Protein–RNA interactions for Protein: Q3U0M1

Trappc9, Trafficking protein particle complex subunit 9, mousemouse

Predictions only

Length 1,148 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trappc9Q3U0M1 Gm12963-201ENSMUST00000131846 783 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Trappc9Q3U0M1 2410004I01Rik-201ENSMUST00000138424 1187 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Trappc9Q3U0M1 Rnf5-201ENSMUST00000015622 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Trappc9Q3U0M1 Rprl3-201ENSMUST00000157400 290 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
Trappc9Q3U0M1 Rnf13-209ENSMUST00000199041 1062 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Trappc9Q3U0M1 Ppp1r3f-205ENSMUST00000150787 4760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Trappc9Q3U0M1 Nmt2-203ENSMUST00000102989 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Trappc9Q3U0M1 Pigl-201ENSMUST00000014389 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Trappc9Q3U0M1 Col11a2-203ENSMUST00000114255 5722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Trappc9Q3U0M1 Fam159b-201ENSMUST00000043061 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Trappc9Q3U0M1 Adck1-204ENSMUST00000222695 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Trappc9Q3U0M1 Smpd5-202ENSMUST00000163991 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Trappc9Q3U0M1 Matn4-201ENSMUST00000103103 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Trappc9Q3U0M1 Uso1-204ENSMUST00000202155 3707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Trappc9Q3U0M1 Kmt5b-202ENSMUST00000052699 3290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Trappc9Q3U0M1 Homez-202ENSMUST00000142283 4713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Trappc9Q3U0M1 Rasgef1b-205ENSMUST00000161148 2430 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Trappc9Q3U0M1 Edem1-201ENSMUST00000089162 5817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Trappc9Q3U0M1 Psen2-205ENSMUST00000111108 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Trappc9Q3U0M1 Adprh-201ENSMUST00000002923 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Trappc9Q3U0M1 Lrrfip1-212ENSMUST00000189617 2155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Trappc9Q3U0M1 Slc35b2-202ENSMUST00000223987 1766 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
Trappc9Q3U0M1 Dhx32-201ENSMUST00000033290 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Trappc9Q3U0M1 Nadk2-202ENSMUST00000100789 3578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Trappc9Q3U0M1 Crocc-203ENSMUST00000102491 6582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Trappc9Q3U0M1 Nosip-201ENSMUST00000003513 1814 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Trappc9Q3U0M1 Cxcl12-202ENSMUST00000112866 1878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Trappc9Q3U0M1 Gm13054-201ENSMUST00000154192 820 ntTSL 3 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Trappc9Q3U0M1 5430416N02Rik-202ENSMUST00000181873 626 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Trappc9Q3U0M1 Tecr-201ENSMUST00000019382 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Trappc9Q3U0M1 Olfr571-201ENSMUST00000061738 969 ntAPPRIS P1 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Trappc9Q3U0M1 H2-D1-202ENSMUST00000172785 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Trappc9Q3U0M1 Shd-201ENSMUST00000044216 1546 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Trappc9Q3U0M1 Pard3-226ENSMUST00000162907 4682 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Trappc9Q3U0M1 Cbarp-201ENSMUST00000105369 3121 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Trappc9Q3U0M1 Efemp2-204ENSMUST00000165485 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Trappc9Q3U0M1 Tm7sf3-201ENSMUST00000037709 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Trappc9Q3U0M1 Hmbs-201ENSMUST00000077353 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Trappc9Q3U0M1 Coro1a-201ENSMUST00000032949 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Trappc9Q3U0M1 Mff-211ENSMUST00000161648 1715 ntTSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Trappc9Q3U0M1 Krt81-201ENSMUST00000061185 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Trappc9Q3U0M1 Zc3h14-203ENSMUST00000110104 3146 ntTSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Trappc9Q3U0M1 Gpr20-201ENSMUST00000064166 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Trappc9Q3U0M1 Dock3-201ENSMUST00000044532 9063 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Trappc9Q3U0M1 Gpr142-202ENSMUST00000106584 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Trappc9Q3U0M1 Gm12216-201ENSMUST00000117316 1152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Trappc9Q3U0M1 Gm17112-201ENSMUST00000163194 432 ntTSL 3 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Trappc9Q3U0M1 Gm26644-201ENSMUST00000181365 958 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Trappc9Q3U0M1 Gm27459-201ENSMUST00000184860 107 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
