Protein–RNA interactions for Protein: Q3U2P1

Sec24a, Protein transport protein Sec24A, mousemouse

Predictions only

Length 1,090 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sec24aQ3U2P1 Gm36967-201ENSMUST00000193814 266 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Sec24aQ3U2P1 1810010D01Rik-204ENSMUST00000208788 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Sec24aQ3U2P1 Rpl18-204ENSMUST00000209693 535 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Sec24aQ3U2P1 Upk3a-201ENSMUST00000023070 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Sec24aQ3U2P1 Tesc-201ENSMUST00000031304 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Sec24aQ3U2P1 Hist1h2ba-201ENSMUST00000052776 384 ntAPPRIS P1 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Sec24aQ3U2P1 Alkbh2-201ENSMUST00000053657 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Sec24aQ3U2P1 Gm10819-201ENSMUST00000099988 561 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Sec24aQ3U2P1 Krt28-201ENSMUST00000006963 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Sec24aQ3U2P1 Tbxas1-201ENSMUST00000003017 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Sec24aQ3U2P1 Whrn-206ENSMUST00000102867 4013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Sec24aQ3U2P1 Cdc27-202ENSMUST00000106961 1863 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Sec24aQ3U2P1 Haghl-201ENSMUST00000077938 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Sec24aQ3U2P1 Acss2-201ENSMUST00000029135 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Sec24aQ3U2P1 Rab37-202ENSMUST00000067754 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Sec24aQ3U2P1 Kptn-201ENSMUST00000006178 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Sec24aQ3U2P1 Csk-201ENSMUST00000034863 2749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Sec24aQ3U2P1 Rasgef1b-205ENSMUST00000161148 2430 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Sec24aQ3U2P1 Dpy30-201ENSMUST00000112571 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Sec24aQ3U2P1 E2f7-205ENSMUST00000173634 827 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Sec24aQ3U2P1 Gm26644-201ENSMUST00000181365 958 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Sec24aQ3U2P1 Npcd-201ENSMUST00000023060 1162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Sec24aQ3U2P1 Stradb-201ENSMUST00000027185 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Sec24aQ3U2P1 Ube2t-201ENSMUST00000027687 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Sec24aQ3U2P1 Slc2a8-201ENSMUST00000028129 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Sec24aQ3U2P1 Gnb2-203ENSMUST00000111023 1471 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Sec24aQ3U2P1 Krt6a-201ENSMUST00000023788 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Sec24aQ3U2P1 Kdf1-201ENSMUST00000042919 1708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Sec24aQ3U2P1 Zic1-201ENSMUST00000034927 5606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Sec24aQ3U2P1 Cdv3-202ENSMUST00000072249 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Sec24aQ3U2P1 Pigz-201ENSMUST00000052174 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Sec24aQ3U2P1 Cpox-201ENSMUST00000060077 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Sec24aQ3U2P1 Proca1-203ENSMUST00000108317 1359 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Sec24aQ3U2P1 Ap1s1-201ENSMUST00000111080 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Sec24aQ3U2P1 Dlgap1-206ENSMUST00000133717 2355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Sec24aQ3U2P1 Mif4gd-201ENSMUST00000021087 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Sec24aQ3U2P1 Pla2g2c-201ENSMUST00000030530 1618 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Sec24aQ3U2P1 Hspb6-201ENSMUST00000044048 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Sec24aQ3U2P1 Fam171a2-201ENSMUST00000049057 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Sec24aQ3U2P1 Fam199x-201ENSMUST00000047852 8299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Sec24aQ3U2P1 Irgc1-204ENSMUST00000205776 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Sec24aQ3U2P1 Hoxaas2-202ENSMUST00000155922 1567 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Sec24aQ3U2P1 Rab6a-201ENSMUST00000032946 3214 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Sec24aQ3U2P1 Zfp746-201ENSMUST00000073124 3651 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Sec24aQ3U2P1 E330011M16Rik-201ENSMUST00000193614 1794 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Sec24aQ3U2P1 Olah-203ENSMUST00000194918 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Sec24aQ3U2P1 Dcdc2c-206ENSMUST00000221349 2209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Sec24aQ3U2P1 Rala-201ENSMUST00000009003 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Sec24aQ3U2P1 BC051019-202ENSMUST00000106735 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Sec24aQ3U2P1 