Protein–RNA interactions for Protein: Q3TYX8

Rufy4, RUN and FYVE domain-containing protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 563 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rufy4Q3TYX8 Atp8b2-201ENSMUST00000069805 5559 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Rufy4Q3TYX8 Tm6sf2-201ENSMUST00000049197 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Rufy4Q3TYX8 Dusp8-201ENSMUST00000039926 4804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Rufy4Q3TYX8 Fip1l1-203ENSMUST00000113535 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Rufy4Q3TYX8 Gpaa1-201ENSMUST00000023221 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Rufy4Q3TYX8 Ybx2-202ENSMUST00000108601 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Rufy4Q3TYX8 Mif4gd-201ENSMUST00000021087 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Rufy4Q3TYX8 Shox2-202ENSMUST00000162060 1537 ntTSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Rufy4Q3TYX8 Rbm12b2-202ENSMUST00000095143 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Rufy4Q3TYX8 Gm7292-201ENSMUST00000194706 2527 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
Rufy4Q3TYX8 Shroom3-211ENSMUST00000225438 5742 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
Rufy4Q3TYX8 Prkcz-203ENSMUST00000105624 694 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Rufy4Q3TYX8 Gm15234-201ENSMUST00000141485 1058 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Rufy4Q3TYX8 Syngr2-206ENSMUST00000177131 935 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Rufy4Q3TYX8 5430416N02Rik-202ENSMUST00000181873 626 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Rufy4Q3TYX8 2010010A06Rik-202ENSMUST00000186356 694 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Rufy4Q3TYX8 Gm7461-201ENSMUST00000058918 827 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
Rufy4Q3TYX8 Rhog-201ENSMUST00000098230 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Rufy4Q3TYX8 Lrrc47-205ENSMUST00000169622 3468 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Rufy4Q3TYX8 Gm3248-201ENSMUST00000163885 2055 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Rufy4Q3TYX8 Ust-201ENSMUST00000061601 4228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Rufy4Q3TYX8 Smim10l1-201ENSMUST00000100864 2842 ntAPPRIS P1 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Rufy4Q3TYX8 Ndufs2-202ENSMUST00000111318 1545 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Rufy4Q3TYX8 Fiz1-208ENSMUST00000208944 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Rufy4Q3TYX8 Cd82-205ENSMUST00000116457 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Rufy4Q3TYX8 Tatdn2-202ENSMUST00000113022 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Rufy4Q3TYX8 Fam159b-201ENSMUST00000043061 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Rufy4Q3TYX8 E330011M16Rik-201ENSMUST00000193614 1794 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
Rufy4Q3TYX8 Gm15743-202ENSMUST00000182690 1901 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
Rufy4Q3TYX8 9330151L19Rik-201ENSMUST00000181850 2545 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Rufy4Q3TYX8 Zscan10-204ENSMUST00000118369 1006 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Rufy4Q3TYX8 Zbtb9-201ENSMUST00000120016 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Rufy4Q3TYX8 Jdp2-202ENSMUST00000171754 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Rufy4Q3TYX8 Flg-202ENSMUST00000178008 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Rufy4Q3TYX8 Erdr1-203ENSMUST00000179077 887 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Rufy4Q3TYX8 Flg-205ENSMUST00000179250 765 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Rufy4Q3TYX8 Flg-206ENSMUST00000179477 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Rufy4Q3TYX8 Stard3nl-208ENSMUST00000200323 1128 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Rufy4Q3TYX8 Adprh-201ENSMUST00000002923 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Rufy4Q3TYX8 Birc2-201ENSMUST00000054878 378 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
Rufy4Q3TYX8 Slc29a1-202ENSMUST00000064889 1988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Rufy4Q3TYX8 Rgs6-206ENSMUST00000186309 1693 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
Rufy4Q3TYX8 Shd-201ENSMUST00000044216 1546 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Rufy4Q3TYX8 Fdps-203ENSMUST00000196709 1382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
