Protein–RNA interactions for Protein: Q3TCJ8

Ccdc69, Coiled-coil domain-containing protein 69, mousemouse

Predictions only

Length 202 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc69Q3TCJ8 Gjb3-201ENSMUST00000046532 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Ccdc69Q3TCJ8 Lrp4-201ENSMUST00000028689 7926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Ccdc69Q3TCJ8 Uso1-201ENSMUST00000031355 3898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Ccdc69Q3TCJ8 Krt73-201ENSMUST00000063292 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Ccdc69Q3TCJ8 Uchl5-201ENSMUST00000018333 1845 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Ccdc69Q3TCJ8 Zfp865-203ENSMUST00000085427 2751 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Ccdc69Q3TCJ8 B4galt3-205ENSMUST00000126699 1758 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Ccdc69Q3TCJ8 Gm21981-201ENSMUST00000143789 2721 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Ccdc69Q3TCJ8 Tbp-202ENSMUST00000117593 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Ccdc69Q3TCJ8 Gm8258-201ENSMUST00000055593 1449 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Ccdc69Q3TCJ8 Eral1-201ENSMUST00000021183 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ccdc69Q3TCJ8 Glra1-201ENSMUST00000075603 2037 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ccdc69Q3TCJ8 Gne-202ENSMUST00000102936 2920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ccdc69Q3TCJ8 Gm42417-201ENSMUST00000191849 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ccdc69Q3TCJ8 Stard7-202ENSMUST00000110375 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ccdc69Q3TCJ8 Bptf-201ENSMUST00000057892 11488 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ccdc69Q3TCJ8 Map4k5-201ENSMUST00000049239 4452 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ccdc69Q3TCJ8 Usp53-201ENSMUST00000090379 6185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ccdc69Q3TCJ8 Lce1j-201ENSMUST00000107304 420 ntAPPRIS P1 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ccdc69Q3TCJ8 Znhit2-201ENSMUST00000162726 1281 ntAPPRIS P1 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ccdc69Q3TCJ8 Has3-202ENSMUST00000175987 1154 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ccdc69Q3TCJ8 Gm29707-201ENSMUST00000196325 491 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Ccdc69Q3TCJ8 Gm44450-201ENSMUST00000199528 114 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Ccdc69Q3TCJ8 Imp3-201ENSMUST00000034827 924 ntAPPRIS P1 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ccdc69Q3TCJ8 Nkx2-9-201ENSMUST00000072631 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ccdc69Q3TCJ8 Slc8a3-202ENSMUST00000085238 4927 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ccdc69Q3TCJ8 Amigo2-201ENSMUST00000053106 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ccdc69Q3TCJ8 Epha10-201ENSMUST00000059343 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ccdc69Q3TCJ8 Kcnk4-201ENSMUST00000025908 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ccdc69Q3TCJ8 Nsun5-201ENSMUST00000000940 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ccdc69Q3TCJ8 Impdh1-210ENSMUST00000162739 2471 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ccdc69Q3TCJ8 Nrip1-201ENSMUST00000054178 4529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ccdc69Q3TCJ8 3110002H16Rik-201ENSMUST00000025276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ccdc69Q3TCJ8 Chd4-201ENSMUST00000056889 6697 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ccdc69Q3TCJ8 Gm26892-201ENSMUST00000181695 1636 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ccdc69Q3TCJ8 Gm10564-201ENSMUST00000097750 3113 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ccdc69Q3TCJ8 4930455H04Rik-201ENSMUST00000117592 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ccdc69Q3TCJ8 Ppp1r1b-201ENSMUST00000078694 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ccdc69Q3TCJ8 Acot4-201ENSMUST00000021652 6203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ccdc69Q3TCJ8 Acss2-201ENSMUST00000029135 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ccdc69Q3TCJ8 G630022F23Rik-201ENSMUST00000202923 3627 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Ccdc69Q3TCJ8 D17Wsu92e-203ENSMUST00000114863 3828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ccdc69Q3TCJ8 Tppp3-201ENSMUST00000014990 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ccdc69Q3TCJ8 Fosl1-201ENSMUST00000025850 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ccdc69Q3TCJ8 Pgm3-202ENSMUST00000072585 1920 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ccdc69Q3TCJ8 Abhd10-201ENSMUST00000066983 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ccdc69Q3TCJ8 Med7-203ENSMUST00000109232 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ccdc69Q3TCJ8 Rbpms-213ENSMUST00000191473 2547 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ccdc69Q3TCJ8 Lmo4-203ENSMUST00000121796 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ccdc69Q3TCJ8 