Protein–RNA interactions for Protein: Q3UL53

Crxos, Cone-rod homeobox, opposite strand, mousemouse

Predictions only

Length 246 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CrxosQ3UL53 Srpx-202ENSMUST00000115543 1218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CrxosQ3UL53 Lamtor5-201ENSMUST00000145735 881 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CrxosQ3UL53 Hist1h2bc-201ENSMUST00000018246 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CrxosQ3UL53 Otx2os1-206ENSMUST00000228153 787 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
CrxosQ3UL53 Hist1h2ba-201ENSMUST00000052776 384 ntAPPRIS P1 BASIC15.79■□□□□ 0.12
CrxosQ3UL53 Rpl36al-201ENSMUST00000054544 526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CrxosQ3UL53 Nadk-203ENSMUST00000105613 3152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CrxosQ3UL53 Lca5l-202ENSMUST00000113804 3162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CrxosQ3UL53 A230072E10Rik-203ENSMUST00000175942 2940 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CrxosQ3UL53 Fam57b-201ENSMUST00000079423 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CrxosQ3UL53 Mta1-203ENSMUST00000109723 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
CrxosQ3UL53 Mta1-204ENSMUST00000109726 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CrxosQ3UL53 Mta1-205ENSMUST00000109727 2789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CrxosQ3UL53 Pde5a-204ENSMUST00000200389 7603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
CrxosQ3UL53 Fmnl3-203ENSMUST00000120633 4290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
CrxosQ3UL53 Celf6-204ENSMUST00000121266 2610 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CrxosQ3UL53 Wdr26-207ENSMUST00000162819 6619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CrxosQ3UL53 Sfrp2-201ENSMUST00000029625 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CrxosQ3UL53 Parg-204ENSMUST00000164137 3013 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
CrxosQ3UL53 Gm11841-201ENSMUST00000117060 1963 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
CrxosQ3UL53 Ikbke-204ENSMUST00000161764 2867 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CrxosQ3UL53 Wdr90-205ENSMUST00000176923 5666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
CrxosQ3UL53 Lrrfip2-201ENSMUST00000035078 3260 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
CrxosQ3UL53 Tmem117-201ENSMUST00000080141 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CrxosQ3UL53 Nectin3-202ENSMUST00000023335 9116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CrxosQ3UL53 Rbfox2-204ENSMUST00000171751 3558 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CrxosQ3UL53 Pole4-201ENSMUST00000095786 1769 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CrxosQ3UL53 Rab33b-201ENSMUST00000054387 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CrxosQ3UL53 Mpv17l-205ENSMUST00000143697 580 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
CrxosQ3UL53 Gm15890-201ENSMUST00000161024 770 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CrxosQ3UL53 Gm10358-201ENSMUST00000212864 1250 ntAPPRIS P1 BASIC15.78■□□□□ 0.12
CrxosQ3UL53 Tomm22-201ENSMUST00000023062 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CrxosQ3UL53 Pdk3-201ENSMUST00000045748 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CrxosQ3UL53 Krt13-201ENSMUST00000007275 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CrxosQ3UL53 Dzip3-202ENSMUST00000121869 5820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
CrxosQ3UL53 Baz1a-205ENSMUST00000173433 5788 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
CrxosQ3UL53 Mrpl57-201ENSMUST00000022538 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CrxosQ3UL53 Plcl2-201ENSMUST00000043938 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CrxosQ3UL53 E230025N22Rik-201ENSMUST00000115682 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CrxosQ3UL53 E130307A14Rik-213ENSMUST00000155482 2803 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CrxosQ3UL53 Ado-201ENSMUST00000075686 4445 ntAPPRIS P1 BASIC15.78■□□□□ 0.12
CrxosQ3UL53 Lhfp-203ENSMUST00000147139 1932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
CrxosQ3UL53 Mier2-203ENSMUST00000165028 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CrxosQ3UL53 Pid1-201ENSMUST00000168574 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CrxosQ3UL53 Arntl-203ENSMUST00000210074 2554 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CrxosQ3UL53 Tmem183a-201ENSMUST00000049470 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
CrxosQ3UL53 Chrd-202ENSMUST00000115423 2417 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
CrxosQ3UL53 Glt28d2-201ENSMUST00000033643 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
CrxosQ3UL53 Magix-201ENSMUST00000115695 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
