201ENSMUST00000039476 6776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Skap2Q3UND0 Rabep1-201ENSMUST00000076270 5408 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Skap2Q3UND0 Tmem175-204ENSMUST00000146207 1686 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Skap2Q3UND0 Rhpn2-201ENSMUST00000032705 3508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Skap2Q3UND0 Sucla2-203ENSMUST00000160507 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Skap2Q3UND0 Bmp8b-201ENSMUST00000002457 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Skap2Q3UND0 Fbxo31-201ENSMUST00000059018 4358 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Skap2Q3UND0 Gm11527-201ENSMUST00000153795 596 ntTSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Skap2Q3UND0 Rsu1-209ENSMUST00000191959 720 ntTSL 3 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Skap2Q3UND0 Tpgs1-201ENSMUST00000020552 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Skap2Q3UND0 Cox8a-201ENSMUST00000039758 545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Skap2Q3UND0 Rbfox3-205ENSMUST00000117731 3084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Skap2Q3UND0 Syn1-201ENSMUST00000081893 3209 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Skap2Q3UND0 Tra2a-204ENSMUST00000204189 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Skap2Q3UND0 Prss53-201ENSMUST00000121394 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Skap2Q3UND0 St7l-211ENSMUST00000200132 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Skap2Q3UND0 Atp2b2-201ENSMUST00000089003 7067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Skap2Q3UND0 Washc1-202ENSMUST00000116556 2887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Skap2Q3UND0 Crem-203ENSMUST00000082141 2820 ntTSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Skap2Q3UND0 Mboat4-201ENSMUST00000095345 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Skap2Q3UND0 Gprin1-201ENSMUST00000099506 4141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Skap2Q3UND0 Psmd12-203ENSMUST00000106752 1955 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Skap2Q3UND0 Stx18-201ENSMUST00000031008 1471 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Skap2Q3UND0 Strn-203ENSMUST00000145910 8629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Skap2Q3UND0 Klhl33-201ENSMUST00000164415 1602 ntTSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Skap2Q3UND0 Kcnn1-207ENSMUST00000212509 1608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Skap2Q3UND0 Rbck1-201ENSMUST00000028964 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Skap2Q3UND0 Nap1l4-201ENSMUST00000072727 2285 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Skap2Q3UND0 Rftn1-201ENSMUST00000044503 4029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Skap2Q3UND0 Zbtb46-202ENSMUST00000087409 2577 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Skap2Q3UND0 Strn4-201ENSMUST00000019220 3535 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Skap2Q3UND0 Entpd7-201ENSMUST00000081079 5911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Skap2Q3UND0 Mthfsl-201ENSMUST00000113110 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Skap2Q3UND0 Cab39-202ENSMUST00000113360 3805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Skap2Q3UND0 Mthfs-203ENSMUST00000118870 705 ntTSL 3 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Skap2Q3UND0 Gm11643-201ENSMUST00000119578 864 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
Skap2Q3UND0 9130019P16Rik-203ENSMUST00000185712 650 ntTSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Skap2Q3UND0 AC061963.1-203ENSMUST00000213473 453 ntTSL 3 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Skap2Q3UND0 Mthfs-201ENSMUST00000085256 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Skap2Q3UND0 Ccr9-202ENSMUST00000163559 3004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Skap2Q3UND0 Dio3-201ENSMUST00000097228 1449 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
Skap2Q3UND0 Tfap2c-201ENSMUST00000030391 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Skap2Q3UND0 Wipf1-202ENSMUST00000102679 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Skap2Q3UND0 Asic4-201ENSMUST00000037708 2464 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Skap2Q3UND0 Acss3-201ENSMUST00000044668 2494 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Skap2Q3UND0 Sh3rf3-205ENSMUST00000153031 5682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Skap2Q3UND0 Apaf1-202ENSMUST00000159110 6433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Skap2Q3UND0 Acot7-203ENSMUST00000105652 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Skap2Q3UND0 Ankrd63-201ENSMUST00000104937 4861 ntAPPRIS P1 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Skap2Q3UND0 Etnk2-203ENSMUST00000135222 2297 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Skap2Q3UND0 Tead3-206ENSMUST00000156862 2573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Skap2Q3UND0 Mtx2-201ENSMUST00000028511 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Skap2Q3UND0 Zfp318-201ENSMUST00000113481 7850 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Skap2Q3UND0 Rabggta-203ENSMUST00000169237 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Skap2Q3UND0 Klhdc8b-214ENSMUST00000195435 1612 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Skap2Q3UND0 Tsc22d1-214ENSMUST00000177207 1476 ntTSL 3 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Skap2Q3UND0 Trim67-202ENSMUST00000167588 8735 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Skap2Q3UND0 AC154231.1-201ENSMUST00000220564 2175 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
Skap2Q3UND0 Degs1-201ENSMUST00000035295 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Skap2Q3UND0 Keap1-201ENSMUST00000049567 3172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Skap2Q3UND0 Gm26663-201ENSMUST00000181105 1882 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Skap2Q3UND0 Ppp2r5e-201ENSMUST00000021447 4810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Skap2Q3UND0 Hsbp1-202ENSMUST00000212468 638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Skap2Q3UND0 Trim7-202ENSMUST00000109213 2356 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Skap2Q3UND0 Dvl2-207ENSMUST00000190940 5037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Skap2Q3UND0 Gpc1-201ENSMUST00000045970 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Skap2Q3UND0 Sacs-204ENSMUST00000121091 4581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Skap2Q3UND0 Noc4l-201ENSMUST00000042147 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Skap2Q3UND0 Cdk12-203ENSMUST00000107539 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Skap2Q3UND0 Lrg1-201ENSMUST00000041357 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Skap2Q3UND0 Cyb561d2-201ENSMUST00000041459 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Skap2Q3UND0 Ppfia3-207ENSMUST00000211067 4565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Skap2Q3UND0 Kif5b-201ENSMUST00000025083 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Skap2Q3UND0 Tox2-202ENSMUST00000109428 2947 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Skap2Q3UND0 Trim45-202ENSMUST00000094048 1815 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Skap2Q3UND0 Ptpro-203ENSMUST00000167679 5096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Skap2Q3UND0 Speg-203ENSMUST00000113588 1078 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Skap2Q3UND0 Pigp-203ENSMUST00000113910 966 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Skap2Q3UND0 Gm11249-201ENSMUST00000117071 859 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
Skap2Q3UND0 Gm15847-201ENSMUST00000121417 1065 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
Skap2Q3UND0 Ccdc51-201ENSMUST00000026735 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23 ms