Protein–RNA interactions for Protein: Q3UHK3

Greb1, Protein GREB1, mousemouse

Predictions only

Length 1,954 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Greb1Q3UHK3 Nkx2-1-201ENSMUST00000001536 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Greb1Q3UHK3 Mta1-203ENSMUST00000109723 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Greb1Q3UHK3 Mta1-204ENSMUST00000109726 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Greb1Q3UHK3 Mta1-205ENSMUST00000109727 2789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Greb1Q3UHK3 Cant1-204ENSMUST00000106288 2873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Greb1Q3UHK3 Bcl7b-203ENSMUST00000111188 1434 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Greb1Q3UHK3 Atat1-214ENSMUST00000149277 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Greb1Q3UHK3 Pgam1-ps2-201ENSMUST00000117129 765 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Greb1Q3UHK3 Zscan10-204ENSMUST00000118369 1006 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Greb1Q3UHK3 Prss40-201ENSMUST00000047840 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Greb1Q3UHK3 Hist1h1a-201ENSMUST00000055770 741 ntAPPRIS P1 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Greb1Q3UHK3 Olfr601-201ENSMUST00000080474 990 ntAPPRIS P1 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Greb1Q3UHK3 Chst8-201ENSMUST00000078686 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Greb1Q3UHK3 Nadk-203ENSMUST00000105613 3152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Greb1Q3UHK3 Stim2-201ENSMUST00000117661 4934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Greb1Q3UHK3 Pnpt1-201ENSMUST00000020756 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Greb1Q3UHK3 P2rx4-201ENSMUST00000031429 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Greb1Q3UHK3 Dlgap2-203ENSMUST00000133298 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Greb1Q3UHK3 Dmpk-203ENSMUST00000108474 2591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Greb1Q3UHK3 Map6-207ENSMUST00000208924 2906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Greb1Q3UHK3 Pofut1-203ENSMUST00000099192 1385 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Greb1Q3UHK3 Men1-204ENSMUST00000113500 2742 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Greb1Q3UHK3 Gm26803-201ENSMUST00000181705 2011 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Greb1Q3UHK3 Gm16181-201ENSMUST00000118793 567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Greb1Q3UHK3 Gm12644-201ENSMUST00000119935 606 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Greb1Q3UHK3 Gm15372-201ENSMUST00000120729 834 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Greb1Q3UHK3 Mir6404-201ENSMUST00000183699 94 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Greb1Q3UHK3 AC164629.2-201ENSMUST00000217916 270 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Greb1Q3UHK3 Dok1-201ENSMUST00000089651 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Greb1Q3UHK3 Glra1-202ENSMUST00000102716 2390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Greb1Q3UHK3 Hnrnpa1-202ENSMUST00000087351 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Greb1Q3UHK3 Gpr150-201ENSMUST00000056130 2146 ntAPPRIS P1 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Greb1Q3UHK3 A830073O21Rik-202ENSMUST00000205693 3096 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Greb1Q3UHK3 Papd4-201ENSMUST00000048702 2990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Greb1Q3UHK3 Evx1-201ENSMUST00000031787 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Greb1Q3UHK3 Fam78b-205ENSMUST00000165874 4986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Greb1Q3UHK3 Rnf44-204ENSMUST00000125871 4292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Greb1Q3UHK3 Speg-202ENSMUST00000113587 1254 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Greb1Q3UHK3 Scin-201ENSMUST00000002640 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Greb1Q3UHK3 Ppib-201ENSMUST00000034947 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Greb1Q3UHK3 Adcy3-202ENSMUST00000124505 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Greb1Q3UHK3 Taf6l-212ENSMUST00000177216 2167 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Greb1Q3UHK3 Ak3-201ENSMUST00000025696 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Greb1Q3UHK3 Nrxn2-202ENSMUST00000113458 3503 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Greb1Q3UHK3 Ep300-201ENSMUST00000068387 9566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Greb1Q3UHK3 Zrsr2-202ENSMUST00000112289 2735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Greb1Q3UHK3 Gm43548-201ENSMUST00000197139 2353 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Greb1Q3UHK3 Ush1c-208ENSMUST00000177212 1696 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Greb1Q3UHK3 Chst13-201ENSMUST00000070890 1653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Greb1Q3UHK3 Soga1-201ENSMUST00000069098 