Protein–RNA interactions for Protein: Q1A3B0

Cers3, Ceramide synthase 3, mousemouse

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Length 383 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cers3Q1A3B0 Ocel1-203ENSMUST00000110052 5285 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Cers3Q1A3B0 Ccdc24-201ENSMUST00000106422 1365 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Cers3Q1A3B0 Dtd1-201ENSMUST00000028917 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Cers3Q1A3B0 Tpt1-201ENSMUST00000110894 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Cers3Q1A3B0 C230012O17Rik-201ENSMUST00000130085 2999 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Cers3Q1A3B0 Fbxo17-205ENSMUST00000167118 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
Cers3Q1A3B0 6430573P05Rik-202ENSMUST00000192648 597 ntTSL 3 BASIC20.52■□□□□ 0.88
Cers3Q1A3B0 Timm10b-211ENSMUST00000210350 529 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
Cers3Q1A3B0 Vti1a-206ENSMUST00000225529 1244 ntBASIC20.52■□□□□ 0.88
Cers3Q1A3B0 AC154757.1-201ENSMUST00000228289 336 ntBASIC20.52■□□□□ 0.88
Cers3Q1A3B0 Ndufb9-201ENSMUST00000022980 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Cers3Q1A3B0 Acyp2-201ENSMUST00000074613 863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Cers3Q1A3B0 Lce3f-201ENSMUST00000090863 611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Cers3Q1A3B0 A930012L18Rik-201ENSMUST00000181094 2364 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Cers3Q1A3B0 Trim7-201ENSMUST00000046903 2161 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
Cers3Q1A3B0 Pdcl3-201ENSMUST00000027247 3914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
Cers3Q1A3B0 Rasgef1b-205ENSMUST00000161148 2430 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
Cers3Q1A3B0 Mink1-201ENSMUST00000072237 4994 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.87
Cers3Q1A3B0 Slc25a20-201ENSMUST00000035222 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Cers3Q1A3B0 Obsl1-202ENSMUST00000113567 5679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Cers3Q1A3B0 Gm10505-201ENSMUST00000151398 1587 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Cers3Q1A3B0 Klf14-201ENSMUST00000101589 3056 ntAPPRIS P1 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Cers3Q1A3B0 Ciz1-201ENSMUST00000048964 2771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Cers3Q1A3B0 Csrp3-202ENSMUST00000167786 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Cers3Q1A3B0 Coa3-201ENSMUST00000017332 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Cers3Q1A3B0 Mir5126-201ENSMUST00000175513 77 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
Cers3Q1A3B0 Gm26695-201ENSMUST00000180920 1251 ntTSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Cers3Q1A3B0 Gm5712-201ENSMUST00000199748 1043 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
Cers3Q1A3B0 Gm7506-201ENSMUST00000207758 815 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
Cers3Q1A3B0 Gm8655-201ENSMUST00000221159 852 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
Cers3Q1A3B0 Tbcc-201ENSMUST00000040434 1164 ntAPPRIS P1 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Cers3Q1A3B0 Anp32a-201ENSMUST00000085519 2113 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Cers3Q1A3B0 Ina-201ENSMUST00000037636 3240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Cers3Q1A3B0 Rab6a-202ENSMUST00000098252 3110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Cers3Q1A3B0 Htr6-202ENSMUST00000105802 2341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Cers3Q1A3B0 Actg1-202ENSMUST00000071555 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Cers3Q1A3B0 Hspa1l-201ENSMUST00000007248 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Cers3Q1A3B0 Ppil3-204ENSMUST00000117069 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Cers3Q1A3B0 Tigd3-201ENSMUST00000055911 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Cers3Q1A3B0 Tmem116-203ENSMUST00000094357 1366 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Cers3Q1A3B0 Cnih1-201ENSMUST00000015903 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Cers3Q1A3B0 Nfix-204ENSMUST00000109764 5476 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Cers3Q1A3B0 Arl4a-201ENSMUST00000101472 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Cers3Q1A3B0 Gm32031-203ENSMUST00000208993 649 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Cers3Q1A3B0 Tmem52-201ENSMUST00000023920 932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Cers3Q1A3B0 Myl12b-201ENSMUST00000038446 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Cers3Q1A3B0 2300002M23Rik-201ENSMUST00000044326 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Cers3Q1A3B0 Sf3b6-201ENSMUST00000046207 1180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Cers3Q1A3B0 Lce1l-201ENSMUST00000054426 670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Cers3Q1A3B0 Irgq-201ENSMUST00000049020 