Protein–RNA interactions for Protein: Q3TP92

Ctdnep1, CTD nuclear envelope phosphatase 1, mousemouse

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Length 244 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ctdnep1Q3TP92 Tmem128-201ENSMUST00000087511 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Ctdnep1Q3TP92 Fgfr2-215ENSMUST00000122054 3323 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Ctdnep1Q3TP92 Casq1-201ENSMUST00000003554 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Ctdnep1Q3TP92 Garem1-201ENSMUST00000049260 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Ctdnep1Q3TP92 Abcb10-201ENSMUST00000075578 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Ctdnep1Q3TP92 Pofut1-204ENSMUST00000109794 1688 ntTSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Ctdnep1Q3TP92 Hs3st2-201ENSMUST00000084628 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Ctdnep1Q3TP92 Dars-201ENSMUST00000027602 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
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Ctdnep1Q3TP92 Dcxr-202ENSMUST00000106148 830 ntTSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
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Ctdnep1Q3TP92 Hnrnph3-203ENSMUST00000119814 682 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
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Ctdnep1Q3TP92 Sprn-201ENSMUST00000059241 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Ctdnep1Q3TP92 Tmem176a-201ENSMUST00000101426 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Ctdnep1Q3TP92 4930519A11Rik-201ENSMUST00000181381 1523 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Ctdnep1Q3TP92 Cyp46a1-201ENSMUST00000021684 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Ctdnep1Q3TP92 Obsl1-202ENSMUST00000113567 5679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Ctdnep1Q3TP92 2210016F16Rik-201ENSMUST00000022032 3051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Ctdnep1Q3TP92 Bend6-204ENSMUST00000129464 1750 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Ctdnep1Q3TP92 Zfp804a-201ENSMUST00000047527 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Ctdnep1Q3TP92 Lmo4-202ENSMUST00000121112 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Ctdnep1Q3TP92 1700034J05Rik-202ENSMUST00000111622 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Ctdnep1Q3TP92 Gm43072-201ENSMUST00000200283 1671 ntBASIC18.98■□□□□ 0.63
Ctdnep1Q3TP92 Mesp2-201ENSMUST00000107394 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Ctdnep1Q3TP92 Pnkp-202ENSMUST00000098478 1550 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
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Ctdnep1Q3TP92 Dusp8-201ENSMUST00000039926 4804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Ctdnep1Q3TP92 Taf5l-202ENSMUST00000165628 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Ctdnep1Q3TP92 Umad1-202ENSMUST00000159335 2615 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Ctdnep1Q3TP92 Clvs2-203ENSMUST00000160299 2610 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Ctdnep1Q3TP92 Sh3yl1-201ENSMUST00000020997 1750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Ctdnep1Q3TP92 Ccdc125-202ENSMUST00000170347 1216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Ctdnep1Q3TP92 Ankrd40-201ENSMUST00000021227 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
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Ctdnep1Q3TP92 Plpp7-201ENSMUST00000057423 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Ctdnep1Q3TP92 Pkp4-202ENSMUST00000102754 4614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Ctdnep1Q3TP92 Chst10-206ENSMUST00000194361 2996 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Ctdnep1Q3TP92 Pde4b-208ENSMUST00000106911 3020 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Ctdnep1Q3TP92 Anp32a-201ENSMUST00000085519 2113 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Ctdnep1Q3TP92 Apeh-206ENSMUST00000193254 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Ctdnep1Q3TP92 Cnbd2-201ENSMUST00000037096 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Ctdnep1Q3TP92 Serpine2-201ENSMUST00000027467 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Ctdnep1Q3TP92 Sctr-202ENSMUST00000189037 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Ctdnep1Q3TP92 Bola2-203ENSMUST00000130498 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Ctdnep1Q3TP92 Pyy-201ENSMUST00000017455 555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
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Ctdnep1Q3TP92 Nudt21-204ENSMUST00000212981 1184 ntTSL 3 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Ctdnep1Q3TP92 4932443I19Rik-204ENSMUST00000214337 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Ctdnep1Q3TP92 Banf1-201ENSMUST00000025762 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Ctdnep1Q3TP92 Xpa-201ENSMUST00000030013 955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
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Ctdnep1Q3TP92 Rgs9-201ENSMUST00000020920 2434 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Ctdnep1Q3TP92 Naprt-201ENSMUST00000023237 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Ctdnep1Q3TP92 Ccdc6-203ENSMUST00000147545 5511 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
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Ctdnep1Q3TP92 Dnajb11-204ENSMUST00000166487 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
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Ctdnep1Q3TP92 Tssc4-206ENSMUST00000177841 1364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
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Ctdnep1Q3TP92 Sdhaf4-201ENSMUST00000027338 683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Ctdnep1Q3TP92 Vpreb1-201ENSMUST00000075017 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Ctdnep1Q3TP92 Rmnd5b-201ENSMUST00000001081 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
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Ctdnep1Q3TP92 Crebl2-201ENSMUST00000046303 3629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Ctdnep1Q3TP92 Igfbp2-201ENSMUST00000047328 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Ctdnep1Q3TP92 Pde8b-201ENSMUST00000022192 2517 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Ctdnep1Q3TP92 Gm26752-201ENSMUST00000181086 1537 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Ctdnep1Q3TP92 Trmt2a-203ENSMUST00000115640 2367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Ctdnep1Q3TP92 Cobll1-205ENSMUST00000112431 5024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Ctdnep1Q3TP92 Hsdl2-201ENSMUST00000030078 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Ctdnep1Q3TP92 Tmem150b-202ENSMUST00000086364 2822 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Ctdnep1Q3TP92 Plcl2-201ENSMUST00000043938 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Ctdnep1Q3TP92 Elf2-201ENSMUST00000062009 3353 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Ctdnep1Q3TP92 Snapc3-201ENSMUST00000030206 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Ctdnep1Q3TP92 BC030336-201ENSMUST00000060175 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Ctdnep1Q3TP92 Ubap1-202ENSMUST00000108060 2514 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Ctdnep1Q3TP92 Ttc13-202ENSMUST00000117624 3096 ntTSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Ctdnep1Q3TP92 Pmepa1-201ENSMUST00000036248 4538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Ctdnep1Q3TP92 1700024G13Rik-201ENSMUST00000100723 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Ctdnep1Q3TP92 Gm15690-201ENSMUST00000128728 432 ntTSL 3 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Ctdnep1Q3TP92 4930505N22Rik-201ENSMUST00000181820 945 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Ctdnep1Q3TP92 Polr2f-201ENSMUST00000040077 543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Ctdnep1Q3TP92 Nudt1-201ENSMUST00000050205 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Ctdnep1Q3TP92 Nudt1-202ENSMUST00000071881 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Ctdnep1Q3TP92 Rad23a-202ENSMUST00000109761 1842 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
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