Trappc9Q3U0M1 AC153556.1-201ENSMUST00000215135 794 ntTSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Trappc9Q3U0M1 Cbr2-201ENSMUST00000026148 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Trappc9Q3U0M1 Gpr142-201ENSMUST00000045319 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Trappc9Q3U0M1 Gm7461-201ENSMUST00000058918 827 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
Trappc9Q3U0M1 Rev1-201ENSMUST00000027251 4262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Trappc9Q3U0M1 Bean1-204ENSMUST00000171018 3386 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Trappc9Q3U0M1 Stk35-202ENSMUST00000166282 5445 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Trappc9Q3U0M1 Hand1-203ENSMUST00000160392 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Trappc9Q3U0M1 Tmem57-201ENSMUST00000030628 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Trappc9Q3U0M1 Cdc42ep3-201ENSMUST00000068958 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Trappc9Q3U0M1 Dok7-202ENSMUST00000101298 2443 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Trappc9Q3U0M1 Synpo-205ENSMUST00000130044 4970 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Trappc9Q3U0M1 Ewsr1-203ENSMUST00000079949 2588 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Trappc9Q3U0M1 Strn-203ENSMUST00000145910 8629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
Trappc9Q3U0M1 Rasal2-201ENSMUST00000078308 10047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
Trappc9Q3U0M1 Lonrf2-202ENSMUST00000147695 6932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.29
Trappc9Q3U0M1 Tnks-201ENSMUST00000033929 9163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Trappc9Q3U0M1 Scml4-203ENSMUST00000105495 1033 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Trappc9Q3U0M1 Eif6-202ENSMUST00000109638 1382 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Trappc9Q3U0M1 Mettl27-204ENSMUST00000111219 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Trappc9Q3U0M1 Chchd2-ps-201ENSMUST00000117487 462 ntBASIC16.83■□□□□ 0.28
Trappc9Q3U0M1 Naf1-201ENSMUST00000118009 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Trappc9Q3U0M1 Btbd10-203ENSMUST00000119278 2394 ntTSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Trappc9Q3U0M1 Gm13830-201ENSMUST00000124378 417 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Trappc9Q3U0M1 2210408F21Rik-212ENSMUST00000152157 490 ntTSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Trappc9Q3U0M1 Kctd9-205ENSMUST00000152243 2528 ntTSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Trappc9Q3U0M1 Tgfb1i1-205ENSMUST00000165667 1812 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Trappc9Q3U0M1 Parg-208ENSMUST00000170840 2894 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Trappc9Q3U0M1 A930003O13Rik-203ENSMUST00000199056 1955 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Trappc9Q3U0M1 Vsig2-201ENSMUST00000002008 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Trappc9Q3U0M1 AC108846.1-201ENSMUST00000214531 513 ntBASIC16.83■□□□□ 0.28
Trappc9Q3U0M1 Ogfod3-201ENSMUST00000026169 1308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Trappc9Q3U0M1 Pla2g12b-201ENSMUST00000009790 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Trappc9Q3U0M1 Grk6-202ENSMUST00000099482 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Trappc9Q3U0M1 Iqsec2-202ENSMUST00000112604 5967 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Trappc9Q3U0M1 Foxp4-204ENSMUST00000113265 3999 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Trappc9Q3U0M1 Cwh43-201ENSMUST00000031040 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Trappc9Q3U0M1 Gm45774-201ENSMUST00000211992 2665 ntBASIC16.83■□□□□ 0.28
Trappc9Q3U0M1 Perp-201ENSMUST00000019998 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Trappc9Q3U0M1 Slc25a20-201ENSMUST00000035222 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Trappc9Q3U0M1 Prdm5-201ENSMUST00000031973 1488 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Trappc9Q3U0M1 Rala-201ENSMUST00000009003 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Trappc9Q3U0M1 Cldn7-203ENSMUST00000108596 664 ntTSL 3 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Trappc9Q3U0M1 Edf1-201ENSMUST00000015236 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Trappc9Q3U0M1 Gm5091-201ENSMUST00000181658 1179 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Trappc9Q3U0M1 Ssr2-205ENSMUST00000193934 569 ntTSL 3 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Trappc9Q3U0M1 Hs3st2-202ENSMUST00000206880 1149 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Trappc9Q3U0M1 Arhgap33-206ENSMUST00000208522 781 ntTSL 3 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Trappc9Q3U0M1 Nmu-201ENSMUST00000031146 828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Trappc9Q3U0M1 Ptp4a2-201ENSMUST00000030578 3646 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Trappc9Q3U0M1 Lrrc36-206ENSMUST00000216765 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 70.1 ms