Protein–RNA interactions for Protein: Q3UMG5

Lrch2, Leucine-rich repeat and calponin homology domain-containing protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 773 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lrch2Q3UMG5 Npw-201ENSMUST00000095544 638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Lrch2Q3UMG5 Naa50-204ENSMUST00000161326 4487 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Lrch2Q3UMG5 Csnk1e-201ENSMUST00000117786 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Lrch2Q3UMG5 Neurl1a-202ENSMUST00000111808 4157 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Lrch2Q3UMG5 Slc6a17-208ENSMUST00000169449 6322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Lrch2Q3UMG5 Slc6a17-201ENSMUST00000029499 6308 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Lrch2Q3UMG5 Bcr-201ENSMUST00000164107 6839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Lrch2Q3UMG5 Adck1-204ENSMUST00000222695 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Lrch2Q3UMG5 Hes6-201ENSMUST00000086851 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.38
Lrch2Q3UMG5 Hnrnpu-201ENSMUST00000037748 7640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.38
Lrch2Q3UMG5 Saysd1-201ENSMUST00000059666 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.38
Lrch2Q3UMG5 4930474H06Rik-201ENSMUST00000132822 1590 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Lrch2Q3UMG5 Chrna2-202ENSMUST00000206455 1933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Lrch2Q3UMG5 Simc1-202ENSMUST00000121401 4819 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Lrch2Q3UMG5 Rrbp1-201ENSMUST00000016072 5177 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Lrch2Q3UMG5 Lrch3-203ENSMUST00000135193 2794 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Lrch2Q3UMG5 Tmem60-201ENSMUST00000115259 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Lrch2Q3UMG5 Cdpf1-204ENSMUST00000144067 761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Lrch2Q3UMG5 U2af1-201ENSMUST00000014684 907 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Lrch2Q3UMG5 U2af1-202ENSMUST00000166526 907 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Lrch2Q3UMG5 Pagr1a-203ENSMUST00000206416 558 ntTSL 3 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Lrch2Q3UMG5 Sdhaf4-201ENSMUST00000027338 683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Lrch2Q3UMG5 Lsm1-201ENSMUST00000038421 2663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Lrch2Q3UMG5 Cwh43-201ENSMUST00000031040 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Lrch2Q3UMG5 Tm6sf2-202ENSMUST00000110160 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Lrch2Q3UMG5 Crhr2-203ENSMUST00000114374 1440 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Lrch2Q3UMG5 Impdh1-202ENSMUST00000159124 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Lrch2Q3UMG5 Gm18336-201ENSMUST00000180787 2298 ntAPPRIS P1 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Lrch2Q3UMG5 Zfp764-201ENSMUST00000059199 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Lrch2Q3UMG5 Ogfod2-201ENSMUST00000024470 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Lrch2Q3UMG5 Lin9-203ENSMUST00000192561 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Lrch2Q3UMG5 Idh1-201ENSMUST00000097709 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Lrch2Q3UMG5 Dcdc2c-206ENSMUST00000221349 2209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Lrch2Q3UMG5 Nfe2-208ENSMUST00000149111 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Lrch2Q3UMG5 Espnl-201ENSMUST00000088904 5445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Lrch2Q3UMG5 Pdcl3-201ENSMUST00000027247 3914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Lrch2Q3UMG5 Jade2-202ENSMUST00000109090 6230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Lrch2Q3UMG5 Gm6623-201ENSMUST00000173570 544 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
Lrch2Q3UMG5 A430033K04Rik-204ENSMUST00000200521 1110 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Lrch2Q3UMG5 Ankrd40-201ENSMUST00000021227 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Lrch2Q3UMG5 AC156576.2-201ENSMUST00000222752 503 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Lrch2Q3UMG5 Fam213b-201ENSMUST00000030935 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Lrch2Q3UMG5 A430033K04Rik-201ENSMUST00000032590 1109 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Lrch2Q3UMG5 Ewsr1-204ENSMUST00000093365 1290 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Lrch2Q3UMG5 Kcnq2-205ENSMUST00000103048 2827 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Lrch2Q3UMG5 Rflna-201ENSMUST00000036109 1681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Lrch2Q3UMG5 Pbx4-201ENSMUST00000081503 1560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Lrch2Q3UMG5 Abl1-202ENSMUST00000075759 6327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Lrch2Q3UMG5 Irx4-202ENSMUST00000176684 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Lrch2Q3UMG5 