Protein–RNA interactions for Protein: Q3MI99

Ccbe1, Collagen and calcium-binding EGF domain-containing protein 1, mousemouse

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Length 408 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccbe1Q3MI99 Pcdha3-201ENSMUST00000192503 5332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Ccbe1Q3MI99 Espn-209ENSMUST00000105655 1350 ntTSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Ccbe1Q3MI99 Espn-211ENSMUST00000105657 1375 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Ccbe1Q3MI99 Zfp467-201ENSMUST00000101443 599 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Ccbe1Q3MI99 Rab6b-202ENSMUST00000189134 716 ntTSL 3 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Ccbe1Q3MI99 Gpx1-202ENSMUST00000191997 787 ntTSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Ccbe1Q3MI99 Snrpd3-203ENSMUST00000220229 442 ntTSL 3 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Ccbe1Q3MI99 5033430I15Rik-201ENSMUST00000038032 729 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Ccbe1Q3MI99 Eda-206ENSMUST00000113779 4955 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Ccbe1Q3MI99 Tulp1-202ENSMUST00000114794 1738 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Ccbe1Q3MI99 Ccr9-202ENSMUST00000163559 3004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Ccbe1Q3MI99 Arfgap2-202ENSMUST00000080008 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Ccbe1Q3MI99 AC108858.1-201ENSMUST00000228461 1498 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
Ccbe1Q3MI99 Cacnb1-204ENSMUST00000107561 1778 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Ccbe1Q3MI99 Map3k6-201ENSMUST00000030677 4334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Ccbe1Q3MI99 Dmtn-201ENSMUST00000022694 5418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Ccbe1Q3MI99 Celf3-204ENSMUST00000197558 2414 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Ccbe1Q3MI99 Mpig6b-201ENSMUST00000097337 2252 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Ccbe1Q3MI99 Adgrl1-201ENSMUST00000045393 5643 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Ccbe1Q3MI99 Zbtb11os1-201ENSMUST00000186480 1350 ntBASIC14.87□□□□□ -0.03
Ccbe1Q3MI99 Zswim4-201ENSMUST00000039480 4625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Ccbe1Q3MI99 Dennd1a-201ENSMUST00000102787 4342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Ccbe1Q3MI99 Gtf3c4-204ENSMUST00000171404 7127 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Ccbe1Q3MI99 Nfe2-208ENSMUST00000149111 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Ccbe1Q3MI99 Tmem28-201ENSMUST00000096363 3909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Ccbe1Q3MI99 Cstf2-203ENSMUST00000113287 3661 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Ccbe1Q3MI99 Socs4-201ENSMUST00000065562 6877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Ccbe1Q3MI99 Arhgef1-201ENSMUST00000047873 3212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Ccbe1Q3MI99 Stxbp1-201ENSMUST00000050000 3892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Ccbe1Q3MI99 Tmem266-201ENSMUST00000034862 2408 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Ccbe1Q3MI99 Klc3-202ENSMUST00000108457 1632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Ccbe1Q3MI99 Cabp7-201ENSMUST00000009219 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Ccbe1Q3MI99 Medag-201ENSMUST00000093110 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Ccbe1Q3MI99 Klhl25-203ENSMUST00000205612 1343 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Ccbe1Q3MI99 Rbfox3-203ENSMUST00000103023 2809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Ccbe1Q3MI99 Enah-212ENSMUST00000195059 2832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Ccbe1Q3MI99 Ppp2r1b-204ENSMUST00000174628 2195 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Ccbe1Q3MI99 Paqr9-201ENSMUST00000079597 8367 ntAPPRIS P1 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Ccbe1Q3MI99 Gm39027-201ENSMUST00000208560 2942 ntTSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Ccbe1Q3MI99 Tcf3-203ENSMUST00000105339 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Ccbe1Q3MI99 Ak1-203ENSMUST00000113278 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Ccbe1Q3MI99 Nipsnap3b-201ENSMUST00000015391 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Ccbe1Q3MI99 Fam167a-201ENSMUST00000121288 4231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Ccbe1Q3MI99 Arrb2-205ENSMUST00000108568 1777 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Ccbe1Q3MI99 9130019P16Rik-202ENSMUST00000145111 4486 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Ccbe1Q3MI99 Zkscan14-201ENSMUST00000031632 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Ccbe1Q3MI99 Ube2w-201ENSMUST00000117146 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Ccbe1Q3MI99 Dpyd-204ENSMUST00000149101 531 ntTSL 3 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Ccbe1Q3MI99 Spcs1-201ENSMUST00000186131 1005 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Ccbe1Q3MI99 