Protein–RNA interactions for Protein: Q3U435

Mmp25, Matrix metalloproteinase-25, mousemouse

Predictions only

Length 615 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mmp25Q3U435 Sfrp1-201ENSMUST00000033952 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Mmp25Q3U435 Piezo2-201ENSMUST00000046860 2849 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Mmp25Q3U435 Ppp2r5d-201ENSMUST00000002839 2926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Mmp25Q3U435 Tpm2-203ENSMUST00000107914 1164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Mmp25Q3U435 Rpl18-204ENSMUST00000209693 535 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Mmp25Q3U435 Npcd-201ENSMUST00000023060 1162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Mmp25Q3U435 Mif4gd-201ENSMUST00000021087 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Mmp25Q3U435 Sart3-201ENSMUST00000019118 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Mmp25Q3U435 Olah-203ENSMUST00000194918 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Mmp25Q3U435 Rab7-203ENSMUST00000113597 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Mmp25Q3U435 Letm1-203ENSMUST00000148451 2478 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Mmp25Q3U435 Anks1-202ENSMUST00000088027 6781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Mmp25Q3U435 Agk-201ENSMUST00000031977 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Mmp25Q3U435 Mid1ip1-202ENSMUST00000115524 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Mmp25Q3U435 Kptn-201ENSMUST00000006178 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Mmp25Q3U435 Ttl-201ENSMUST00000035812 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Mmp25Q3U435 Gm26580-201ENSMUST00000181002 2095 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Mmp25Q3U435 Cdc27-202ENSMUST00000106961 1863 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Mmp25Q3U435 Nfe2-208ENSMUST00000149111 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Mmp25Q3U435 Ppp2r5e-201ENSMUST00000021447 4810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Mmp25Q3U435 Smad1-202ENSMUST00000066091 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Mmp25Q3U435 Sorcs3-201ENSMUST00000078880 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Mmp25Q3U435 Cacna1c-216ENSMUST00000188522 7338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Mmp25Q3U435 Sirt7-202ENSMUST00000106183 427 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Mmp25Q3U435 Dbndd2-204ENSMUST00000109350 1055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Mmp25Q3U435 Dpy30-201ENSMUST00000112571 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Mmp25Q3U435 4930401G09Rik-201ENSMUST00000139500 637 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Mmp25Q3U435 Mocs1-202ENSMUST00000165390 729 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Mmp25Q3U435 Rbm4-203ENSMUST00000178615 1018 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Mmp25Q3U435 Lce1k-201ENSMUST00000179917 663 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Mmp25Q3U435 Otx2os1-206ENSMUST00000228153 787 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Mmp25Q3U435 Upk3a-201ENSMUST00000023070 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Mmp25Q3U435 Tesc-201ENSMUST00000031304 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Mmp25Q3U435 Cebpzos-201ENSMUST00000063817 753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Mmp25Q3U435 Olfr601-201ENSMUST00000080474 990 ntAPPRIS P1 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Mmp25Q3U435 Spata6-201ENSMUST00000038868 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Mmp25Q3U435 Kdf1-201ENSMUST00000042919 1708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Mmp25Q3U435 Abcb10-201ENSMUST00000075578 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Mmp25Q3U435 Krt28-201ENSMUST00000006963 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Mmp25Q3U435 Slc27a4-201ENSMUST00000080065 4054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Mmp25Q3U435 Hsd17b1-201ENSMUST00000019445 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Mmp25Q3U435 Cdv3-207ENSMUST00000190226 3107 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Mmp25Q3U435 Luc7l2-208ENSMUST00000161538 4253 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Mmp25Q3U435 Zfp710-201ENSMUST00000049680 4721 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Mmp25Q3U435 Dach1-201ENSMUST00000069334 5063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Mmp25Q3U435 Slc39a1-201ENSMUST00000015467 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Mmp25Q3U435 Bcor-202ENSMUST00000065143 6839 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Mmp25Q3U435 Klf14-201ENSMUST00000101589 3056 ntAPPRIS P1 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Mmp25Q3U435 Sf1-202ENSMUST00000113487 2649 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Mmp25Q3U435 E230001N04Rik-202ENSMUST00000181029 