Protein–RNA interactions for Protein: Q3TS39

1700066B19Rik, RIKEN cDNA 1700066B19 gene, mousemouse

Predictions only

Length 127 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
1700066B19RikQ3TS39 Gm38186-201ENSMUST00000192574 449 ntTSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
1700066B19RikQ3TS39 4732471J01Rik-202ENSMUST00000205787 991 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
1700066B19RikQ3TS39 Gm10358-201ENSMUST00000212864 1250 ntAPPRIS P1 BASIC15.24■□□□□ 0.03
1700066B19RikQ3TS39 Sdhaf4-201ENSMUST00000027338 683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
1700066B19RikQ3TS39 Cenps-201ENSMUST00000030813 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
1700066B19RikQ3TS39 Nudt1-201ENSMUST00000050205 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
1700066B19RikQ3TS39 Cdkn2c-201ENSMUST00000063531 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
1700066B19RikQ3TS39 Nudt1-202ENSMUST00000071881 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
1700066B19RikQ3TS39 Ewsr1-204ENSMUST00000093365 1290 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
1700066B19RikQ3TS39 Fhl3-201ENSMUST00000038684 1664 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
1700066B19RikQ3TS39 Hira-202ENSMUST00000120532 2063 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
1700066B19RikQ3TS39 Zfp689-202ENSMUST00000106299 1417 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
1700066B19RikQ3TS39 Tbx18-201ENSMUST00000034991 4679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
1700066B19RikQ3TS39 Smpd5-202ENSMUST00000163991 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
1700066B19RikQ3TS39 Mag-203ENSMUST00000187137 2434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
1700066B19RikQ3TS39 Miga1-205ENSMUST00000199397 2842 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
1700066B19RikQ3TS39 Shh-201ENSMUST00000002708 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
1700066B19RikQ3TS39 Lrrc14-202ENSMUST00000127208 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
1700066B19RikQ3TS39 Ankra2-201ENSMUST00000022164 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
1700066B19RikQ3TS39 Cyp4f13-204ENSMUST00000139353 1389 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
1700066B19RikQ3TS39 March11-203ENSMUST00000152841 1365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
1700066B19RikQ3TS39 G3bp2-204ENSMUST00000169094 2716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
1700066B19RikQ3TS39 Gdf5-201ENSMUST00000040162 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
1700066B19RikQ3TS39 Cldn6-201ENSMUST00000024699 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
1700066B19RikQ3TS39 E130307A14Rik-213ENSMUST00000155482 2803 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
1700066B19RikQ3TS39 Hhatl-201ENSMUST00000035110 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
1700066B19RikQ3TS39 Gm14634-201ENSMUST00000139163 1662 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
1700066B19RikQ3TS39 Col11a2-203ENSMUST00000114255 5722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
1700066B19RikQ3TS39 Gm13446-201ENSMUST00000124555 2033 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
1700066B19RikQ3TS39 Ccnd3-ps-201ENSMUST00000117963 881 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
1700066B19RikQ3TS39 Gm26827-201ENSMUST00000181911 148 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
1700066B19RikQ3TS39 Atp23-201ENSMUST00000026504 903 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
1700066B19RikQ3TS39 Coq7-201ENSMUST00000032887 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
1700066B19RikQ3TS39 Cltb-201ENSMUST00000049575 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
1700066B19RikQ3TS39 Hist1h2ad-201ENSMUST00000090776 572 ntAPPRIS P1 BASIC15.23■□□□□ 0.03
1700066B19RikQ3TS39 Ankrd23-201ENSMUST00000054665 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
1700066B19RikQ3TS39 Spef1-201ENSMUST00000028801 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
1700066B19RikQ3TS39 Hoxa10-201ENSMUST00000121043 1436 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
1700066B19RikQ3TS39 Samd4-211ENSMUST00000228404 3039 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
1700066B19RikQ3TS39 Bend6-204ENSMUST00000129464 1750 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
1700066B19RikQ3TS39 Kifc3-212ENSMUST00000213004 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
1700066B19RikQ3TS39 Papd4-201ENSMUST00000048702 2990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
1700066B19RikQ3TS39 Pick1-202ENSMUST00000053926 2415 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
1700066B19RikQ3TS39 Dab2-208ENSMUST00000160134 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
1700066B19RikQ3TS39 Zbtb46-202ENSMUST00000087409 2577 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
1700066B19RikQ3TS39 Idh1-201ENSMUST00000097709 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
1700066B19RikQ3TS39 2810013P06Rik-201ENSMUST00000186531 2137 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
1700066B19RikQ3TS39 Ly6e-201ENSMUST00000051698 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
1700066B19RikQ3TS39 Marveld1-201ENSMUST00000061111 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