Fam58b-201ENSMUST00000059468 1224 ntAPPRIS P1 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Ccbe1Q3MI99 Gnb3-201ENSMUST00000024206 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Ccbe1Q3MI99 Robo3-202ENSMUST00000115038 4797 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Ccbe1Q3MI99 Gm5934-201ENSMUST00000120734 2588 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Ccbe1Q3MI99 Sf1-203ENSMUST00000113488 2282 ntTSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Ccbe1Q3MI99 Hist3h2a-201ENSMUST00000108817 2146 ntAPPRIS P1 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Ccbe1Q3MI99 Zfp36l3-201ENSMUST00000071711 2347 ntAPPRIS P1 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Ccbe1Q3MI99 Ephb4-203ENSMUST00000111055 4296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Ccbe1Q3MI99 Shisa7-201ENSMUST00000066041 6006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Ccbe1Q3MI99 B230219D22Rik-201ENSMUST00000057844 4652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Ccbe1Q3MI99 F2rl3-201ENSMUST00000058099 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Ccbe1Q3MI99 Phf7-203ENSMUST00000226565 1971 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
Ccbe1Q3MI99 Lrrc56-203ENSMUST00000084446 2390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Ccbe1Q3MI99 Pik3ap1-201ENSMUST00000059672 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Ccbe1Q3MI99 Zfp142-201ENSMUST00000027315 6480 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Ccbe1Q3MI99 Ppp6r2-208ENSMUST00000228284 3297 ntAPPRIS P1 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Ccbe1Q3MI99 Foxl1-201ENSMUST00000181609 2705 ntAPPRIS P1 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Ccbe1Q3MI99 Ikzf5-203ENSMUST00000128432 714 ntTSL 3 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Ccbe1Q3MI99 Gm4553-201ENSMUST00000168049 714 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Ccbe1Q3MI99 Gnai2-203ENSMUST00000192837 421 ntTSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Ccbe1Q3MI99 A930018P22Rik-201ENSMUST00000040374 822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Ccbe1Q3MI99 Gpx1-201ENSMUST00000082429 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Ccbe1Q3MI99 Camsap3-201ENSMUST00000057028 4450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Ccbe1Q3MI99 Fdx1-202ENSMUST00000214013 2759 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Ccbe1Q3MI99 Gm10676-201ENSMUST00000098778 3221 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
Ccbe1Q3MI99 Casp3-201ENSMUST00000093517 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Ccbe1Q3MI99 Srsf10-204ENSMUST00000105853 3058 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Ccbe1Q3MI99 Srsf10-202ENSMUST00000097844 3055 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Ccbe1Q3MI99 Flywch1-202ENSMUST00000086325 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Ccbe1Q3MI99 Slc39a11-202ENSMUST00000071539 2664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Ccbe1Q3MI99 Neo1-201ENSMUST00000068664 7379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Ccbe1Q3MI99 Hmces-202ENSMUST00000113606 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Ccbe1Q3MI99 Slc22a7-201ENSMUST00000087012 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Ccbe1Q3MI99 Pnkp-202ENSMUST00000098478 1550 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Ccbe1Q3MI99 Ppm1e-201ENSMUST00000055438 6344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Ccbe1Q3MI99 Pdzd4-202ENSMUST00000114438 3625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Ccbe1Q3MI99 Kcna1-202ENSMUST00000203094 3150 ntAPPRIS P1 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Ccbe1Q3MI99 Hsf4-202ENSMUST00000163734 1630 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Ccbe1Q3MI99 Klhdc10-201ENSMUST00000068240 3951 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Ccbe1Q3MI99 Nelfa-201ENSMUST00000030993 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Ccbe1Q3MI99 Dclk2-201ENSMUST00000029719 4012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Ccbe1Q3MI99 Ppp2r5e-201ENSMUST00000021447 4810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Ccbe1Q3MI99 Grb2-203ENSMUST00000106497 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Ccbe1Q3MI99 Csnk1e-201ENSMUST00000117786 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Ccbe1Q3MI99 Xylt2-201ENSMUST00000116349 3442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Ccbe1Q3MI99 Aldh3a1-201ENSMUST00000019246 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Ccbe1Q3MI99 Sharpin-201ENSMUST00000023211 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Ccbe1Q3MI99 Gm17200-201ENSMUST00000170214 2022 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Ccbe1Q3MI99 0610038B21Rik-202ENSMUST00000184762 1524 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
Ccbe1Q3MI99 Rbm39-202ENSMUST00000109584 667 ntTSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Ccbe1Q3MI99 Wdr4-203ENSMUST00000167419 813 ntTSL 3 BASIC14.84□□□□□ -0.03
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