6083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Cers3Q1A3B0 Lmo4-202ENSMUST00000121112 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Cers3Q1A3B0 Amigo2-201ENSMUST00000053106 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Cers3Q1A3B0 Ecel1-204ENSMUST00000161002 3033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Cers3Q1A3B0 St3gal2-201ENSMUST00000034197 4396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Cers3Q1A3B0 Wdr13-202ENSMUST00000115623 1749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Cers3Q1A3B0 Etnk2-203ENSMUST00000135222 2297 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Cers3Q1A3B0 Fmr1-201ENSMUST00000088546 4409 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Cers3Q1A3B0 Gm16863-201ENSMUST00000181476 2431 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Cers3Q1A3B0 Gm26548-201ENSMUST00000181165 2029 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Cers3Q1A3B0 Insm1-201ENSMUST00000089257 3100 ntAPPRIS P1 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Cers3Q1A3B0 Lrrfip1-212ENSMUST00000189617 2155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Cers3Q1A3B0 Matn4-201ENSMUST00000103103 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Cers3Q1A3B0 Atp5a1-201ENSMUST00000026495 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Cers3Q1A3B0 Rgs6-206ENSMUST00000186309 1693 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Cers3Q1A3B0 Chst13-201ENSMUST00000070890 1653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Cers3Q1A3B0 Pgap2-203ENSMUST00000120119 1979 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Cers3Q1A3B0 Bhlhb9-201ENSMUST00000068755 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Cers3Q1A3B0 Cd164l2-201ENSMUST00000105910 986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Cers3Q1A3B0 Timm23-206ENSMUST00000170331 777 ntTSL 3 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Cers3Q1A3B0 Gm4189-202ENSMUST00000174167 367 ntTSL 3 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Cers3Q1A3B0 D530033B14Rik-201ENSMUST00000205412 546 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Cers3Q1A3B0 Il3ra-205ENSMUST00000224877 1128 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Cers3Q1A3B0 1700019N19Rik-201ENSMUST00000028299 970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Cers3Q1A3B0 Tmed9-201ENSMUST00000109905 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Cers3Q1A3B0 Atp9a-211ENSMUST00000178504 3668 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Cers3Q1A3B0 Gm3248-201ENSMUST00000163885 2055 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Cers3Q1A3B0 Clcn2-202ENSMUST00000120099 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Cers3Q1A3B0 Ubr5-201ENSMUST00000110336 9242 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Cers3Q1A3B0 Snx27-201ENSMUST00000029783 6261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Cers3Q1A3B0 Krt81-201ENSMUST00000061185 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Cers3Q1A3B0 Atp8b2-202ENSMUST00000107396 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Cers3Q1A3B0 Mef2b-201ENSMUST00000110140 1223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Cers3Q1A3B0 Mef2b-202ENSMUST00000110141 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Cers3Q1A3B0 Gm4459-201ENSMUST00000118750 468 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
Cers3Q1A3B0 Gm13418-201ENSMUST00000119097 944 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
Cers3Q1A3B0 Gm37584-201ENSMUST00000193595 1290 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
Cers3Q1A3B0 Cenpp-201ENSMUST00000021818 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Cers3Q1A3B0 Ppt1-202ENSMUST00000097902 1191 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Cers3Q1A3B0 Mrgpra9-201ENSMUST00000098436 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Cers3Q1A3B0 Olah-203ENSMUST00000194918 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Cers3Q1A3B0 Dlgap2-203ENSMUST00000133298 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Cers3Q1A3B0 Wipf1-202ENSMUST00000102679 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Cers3Q1A3B0 Amigo1-202ENSMUST00000106656 5482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Cers3Q1A3B0 Slc25a11-201ENSMUST00000014750 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Cers3Q1A3B0 Dclk2-208ENSMUST00000194452 2066 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Cers3Q1A3B0 Whrn-207ENSMUST00000107393 4028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Cers3Q1A3B0 Whrn-201ENSMUST00000063650 4016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Cers3Q1A3B0 Pbx4-201ENSMUST00000081503 1560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Cers3Q1A3B0 Whrn-203ENSMUST00000084510 4049 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Cers3Q1A3B0 Srf-201ENSMUST00000015749 4093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
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