Protein–RNA interactions for Protein: Q3UI66

Ccdc34, Coiled-coil domain-containing protein 34, mousemouse

Predictions only

Length 367 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc34Q3UI66 Tbrg4-212ENSMUST00000189268 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Ccdc34Q3UI66 Sf1-202ENSMUST00000113487 2649 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Ccdc34Q3UI66 Insig1-201ENSMUST00000059155 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Ccdc34Q3UI66 Tbc1d8-201ENSMUST00000054462 4451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Ccdc34Q3UI66 Papd5-202ENSMUST00000118952 4597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Ccdc34Q3UI66 Synm-204ENSMUST00000208231 4457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Ccdc34Q3UI66 Prob1-201ENSMUST00000097619 3021 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
Ccdc34Q3UI66 Kif12-201ENSMUST00000030042 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Ccdc34Q3UI66 Gm37820-201ENSMUST00000194021 2147 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
Ccdc34Q3UI66 Coro1a-202ENSMUST00000106364 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Ccdc34Q3UI66 Sh3yl1-202ENSMUST00000110880 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Ccdc34Q3UI66 Bnc1-201ENSMUST00000026096 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Ccdc34Q3UI66 Zbtb11os1-201ENSMUST00000186480 1350 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
Ccdc34Q3UI66 Pigx-210ENSMUST00000155966 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Ccdc34Q3UI66 AI480526-205ENSMUST00000160255 1095 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Ccdc34Q3UI66 Bag1-204ENSMUST00000215842 1068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Ccdc34Q3UI66 Gp1bb-201ENSMUST00000051160 645 ntAPPRIS P3 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Ccdc34Q3UI66 Clstn1-201ENSMUST00000039144 3319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Ccdc34Q3UI66 Atl1-201ENSMUST00000021466 5150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Ccdc34Q3UI66 Agfg1-208ENSMUST00000190052 2991 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Ccdc34Q3UI66 Kcnq2-204ENSMUST00000103047 2899 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Ccdc34Q3UI66 Lefty2-201ENSMUST00000085797 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Ccdc34Q3UI66 Agbl3-204ENSMUST00000115016 3734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Ccdc34Q3UI66 Gm26891-201ENSMUST00000181644 2599 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Ccdc34Q3UI66 Actr3-201ENSMUST00000027579 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.41
Ccdc34Q3UI66 Slc46a3-201ENSMUST00000031655 2434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Ccdc34Q3UI66 Crybg1-201ENSMUST00000020017 6608 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Ccdc34Q3UI66 Arhgef40-204ENSMUST00000182061 4756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Ccdc34Q3UI66 Klf13-202ENSMUST00000183817 599 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Ccdc34Q3UI66 Fars2-201ENSMUST00000021857 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Ccdc34Q3UI66 Tpm4-201ENSMUST00000003575 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Ccdc34Q3UI66 Eif4g1-206ENSMUST00000115463 5378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Ccdc34Q3UI66 Per3-201ENSMUST00000103204 5999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Ccdc34Q3UI66 A830018L16Rik-201ENSMUST00000048613 2779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Ccdc34Q3UI66 Abl1-201ENSMUST00000028190 5794 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Ccdc34Q3UI66 Gprc5c-203ENSMUST00000122967 1709 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Ccdc34Q3UI66 Nos1ap-207ENSMUST00000161966 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Ccdc34Q3UI66 6330411D24Rik-201ENSMUST00000211105 1568 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Ccdc34Q3UI66 Six4-201ENSMUST00000043208 6402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Ccdc34Q3UI66 Cldn6-201ENSMUST00000024699 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Ccdc34Q3UI66 Agbl5-213ENSMUST00000201917 3579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Ccdc34Q3UI66 AC115863.1-201ENSMUST00000214815 1813 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
Ccdc34Q3UI66 Parg-202ENSMUST00000163350 3374 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Ccdc34Q3UI66 Akt1s1-203ENSMUST00000107882 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Ccdc34Q3UI66 Mir7075-201ENSMUST00000184187 82 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
