Protein–RNA interactions for Protein: Q3UIW8

Rnf224, RING finger protein 224, mousemouse

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Length 156 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnf224Q3UIW8 Mrpl15-203ENSMUST00000130201 1894 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Rnf224Q3UIW8 Gfra2-202ENSMUST00000227633 1480 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Rnf224Q3UIW8 Gbx1-201ENSMUST00000088311 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Rnf224Q3UIW8 Nploc4-202ENSMUST00000103017 4025 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Rnf224Q3UIW8 Men1-205ENSMUST00000113501 2508 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Rnf224Q3UIW8 Gm10505-201ENSMUST00000151398 1587 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Rnf224Q3UIW8 Lhfp-201ENSMUST00000059562 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Rnf224Q3UIW8 2610301B20Rik-201ENSMUST00000080517 2116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Rnf224Q3UIW8 Slc30a5-205ENSMUST00000225922 2722 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Rnf224Q3UIW8 Vrk2-201ENSMUST00000078362 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Rnf224Q3UIW8 Meig1-204ENSMUST00000115083 567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Rnf224Q3UIW8 Gm4459-201ENSMUST00000118750 468 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Rnf224Q3UIW8 Nup188-205ENSMUST00000138666 534 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Rnf224Q3UIW8 Hmgb1-208ENSMUST00000139443 923 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Rnf224Q3UIW8 Hsf4-203ENSMUST00000172525 1276 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Rnf224Q3UIW8 Skiv2l-ps1-201ENSMUST00000173935 658 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Rnf224Q3UIW8 Rab10os-206ENSMUST00000179908 746 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Rnf224Q3UIW8 Dnmt3a-ps1-201ENSMUST00000192011 1271 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Rnf224Q3UIW8 Gm30191-201ENSMUST00000205501 647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Rnf224Q3UIW8 Lce1b-201ENSMUST00000029531 647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Rnf224Q3UIW8 Sfxn5-202ENSMUST00000059034 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Rnf224Q3UIW8 Psmb4-201ENSMUST00000005923 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Rnf224Q3UIW8 Klk15-201ENSMUST00000068625 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Rnf224Q3UIW8 Olfr541-201ENSMUST00000080681 1103 ntAPPRIS P1 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Rnf224Q3UIW8 4930455H04Rik-201ENSMUST00000117592 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Rnf224Q3UIW8 Mettl21a-202ENSMUST00000114079 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Rnf224Q3UIW8 Irx4-202ENSMUST00000176684 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Rnf224Q3UIW8 Obsl1-202ENSMUST00000113567 5679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Rnf224Q3UIW8 Bean1-204ENSMUST00000171018 3386 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Rnf224Q3UIW8 Cckbr-201ENSMUST00000033189 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Rnf224Q3UIW8 Mtmr14-201ENSMUST00000113146 2676 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Rnf224Q3UIW8 Yipf2-202ENSMUST00000078572 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Rnf224Q3UIW8 Dio3-202ENSMUST00000173014 2030 ntAPPRIS P1 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Rnf224Q3UIW8 Il4i1-201ENSMUST00000033015 2048 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Rnf224Q3UIW8 Cdc14b-203ENSMUST00000109770 3052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Rnf224Q3UIW8 Vps53-203ENSMUST00000108419 2209 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Rnf224Q3UIW8 Smox-204ENSMUST00000110181 2299 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Rnf224Q3UIW8 Akain1-201ENSMUST00000169935 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Rnf224Q3UIW8 Ttyh3-201ENSMUST00000042661 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Rnf224Q3UIW8 Ms4a6d-202ENSMUST00000125291 679 ntTSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Rnf224Q3UIW8 Edn3-203ENSMUST00000140908 731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Rnf224Q3UIW8 Tsc22d1-208ENSMUST00000142683 797 ntTSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Rnf224Q3UIW8 Mir6956-201ENSMUST00000183598 62 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Rnf224Q3UIW8 Apof-201ENSMUST00000050901 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Rnf224Q3UIW8 Rpl27-201ENSMUST00000077856 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Rnf224Q3UIW8 Crxos-201ENSMUST00000098801 934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Rnf224Q3UIW8 Mef2b-203ENSMUST00000110143 1312 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Rnf224Q3UIW8 Mef2b-204ENSMUST00000110146 1342 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Rnf224Q3UIW8 Whrn-206ENSMUST00000102867 4013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Rnf224Q3UIW8 