Protein–RNA interactions for Protein: Q3UDK1

Trafd1, TRAF-type zinc finger domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 580 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trafd1Q3UDK1 Il11ra1-204ENSMUST00000108042 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Trafd1Q3UDK1 Inhba-202ENSMUST00000164993 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Trafd1Q3UDK1 Gm13186-201ENSMUST00000118031 316 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Trafd1Q3UDK1 Arhgef4-208ENSMUST00000211073 171 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Trafd1Q3UDK1 Rps28-201ENSMUST00000087342 392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Trafd1Q3UDK1 Gdf5-201ENSMUST00000040162 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Trafd1Q3UDK1 Ap1m1-201ENSMUST00000003117 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Trafd1Q3UDK1 Utp18-201ENSMUST00000066888 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Trafd1Q3UDK1 Dlk2-202ENSMUST00000166280 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Trafd1Q3UDK1 Atxn7l3-202ENSMUST00000107132 3706 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Trafd1Q3UDK1 Agbl4-205ENSMUST00000106591 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Trafd1Q3UDK1 Kcnq2-204ENSMUST00000103047 2899 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Trafd1Q3UDK1 Slc35a1-201ENSMUST00000029970 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Trafd1Q3UDK1 Ccdc30-201ENSMUST00000044781 1464 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Trafd1Q3UDK1 9530085L11Rik-201ENSMUST00000203963 2115 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Trafd1Q3UDK1 B4galt7-201ENSMUST00000064701 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Trafd1Q3UDK1 Klhdc10-201ENSMUST00000068240 3951 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Trafd1Q3UDK1 Fam3a-206ENSMUST00000114143 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Trafd1Q3UDK1 Fam76a-202ENSMUST00000097856 1863 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Trafd1Q3UDK1 Dand5-201ENSMUST00000065539 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Trafd1Q3UDK1 Lca5l-202ENSMUST00000113804 3162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Trafd1Q3UDK1 Cutc-202ENSMUST00000112047 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Trafd1Q3UDK1 Gm6433-201ENSMUST00000118634 875 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Trafd1Q3UDK1 Sct-202ENSMUST00000167790 507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Trafd1Q3UDK1 Gm26643-201ENSMUST00000180854 1274 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Trafd1Q3UDK1 Lamtor5-202ENSMUST00000199317 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Trafd1Q3UDK1 Ndufa12-201ENSMUST00000020209 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Trafd1Q3UDK1 Gm3375-201ENSMUST00000203929 796 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Trafd1Q3UDK1 AC159205.3-201ENSMUST00000224614 874 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Trafd1Q3UDK1 Otx2os1-204ENSMUST00000227221 751 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Trafd1Q3UDK1 Sct-201ENSMUST00000046156 534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Trafd1Q3UDK1 Dgkz-202ENSMUST00000099709 3512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Trafd1Q3UDK1 Hey2-201ENSMUST00000019924 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Trafd1Q3UDK1 Klhdc8b-214ENSMUST00000195435 1612 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Trafd1Q3UDK1 Chic2-201ENSMUST00000075452 9699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Trafd1Q3UDK1 BC024978-204ENSMUST00000179391 1748 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Trafd1Q3UDK1 Chst10-206ENSMUST00000194361 2996 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Trafd1Q3UDK1 Kif17-204ENSMUST00000105821 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Trafd1Q3UDK1 Rerg-202ENSMUST00000117919 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Trafd1Q3UDK1 Hps5-202ENSMUST00000107653 4702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Trafd1Q3UDK1 Atp6v1b1-206ENSMUST00000206911 1591 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Trafd1Q3UDK1 Atp8b1-201ENSMUST00000025482 6440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Trafd1Q3UDK1 Tlk2-204ENSMUST00000106941 3699 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Trafd1Q3UDK1 Pten-201ENSMUST00000013807 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Trafd1Q3UDK1 Dbx1-201ENSMUST00000032717 2091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Trafd1Q3UDK1 Ush1c-208ENSMUST00000177212 1696 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Trafd1Q3UDK1 Eva1c-201ENSMUST00000037539 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Trafd1Q3UDK1 Dach1-201ENSMUST00000069334 5063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Trafd1Q3UDK1 Pdcd5-202ENSMUST00000120714 767 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Trafd1Q3UDK1 4833413E03Rik-201ENSMUST00000013706 