Rufy4Q3TYX8 Atp2c1-204ENSMUST00000112558 5642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Rufy4Q3TYX8 Ptn-201ENSMUST00000101534 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Rufy4Q3TYX8 Pigz-201ENSMUST00000052174 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Rufy4Q3TYX8 Kcnq2-205ENSMUST00000103048 2827 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Rufy4Q3TYX8 Fiz1-201ENSMUST00000077385 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Rufy4Q3TYX8 Adam33-201ENSMUST00000052104 2795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Rufy4Q3TYX8 Dcdc2c-206ENSMUST00000221349 2209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Rufy4Q3TYX8 Pemt-203ENSMUST00000102693 961 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Rufy4Q3TYX8 Hint3-203ENSMUST00000161074 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Rufy4Q3TYX8 Sbsn-202ENSMUST00000182227 432 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Rufy4Q3TYX8 Sbsn-203ENSMUST00000182229 732 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Rufy4Q3TYX8 Gm27867-201ENSMUST00000184778 125 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
Rufy4Q3TYX8 Ssr2-205ENSMUST00000193934 569 ntTSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Rufy4Q3TYX8 Rnf13-209ENSMUST00000199041 1062 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Rufy4Q3TYX8 Arhgap33-206ENSMUST00000208522 781 ntTSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Rufy4Q3TYX8 Gm44930-202ENSMUST00000208733 689 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Rufy4Q3TYX8 Man2a2-201ENSMUST00000098346 6554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Rufy4Q3TYX8 Ankra2-201ENSMUST00000022164 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Rufy4Q3TYX8 Rab35-201ENSMUST00000031492 2820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Rufy4Q3TYX8 Cdc14b-203ENSMUST00000109770 3052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Rufy4Q3TYX8 Pkp4-202ENSMUST00000102754 4614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Rufy4Q3TYX8 Grwd1-201ENSMUST00000107723 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Rufy4Q3TYX8 Kdf1-201ENSMUST00000042919 1708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Rufy4Q3TYX8 Taf6l-205ENSMUST00000176496 2224 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Rufy4Q3TYX8 Slc25a3-206ENSMUST00000170810 1341 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Rufy4Q3TYX8 Pbx4-201ENSMUST00000081503 1560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Rufy4Q3TYX8 Fhl2-201ENSMUST00000008280 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Rufy4Q3TYX8 Zfp746-201ENSMUST00000073124 3651 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Rufy4Q3TYX8 Ctcf-201ENSMUST00000005841 3782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Rufy4Q3TYX8 Nelfb-201ENSMUST00000059849 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Rufy4Q3TYX8 Ovol2-202ENSMUST00000103171 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Rufy4Q3TYX8 Hspa8-201ENSMUST00000015800 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Rufy4Q3TYX8 Lmo1-203ENSMUST00000208136 772 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
Rufy4Q3TYX8 Slc2a8-201ENSMUST00000028129 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Rufy4Q3TYX8 Tub-201ENSMUST00000033341 5997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Rufy4Q3TYX8 Gm8839-201ENSMUST00000121279 1645 ntBASIC18■□□□□ 0.47
Rufy4Q3TYX8 Prkar2a-201ENSMUST00000035220 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Rufy4Q3TYX8 Tssc4-206ENSMUST00000177841 1364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
Rufy4Q3TYX8 Kcnk10-203ENSMUST00000221305 1357 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Rufy4Q3TYX8 Ift74-202ENSMUST00000107104 1713 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
Rufy4Q3TYX8 Gm26596-201ENSMUST00000180464 2655 ntBASIC18■□□□□ 0.47
Rufy4Q3TYX8 E230001N04Rik-202ENSMUST00000181029 2091 ntBASIC18■□□□□ 0.47
Rufy4Q3TYX8 Abtb1-201ENSMUST00000032169 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Rufy4Q3TYX8 Pi4kb-202ENSMUST00000107251 2895 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Rufy4Q3TYX8 Gapvd1-203ENSMUST00000113099 5758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Rufy4Q3TYX8 Emd-201ENSMUST00000002029 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Rufy4Q3TYX8 Snx2-201ENSMUST00000037850 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Rufy4Q3TYX8 Mrm2-201ENSMUST00000031536 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Rufy4Q3TYX8 Cntln-201ENSMUST00000047023 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Rufy4Q3TYX8 Matk-202ENSMUST00000117488 1980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Rufy4Q3TYX8 Cdv3-202ENSMUST00000072249 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Rufy4Q3TYX8 Krt28-201ENSMUST00000006963 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Rufy4Q3TYX8 Tfdp2-206ENSMUST00000185644 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Rufy4Q3TYX8 Zfp668-203ENSMUST00000106262 3169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Rufy4Q3TYX8 Rnpep-202ENSMUST00000077340 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Rufy4Q3TYX8 Psma3-204ENSMUST00000160864 859 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 63.2 ms