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Greb1Q3UHK3 Spock3-204ENSMUST00000119068 3201 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Greb1Q3UHK3 Rbm4-203ENSMUST00000178615 1018 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Greb1Q3UHK3 Nudt16l1-201ENSMUST00000050881 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Greb1Q3UHK3 Taok3-202ENSMUST00000111975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Greb1Q3UHK3 Mff-212ENSMUST00000162003 2087 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Greb1Q3UHK3 Nudt4-201ENSMUST00000020217 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Greb1Q3UHK3 E230025N22Rik-201ENSMUST00000115682 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Greb1Q3UHK3 Gstm4-201ENSMUST00000029489 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Greb1Q3UHK3 B3gnt4-201ENSMUST00000031384 1423 ntAPPRIS P1 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Greb1Q3UHK3 Arrdc1-201ENSMUST00000028349 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Greb1Q3UHK3 Rasgrp2-201ENSMUST00000035716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Greb1Q3UHK3 Neu1-201ENSMUST00000007253 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Greb1Q3UHK3 Rnf103-201ENSMUST00000064637 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Greb1Q3UHK3 Kcmf1-201ENSMUST00000068697 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Greb1Q3UHK3 Tcp1-209ENSMUST00000151287 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Greb1Q3UHK3 Nrxn2-205ENSMUST00000113462 6667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Greb1Q3UHK3 Simc1-201ENSMUST00000118072 2116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Greb1Q3UHK3 4930448E22Rik-202ENSMUST00000215242 2102 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Greb1Q3UHK3 Slc25a3-206ENSMUST00000170810 1341 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Greb1Q3UHK3 Sulf2-201ENSMUST00000088086 3927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Greb1Q3UHK3 Sox14-201ENSMUST00000054819 2065 ntAPPRIS P1 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Greb1Q3UHK3 Gm28265-201ENSMUST00000188201 2319 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Greb1Q3UHK3 Gm7935-201ENSMUST00000100555 1278 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Greb1Q3UHK3 Tfpt-202ENSMUST00000108641 1166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Greb1Q3UHK3 Pafah1b3-207ENSMUST00000155118 679 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Greb1Q3UHK3 Gm25745-201ENSMUST00000174945 133 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Greb1Q3UHK3 Syne4-208ENSMUST00000176304 1006 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Greb1Q3UHK3 Flg-202ENSMUST00000178008 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Greb1Q3UHK3 Flg-205ENSMUST00000179250 765 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Greb1Q3UHK3 Flg-206ENSMUST00000179477 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Greb1Q3UHK3 Gm27459-201ENSMUST00000184860 107 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Greb1Q3UHK3 Tecr-201ENSMUST00000019382 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Greb1Q3UHK3 Dcdc2c-201ENSMUST00000020963 1041 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Greb1Q3UHK3 Cmtm5-203ENSMUST00000227441 610 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Greb1Q3UHK3 Ephx4-201ENSMUST00000049146 1279 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Greb1Q3UHK3 Foxd1-201ENSMUST00000105098 5064 ntAPPRIS P1 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Greb1Q3UHK3 Hnrnpll-205ENSMUST00000184635 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Greb1Q3UHK3 2810039B14Rik-201ENSMUST00000183928 1459 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Greb1Q3UHK3 Rab9-202ENSMUST00000112091 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Greb1Q3UHK3 E130307A14Rik-213ENSMUST00000155482 2803 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Greb1Q3UHK3 Tbrg4-212ENSMUST00000189268 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Greb1Q3UHK3 Slc25a2-201ENSMUST00000058635 1369 ntAPPRIS P1 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Greb1Q3UHK3 Fkbp14-202ENSMUST00000117375 1830 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Greb1Q3UHK3 Lrrc42-201ENSMUST00000030360 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Greb1Q3UHK3 Chst5-201ENSMUST00000034430 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Greb1Q3UHK3 Gm12216-201ENSMUST00000117316 1152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Greb1Q3UHK3 Gm16295-201ENSMUST00000139512 643 ntTSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Greb1Q3UHK3 Smim12-201ENSMUST00000142029 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Greb1Q3UHK3 Gm7616-201ENSMUST00000143112 624 ntTSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Greb1Q3UHK3 Vsig2-201ENSMUST00000002008 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.9 ms