Protein–RNA interactions for Protein: Q3LRV9

Treml4, Trem-like transcript 4 protein, mousemouse

Predictions only

Length 263 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Treml4Q3LRV9 Relb-201ENSMUST00000049912 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Treml4Q3LRV9 Jade1-202ENSMUST00000163764 5584 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Treml4Q3LRV9 Akap8l-201ENSMUST00000050214 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Treml4Q3LRV9 Atp6v1g2-201ENSMUST00000068261 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Treml4Q3LRV9 Sharpin-201ENSMUST00000023211 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Treml4Q3LRV9 Mtmr1-201ENSMUST00000015358 4634 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Treml4Q3LRV9 Glis1-201ENSMUST00000046005 2906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Treml4Q3LRV9 Ager-201ENSMUST00000015596 1370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Treml4Q3LRV9 P3h1-203ENSMUST00000102662 2977 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Treml4Q3LRV9 Crem-203ENSMUST00000082141 2820 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Treml4Q3LRV9 Relt-201ENSMUST00000008462 2851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Treml4Q3LRV9 Tcf3-206ENSMUST00000105342 2928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Treml4Q3LRV9 Nrn1l-202ENSMUST00000118920 603 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Treml4Q3LRV9 Atp6v1g2-203ENSMUST00000130992 524 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Treml4Q3LRV9 Gm27002-201ENSMUST00000182789 620 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Treml4Q3LRV9 Gm9925-201ENSMUST00000066583 483 ntAPPRIS P1 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Treml4Q3LRV9 Rhog-201ENSMUST00000098230 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Treml4Q3LRV9 Cdc25a-201ENSMUST00000094324 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Treml4Q3LRV9 Nr1h2-213ENSMUST00000167197 1944 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Treml4Q3LRV9 Trmt2a-203ENSMUST00000115640 2367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Treml4Q3LRV9 A530016L24Rik-202ENSMUST00000223266 1547 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Treml4Q3LRV9 Helt-201ENSMUST00000058636 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Treml4Q3LRV9 Fiz1-203ENSMUST00000167804 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Treml4Q3LRV9 Hbs1l-203ENSMUST00000092674 2625 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Treml4Q3LRV9 Kcnq2-201ENSMUST00000016491 3067 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Treml4Q3LRV9 Gm11532-201ENSMUST00000128111 5272 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Treml4Q3LRV9 Tubb6-201ENSMUST00000001513 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Treml4Q3LRV9 Higd1a-201ENSMUST00000060251 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Treml4Q3LRV9 Pcolce-202ENSMUST00000054564 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Treml4Q3LRV9 Ap1s1-201ENSMUST00000111080 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Treml4Q3LRV9 Nrros-201ENSMUST00000099991 2548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Treml4Q3LRV9 Zfp367-202ENSMUST00000117241 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Treml4Q3LRV9 Mff-208ENSMUST00000160786 1645 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Treml4Q3LRV9 Ankrd13a-201ENSMUST00000102578 3717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Treml4Q3LRV9 Isyna1-204ENSMUST00000210005 1914 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Treml4Q3LRV9 Fscn1-207ENSMUST00000198017 2157 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Treml4Q3LRV9 Mfsd4b1-201ENSMUST00000163705 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Treml4Q3LRV9 Stim2-204ENSMUST00000201469 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Treml4Q3LRV9 Lca5l-202ENSMUST00000113804 3162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Treml4Q3LRV9 Platr31-201ENSMUST00000180653 1466 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Treml4Q3LRV9 Pole4-201ENSMUST00000095786 1769 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Treml4Q3LRV9 Rplp2-203ENSMUST00000106004 421 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Treml4Q3LRV9 Ndufb6-202ENSMUST00000108108 480 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Treml4Q3LRV9 Gm13830-201ENSMUST00000124378 417 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Treml4Q3LRV9 A230065H16Rik-201ENSMUST00000150384 670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Treml4Q3LRV9 Ndufaf8-202ENSMUST00000185558 427 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Treml4Q3LRV9 Vsig2-201ENSMUST00000002008 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Treml4Q3LRV9 Lmo1-203ENSMUST00000208136 772 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Treml4Q3LRV9 AC138767.1-201ENSMUST00000222661 415 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Treml4Q3LRV9 