Protein–RNA interactions for Protein: Q3UHE1

Pitpnm3, Membrane-associated phosphatidylinositol transfer protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 974 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pitpnm3Q3UHE1 Mis18bp1-208ENSMUST00000222244 2053 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Pitpnm3Q3UHE1 Taf10-203ENSMUST00000141116 4281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Pitpnm3Q3UHE1 Mzf1-202ENSMUST00000182087 2197 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Pitpnm3Q3UHE1 Slc15a3-201ENSMUST00000025646 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Pitpnm3Q3UHE1 Napa-201ENSMUST00000006181 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Pitpnm3Q3UHE1 Rhno1-202ENSMUST00000112151 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Pitpnm3Q3UHE1 Gm9731-201ENSMUST00000209480 747 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
Pitpnm3Q3UHE1 Gm8994-201ENSMUST00000077886 1236 ntAPPRIS P1 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Pitpnm3Q3UHE1 1700096K18Rik-201ENSMUST00000188465 1454 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
Pitpnm3Q3UHE1 Rundc3b-201ENSMUST00000047485 3677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Pitpnm3Q3UHE1 Ubr2-202ENSMUST00000113337 7633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Pitpnm3Q3UHE1 A230103J11Rik-202ENSMUST00000156084 2086 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Pitpnm3Q3UHE1 Fscn1-207ENSMUST00000198017 2157 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Pitpnm3Q3UHE1 Dars-201ENSMUST00000027602 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Pitpnm3Q3UHE1 Tmem117-201ENSMUST00000080141 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Pitpnm3Q3UHE1 Tor1b-201ENSMUST00000028199 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Pitpnm3Q3UHE1 Sybu-202ENSMUST00000110267 3127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Pitpnm3Q3UHE1 Mios-201ENSMUST00000040017 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Pitpnm3Q3UHE1 Ankrd44-210ENSMUST00000179030 6140 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Pitpnm3Q3UHE1 Ablim1-204ENSMUST00000111524 1251 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Pitpnm3Q3UHE1 Cutc-202ENSMUST00000112047 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Pitpnm3Q3UHE1 Pacsin1-203ENSMUST00000114872 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Pitpnm3Q3UHE1 Usp27x-201ENSMUST00000115744 3240 ntAPPRIS P1 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Pitpnm3Q3UHE1 Gm16759-201ENSMUST00000126238 1393 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Pitpnm3Q3UHE1 Prps1l3-201ENSMUST00000139049 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Pitpnm3Q3UHE1 Gm17661-201ENSMUST00000170317 270 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
Pitpnm3Q3UHE1 Gm26755-201ENSMUST00000180703 2657 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Pitpnm3Q3UHE1 Gm19721-201ENSMUST00000195284 1764 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
Pitpnm3Q3UHE1 Rogdi-207ENSMUST00000202281 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Pitpnm3Q3UHE1 Cygb-201ENSMUST00000021166 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Pitpnm3Q3UHE1 Gm7791-201ENSMUST00000219066 539 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
Pitpnm3Q3UHE1 Gm32151-201ENSMUST00000223521 915 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Pitpnm3Q3UHE1 Il3ra-202ENSMUST00000223589 738 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
Pitpnm3Q3UHE1 Ube2r2-201ENSMUST00000040008 3600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Pitpnm3Q3UHE1 Lsm10-201ENSMUST00000055575 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Pitpnm3Q3UHE1 Ripply2-201ENSMUST00000058846 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Pitpnm3Q3UHE1 Olfr464-201ENSMUST00000074874 1084 ntAPPRIS P1 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Pitpnm3Q3UHE1 Rnf103-202ENSMUST00000114178 3431 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Pitpnm3Q3UHE1 Tmem5-205ENSMUST00000140299 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Pitpnm3Q3UHE1 Itga5-201ENSMUST00000023128 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Pitpnm3Q3UHE1 Yipf4-201ENSMUST00000024873 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Pitpnm3Q3UHE1 Car9-201ENSMUST00000030183 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Pitpnm3Q3UHE1 Ttc39b-202ENSMUST00000048274 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Pitpnm3Q3UHE1 Lrriq4-203ENSMUST00000172350 1797 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Pitpnm3Q3UHE1 Zscan25-201ENSMUST00000094116 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Pitpnm3Q3UHE1 Srpr-201ENSMUST00000034541 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Pitpnm3Q3UHE1 Dusp12-201ENSMUST00000027970 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Pitpnm3Q3UHE1 Lhx5-201ENSMUST00000031591 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Pitpnm3Q3UHE1 Ppp1r1b-204ENSMUST00000137634 1343 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Pitpnm3Q3UHE1 Gramd3-201ENSMUST00000070166 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Pitpnm3Q3UHE1 Slc2a8-204ENSMUST00000153484 1168 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Pitpnm3Q3UHE1 AC159205.6-201ENSMUST00000224935 887 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