Anks6-201ENSMUST00000084616 3552 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ccdc69Q3TCJ8 Arhgef9-216ENSMUST00000197206 2227 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ccdc69Q3TCJ8 Cdk9-202ENSMUST00000120105 1565 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ccdc69Q3TCJ8 Cnpy1-202ENSMUST00000118882 1984 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ccdc69Q3TCJ8 Pitpnm1-201ENSMUST00000049658 4206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ccdc69Q3TCJ8 Rbms1-201ENSMUST00000028347 4436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ccdc69Q3TCJ8 Gm20604-201ENSMUST00000174651 2795 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ccdc69Q3TCJ8 Hes6-201ENSMUST00000086851 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ccdc69Q3TCJ8 Helt-201ENSMUST00000058636 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ccdc69Q3TCJ8 Zbtb7c-201ENSMUST00000058997 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ccdc69Q3TCJ8 Casp3-201ENSMUST00000093517 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ccdc69Q3TCJ8 B3gnt9-202ENSMUST00000136822 2516 ntAPPRIS P1 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ccdc69Q3TCJ8 Kat14-208ENSMUST00000147747 3299 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ccdc69Q3TCJ8 Mbp-201ENSMUST00000047865 2492 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ccdc69Q3TCJ8 Rfesd-202ENSMUST00000167271 595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ccdc69Q3TCJ8 Gm19553-201ENSMUST00000175723 494 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ccdc69Q3TCJ8 Gm6345-202ENSMUST00000180900 204 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Ccdc69Q3TCJ8 Phtf1-203ENSMUST00000090685 3006 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ccdc69Q3TCJ8 Stk33-201ENSMUST00000090414 2221 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ccdc69Q3TCJ8 Thsd7a-202ENSMUST00000119581 5678 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ccdc69Q3TCJ8 Nsmf-203ENSMUST00000100334 2957 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ccdc69Q3TCJ8 Dvl2-201ENSMUST00000019362 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ccdc69Q3TCJ8 Nrn1-201ENSMUST00000037623 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ccdc69Q3TCJ8 S1pr5-201ENSMUST00000122088 2500 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ccdc69Q3TCJ8 Gpat3-203ENSMUST00000112887 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ccdc69Q3TCJ8 Idh1-201ENSMUST00000097709 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ccdc69Q3TCJ8 Pprc1-203ENSMUST00000111899 5246 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ccdc69Q3TCJ8 Tmem30c-202ENSMUST00000119407 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ccdc69Q3TCJ8 Rusc1-203ENSMUST00000166687 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ccdc69Q3TCJ8 Cyfip2-205ENSMUST00000165599 6659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ccdc69Q3TCJ8 Bmp8a-201ENSMUST00000040496 2405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ccdc69Q3TCJ8 Relb-201ENSMUST00000049912 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ccdc69Q3TCJ8 Nsmce3-201ENSMUST00000094331 5946 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ccdc69Q3TCJ8 Itgav-202ENSMUST00000111740 6788 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ccdc69Q3TCJ8 Ramp2-202ENSMUST00000122006 899 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ccdc69Q3TCJ8 Gm11860-201ENSMUST00000122346 1010 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Ccdc69Q3TCJ8 Stx3-208ENSMUST00000211641 1018 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ccdc69Q3TCJ8 Angptl8-201ENSMUST00000058777 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ccdc69Q3TCJ8 Fgf9-202ENSMUST00000074654 1198 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ccdc69Q3TCJ8 Znhit1-202ENSMUST00000085941 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ccdc69Q3TCJ8 Prdm6-201ENSMUST00000091900 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ccdc69Q3TCJ8 Zc3h13-203ENSMUST00000227049 6144 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ccdc69Q3TCJ8 Arhgef19-201ENSMUST00000006618 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ccdc69Q3TCJ8 Gm16401-202ENSMUST00000197463 2074 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Ccdc69Q3TCJ8 Large1-204ENSMUST00000212459 4746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ccdc69Q3TCJ8 Npas3-203ENSMUST00000223057 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ccdc69Q3TCJ8 Gprc5b-201ENSMUST00000008878 4518 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ccdc69Q3TCJ8 Casd1-201ENSMUST00000015333 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ccdc69Q3TCJ8 Msmo1-201ENSMUST00000034015 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ccdc69Q3TCJ8 Vangl2-202ENSMUST00000111263 6528 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ccdc69Q3TCJ8 Plxnc1-201ENSMUST00000099337 7302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.3 ms