1700037H04Rik-201ENSMUST00000028800 832 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Treml4Q3LRV9 Ndufb7-201ENSMUST00000036996 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Treml4Q3LRV9 Thrsp-201ENSMUST00000043077 1277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Treml4Q3LRV9 Col4a3bp-202ENSMUST00000109444 5285 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Treml4Q3LRV9 Gins4-201ENSMUST00000033950 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Treml4Q3LRV9 Zcchc17-202ENSMUST00000134159 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Treml4Q3LRV9 2810408A11Rik-203ENSMUST00000102580 1640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Treml4Q3LRV9 Gbe1-206ENSMUST00000170464 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Treml4Q3LRV9 Antxr2-202ENSMUST00000199088 2739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Treml4Q3LRV9 Lhfp-203ENSMUST00000147139 1932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Treml4Q3LRV9 Adgra2-201ENSMUST00000033876 5760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Treml4Q3LRV9 Galnt18-202ENSMUST00000106663 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Treml4Q3LRV9 Kcnn1-208ENSMUST00000212611 2528 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Treml4Q3LRV9 Shpk-201ENSMUST00000006105 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Treml4Q3LRV9 Rybp-201ENSMUST00000101118 4503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Treml4Q3LRV9 Mtch2-205ENSMUST00000136872 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Treml4Q3LRV9 Gm10435-202ENSMUST00000162526 2878 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Treml4Q3LRV9 Crhbp-201ENSMUST00000045583 1701 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Treml4Q3LRV9 Agap1-204ENSMUST00000190096 4078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Treml4Q3LRV9 Gm9917-202ENSMUST00000181099 1499 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Treml4Q3LRV9 Prdm5-201ENSMUST00000031973 1488 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Treml4Q3LRV9 Hmbox1-203ENSMUST00000175744 1771 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Treml4Q3LRV9 Ptgfrn-201ENSMUST00000102694 5902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Treml4Q3LRV9 Sprn-201ENSMUST00000059241 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Treml4Q3LRV9 Atrnl1-201ENSMUST00000077282 6581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Treml4Q3LRV9 Dnajc24-201ENSMUST00000102555 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Treml4Q3LRV9 Trmt112-ps2-201ENSMUST00000117987 378 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Treml4Q3LRV9 Gm20324-201ENSMUST00000186291 1118 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Treml4Q3LRV9 Snrpf-201ENSMUST00000020203 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Treml4Q3LRV9 Gm5145-201ENSMUST00000095633 837 ntAPPRIS P1 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Treml4Q3LRV9 Srpr-201ENSMUST00000034541 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Treml4Q3LRV9 Tlk2-204ENSMUST00000106941 3699 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Treml4Q3LRV9 Tmem116-203ENSMUST00000094357 1366 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Treml4Q3LRV9 Wasf3-201ENSMUST00000016143 5196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Treml4Q3LRV9 Tapt1-201ENSMUST00000055128 3513 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Treml4Q3LRV9 Mier2-212ENSMUST00000172158 1400 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Treml4Q3LRV9 Pla2g10-201ENSMUST00000023364 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Treml4Q3LRV9 Amigo2-201ENSMUST00000053106 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Treml4Q3LRV9 Crocc-211ENSMUST00000168157 6244 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Treml4Q3LRV9 Acads-201ENSMUST00000031524 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Treml4Q3LRV9 Pitx2-207ENSMUST00000174661 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Treml4Q3LRV9 Atp11a-202ENSMUST00000091237 7443 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Treml4Q3LRV9 Lonrf1-201ENSMUST00000065297 3930 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
Treml4Q3LRV9 Emd-201ENSMUST00000002029 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Treml4Q3LRV9 Ccdc6-203ENSMUST00000147545 5511 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
Treml4Q3LRV9 Phf7-203ENSMUST00000226565 1971 ntBASIC15.33■□□□□ 0.05
Treml4Q3LRV9 Zfp879-203ENSMUST00000109134 2414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Treml4Q3LRV9 Zfp879-201ENSMUST00000049625 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Treml4Q3LRV9 Chst8-203ENSMUST00000154629 2079 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Treml4Q3LRV9 Chsy3-201ENSMUST00000080721 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Treml4Q3LRV9 Atf7-209ENSMUST00000184485 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.6 ms