2091 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Mmp25Q3U435 0610010K14Rik-207ENSMUST00000108577 659 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Mmp25Q3U435 2310009B15Rik-201ENSMUST00000112025 565 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Mmp25Q3U435 Olfr129-201ENSMUST00000122318 993 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Mmp25Q3U435 Rnf13-209ENSMUST00000199041 1062 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Mmp25Q3U435 1810010D01Rik-204ENSMUST00000208788 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Mmp25Q3U435 Rpp25l-201ENSMUST00000038434 856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Mmp25Q3U435 Alkbh2-201ENSMUST00000053657 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Mmp25Q3U435 Tbxas1-201ENSMUST00000003017 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Mmp25Q3U435 Yipf2-204ENSMUST00000213809 1883 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Mmp25Q3U435 E330011M16Rik-201ENSMUST00000193614 1794 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Mmp25Q3U435 Tmem267-205ENSMUST00000223912 1789 ntAPPRIS P1 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Mmp25Q3U435 Cacna1b-204ENSMUST00000102939 9736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Mmp25Q3U435 Haghl-201ENSMUST00000077938 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Mmp25Q3U435 Gja4-201ENSMUST00000053753 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Mmp25Q3U435 Hoxaas2-202ENSMUST00000155922 1567 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Mmp25Q3U435 Sema6c-214ENSMUST00000202315 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Mmp25Q3U435 Gm13283-201ENSMUST00000191112 1463 ntAPPRIS P1 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Mmp25Q3U435 Otud5-202ENSMUST00000115665 3821 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Mmp25Q3U435 BC051019-202ENSMUST00000106735 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Mmp25Q3U435 Fbxl21-201ENSMUST00000045428 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Mmp25Q3U435 Slc16a3-202ENSMUST00000100130 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Mmp25Q3U435 Aptx-203ENSMUST00000108103 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Mmp25Q3U435 Gm17509-201ENSMUST00000165680 2375 ntAPPRIS P1 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Mmp25Q3U435 Parg-208ENSMUST00000170840 2894 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Mmp25Q3U435 Lrig3-201ENSMUST00000074807 4016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Mmp25Q3U435 Uri1-201ENSMUST00000085513 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Mmp25Q3U435 Gm15234-201ENSMUST00000141485 1058 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Mmp25Q3U435 Nsmf-203ENSMUST00000100334 2957 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Mmp25Q3U435 4933434E20Rik-209ENSMUST00000162114 1411 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Mmp25Q3U435 Hspa8-201ENSMUST00000015800 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Mmp25Q3U435 Slc2a8-201ENSMUST00000028129 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Mmp25Q3U435 Chsy3-201ENSMUST00000080721 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Mmp25Q3U435 Gnb2-203ENSMUST00000111023 1471 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Mmp25Q3U435 Rab35-201ENSMUST00000031492 2820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.06
Mmp25Q3U435 Cdv3-202ENSMUST00000072249 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Mmp25Q3U435 Ptn-201ENSMUST00000101534 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Mmp25Q3U435 Pla2g2c-201ENSMUST00000030530 1618 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Mmp25Q3U435 Taok3-203ENSMUST00000111978 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Mmp25Q3U435 Rps6ka1-202ENSMUST00000105894 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Mmp25Q3U435 Ccdc174-201ENSMUST00000037783 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Mmp25Q3U435 Ap1s1-201ENSMUST00000111080 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Mmp25Q3U435 Tssc4-206ENSMUST00000177841 1364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Mmp25Q3U435 Hspb6-201ENSMUST00000044048 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Mmp25Q3U435 Shroom4-202ENSMUST00000103005 4839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Mmp25Q3U435 Mark3-201ENSMUST00000075281 3321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Mmp25Q3U435 Dcdc2c-206ENSMUST00000221349 2209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Mmp25Q3U435 Rap2a-201ENSMUST00000062117 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Mmp25Q3U435 Tuba1c-201ENSMUST00000058914 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Mmp25Q3U435 Ciao1-204ENSMUST00000174030 1109 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Mmp25Q3U435 Hist1h2bc-201ENSMUST00000018246 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.3 ms