Otud5-202ENSMUST00000115665 3821 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Sec24aQ3U2P1 Rbm4-203ENSMUST00000178615 1018 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Sec24aQ3U2P1 Celrr-203ENSMUST00000185678 937 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Sec24aQ3U2P1 Ank2-226ENSMUST00000189368 339 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Sec24aQ3U2P1 Gm10459-201ENSMUST00000202708 1155 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Sec24aQ3U2P1 Krt10-202ENSMUST00000211768 557 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Sec24aQ3U2P1 Cep104-201ENSMUST00000047497 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Sec24aQ3U2P1 Snx27-201ENSMUST00000029783 6261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Sec24aQ3U2P1 Elk4-202ENSMUST00000086556 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Sec24aQ3U2P1 Miga1-205ENSMUST00000199397 2842 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Sec24aQ3U2P1 Yipf2-204ENSMUST00000213809 1883 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Sec24aQ3U2P1 Gnaz-201ENSMUST00000037813 3519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Sec24aQ3U2P1 A830018L16Rik-208ENSMUST00000171690 6158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Sec24aQ3U2P1 Ccdc174-201ENSMUST00000037783 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Sec24aQ3U2P1 Fbxl21-201ENSMUST00000045428 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Sec24aQ3U2P1 Irx4-202ENSMUST00000176684 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Sec24aQ3U2P1 Dok4-201ENSMUST00000046461 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Sec24aQ3U2P1 Rbm12b2-202ENSMUST00000095143 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Sec24aQ3U2P1 Zswim8-201ENSMUST00000022358 6073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Sec24aQ3U2P1 Zfp326-201ENSMUST00000031227 2667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Sec24aQ3U2P1 Gm27357-201ENSMUST00000183754 135 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Sec24aQ3U2P1 Tfdp2-206ENSMUST00000185644 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Sec24aQ3U2P1 Rnf121-202ENSMUST00000096639 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Sec24aQ3U2P1 Tubg1-201ENSMUST00000043680 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Sec24aQ3U2P1 Ubfd1-201ENSMUST00000033158 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Sec24aQ3U2P1 Kdm2a-202ENSMUST00000075856 7242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Sec24aQ3U2P1 Tmem267-205ENSMUST00000223912 1789 ntAPPRIS P1 BASIC16■□□□□ 0.15
Sec24aQ3U2P1 Tssc4-206ENSMUST00000177841 1364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
Sec24aQ3U2P1 Arhgap39-202ENSMUST00000077821 4494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Sec24aQ3U2P1 Gm45244-201ENSMUST00000211328 2200 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Sec24aQ3U2P1 Gpsm3-201ENSMUST00000038244 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Sec24aQ3U2P1 Gja4-201ENSMUST00000053753 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Sec24aQ3U2P1 Atg5-201ENSMUST00000039286 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Sec24aQ3U2P1 Gm13283-201ENSMUST00000191112 1463 ntAPPRIS P1 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Sec24aQ3U2P1 Large1-204ENSMUST00000212459 4746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Sec24aQ3U2P1 Tuba1c-201ENSMUST00000058914 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Sec24aQ3U2P1 Zfand5-201ENSMUST00000025659 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Sec24aQ3U2P1 Krtap1-4-201ENSMUST00000100479 593 ntAPPRIS P1 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Sec24aQ3U2P1 Mir3081-201ENSMUST00000175305 84 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Sec24aQ3U2P1 Gm17807-201ENSMUST00000186869 298 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Sec24aQ3U2P1 Rnf13-209ENSMUST00000199041 1062 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Sec24aQ3U2P1 Jagn1-202ENSMUST00000204254 1147 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Sec24aQ3U2P1 Etfb-201ENSMUST00000004729 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Sec24aQ3U2P1 Il11ra1-204ENSMUST00000108042 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Sec24aQ3U2P1 Mfsd10-203ENSMUST00000114331 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Sec24aQ3U2P1 Dbnl-202ENSMUST00000102928 2295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Sec24aQ3U2P1 4933434E20Rik-209ENSMUST00000162114 1411 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Sec24aQ3U2P1 Babam1-201ENSMUST00000002473 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Sec24aQ3U2P1 Susd1-202ENSMUST00000107544 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Sec24aQ3U2P1 Cgn-204ENSMUST00000155485 2361 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Sec24aQ3U2P1 Tbp-201ENSMUST00000014911 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.3 ms