Protein–RNA interactions for Protein: Q3U4B1

Ssbp4, Single stranded DNA binding protein 4, isoform CRA_b, mousemouse

Predictions only

Length 363 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ssbp4Q3U4B1 Ogfod3-201ENSMUST00000026169 1308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Ssbp4Q3U4B1 Whrn-205ENSMUST00000095038 2665 ntTSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Ssbp4Q3U4B1 Cd302-202ENSMUST00000074606 1354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Ssbp4Q3U4B1 Phtf1-203ENSMUST00000090685 3006 ntTSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Ssbp4Q3U4B1 Wt1-205ENSMUST00000143043 3090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Ssbp4Q3U4B1 Vac14-201ENSMUST00000034190 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Ssbp4Q3U4B1 Hmbs-201ENSMUST00000077353 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Ssbp4Q3U4B1 Prkar2a-201ENSMUST00000035220 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Ssbp4Q3U4B1 Timm44-201ENSMUST00000003029 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Ssbp4Q3U4B1 Mst1-204ENSMUST00000162886 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.78□□□□□ -0.2
Ssbp4Q3U4B1 Dnm1-216ENSMUST00000201494 2732 ntTSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.2
Ssbp4Q3U4B1 Arhgef16-201ENSMUST00000030898 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.2
Ssbp4Q3U4B1 Fzd5-201ENSMUST00000063982 6915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.2
Ssbp4Q3U4B1 Ino80e-203ENSMUST00000106343 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Ssbp4Q3U4B1 Kif21a-204ENSMUST00000109287 6124 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Ssbp4Q3U4B1 Mfsd10-203ENSMUST00000114331 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Ssbp4Q3U4B1 Gss-203ENSMUST00000130881 1724 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Ssbp4Q3U4B1 Hand1-203ENSMUST00000160392 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Ssbp4Q3U4B1 Fgfr1-214ENSMUST00000178276 4741 ntTSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.21
Ssbp4Q3U4B1 Gm26644-201ENSMUST00000181365 958 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Ssbp4Q3U4B1 Anks1b-219ENSMUST00000182600 1697 ntTSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.21
Ssbp4Q3U4B1 Gm29246-201ENSMUST00000189221 349 ntTSL 3 BASIC13.77□□□□□ -0.21
Ssbp4Q3U4B1 Tm4sf5-201ENSMUST00000019063 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Ssbp4Q3U4B1 Gm29103-201ENSMUST00000191034 598 ntTSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.21
Ssbp4Q3U4B1 Cep83-201ENSMUST00000020212 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Ssbp4Q3U4B1 Hs3st2-202ENSMUST00000206880 1149 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Ssbp4Q3U4B1 Zfp524-203ENSMUST00000209030 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.21
Ssbp4Q3U4B1 Cbr2-201ENSMUST00000026148 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Ssbp4Q3U4B1 B3gnt4-201ENSMUST00000031384 1423 ntAPPRIS P1 BASIC13.77□□□□□ -0.21
Ssbp4Q3U4B1 Qprt-201ENSMUST00000032912 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Ssbp4Q3U4B1 Polr2f-201ENSMUST00000040077 543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Ssbp4Q3U4B1 Fezf1-201ENSMUST00000031709 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Ssbp4Q3U4B1 Gm19439-201ENSMUST00000198195 2273 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
Ssbp4Q3U4B1 Ing1-207ENSMUST00000211007 2241 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Ssbp4Q3U4B1 Ell2-201ENSMUST00000001583 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Ssbp4Q3U4B1 Ruvbl2-201ENSMUST00000107771 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Ssbp4Q3U4B1 Mcl1-201ENSMUST00000037947 3418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Ssbp4Q3U4B1 Cend1-201ENSMUST00000084436 1672 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Ssbp4Q3U4B1 Efemp2-204ENSMUST00000165485 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Ssbp4Q3U4B1 Ndufv2-203ENSMUST00000143987 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Ssbp4Q3U4B1 Tcf7l2-203ENSMUST00000111646 2839 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Ssbp4Q3U4B1 Eepd1-201ENSMUST00000040677 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Ssbp4Q3U4B1 Nploc4-202ENSMUST00000103017 4025 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Ssbp4Q3U4B1 Mlxip-202ENSMUST00000111596 2653 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Ssbp4Q3U4B1 Slc25a3-206ENSMUST00000170810 1341 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Ssbp4Q3U4B1 Selenoh-201ENSMUST00000102646 783 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Ssbp4Q3U4B1 Bex1-203ENSMUST00000113120 718 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Ssbp4Q3U4B1 Gm12216-201ENSMUST00000117316 1152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Ssbp4Q3U4B1 Oip5-202ENSMUST00000123818 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Ssbp4Q3U4B1 Pym1-202ENSMUST00000163377 1158 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Ssbp4Q3U4B1 Mir8098-201ENSMUST00000184011 137 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