Lrrc58-201ENSMUST00000078717 8604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Rnf224Q3UIW8 Fgf11-201ENSMUST00000011285 2534 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Rnf224Q3UIW8 Nploc4-201ENSMUST00000044271 4121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Rnf224Q3UIW8 Akt2-205ENSMUST00000108344 4544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Rnf224Q3UIW8 Dap3-201ENSMUST00000090938 4760 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Rnf224Q3UIW8 Rbpj-203ENSMUST00000113865 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Rnf224Q3UIW8 Tmem176a-201ENSMUST00000101426 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Rnf224Q3UIW8 Fis1-202ENSMUST00000111094 948 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Rnf224Q3UIW8 Psmb5-ps-201ENSMUST00000119744 798 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Rnf224Q3UIW8 Ppp3cb-206ENSMUST00000161989 2322 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Rnf224Q3UIW8 Entpd4-205ENSMUST00000184314 989 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Rnf224Q3UIW8 Fbrsl1-206ENSMUST00000198834 2571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Rnf224Q3UIW8 Agbl5-209ENSMUST00000201225 2646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Rnf224Q3UIW8 Ttc9-202ENSMUST00000218362 4754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Rnf224Q3UIW8 Nap1l1-206ENSMUST00000219143 1365 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Rnf224Q3UIW8 Prss8-201ENSMUST00000032988 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Rnf224Q3UIW8 Acaa2-201ENSMUST00000041053 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Rnf224Q3UIW8 Entpd4b-201ENSMUST00000064846 989 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Rnf224Q3UIW8 Tmem131-208ENSMUST00000194563 6698 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Rnf224Q3UIW8 Zbtb24-201ENSMUST00000080771 2844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Rnf224Q3UIW8 Gnptab-201ENSMUST00000020251 5390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Rnf224Q3UIW8 Syt3-202ENSMUST00000118962 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Rnf224Q3UIW8 Slc16a10-202ENSMUST00000213488 2325 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Rnf224Q3UIW8 Fbxl3-201ENSMUST00000022720 4309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Rnf224Q3UIW8 Pdcl3-201ENSMUST00000027247 3914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Rnf224Q3UIW8 Irak1-205ENSMUST00000114353 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Rnf224Q3UIW8 Nadk2-202ENSMUST00000100789 3578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Rnf224Q3UIW8 Prlhr-201ENSMUST00000051277 1572 ntAPPRIS P1 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Rnf224Q3UIW8 Ankrd61-202ENSMUST00000110717 1498 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Rnf224Q3UIW8 Coro6-201ENSMUST00000021190 1418 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Rnf224Q3UIW8 Tmed1-201ENSMUST00000034698 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Rnf224Q3UIW8 Ccdc3-201ENSMUST00000027988 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Rnf224Q3UIW8 Gm3928-201ENSMUST00000121141 1307 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Rnf224Q3UIW8 Ltc4s-202ENSMUST00000102772 649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Rnf224Q3UIW8 Fam53b-204ENSMUST00000106165 1232 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Rnf224Q3UIW8 Gm7222-201ENSMUST00000117512 906 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Rnf224Q3UIW8 Pcp2-205ENSMUST00000142431 524 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Rnf224Q3UIW8 4930445N18Rik-202ENSMUST00000181345 1033 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Rnf224Q3UIW8 Mir8117-201ENSMUST00000184773 107 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Rnf224Q3UIW8 Nckipsd-206ENSMUST00000195323 467 ntTSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Rnf224Q3UIW8 Gm34933-201ENSMUST00000203245 1067 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Rnf224Q3UIW8 Gm45091-201ENSMUST00000205799 504 ntTSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Rnf224Q3UIW8 Gm44945-201ENSMUST00000206764 1187 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Rnf224Q3UIW8 Gm44872-201ENSMUST00000207864 420 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Rnf224Q3UIW8 Wdyhv1-206ENSMUST00000227142 786 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Rnf224Q3UIW8 Tmem51os1-202ENSMUST00000141769 2131 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Rnf224Q3UIW8 Negr1-201ENSMUST00000041425 2095 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Rnf224Q3UIW8 Gm36447-201ENSMUST00000201101 1978 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Rnf224Q3UIW8 Podxl2-201ENSMUST00000038409 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Rnf224Q3UIW8 Eif5-201ENSMUST00000050993 1969 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Rnf224Q3UIW8 Smpd5-202ENSMUST00000163991 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32 ms