Protein–RNA interactions for Protein: Q3TSA9

Fbxw18, Expressed sequence C85627, mousemouse

Predictions only

Length 469 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fbxw18Q3TSA9 Klhl33-202ENSMUST00000170855 1422 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Fbxw18Q3TSA9 Mier2-212ENSMUST00000172158 1400 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Fbxw18Q3TSA9 Gm32996-201ENSMUST00000199828 1447 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
Fbxw18Q3TSA9 Tmem241-205ENSMUST00000209859 1426 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Fbxw18Q3TSA9 Gbe1-201ENSMUST00000023393 2846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Fbxw18Q3TSA9 Ogfod3-201ENSMUST00000026169 1308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Fbxw18Q3TSA9 Fam159b-201ENSMUST00000043061 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Fbxw18Q3TSA9 Dnajc2-204ENSMUST00000115195 1994 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Fbxw18Q3TSA9 Gm38973-201ENSMUST00000206810 878 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Fbxw18Q3TSA9 CAAA01066804.1-201ENSMUST00000217800 611 ntTSL 3 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Fbxw18Q3TSA9 Cdv3-202ENSMUST00000072249 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Fbxw18Q3TSA9 Pcmt1-202ENSMUST00000159917 2491 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Fbxw18Q3TSA9 Klhl40-201ENSMUST00000098272 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Fbxw18Q3TSA9 Mir22hg-202ENSMUST00000149940 1752 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Fbxw18Q3TSA9 Slc25a39-201ENSMUST00000018821 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Fbxw18Q3TSA9 Prmt9-202ENSMUST00000118622 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Fbxw18Q3TSA9 Homer2-206ENSMUST00000207983 1634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Fbxw18Q3TSA9 Hpca-203ENSMUST00000116442 1568 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Fbxw18Q3TSA9 Plekha4-202ENSMUST00000209517 2577 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Fbxw18Q3TSA9 Snx2-201ENSMUST00000037850 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Fbxw18Q3TSA9 Pgap2-203ENSMUST00000120119 1979 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Fbxw18Q3TSA9 Ankrd61-202ENSMUST00000110717 1498 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Fbxw18Q3TSA9 Tfap2b-202ENSMUST00000064976 1946 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Fbxw18Q3TSA9 Nagk-201ENSMUST00000037376 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Fbxw18Q3TSA9 Pmm1-201ENSMUST00000023112 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Fbxw18Q3TSA9 Lcorl-202ENSMUST00000045586 5708 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Fbxw18Q3TSA9 Bicdl1-201ENSMUST00000055408 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Fbxw18Q3TSA9 Bhlhe41-202ENSMUST00000111703 744 ntTSL 3 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Fbxw18Q3TSA9 Gm28051-201ENSMUST00000179306 445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Fbxw18Q3TSA9 Dvl2-201ENSMUST00000019362 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Fbxw18Q3TSA9 Cldn19-201ENSMUST00000084309 924 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Fbxw18Q3TSA9 Adam22-201ENSMUST00000046838 2773 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Fbxw18Q3TSA9 Arid1a-202ENSMUST00000105897 8175 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Fbxw18Q3TSA9 Disc1-201ENSMUST00000074562 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Fbxw18Q3TSA9 Disc1-203ENSMUST00000098311 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Fbxw18Q3TSA9 Cnot9-201ENSMUST00000087215 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Fbxw18Q3TSA9 Amfr-201ENSMUST00000053766 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Fbxw18Q3TSA9 Tmem260-209ENSMUST00000226422 6333 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Fbxw18Q3TSA9 Lrch3-203ENSMUST00000135193 2794 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Fbxw18Q3TSA9 Haglr-201ENSMUST00000100000 2085 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
Fbxw18Q3TSA9 Cdv3-201ENSMUST00000035484 3387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Fbxw18Q3TSA9 Mybl2-201ENSMUST00000018005 3651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Fbxw18Q3TSA9 Dyx1c1-201ENSMUST00000034734 1975 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Fbxw18Q3TSA9 Zmynd15-203ENSMUST00000108563 2649 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Fbxw18Q3TSA9 Sbsn-202ENSMUST00000182227 432 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Fbxw18Q3TSA9 Sbsn-203ENSMUST00000182229 732 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Fbxw18Q3TSA9 Ank1-201ENSMUST00000033947 1030 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Fbxw18Q3TSA9 Ahnak-201ENSMUST00000092955 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Fbxw18Q3TSA9 Jdp2-202ENSMUST00000171754 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Fbxw18Q3TSA9 