Protein–RNA interactions for Protein: Q3TTJ4

Uncharacterized protein C8orf48 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 293 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q3TTJ4 Trim7-201ENSMUST00000046903 2161 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Q3TTJ4 March2-201ENSMUST00000066121 3400 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Q3TTJ4 Ddx51-201ENSMUST00000031478 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Q3TTJ4 Vps37a-201ENSMUST00000098817 6379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Q3TTJ4 Rassf1-204ENSMUST00000122225 1783 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Q3TTJ4 Slc25a20-201ENSMUST00000035222 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Q3TTJ4 Gm19569-202ENSMUST00000184658 1305 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Q3TTJ4 Snph-203ENSMUST00000109875 4910 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Q3TTJ4 Acap3-201ENSMUST00000079031 4301 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Q3TTJ4 Stambp-206ENSMUST00000206400 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Q3TTJ4 Pdk3-201ENSMUST00000045748 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Q3TTJ4 Pde8b-214ENSMUST00000172104 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Q3TTJ4 Cdh24-201ENSMUST00000067784 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Q3TTJ4 Lcmt2-201ENSMUST00000099486 2047 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Q3TTJ4 Nadk-203ENSMUST00000105613 3152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Q3TTJ4 Sphk1-202ENSMUST00000063446 2527 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Q3TTJ4 Exoc8-201ENSMUST00000098312 4598 ntAPPRIS P1 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Q3TTJ4 Kcna6-204ENSMUST00000185333 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Q3TTJ4 Gatc-201ENSMUST00000139167 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Q3TTJ4 Gm1673-202ENSMUST00000114382 451 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Q3TTJ4 Tmem80-202ENSMUST00000126510 959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Q3TTJ4 Psmd13-209ENSMUST00000164681 726 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Q3TTJ4 Ppdpf-201ENSMUST00000016488 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Q3TTJ4 4930579K19Rik-202ENSMUST00000190541 632 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Q3TTJ4 Gm18421-201ENSMUST00000204122 625 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
Q3TTJ4 AC134329.2-201ENSMUST00000217897 428 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
Q3TTJ4 Gadd45b-203ENSMUST00000220246 732 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Q3TTJ4 Krtcap3-201ENSMUST00000054829 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Q3TTJ4 Hist3h2ba-201ENSMUST00000078267 614 ntAPPRIS P1 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Q3TTJ4 Eif2ak3-201ENSMUST00000034093 4513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Q3TTJ4 Ptprd-206ENSMUST00000107289 9899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Q3TTJ4 Kank3-202ENSMUST00000172649 2652 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Q3TTJ4 Lrp8-201ENSMUST00000030356 4555 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Q3TTJ4 Alg5-201ENSMUST00000044567 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Q3TTJ4 Col17a1-202ENSMUST00000086923 5477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Q3TTJ4 Slc29a1-222ENSMUST00000171847 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Q3TTJ4 Tbx3os2-201ENSMUST00000135385 1345 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Q3TTJ4 Gsk3b-201ENSMUST00000023507 8303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Q3TTJ4 Adck1-204ENSMUST00000222695 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Q3TTJ4 Kbtbd11-201ENSMUST00000069399 6973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Q3TTJ4 Fscn1-207ENSMUST00000198017 2157 ntTSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Q3TTJ4 Zkscan3-204ENSMUST00000117721 5788 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Q3TTJ4 Irx4-202ENSMUST00000176684 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Q3TTJ4 Rpl14-201ENSMUST00000165532 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Q3TTJ4 Bcl7c-205ENSMUST00000205977 891 ntTSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Q3TTJ4 Sox6os-201ENSMUST00000032900 420 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Q3TTJ4 Rpl39l-201ENSMUST00000044103 805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Q3TTJ4 Ly6h-202ENSMUST00000065417 985 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Q3TTJ4 Nploc4-202ENSMUST00000103017 4025 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Q3TTJ4 Dag1-203ENSMUST00000171412 