1700066B19RikQ3TS39 Pard3-209ENSMUST00000160272 5815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
1700066B19RikQ3TS39 Sppl3-201ENSMUST00000031530 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
1700066B19RikQ3TS39 Coro2a-202ENSMUST00000107756 4154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
1700066B19RikQ3TS39 Il7-203ENSMUST00000192202 2057 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
1700066B19RikQ3TS39 Tlcd2-202ENSMUST00000108435 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
1700066B19RikQ3TS39 Hnrnph3-203ENSMUST00000119814 682 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
1700066B19RikQ3TS39 Sec61b-201ENSMUST00000065678 564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
1700066B19RikQ3TS39 Nkx2-9-201ENSMUST00000072631 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
1700066B19RikQ3TS39 Snapc3-201ENSMUST00000030206 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
1700066B19RikQ3TS39 Bicdl1-204ENSMUST00000121746 1568 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
1700066B19RikQ3TS39 Pnkp-202ENSMUST00000098478 1550 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
1700066B19RikQ3TS39 Dtx2-202ENSMUST00000111142 2650 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
1700066B19RikQ3TS39 Cux1-206ENSMUST00000176172 4882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
1700066B19RikQ3TS39 Fam131b-201ENSMUST00000031891 4065 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
1700066B19RikQ3TS39 Mtx2-201ENSMUST00000028511 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
1700066B19RikQ3TS39 A830073O21Rik-202ENSMUST00000205693 3096 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
1700066B19RikQ3TS39 Slc7a5-201ENSMUST00000045557 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
1700066B19RikQ3TS39 Sctr-202ENSMUST00000189037 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
1700066B19RikQ3TS39 Jam2-201ENSMUST00000098407 1998 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
1700066B19RikQ3TS39 Slc2a13-202ENSMUST00000109283 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
1700066B19RikQ3TS39 Rnpep-202ENSMUST00000077340 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
1700066B19RikQ3TS39 Lrig3-201ENSMUST00000074807 4016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
1700066B19RikQ3TS39 Homer2-206ENSMUST00000207983 1634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
1700066B19RikQ3TS39 Tom1l2-201ENSMUST00000064019 2151 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
1700066B19RikQ3TS39 Atf4-201ENSMUST00000109605 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
1700066B19RikQ3TS39 Nhs-201ENSMUST00000081569 4881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
1700066B19RikQ3TS39 Kiss1r-202ENSMUST00000219745 979 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
1700066B19RikQ3TS39 AC121577.1-201ENSMUST00000227302 707 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
1700066B19RikQ3TS39 Imp3-201ENSMUST00000034827 924 ntAPPRIS P1 BASIC15.21■□□□□ 0.03
1700066B19RikQ3TS39 B4galt7-201ENSMUST00000064701 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
1700066B19RikQ3TS39 Sftpb-201ENSMUST00000070437 1131 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
1700066B19RikQ3TS39 Nadk2-203ENSMUST00000100790 3665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
1700066B19RikQ3TS39 Dtx3-202ENSMUST00000116229 1994 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
1700066B19RikQ3TS39 Dok3-202ENSMUST00000223563 1644 ntAPPRIS P1 BASIC15.21■□□□□ 0.02
1700066B19RikQ3TS39 Dag1-201ENSMUST00000080435 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
1700066B19RikQ3TS39 Psmd12-203ENSMUST00000106752 1955 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
1700066B19RikQ3TS39 Rassf7-208ENSMUST00000209500 1560 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
1700066B19RikQ3TS39 Rpp25-201ENSMUST00000080514 1423 ntAPPRIS P1 BASIC15.2■□□□□ 0.02
1700066B19RikQ3TS39 Fam83f-201ENSMUST00000023044 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
1700066B19RikQ3TS39 Tfap2b-202ENSMUST00000064976 1946 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
1700066B19RikQ3TS39 0610009B22Rik-202ENSMUST00000109098 892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
1700066B19RikQ3TS39 Apopt1-204ENSMUST00000163220 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
1700066B19RikQ3TS39 Gm44430-201ENSMUST00000203376 995 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
1700066B19RikQ3TS39 Gm5587-201ENSMUST00000206270 674 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
1700066B19RikQ3TS39 Xpa-201ENSMUST00000030013 955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
1700066B19RikQ3TS39 Spsb2-202ENSMUST00000052727 1219 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
1700066B19RikQ3TS39 BC030336-201ENSMUST00000060175 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
1700066B19RikQ3TS39 Hnrnpll-205ENSMUST00000184635 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
1700066B19RikQ3TS39 Gapvd1-203ENSMUST00000113099 5758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
1700066B19RikQ3TS39 Arrb2-203ENSMUST00000102563 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
1700066B19RikQ3TS39 D430001F17Rik-201ENSMUST00000141344 1858 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.9 ms