Iqsec2-207ENSMUST00000168786 5993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Fbxw18Q3TSA9 Ovol2-202ENSMUST00000103171 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Fbxw18Q3TSA9 Ppp1r3f-205ENSMUST00000150787 4760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Fbxw18Q3TSA9 Mycs-201ENSMUST00000058404 2368 ntAPPRIS P1 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Fbxw18Q3TSA9 Arhgap21-201ENSMUST00000114594 7351 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Fbxw18Q3TSA9 Fam131b-203ENSMUST00000143278 4104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Fbxw18Q3TSA9 Otud5-202ENSMUST00000115665 3821 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Fbxw18Q3TSA9 Lrrfip2-202ENSMUST00000098340 3191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Fbxw18Q3TSA9 Atad2b-201ENSMUST00000045664 8035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Fbxw18Q3TSA9 Txndc11-201ENSMUST00000038424 3095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Fbxw18Q3TSA9 Lzts2-203ENSMUST00000179108 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Fbxw18Q3TSA9 Stxbp3-201ENSMUST00000102621 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Fbxw18Q3TSA9 Gm12216-201ENSMUST00000117316 1152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Fbxw18Q3TSA9 Cbr2-201ENSMUST00000026148 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Fbxw18Q3TSA9 Slc25a43-201ENSMUST00000047655 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Fbxw18Q3TSA9 Borcs5-201ENSMUST00000062755 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Fbxw18Q3TSA9 Lrch3-211ENSMUST00000170899 2752 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Fbxw18Q3TSA9 Kif7-202ENSMUST00000178048 4524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Fbxw18Q3TSA9 A530084C06Rik-201ENSMUST00000170573 3200 ntAPPRIS P1 BASIC16.27■□□□□ 0.19
Fbxw18Q3TSA9 Cwh43-201ENSMUST00000031040 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Fbxw18Q3TSA9 Gm45244-201ENSMUST00000211328 2200 ntBASIC16.27■□□□□ 0.19
Fbxw18Q3TSA9 Large1-202ENSMUST00000119826 4647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
Fbxw18Q3TSA9 Hps6-201ENSMUST00000099393 2696 ntAPPRIS P1 BASIC16.27■□□□□ 0.19
Fbxw18Q3TSA9 Lhfp-203ENSMUST00000147139 1932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
Fbxw18Q3TSA9 Shc1-202ENSMUST00000094378 2617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Fbxw18Q3TSA9 Fam181a-203ENSMUST00000191218 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
Fbxw18Q3TSA9 Naif1-201ENSMUST00000048431 4650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Fbxw18Q3TSA9 Cd302-202ENSMUST00000074606 1354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Fbxw18Q3TSA9 Larp1-201ENSMUST00000071487 6614 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Fbxw18Q3TSA9 Snx16-201ENSMUST00000029047 2288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Fbxw18Q3TSA9 Klf3-201ENSMUST00000165536 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Fbxw18Q3TSA9 Cul1-201ENSMUST00000031697 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Fbxw18Q3TSA9 Syt3-202ENSMUST00000118962 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Fbxw18Q3TSA9 Slc1a6-201ENSMUST00000005490 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Fbxw18Q3TSA9 Dand5-201ENSMUST00000065539 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Fbxw18Q3TSA9 Lsm1-201ENSMUST00000038421 2663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Fbxw18Q3TSA9 Krt6b-201ENSMUST00000023786 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Fbxw18Q3TSA9 Ccdc51-201ENSMUST00000026735 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Fbxw18Q3TSA9 Zbtb24-201ENSMUST00000080771 2844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Fbxw18Q3TSA9 Sppl3-201ENSMUST00000031530 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Fbxw18Q3TSA9 Pgam1-ps2-201ENSMUST00000117129 765 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
Fbxw18Q3TSA9 Gm12895-201ENSMUST00000122214 226 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
Fbxw18Q3TSA9 Gm13830-201ENSMUST00000124378 417 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Fbxw18Q3TSA9 Mpv17l-205ENSMUST00000143697 580 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Fbxw18Q3TSA9 Gm40457-201ENSMUST00000205319 1174 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Fbxw18Q3TSA9 AC153889.1-201ENSMUST00000219257 330 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
Fbxw18Q3TSA9 Sult2b1-201ENSMUST00000075571 1193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Fbxw18Q3TSA9 Serf2-201ENSMUST00000099475 525 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Fbxw18Q3TSA9 Il3ra-203ENSMUST00000224163 2315 ntAPPRIS P2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Fbxw18Q3TSA9 Fam76a-202ENSMUST00000097856 1863 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Fbxw18Q3TSA9 Mfsd4b1-201ENSMUST00000163705 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.9 ms