Protein–RNA interactions for Protein: Q14C51

Ptcd3, Pentatricopeptide repeat domain-containing protein 3, mitochondrial, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 685 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ptcd3Q14C51 Jmy-201ENSMUST00000065537 8776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Ptcd3Q14C51 Capn1-202ENSMUST00000164843 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Ptcd3Q14C51 Pex11a-201ENSMUST00000032761 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Ptcd3Q14C51 Rgs6-206ENSMUST00000186309 1693 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Ptcd3Q14C51 Dohh-201ENSMUST00000072751 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Ptcd3Q14C51 Sufu-202ENSMUST00000111867 1747 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Ptcd3Q14C51 Ap2a2-201ENSMUST00000003038 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Ptcd3Q14C51 E330011M16Rik-201ENSMUST00000193614 1794 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
Ptcd3Q14C51 Fbxo33-201ENSMUST00000043204 3688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Ptcd3Q14C51 Large2-215ENSMUST00000176810 2477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Ptcd3Q14C51 Hps4-201ENSMUST00000035279 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Ptcd3Q14C51 Edf1-201ENSMUST00000015236 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Ptcd3Q14C51 Pym1-202ENSMUST00000163377 1158 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Ptcd3Q14C51 Gm29103-201ENSMUST00000191034 598 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Ptcd3Q14C51 Gm43347-201ENSMUST00000200226 580 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
Ptcd3Q14C51 Pard3-209ENSMUST00000160272 5815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Ptcd3Q14C51 Cacng6-202ENSMUST00000183200 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Ptcd3Q14C51 Wipf1-202ENSMUST00000102679 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Ptcd3Q14C51 Mif4gd-201ENSMUST00000021087 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Ptcd3Q14C51 Coro1a-202ENSMUST00000106364 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Ptcd3Q14C51 H13-204ENSMUST00000125366 5204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Ptcd3Q14C51 Ube2e1-201ENSMUST00000022296 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Ptcd3Q14C51 Zbtb45-201ENSMUST00000051390 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Ptcd3Q14C51 Plekha7-210ENSMUST00000182834 5257 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Ptcd3Q14C51 Ecel1-204ENSMUST00000161002 3033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Ptcd3Q14C51 Eml2-203ENSMUST00000120595 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Ptcd3Q14C51 Synm-205ENSMUST00000208815 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Ptcd3Q14C51 Uhrf2-201ENSMUST00000025739 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Ptcd3Q14C51 Wdr45-201ENSMUST00000043045 1609 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Ptcd3Q14C51 Axin1-203ENSMUST00000163421 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Ptcd3Q14C51 Eps8-201ENSMUST00000058210 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Ptcd3Q14C51 Gm26526-201ENSMUST00000181075 2927 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Ptcd3Q14C51 1700066B19Rik-201ENSMUST00000097617 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Ptcd3Q14C51 Selenoh-201ENSMUST00000102646 783 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Ptcd3Q14C51 Pemt-203ENSMUST00000102693 961 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Ptcd3Q14C51 Kxd1-202ENSMUST00000117580 696 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Ptcd3Q14C51 Gm12644-201ENSMUST00000119935 606 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
Ptcd3Q14C51 Slc19a2-204ENSMUST00000169394 894 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Ptcd3Q14C51 Syne4-208ENSMUST00000176304 1006 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Ptcd3Q14C51 Selenoh-206ENSMUST00000189988 390 ntTSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Ptcd3Q14C51 1700001G17Rik-201ENSMUST00000191779 889 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
Ptcd3Q14C51 Gm36967-201ENSMUST00000193814 266 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
Ptcd3Q14C51 Gm44454-201ENSMUST00000198541 138 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
