Protein–RNA interactions for Protein: Q3U0S6

Rasip1, Ras-interacting protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 961 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rasip1Q3U0S6 Yipf2-202ENSMUST00000078572 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Rasip1Q3U0S6 Foxp4-204ENSMUST00000113265 3999 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Rasip1Q3U0S6 Wnt4-201ENSMUST00000045747 4194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Rasip1Q3U0S6 Eps8-201ENSMUST00000058210 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Rasip1Q3U0S6 Cadm1-204ENSMUST00000114548 4482 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Rasip1Q3U0S6 Zhx1-202ENSMUST00000110168 5212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Rasip1Q3U0S6 Gm15165-201ENSMUST00000118140 502 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
Rasip1Q3U0S6 Fcnb-201ENSMUST00000028179 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Rasip1Q3U0S6 Pkp4-202ENSMUST00000102754 4614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Rasip1Q3U0S6 Lrrc47-205ENSMUST00000169622 3468 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Rasip1Q3U0S6 Erich2-203ENSMUST00000134607 1659 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Rasip1Q3U0S6 E230001N04Rik-202ENSMUST00000181029 2091 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
Rasip1Q3U0S6 Antxr2-202ENSMUST00000199088 2739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Rasip1Q3U0S6 Large2-215ENSMUST00000176810 2477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Rasip1Q3U0S6 Rhof-201ENSMUST00000031401 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Rasip1Q3U0S6 Jam2-201ENSMUST00000098407 1998 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Rasip1Q3U0S6 Cpox-201ENSMUST00000060077 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Rasip1Q3U0S6 Mfsd10-203ENSMUST00000114331 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Rasip1Q3U0S6 Rassf1-204ENSMUST00000122225 1783 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Rasip1Q3U0S6 Pus1-204ENSMUST00000112426 1389 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Rasip1Q3U0S6 Lrig1-201ENSMUST00000032105 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Rasip1Q3U0S6 Scarf2-201ENSMUST00000012161 3302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Rasip1Q3U0S6 Dlgap1-206ENSMUST00000133717 2355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Rasip1Q3U0S6 Rala-201ENSMUST00000009003 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Rasip1Q3U0S6 Kctd14-202ENSMUST00000121987 1210 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Rasip1Q3U0S6 Gm18206-201ENSMUST00000207027 926 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
Rasip1Q3U0S6 Gm6376-201ENSMUST00000209407 580 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
Rasip1Q3U0S6 AC133183.1-201ENSMUST00000221229 429 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Rasip1Q3U0S6 Eml2-203ENSMUST00000120595 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Rasip1Q3U0S6 Jdp2-202ENSMUST00000171754 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Rasip1Q3U0S6 Runx1t1-201ENSMUST00000006761 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Rasip1Q3U0S6 Rnf157-201ENSMUST00000100202 4619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Rasip1Q3U0S6 Cpeb2-204ENSMUST00000166713 6846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Rasip1Q3U0S6 4930455H04Rik-201ENSMUST00000117592 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Rasip1Q3U0S6 Rassf1-202ENSMUST00000093786 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Rasip1Q3U0S6 Gm36858-201ENSMUST00000194501 2391 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
Rasip1Q3U0S6 Tm9sf1-205ENSMUST00000122358 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Rasip1Q3U0S6 Amfr-201ENSMUST00000053766 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Rasip1Q3U0S6 Tbxas1-201ENSMUST00000003017 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Rasip1Q3U0S6 Pcbp4-201ENSMUST00000024260 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Rasip1Q3U0S6 Sbf1-201ENSMUST00000123791 6190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Rasip1Q3U0S6 Sdhb-201ENSMUST00000010007 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Rasip1Q3U0S6 Gm7862-201ENSMUST00000121461 292 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