CrxosQ3UL53 Gpsm3-201ENSMUST00000038244 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
CrxosQ3UL53 Tdrd12-201ENSMUST00000032701 1620 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
CrxosQ3UL53 Chn1-209ENSMUST00000166199 3876 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
CrxosQ3UL53 Cyp4f41-ps-201ENSMUST00000126790 1077 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
CrxosQ3UL53 Atp6v0b-208ENSMUST00000150204 935 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
CrxosQ3UL53 Gm37722-201ENSMUST00000193757 208 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
CrxosQ3UL53 Spem1-201ENSMUST00000045771 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
CrxosQ3UL53 Bex3-201ENSMUST00000053540 930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
CrxosQ3UL53 Rln3-201ENSMUST00000061923 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
CrxosQ3UL53 Nipsnap3b-201ENSMUST00000015391 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
CrxosQ3UL53 Proc-201ENSMUST00000171765 1566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
CrxosQ3UL53 Il9r-204ENSMUST00000142396 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
CrxosQ3UL53 Hoxc4-202ENSMUST00000165375 2121 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
CrxosQ3UL53 Dnajc2-201ENSMUST00000030771 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
CrxosQ3UL53 Fbrsl1-201ENSMUST00000056124 2700 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
CrxosQ3UL53 Fzd5-201ENSMUST00000063982 6915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
CrxosQ3UL53 Tnfaip2-202ENSMUST00000109792 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
CrxosQ3UL53 Fubp3-202ENSMUST00000113482 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
CrxosQ3UL53 Tia1-203ENSMUST00000095754 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
CrxosQ3UL53 Serac1-201ENSMUST00000024570 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
CrxosQ3UL53 Ccdc105-201ENSMUST00000105383 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
CrxosQ3UL53 Sik3-204ENSMUST00000126865 6287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
CrxosQ3UL53 Rasa2-201ENSMUST00000034984 5813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CrxosQ3UL53 Ttc6-203ENSMUST00000172939 5782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CrxosQ3UL53 Rhobtb2-201ENSMUST00000022665 5322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CrxosQ3UL53 Il17re-208ENSMUST00000204774 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CrxosQ3UL53 Hmg20b-213ENSMUST00000167481 1321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CrxosQ3UL53 B3gnt6-201ENSMUST00000098278 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CrxosQ3UL53 Aqp5-202ENSMUST00000169082 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CrxosQ3UL53 Dnajb2-208ENSMUST00000188346 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CrxosQ3UL53 Atp5g1-202ENSMUST00000107684 596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CrxosQ3UL53 0610025J13Rik-203ENSMUST00000180374 713 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CrxosQ3UL53 Gm27742-201ENSMUST00000184667 60 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
CrxosQ3UL53 Jagn1-202ENSMUST00000204254 1147 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CrxosQ3UL53 Ahnak-201ENSMUST00000092955 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CrxosQ3UL53 Acot7-206ENSMUST00000167926 1505 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CrxosQ3UL53 Prss54-205ENSMUST00000213096 1501 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CrxosQ3UL53 Zfyve19-201ENSMUST00000090174 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CrxosQ3UL53 Gch1-201ENSMUST00000089959 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CrxosQ3UL53 Gm13327-201ENSMUST00000133391 2741 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CrxosQ3UL53 F12-201ENSMUST00000021948 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CrxosQ3UL53 Prps1l3-201ENSMUST00000139049 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CrxosQ3UL53 Pick1-206ENSMUST00000166155 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CrxosQ3UL53 Impdh1-202ENSMUST00000159124 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CrxosQ3UL53 Doc2g-201ENSMUST00000025806 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CrxosQ3UL53 Klhdc8b-214ENSMUST00000195435 1612 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CrxosQ3UL53 St8sia1-201ENSMUST00000032421 8991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CrxosQ3UL53 Aida-206ENSMUST00000193625 1810 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CrxosQ3UL53 Cacna2d2-203ENSMUST00000164988 5542 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CrxosQ3UL53 Ern1-204ENSMUST00000106801 1957 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CrxosQ3UL53 Pdcl3-201ENSMUST00000027247 3914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.2 ms