Ccdc34Q3UI66 Nol7-205ENSMUST00000222499 756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Ccdc34Q3UI66 Glis1-202ENSMUST00000106738 2744 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Ccdc34Q3UI66 Psmd5-201ENSMUST00000028225 4397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Ccdc34Q3UI66 Rnf152-201ENSMUST00000058688 8492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Ccdc34Q3UI66 Ccna2-201ENSMUST00000029270 2965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Ccdc34Q3UI66 Nrxn1-204ENSMUST00000159778 3414 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Ccdc34Q3UI66 Wnk1-223ENSMUST00000177761 11303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Ccdc34Q3UI66 Gm9821-201ENSMUST00000178895 1953 ntAPPRIS P1 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Ccdc34Q3UI66 Rft1-201ENSMUST00000064230 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Ccdc34Q3UI66 Phax-201ENSMUST00000008445 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Ccdc34Q3UI66 Tgfbr3-201ENSMUST00000031224 6087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Ccdc34Q3UI66 Zc3h14-204ENSMUST00000110105 3514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Ccdc34Q3UI66 Mpig6b-201ENSMUST00000097337 2252 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Ccdc34Q3UI66 Tnfaip2-201ENSMUST00000102745 3762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Ccdc34Q3UI66 Iscu-202ENSMUST00000112311 1395 ntTSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Ccdc34Q3UI66 Fnbp1-208ENSMUST00000113560 4726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Ccdc34Q3UI66 Syne3-201ENSMUST00000067005 5097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Ccdc34Q3UI66 AC114678.1-201ENSMUST00000219640 622 ntTSL 3 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Ccdc34Q3UI66 4930505A04Rik-201ENSMUST00000041763 904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Ccdc34Q3UI66 Krtap5-5-201ENSMUST00000097942 1177 ntAPPRIS P1 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Ccdc34Q3UI66 Zkscan14-201ENSMUST00000031632 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Ccdc34Q3UI66 Gbe1-203ENSMUST00000163832 2984 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Ccdc34Q3UI66 Pcdha11-202ENSMUST00000115657 5360 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Ccdc34Q3UI66 Adcy3-204ENSMUST00000127756 4672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Ccdc34Q3UI66 Ablim2-205ENSMUST00000114205 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Ccdc34Q3UI66 Gm26663-201ENSMUST00000181105 1882 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Ccdc34Q3UI66 Ndufs2-202ENSMUST00000111318 1545 ntTSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Ccdc34Q3UI66 Pde4d-207ENSMUST00000120664 4207 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Ccdc34Q3UI66 Sympk-201ENSMUST00000023882 4116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Ccdc34Q3UI66 Ttll3-202ENSMUST00000038889 3114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Ccdc34Q3UI66 Cdkn1b-201ENSMUST00000003115 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Ccdc34Q3UI66 Ran-201ENSMUST00000031383 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Ccdc34Q3UI66 Ilk-212ENSMUST00000163389 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Ccdc34Q3UI66 Dbnl-202ENSMUST00000102928 2295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Ccdc34Q3UI66 Arfip2-202ENSMUST00000084782 2254 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Ccdc34Q3UI66 Dclk2-201ENSMUST00000029719 4012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Ccdc34Q3UI66 Tubb4b-ps1-201ENSMUST00000179460 1336 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
Ccdc34Q3UI66 Yeats4-201ENSMUST00000020382 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Ccdc34Q3UI66 Pdia3-201ENSMUST00000028683 2770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Ccdc34Q3UI66 Rfx5-203ENSMUST00000107254 4450 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Ccdc34Q3UI66 Rint1-205ENSMUST00000120869 1886 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Ccdc34Q3UI66 Nipsnap3b-201ENSMUST00000015391 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Ccdc34Q3UI66 Ptges3-202ENSMUST00000084771 1559 ntTSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Ccdc34Q3UI66 Aktip-201ENSMUST00000109609 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Ccdc34Q3UI66 Anapc1-202ENSMUST00000110332 1214 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Ccdc34Q3UI66 Tmem9-202ENSMUST00000117950 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Ccdc34Q3UI66 Gm43173-201ENSMUST00000202246 593 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
Ccdc34Q3UI66 Hebp1-201ENSMUST00000045855 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Ccdc34Q3UI66 Asic1-205ENSMUST00000228185 1818 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
Ccdc34Q3UI66 Pde4dip-201ENSMUST00000045243 6185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Ccdc34Q3UI66 Sctr-201ENSMUST00000072886 2012 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Ccdc34Q3UI66 Phf12-201ENSMUST00000049167 4410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Ccdc34Q3UI66 Ndufaf3-201ENSMUST00000074208 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Ccdc34Q3UI66 Wdr13-202ENSMUST00000115623 1749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Ccdc34Q3UI66 Strn4-201ENSMUST00000019220 3535 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.8 ms