4415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Q3TTJ4 Htr3a-201ENSMUST00000003826 2082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Q3TTJ4 Gm10435-202ENSMUST00000162526 2878 ntTSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Q3TTJ4 Zswim1-201ENSMUST00000017908 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Q3TTJ4 Slc11a1-201ENSMUST00000027368 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Q3TTJ4 4930519A11Rik-201ENSMUST00000181381 1523 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Q3TTJ4 Spg21-202ENSMUST00000213957 1302 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Q3TTJ4 Dok5-201ENSMUST00000029075 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Q3TTJ4 Haus4-201ENSMUST00000022784 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Q3TTJ4 Psmd6-201ENSMUST00000022256 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Q3TTJ4 Kctd6-202ENSMUST00000170111 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Q3TTJ4 Ngly1-201ENSMUST00000022310 2935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Q3TTJ4 Npm1-201ENSMUST00000075641 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Q3TTJ4 Bcor-203ENSMUST00000115512 6887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Q3TTJ4 Lgr6-201ENSMUST00000044828 6675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Q3TTJ4 Hps5-202ENSMUST00000107653 4702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Q3TTJ4 Ppp3cb-206ENSMUST00000161989 2322 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Q3TTJ4 Nrxn1-206ENSMUST00000160800 5683 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Q3TTJ4 Shh-201ENSMUST00000002708 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Q3TTJ4 Gm16731-201ENSMUST00000132432 922 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Q3TTJ4 4930405A21Rik-202ENSMUST00000139042 994 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Q3TTJ4 2210408F21Rik-208ENSMUST00000144612 450 ntTSL 3 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Q3TTJ4 Tmem35b-201ENSMUST00000094712 1120 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Q3TTJ4 Fbxo36-201ENSMUST00000097672 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Q3TTJ4 3110070M22Rik-201ENSMUST00000099148 1123 ntAPPRIS P1 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Q3TTJ4 Myo16-204ENSMUST00000208309 2462 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Q3TTJ4 Ripor2-205ENSMUST00000110384 5608 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Q3TTJ4 Snx8-204ENSMUST00000196130 2547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Q3TTJ4 Tgfb1i1-205ENSMUST00000165667 1812 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Q3TTJ4 Zbtb46-202ENSMUST00000087409 2577 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Q3TTJ4 Celf1-201ENSMUST00000005643 4830 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Q3TTJ4 Fam149b-216ENSMUST00000225942 2151 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.64■□□□□ 0.42
Q3TTJ4 Iqcd-202ENSMUST00000094391 1673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.42
Q3TTJ4 Ptprj-204ENSMUST00000168621 7634 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.42
Q3TTJ4 Ube2e1-201ENSMUST00000022296 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.42
Q3TTJ4 Dnajc25-201ENSMUST00000095070 4023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.42
Q3TTJ4 Tmem214-201ENSMUST00000114716 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.42
Q3TTJ4 Sptbn4-202ENSMUST00000108362 4861 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Q3TTJ4 Mrpl37-201ENSMUST00000030365 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Q3TTJ4 Camk2d-226ENSMUST00000199300 5524 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Q3TTJ4 Dhfr-201ENSMUST00000022218 5347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Q3TTJ4 Cygb-201ENSMUST00000021166 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Q3TTJ4 Wscd1-203ENSMUST00000108511 2866 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Q3TTJ4 Crtac1-201ENSMUST00000048630 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Q3TTJ4 Ccdc51-201ENSMUST00000026735 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Q3TTJ4 Hap1-201ENSMUST00000103124 2120 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Q3TTJ4 Fam229a-201ENSMUST00000106043 558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Q3TTJ4 1810012K08Rik-201ENSMUST00000155199 574 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Q3TTJ4 4930544D05Rik-204ENSMUST00000180052 755 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Q3TTJ4 Snrnp35-201ENSMUST00000031349 1115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Q3TTJ4 Snapc3-202ENSMUST00000071544 942 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.3 ms