Ptcd3Q14C51 Gm45890-204ENSMUST00000212356 545 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Ptcd3Q14C51 Fam135a-201ENSMUST00000027337 5536 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Ptcd3Q14C51 Zkscan2-203ENSMUST00000128217 2218 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Ptcd3Q14C51 Tssc4-206ENSMUST00000177841 1364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Ptcd3Q14C51 Edem1-201ENSMUST00000089162 5817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Ptcd3Q14C51 Ankrd61-202ENSMUST00000110717 1498 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Ptcd3Q14C51 Gm13283-201ENSMUST00000191112 1463 ntAPPRIS P1 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Ptcd3Q14C51 Gm9821-201ENSMUST00000178895 1953 ntAPPRIS P1 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Ptcd3Q14C51 Tmem214-202ENSMUST00000201203 6110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Ptcd3Q14C51 Iqgap2-201ENSMUST00000068603 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Ptcd3Q14C51 Uso1-204ENSMUST00000202155 3707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Ptcd3Q14C51 Lrp3-201ENSMUST00000118444 3877 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Ptcd3Q14C51 Mtmr3-202ENSMUST00000109943 5674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Ptcd3Q14C51 Zfp512b-201ENSMUST00000108789 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Ptcd3Q14C51 Gm15165-201ENSMUST00000118140 502 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
Ptcd3Q14C51 Gm27867-201ENSMUST00000184778 125 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
Ptcd3Q14C51 Gm29246-201ENSMUST00000189221 349 ntTSL 3 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Ptcd3Q14C51 4931422A03Rik-201ENSMUST00000056170 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Ptcd3Q14C51 Zfp92-202ENSMUST00000086470 2050 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Ptcd3Q14C51 Lonp2-201ENSMUST00000034141 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Ptcd3Q14C51 Map3k10-201ENSMUST00000036453 3682 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Ptcd3Q14C51 Atxn7l2-204ENSMUST00000119650 2274 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Ptcd3Q14C51 Gm36858-201ENSMUST00000194501 2391 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
Ptcd3Q14C51 Fcho1-209ENSMUST00000146100 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Ptcd3Q14C51 Baiap2-204ENSMUST00000106231 4005 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Ptcd3Q14C51 Aspscr1-204ENSMUST00000106159 1615 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Ptcd3Q14C51 Vsig10l-204ENSMUST00000203769 2473 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Ptcd3Q14C51 Agk-201ENSMUST00000031977 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Ptcd3Q14C51 Sf1-202ENSMUST00000113487 2649 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Ptcd3Q14C51 Tnrc6c-202ENSMUST00000106344 8847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Ptcd3Q14C51 F830208F22Rik-202ENSMUST00000143732 2891 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Ptcd3Q14C51 Cacna2d2-203ENSMUST00000164988 5542 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Ptcd3Q14C51 Inpp4a-201ENSMUST00000027287 5691 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Ptcd3Q14C51 Rbck1-202ENSMUST00000109847 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Ptcd3Q14C51 Gm11729-201ENSMUST00000124901 713 ntTSL 3 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Ptcd3Q14C51 Ssr2-205ENSMUST00000193934 569 ntTSL 3 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Ptcd3Q14C51 Snrpf-201ENSMUST00000020203 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Ptcd3Q14C51 Cmtm5-203ENSMUST00000227441 610 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
Ptcd3Q14C51 AC114585.2-202ENSMUST00000228094 426 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
Ptcd3Q14C51 Tmem94-202ENSMUST00000103033 5238 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Ptcd3Q14C51 Cdv3-207ENSMUST00000190226 3107 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Ptcd3Q14C51 Unc13b-201ENSMUST00000079978 6354 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Ptcd3Q14C51 Rab6b-201ENSMUST00000035155 5007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Ptcd3Q14C51 Borcs5-201ENSMUST00000062755 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Ptcd3Q14C51 Adamtsl1-201ENSMUST00000048885 1842 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Ptcd3Q14C51 Grwd1-201ENSMUST00000107723 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Ptcd3Q14C51 Nfe2l1-202ENSMUST00000107657 3869 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Ptcd3Q14C51 Cdc42ep3-201ENSMUST00000068958 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Ptcd3Q14C51 Gpaa1-201ENSMUST00000023221 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Ptcd3Q14C51 Vgf-201ENSMUST00000041543 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Ptcd3Q14C51 Arid1a-205ENSMUST00000145664 8187 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Ptcd3Q14C51 Cbarp-201ENSMUST00000105369 3121 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Ptcd3Q14C51 Adnp-202ENSMUST00000088001 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Ptcd3Q14C51 Usp47-201ENSMUST00000106653 5540 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Ptcd3Q14C51 Scml4-203ENSMUST00000105495 1033 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Ptcd3Q14C51 Pih1d1-202ENSMUST00000107811 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Ptcd3Q14C51 Ubl7-201ENSMUST00000163329 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 54.1 ms