Pitpnm3Q3UHE1 Rgcc-201ENSMUST00000022595 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Pitpnm3Q3UHE1 Mrpl21-201ENSMUST00000025743 802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Pitpnm3Q3UHE1 Krt90-201ENSMUST00000023714 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Pitpnm3Q3UHE1 Rbck1-202ENSMUST00000109847 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Pitpnm3Q3UHE1 Exoc8-201ENSMUST00000098312 4598 ntAPPRIS P1 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Pitpnm3Q3UHE1 Zkscan2-203ENSMUST00000128217 2218 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Pitpnm3Q3UHE1 Taf5-201ENSMUST00000026027 3258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Pitpnm3Q3UHE1 Atoh1-201ENSMUST00000101351 2121 ntAPPRIS P1 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Pitpnm3Q3UHE1 Akt2-214ENSMUST00000167435 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Pitpnm3Q3UHE1 Ltbp1-201ENSMUST00000001927 6671 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Pitpnm3Q3UHE1 Chgb-201ENSMUST00000028826 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Pitpnm3Q3UHE1 Anks6-201ENSMUST00000084616 3552 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Pitpnm3Q3UHE1 Ccdc84-202ENSMUST00000213813 2675 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Pitpnm3Q3UHE1 Pde8b-201ENSMUST00000022192 2517 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Pitpnm3Q3UHE1 BC029722-201ENSMUST00000124586 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Pitpnm3Q3UHE1 Ogfr-201ENSMUST00000029087 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Pitpnm3Q3UHE1 Dlgap1-201ENSMUST00000060072 5420 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Pitpnm3Q3UHE1 Slc39a7-201ENSMUST00000025186 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Pitpnm3Q3UHE1 Chuk-202ENSMUST00000119591 3481 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Pitpnm3Q3UHE1 Qprt-201ENSMUST00000032912 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Pitpnm3Q3UHE1 Fam166b-201ENSMUST00000052829 1349 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Pitpnm3Q3UHE1 Nmnat3-203ENSMUST00000112938 848 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Pitpnm3Q3UHE1 Pdcd5-202ENSMUST00000120714 767 ntTSL 3 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Pitpnm3Q3UHE1 Gm14114-201ENSMUST00000139345 287 ntTSL 3 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Pitpnm3Q3UHE1 Gm3764-209ENSMUST00000181550 1093 ntTSL 3 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Pitpnm3Q3UHE1 Gm10231-201ENSMUST00000181584 441 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
Pitpnm3Q3UHE1 Atp5g2-202ENSMUST00000185641 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Pitpnm3Q3UHE1 Gm10175-202ENSMUST00000208752 441 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
Pitpnm3Q3UHE1 Gm26709-202ENSMUST00000223049 819 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Pitpnm3Q3UHE1 Atp5g2-201ENSMUST00000075630 441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Pitpnm3Q3UHE1 Hnrnpll-201ENSMUST00000061331 3116 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Pitpnm3Q3UHE1 Adamtsl1-201ENSMUST00000048885 1842 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Pitpnm3Q3UHE1 Cct6b-201ENSMUST00000021040 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Pitpnm3Q3UHE1 Capn10-201ENSMUST00000027488 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Pitpnm3Q3UHE1 Capn15-205ENSMUST00000212520 5216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Pitpnm3Q3UHE1 Ctnna2-205ENSMUST00000161846 4018 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Pitpnm3Q3UHE1 Cops7b-201ENSMUST00000027446 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Pitpnm3Q3UHE1 Zbtb24-202ENSMUST00000213797 2734 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Pitpnm3Q3UHE1 Rbm12b2-202ENSMUST00000095143 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Pitpnm3Q3UHE1 Mcoln2-202ENSMUST00000098524 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Pitpnm3Q3UHE1 Map3k6-201ENSMUST00000030677 4334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Pitpnm3Q3UHE1 Vangl2-202ENSMUST00000111263 6528 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Pitpnm3Q3UHE1 Slc37a4-203ENSMUST00000213388 2344 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Pitpnm3Q3UHE1 Ttll5-201ENSMUST00000040179 5081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Pitpnm3Q3UHE1 4933428P19Rik-201ENSMUST00000199616 1376 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
Pitpnm3Q3UHE1 Rundc3a-202ENSMUST00000107102 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Pitpnm3Q3UHE1 Adnp-201ENSMUST00000057793 4917 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Pitpnm3Q3UHE1 Pid1-201ENSMUST00000168574 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 73.1 ms