Rasip1Q3U0S6 AC140264.2-201ENSMUST00000219668 289 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Rasip1Q3U0S6 Vopp1-201ENSMUST00000114297 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Rasip1Q3U0S6 Cmtm3-201ENSMUST00000034343 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Rasip1Q3U0S6 BC051019-202ENSMUST00000106735 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Rasip1Q3U0S6 Ocel1-203ENSMUST00000110052 5285 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Rasip1Q3U0S6 Ppp3cb-206ENSMUST00000161989 2322 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Rasip1Q3U0S6 Lrrfip2-202ENSMUST00000098340 3191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Rasip1Q3U0S6 Pcdhac2-201ENSMUST00000047479 5888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Rasip1Q3U0S6 1700066B19Rik-201ENSMUST00000097617 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Rasip1Q3U0S6 Zfp24-203ENSMUST00000153337 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Rasip1Q3U0S6 Btnl9-201ENSMUST00000046522 5273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Rasip1Q3U0S6 Dusp8-201ENSMUST00000039926 4804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Rasip1Q3U0S6 Dclk2-208ENSMUST00000194452 2066 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Rasip1Q3U0S6 Cdca7-201ENSMUST00000102691 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Rasip1Q3U0S6 Sgsm1-204ENSMUST00000112325 2274 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Rasip1Q3U0S6 Casp3-204ENSMUST00000211115 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Rasip1Q3U0S6 Zkscan6-202ENSMUST00000071465 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Rasip1Q3U0S6 Inip-202ENSMUST00000107526 1438 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Rasip1Q3U0S6 Fiz1-208ENSMUST00000208944 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Rasip1Q3U0S6 Map4k5-210ENSMUST00000171211 4334 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Rasip1Q3U0S6 Gm5712-201ENSMUST00000199748 1043 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
Rasip1Q3U0S6 Gm44430-201ENSMUST00000203376 995 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
Rasip1Q3U0S6 Lat-206ENSMUST00000206793 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Rasip1Q3U0S6 Rfc4-201ENSMUST00000023598 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Rasip1Q3U0S6 Ewsr1-203ENSMUST00000079949 2588 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Rasip1Q3U0S6 Ttyh1-217ENSMUST00000206869 1491 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Rasip1Q3U0S6 Zfand5-201ENSMUST00000025659 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Rasip1Q3U0S6 Opn4-202ENSMUST00000168444 2075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Rasip1Q3U0S6 Ggnbp2-201ENSMUST00000018547 2478 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Rasip1Q3U0S6 Ovol2-202ENSMUST00000103171 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Rasip1Q3U0S6 Iqck-201ENSMUST00000098087 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Rasip1Q3U0S6 Gatc-201ENSMUST00000139167 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Rasip1Q3U0S6 Slc46a1-201ENSMUST00000001126 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Rasip1Q3U0S6 Slc29a1-202ENSMUST00000064889 1988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Rasip1Q3U0S6 Tmem260-209ENSMUST00000226422 6333 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Rasip1Q3U0S6 Slc29a1-222ENSMUST00000171847 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Rasip1Q3U0S6 Nrn1-201ENSMUST00000037623 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Rasip1Q3U0S6 Hmbs-201ENSMUST00000077353 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Rasip1Q3U0S6 Dguok-202ENSMUST00000113888 1007 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Rasip1Q3U0S6 Enkd1-201ENSMUST00000013299 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Rasip1Q3U0S6 Dguok-201ENSMUST00000014698 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Rasip1Q3U0S6 Tsfm-207ENSMUST00000152054 655 ntTSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Rasip1Q3U0S6 1600014C10Rik-209ENSMUST00000179992 568 ntTSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Rasip1Q3U0S6 4930477E14Rik-201ENSMUST00000181412 621 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Rasip1Q3U0S6 Rbck1-202ENSMUST00000109847 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Rasip1Q3U0S6 Rasgef1b-205ENSMUST00000161148 2430 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Rasip1Q3U0S6 Zkscan2-203ENSMUST00000128217 2218 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Rasip1Q3U0S6 Hoxaas2-202ENSMUST00000155922 1567 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Rasip1Q3U0S6 Zfp668-203ENSMUST00000106262 3169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Rasip1Q3U0S6 Fcho1-209ENSMUST00000146100 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Rasip1Q3U0S6 Gm8839-201ENSMUST00000121279 1645 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
Rasip1Q3U0S6 Gnas-222ENSMUST00000180362 1645 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Rasip1Q3U0S6 Pacs2-202ENSMUST00000220541 3101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Rasip1Q3U0S6 B3gat2-203ENSMUST00000144602 1488 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Rasip1Q3U0S6 Sbf2-213ENSMUST00000171218 1476 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Rasip1Q3U0S6 Naif1-201ENSMUST00000048431 4650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Rasip1Q3U0S6 Pex11a-201ENSMUST00000032761 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.9 ms