Protein–RNA interactions for Protein: Q3UJB0

Sf3b2, Splicing factor 3b, subunit 2, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 878 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sf3b2Q3UJB0 Gm27494-201ENSMUST00000184735 189 ntBASIC21.17■□□□□ 0.98
Sf3b2Q3UJB0 Gm27335-201ENSMUST00000184758 97 ntBASIC21.17■□□□□ 0.98
Sf3b2Q3UJB0 Gm45167-201ENSMUST00000208007 322 ntBASIC21.17■□□□□ 0.98
Sf3b2Q3UJB0 Iqcj-201ENSMUST00000063263 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Sf3b2Q3UJB0 Tacstd2-201ENSMUST00000058178 1735 ntAPPRIS P1 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Sf3b2Q3UJB0 Gnptg-202ENSMUST00000115154 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Sf3b2Q3UJB0 Ift57-201ENSMUST00000046777 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Sf3b2Q3UJB0 Sox4-201ENSMUST00000067230 4795 ntAPPRIS P1 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Sf3b2Q3UJB0 Atp6v0a2-201ENSMUST00000037865 5345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Sf3b2Q3UJB0 Kmt5b-204ENSMUST00000113970 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Sf3b2Q3UJB0 Ino80e-201ENSMUST00000050833 1944 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Sf3b2Q3UJB0 B4galt3-205ENSMUST00000126699 1758 ntTSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Sf3b2Q3UJB0 Snai3-201ENSMUST00000006762 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Sf3b2Q3UJB0 Rnase10-202ENSMUST00000164632 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Sf3b2Q3UJB0 Casp3-201ENSMUST00000093517 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Sf3b2Q3UJB0 Rhox2d-201ENSMUST00000115179 685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Sf3b2Q3UJB0 Gm44492-201ENSMUST00000197012 141 ntBASIC21.16■□□□□ 0.98
Sf3b2Q3UJB0 AC159295.1-201ENSMUST00000225326 940 ntBASIC21.16■□□□□ 0.98
Sf3b2Q3UJB0 Iqsec1-210ENSMUST00000212100 3500 ntTSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Sf3b2Q3UJB0 Miga1-201ENSMUST00000068243 2689 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Sf3b2Q3UJB0 Palm-202ENSMUST00000105379 2519 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Sf3b2Q3UJB0 Papola-212ENSMUST00000168186 2436 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Sf3b2Q3UJB0 Il17re-208ENSMUST00000204774 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Sf3b2Q3UJB0 Syndig1-202ENSMUST00000109935 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Sf3b2Q3UJB0 Tmed4-201ENSMUST00000004508 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Sf3b2Q3UJB0 Stambpl1-201ENSMUST00000054956 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Sf3b2Q3UJB0 Sept8-203ENSMUST00000120878 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Sf3b2Q3UJB0 St8sia5-201ENSMUST00000075290 1841 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Sf3b2Q3UJB0 Map3k1-201ENSMUST00000109267 6978 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Sf3b2Q3UJB0 Slk-201ENSMUST00000026043 7278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Sf3b2Q3UJB0 3110082I17Rik-201ENSMUST00000066052 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Sf3b2Q3UJB0 Best2-203ENSMUST00000209421 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Sf3b2Q3UJB0 Nmnat3-201ENSMUST00000112935 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Sf3b2Q3UJB0 Gm37335-201ENSMUST00000192656 447 ntTSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Sf3b2Q3UJB0 4930448I06Rik-201ENSMUST00000194002 546 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Sf3b2Q3UJB0 Atp5o-201ENSMUST00000023677 838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Sf3b2Q3UJB0 Hist1h2ab-201ENSMUST00000078369 473 ntAPPRIS P1 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Sf3b2Q3UJB0 Ttyh3-202ENSMUST00000197452 4576 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Sf3b2Q3UJB0 Slc38a10-202ENSMUST00000053692 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Sf3b2Q3UJB0 Rfx7-201ENSMUST00000093820 7988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Sf3b2Q3UJB0 Smtnl2-201ENSMUST00000050226 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Sf3b2Q3UJB0 Large1-202ENSMUST00000119826 4647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Sf3b2Q3UJB0 Dcaf17-202ENSMUST00000102701 1703 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Sf3b2Q3UJB0 Mast4-202ENSMUST00000164111 2350 ntTSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Sf3b2Q3UJB0 Soga1-201ENSMUST00000069098 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
Sf3b2Q3UJB0 Hmgb3-201ENSMUST00000015361 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
Sf3b2Q3UJB0 Lrig1-202ENSMUST00000101126 4951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
Sf3b2Q3UJB0 Dcps-202ENSMUST00000119847 1445 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
Sf3b2Q3UJB0 Tatdn2-201ENSMUST00000089018 3096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
Sf3b2Q3UJB0 Zfp697-202ENSMUST00000178372 4703 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.98