1091 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Trafd1Q3UDK1 2210408F21Rik-211ENSMUST00000151800 750 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Trafd1Q3UDK1 Serf1-205ENSMUST00000152286 465 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Trafd1Q3UDK1 Gm10231-201ENSMUST00000181584 441 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Trafd1Q3UDK1 Atp5g2-202ENSMUST00000185641 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Trafd1Q3UDK1 4732471J01Rik-202ENSMUST00000205787 991 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Trafd1Q3UDK1 Gm10175-202ENSMUST00000208752 441 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Trafd1Q3UDK1 Atp5g2-201ENSMUST00000075630 441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Trafd1Q3UDK1 Kat2a-202ENSMUST00000103118 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Trafd1Q3UDK1 Adgrl1-205ENSMUST00000132500 5719 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Trafd1Q3UDK1 Mettl27-205ENSMUST00000111221 1796 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Trafd1Q3UDK1 Specc1-210ENSMUST00000201723 2690 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Trafd1Q3UDK1 Nipa2-201ENSMUST00000032635 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Trafd1Q3UDK1 Prss8-201ENSMUST00000032988 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Trafd1Q3UDK1 C130073E24Rik-201ENSMUST00000210222 6144 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Trafd1Q3UDK1 Ptbp2-213ENSMUST00000200097 3777 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Trafd1Q3UDK1 Gm1043-204ENSMUST00000207866 4296 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Trafd1Q3UDK1 Fmnl2-202ENSMUST00000050719 3380 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Trafd1Q3UDK1 Zpr1-206ENSMUST00000156440 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Trafd1Q3UDK1 Dhcr24-201ENSMUST00000047973 4028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Trafd1Q3UDK1 Pnkp-202ENSMUST00000098478 1550 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Trafd1Q3UDK1 Rasa2-201ENSMUST00000034984 5813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Trafd1Q3UDK1 Thegl-202ENSMUST00000117880 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Trafd1Q3UDK1 Apbb1-205ENSMUST00000187057 1630 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Trafd1Q3UDK1 Slc8a3-202ENSMUST00000085238 4927 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Trafd1Q3UDK1 Ehmt2-204ENSMUST00000114033 3882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Trafd1Q3UDK1 Sprn-201ENSMUST00000059241 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Trafd1Q3UDK1 Tbrg4-212ENSMUST00000189268 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Trafd1Q3UDK1 Rnf170-209ENSMUST00000209300 1881 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Trafd1Q3UDK1 Rcbtb2-217ENSMUST00000167401 868 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Trafd1Q3UDK1 Ccnd2-204ENSMUST00000201637 1006 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Trafd1Q3UDK1 Gm42884-202ENSMUST00000202523 423 ntTSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Trafd1Q3UDK1 Pgpep1-208ENSMUST00000211715 676 ntTSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Trafd1Q3UDK1 Rgcc-201ENSMUST00000022595 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Trafd1Q3UDK1 Mrpl21-202ENSMUST00000025745 1138 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Trafd1Q3UDK1 Nudt8-202ENSMUST00000025802 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Trafd1Q3UDK1 Gnas-202ENSMUST00000087871 3903 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Trafd1Q3UDK1 1700034J05Rik-202ENSMUST00000111622 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Trafd1Q3UDK1 E2f2-201ENSMUST00000061721 4739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Trafd1Q3UDK1 Tekt1-203ENSMUST00000108503 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Trafd1Q3UDK1 Dnajc2-201ENSMUST00000030771 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Trafd1Q3UDK1 Cnksr2-201ENSMUST00000026750 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Trafd1Q3UDK1 Tmem132c-201ENSMUST00000119026 5134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Trafd1Q3UDK1 Prkag2-203ENSMUST00000114975 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Trafd1Q3UDK1 Il6st-206ENSMUST00000183886 3004 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Trafd1Q3UDK1 Rasgef1b-205ENSMUST00000161148 2430 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Trafd1Q3UDK1 Rd3-203ENSMUST00000181512 1760 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.21
Trafd1Q3UDK1 Sh3yl1-201ENSMUST00000020997 1750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Trafd1Q3UDK1 Mta1-203ENSMUST00000109723 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.21
Trafd1Q3UDK1 Mta1-204ENSMUST00000109726 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Trafd1Q3UDK1 Mta1-205ENSMUST00000109727 2789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 103.7 ms