Ssbp4Q3U4B1 AV026068-207ENSMUST00000187718 400 ntTSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Ssbp4Q3U4B1 Selenoh-206ENSMUST00000189988 390 ntTSL 3 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Ssbp4Q3U4B1 Gm44454-201ENSMUST00000198541 138 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
Ssbp4Q3U4B1 AC114585.2-202ENSMUST00000228094 426 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
Ssbp4Q3U4B1 Mgarp-201ENSMUST00000038154 1232 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Ssbp4Q3U4B1 Slc6a17-208ENSMUST00000169449 6322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Ssbp4Q3U4B1 Slc6a17-201ENSMUST00000029499 6308 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Ssbp4Q3U4B1 Prdm11-201ENSMUST00000111272 3012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Ssbp4Q3U4B1 Mroh5-201ENSMUST00000071419 2766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Ssbp4Q3U4B1 Gck-202ENSMUST00000109822 1786 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Ssbp4Q3U4B1 Cables1-201ENSMUST00000046948 3202 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Ssbp4Q3U4B1 Slc39a1-201ENSMUST00000015467 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Ssbp4Q3U4B1 Myo9b-206ENSMUST00000212935 6316 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Ssbp4Q3U4B1 Emd-201ENSMUST00000002029 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Ssbp4Q3U4B1 Matn4-201ENSMUST00000103103 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Ssbp4Q3U4B1 Fmnl3-202ENSMUST00000088233 4423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Ssbp4Q3U4B1 Gm14261-201ENSMUST00000145105 1429 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Ssbp4Q3U4B1 Ubl7-201ENSMUST00000163329 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Ssbp4Q3U4B1 Syne4-208ENSMUST00000176304 1006 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Ssbp4Q3U4B1 Vsig2-201ENSMUST00000002008 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Ssbp4Q3U4B1 Fcnb-201ENSMUST00000028179 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Ssbp4Q3U4B1 Rbpms-213ENSMUST00000191473 2547 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Ssbp4Q3U4B1 Adgrl1-201ENSMUST00000045393 5643 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Ssbp4Q3U4B1 Elk4-202ENSMUST00000086556 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Ssbp4Q3U4B1 Ptn-201ENSMUST00000101534 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Ssbp4Q3U4B1 Sar1a-201ENSMUST00000020285 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Ssbp4Q3U4B1 Coil-201ENSMUST00000036649 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Ssbp4Q3U4B1 Ankrd9-202ENSMUST00000128353 2577 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Ssbp4Q3U4B1 Msmo1-201ENSMUST00000034015 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Ssbp4Q3U4B1 Cnksr1-201ENSMUST00000030645 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Ssbp4Q3U4B1 Lonrf1-201ENSMUST00000065297 3930 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Ssbp4Q3U4B1 Meis2-202ENSMUST00000074285 2844 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Ssbp4Q3U4B1 Smpd5-202ENSMUST00000163991 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Ssbp4Q3U4B1 Nosip-201ENSMUST00000003513 1814 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Ssbp4Q3U4B1 St8sia5-201ENSMUST00000075290 1841 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Ssbp4Q3U4B1 Nrbp1-207ENSMUST00000202576 2221 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Ssbp4Q3U4B1 Nrbp1-201ENSMUST00000031034 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Ssbp4Q3U4B1 Tsacc-202ENSMUST00000107556 584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Ssbp4Q3U4B1 Pih1d1-202ENSMUST00000107811 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Ssbp4Q3U4B1 Gm15165-201ENSMUST00000118140 502 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
Ssbp4Q3U4B1 Platr15-201ENSMUST00000147128 768 ntTSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Ssbp4Q3U4B1 Rnf5-201ENSMUST00000015622 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Ssbp4Q3U4B1 Syngr2-206ENSMUST00000177131 935 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Ssbp4Q3U4B1 AC153556.1-201ENSMUST00000215135 794 ntTSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Ssbp4Q3U4B1 Rhoc-201ENSMUST00000002303 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Ssbp4Q3U4B1 Sytl3-201ENSMUST00000097430 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Ssbp4Q3U4B1 Rhog-201ENSMUST00000098230 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Ssbp4Q3U4B1 Papola-203ENSMUST00000163473 2544 ntTSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Ssbp4Q3U4B1 Gm43702-201ENSMUST00000198772 2546 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.4 ms