Sf3b2Q3UJB0 Stk32c-202ENSMUST00000165870 1883 ntTSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
Sf3b2Q3UJB0 Arhgef17-204ENSMUST00000209041 4516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Sf3b2Q3UJB0 Golga5-202ENSMUST00000179218 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Sf3b2Q3UJB0 Chchd7-208ENSMUST00000121651 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Sf3b2Q3UJB0 Xrcc2-204ENSMUST00000134972 464 ntTSL 3 BASIC21.14■□□□□ 0.97
Sf3b2Q3UJB0 Gm44596-201ENSMUST00000204223 647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
Sf3b2Q3UJB0 Pecr-201ENSMUST00000027381 1186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Sf3b2Q3UJB0 Chchd7-201ENSMUST00000041122 672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Sf3b2Q3UJB0 Dpep3-201ENSMUST00000034371 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Sf3b2Q3UJB0 Fam107a-202ENSMUST00000120411 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Sf3b2Q3UJB0 Ank1-203ENSMUST00000110688 7206 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Sf3b2Q3UJB0 Spats2l-212ENSMUST00000170139 2315 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Sf3b2Q3UJB0 Slc22a12-201ENSMUST00000113451 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Sf3b2Q3UJB0 Pitpnm1-201ENSMUST00000049658 4206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Sf3b2Q3UJB0 Inppl1-201ENSMUST00000035836 4995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Sf3b2Q3UJB0 Tspan5-203ENSMUST00000121826 1114 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Sf3b2Q3UJB0 Nxnl2-201ENSMUST00000021828 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Sf3b2Q3UJB0 Vps53-202ENSMUST00000094015 2645 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Sf3b2Q3UJB0 4933434E20Rik-203ENSMUST00000068798 1500 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Sf3b2Q3UJB0 AU022751-201ENSMUST00000101698 1838 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Sf3b2Q3UJB0 Gm38575-203ENSMUST00000215824 1490 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Sf3b2Q3UJB0 Lcorl-202ENSMUST00000045586 5708 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Sf3b2Q3UJB0 Layn-201ENSMUST00000098782 1786 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Sf3b2Q3UJB0 Ccdc42-203ENSMUST00000154294 1384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Sf3b2Q3UJB0 Mettl27-202ENSMUST00000068617 1685 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Sf3b2Q3UJB0 Gm15743-202ENSMUST00000182690 1901 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
Sf3b2Q3UJB0 Zfp78-205ENSMUST00000208030 2169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Sf3b2Q3UJB0 Trim71-201ENSMUST00000111816 9332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Sf3b2Q3UJB0 Gm21984-201ENSMUST00000123117 822 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Sf3b2Q3UJB0 Rabep1-208ENSMUST00000179114 1264 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Sf3b2Q3UJB0 Mir7023-201ENSMUST00000185093 64 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
Sf3b2Q3UJB0 Gm5312-201ENSMUST00000203728 547 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
Sf3b2Q3UJB0 Gm10747-201ENSMUST00000217799 1014 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Sf3b2Q3UJB0 AC154572.2-201ENSMUST00000225105 997 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
Sf3b2Q3UJB0 AC123857.1-201ENSMUST00000181053 2312 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Sf3b2Q3UJB0 Map4k5-201ENSMUST00000049239 4452 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Sf3b2Q3UJB0 Phldb3-204ENSMUST00000206422 2564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Sf3b2Q3UJB0 Mdh2-201ENSMUST00000019323 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Sf3b2Q3UJB0 Shc2-201ENSMUST00000020564 3243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Sf3b2Q3UJB0 Asap2-204ENSMUST00000101562 5552 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Sf3b2Q3UJB0 Gipc2-201ENSMUST00000046614 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Sf3b2Q3UJB0 Mtmr1-201ENSMUST00000015358 4634 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Sf3b2Q3UJB0 9930012K11Rik-205ENSMUST00000153871 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Sf3b2Q3UJB0 9930012K11Rik-201ENSMUST00000058240 1986 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Sf3b2Q3UJB0 Abhd8-201ENSMUST00000008094 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Sf3b2Q3UJB0 Nkain4-202ENSMUST00000108873 865 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Sf3b2Q3UJB0 Pcp2-203ENSMUST00000133459 470 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Sf3b2Q3UJB0 Tgfb1i1-203ENSMUST00000163609 1053 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Sf3b2Q3UJB0 Esd-207ENSMUST00000176957 1117 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Sf3b2Q3UJB0 Tbc1d7-202ENSMUST00000179852 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.4 ms