Ociad2-202ENSMUST00000200776 2359 ntTSL 3 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Lrch2Q3UMG5 Zfp865-203ENSMUST00000085427 2751 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Lrch2Q3UMG5 Kcnq2-201ENSMUST00000016491 3067 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Lrch2Q3UMG5 Crebzf-201ENSMUST00000061767 3376 ntAPPRIS P1 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Lrch2Q3UMG5 Itga6-201ENSMUST00000028522 4310 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Lrch2Q3UMG5 Slit1-201ENSMUST00000025993 5045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Lrch2Q3UMG5 Zfp281-201ENSMUST00000047734 4933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Lrch2Q3UMG5 Sclt1-201ENSMUST00000026866 3005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Lrch2Q3UMG5 Adam22-201ENSMUST00000046838 2773 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Lrch2Q3UMG5 Chn1-203ENSMUST00000112024 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Lrch2Q3UMG5 Chn1-210ENSMUST00000180045 4050 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Lrch2Q3UMG5 Asph-210ENSMUST00000108337 2836 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Lrch2Q3UMG5 Matr3-214ENSMUST00000190029 2845 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Lrch2Q3UMG5 Rab28-205ENSMUST00000202913 863 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Lrch2Q3UMG5 Imp3-201ENSMUST00000034827 924 ntAPPRIS P1 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Lrch2Q3UMG5 Prss27-201ENSMUST00000059482 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Lrch2Q3UMG5 Eif1b-201ENSMUST00000007139 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Lrch2Q3UMG5 Abcc5-203ENSMUST00000096199 1136 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Lrch2Q3UMG5 Tmem254b-201ENSMUST00000022418 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Lrch2Q3UMG5 Tatdn2-202ENSMUST00000113022 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Lrch2Q3UMG5 Braf-201ENSMUST00000002487 9728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Lrch2Q3UMG5 Pi4kb-202ENSMUST00000107251 2895 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Lrch2Q3UMG5 Eda-202ENSMUST00000113775 5088 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Lrch2Q3UMG5 Klhdc10-201ENSMUST00000068240 3951 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Lrch2Q3UMG5 Gm1043-204ENSMUST00000207866 4296 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Lrch2Q3UMG5 Dennd4b-202ENSMUST00000129564 5647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Lrch2Q3UMG5 Mms22l-202ENSMUST00000108222 4478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Lrch2Q3UMG5 Arhgap42-201ENSMUST00000093893 6116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Lrch2Q3UMG5 Lhx6-203ENSMUST00000112963 3481 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Lrch2Q3UMG5 Cul1-201ENSMUST00000031697 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Lrch2Q3UMG5 Ruvbl2-201ENSMUST00000107771 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Lrch2Q3UMG5 Tgfb1i1-205ENSMUST00000165667 1812 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Lrch2Q3UMG5 Cldn6-201ENSMUST00000024699 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Lrch2Q3UMG5 Sppl3-201ENSMUST00000031530 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Lrch2Q3UMG5 Cnksr2-201ENSMUST00000026750 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Lrch2Q3UMG5 Whrn-207ENSMUST00000107393 4028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Lrch2Q3UMG5 Whrn-201ENSMUST00000063650 4016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Lrch2Q3UMG5 Whrn-203ENSMUST00000084510 4049 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Lrch2Q3UMG5 Celf1-201ENSMUST00000005643 4830 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Lrch2Q3UMG5 Ube2e1-201ENSMUST00000022296 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Lrch2Q3UMG5 Elf2-202ENSMUST00000091144 2366 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Lrch2Q3UMG5 Gm15138-201ENSMUST00000151778 379 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Lrch2Q3UMG5 Lamtor5-202ENSMUST00000199317 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Lrch2Q3UMG5 Flt3l-206ENSMUST00000210197 834 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Lrch2Q3UMG5 Psma6-201ENSMUST00000021412 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Lrch2Q3UMG5 Sftpb-201ENSMUST00000070437 1131 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Lrch2Q3UMG5 Rpl21-202ENSMUST00000075453 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Lrch2Q3UMG5 Hist1h2ad-201ENSMUST00000090776 572 ntAPPRIS P1 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Lrch2Q3UMG5 Haglr-201ENSMUST00000100000 2085 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
Lrch2Q3UMG5 Htr3a-201ENSMUST00000003826 2082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Lrch2Q3UMG5 Kbtbd11-201ENSMUST00000069399 6973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.1 ms