Protein–RNA interactions for Protein: Q148B6

Spatc1, Speriolin, mousemouse

Predictions only

Length 480 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Spatc1Q148B6 Gm11973-203ENSMUST00000155498 867 ntTSL 3 BASIC14.17□□□□□ -0.14
Spatc1Q148B6 Gm18958-201ENSMUST00000174258 762 ntBASIC14.17□□□□□ -0.14
Spatc1Q148B6 Calml4-206ENSMUST00000215870 803 ntTSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Spatc1Q148B6 Wapl-201ENSMUST00000048263 6351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Spatc1Q148B6 Crem-239ENSMUST00000165086 2778 ntTSL 5 BASIC14.17□□□□□ -0.14
Spatc1Q148B6 Tmem87b-201ENSMUST00000110325 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Spatc1Q148B6 Zfp786-201ENSMUST00000058844 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Spatc1Q148B6 Rbck1-202ENSMUST00000109847 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Spatc1Q148B6 Wrb-201ENSMUST00000023913 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Spatc1Q148B6 Fhl2-201ENSMUST00000008280 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Spatc1Q148B6 Kcna6-204ENSMUST00000185333 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Spatc1Q148B6 Atp1a1-201ENSMUST00000036493 3679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Spatc1Q148B6 Slc29a4-201ENSMUST00000058418 2789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Spatc1Q148B6 Foxo3-201ENSMUST00000056974 2889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Spatc1Q148B6 Mpst-203ENSMUST00000169133 1309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.16□□□□□ -0.14
Spatc1Q148B6 Apoa5-202ENSMUST00000121598 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Spatc1Q148B6 E130307A14Rik-213ENSMUST00000155482 2803 ntTSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Spatc1Q148B6 Crem-203ENSMUST00000082141 2820 ntTSL 5 BASIC14.16□□□□□ -0.14
Spatc1Q148B6 Pld2-203ENSMUST00000108557 3655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Spatc1Q148B6 Gm36858-201ENSMUST00000194501 2391 ntBASIC14.16□□□□□ -0.14
Spatc1Q148B6 Mdm1-204ENSMUST00000169817 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Spatc1Q148B6 Hilpda-202ENSMUST00000115289 658 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.16□□□□□ -0.14
Spatc1Q148B6 Ubtf-207ENSMUST00000128016 1062 ntTSL 2 BASIC14.16□□□□□ -0.14
Spatc1Q148B6 Gm17182-201ENSMUST00000163795 860 ntTSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Spatc1Q148B6 Zfas1-205ENSMUST00000189909 738 ntTSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
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Spatc1Q148B6 Lsm10-201ENSMUST00000055575 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Spatc1Q148B6 BC048679-201ENSMUST00000073406 522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Spatc1Q148B6 Slc15a3-201ENSMUST00000025646 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Spatc1Q148B6 Zfc3h1-201ENSMUST00000036044 6957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
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Spatc1Q148B6 Snapc3-201ENSMUST00000030206 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
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Spatc1Q148B6 Nrros-201ENSMUST00000099991 2548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Spatc1Q148B6 Ube2r2-201ENSMUST00000040008 3600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Spatc1Q148B6 Sgsm2-201ENSMUST00000057631 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Spatc1Q148B6 Ttyh1-217ENSMUST00000206869 1491 ntTSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
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Spatc1Q148B6 Ssr2-207ENSMUST00000195014 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
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Spatc1Q148B6 Rcc1-203ENSMUST00000105951 2326 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.15□□□□□ -0.14
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Spatc1Q148B6 Kdelr2-201ENSMUST00000110731 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Spatc1Q148B6 Mrpl49-201ENSMUST00000007482 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
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Spatc1Q148B6 Tnfaip2-202ENSMUST00000109792 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
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Spatc1Q148B6 Steap1-201ENSMUST00000015796 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
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Spatc1Q148B6 Banf1-201ENSMUST00000025762 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Spatc1Q148B6 Foxp4-202ENSMUST00000113262 3198 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Spatc1Q148B6 Atp2b2-201ENSMUST00000089003 7067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Spatc1Q148B6 Chn1-209ENSMUST00000166199 3876 ntTSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Spatc1Q148B6 Trim25-202ENSMUST00000100627 1433 ntTSL 5 BASIC14.14□□□□□ -0.15
Spatc1Q148B6 Col18a1-202ENSMUST00000081654 5063 ntTSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Spatc1Q148B6 B4galt3-205ENSMUST00000126699 1758 ntTSL 5 BASIC14.14□□□□□ -0.15
Spatc1Q148B6 Gprc5b-201ENSMUST00000008878 4518 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Spatc1Q148B6 Asic4-201ENSMUST00000037708 2464 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Spatc1Q148B6 Dlk2-202ENSMUST00000166280 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Spatc1Q148B6 Klhl40-201ENSMUST00000098272 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Spatc1Q148B6 Fam214a-202ENSMUST00000170846 4355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.13□□□□□ -0.15
Spatc1Q148B6 Cnbd2-201ENSMUST00000037096 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Spatc1Q148B6 Plac9a-201ENSMUST00000052286 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Spatc1Q148B6 Trim31-201ENSMUST00000078438 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Spatc1Q148B6 Dsg2-202ENSMUST00000120102 3590 ntTSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Spatc1Q148B6 Ttc13-203ENSMUST00000118134 3277 ntTSL 5 BASIC14.13□□□□□ -0.15
Spatc1Q148B6 Vps37a-201ENSMUST00000098817 6379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Spatc1Q148B6 Lrrc36-206ENSMUST00000216765 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.13□□□□□ -0.15
Spatc1Q148B6 Tcf3-207ENSMUST00000105343 2920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Spatc1Q148B6 Ankra2-204ENSMUST00000150352 2217 ntTSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Spatc1Q148B6 Klhdc8b-201ENSMUST00000035232 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Spatc1Q148B6 Rpl18-ps2-201ENSMUST00000118863 567 ntBASIC14.13□□□□□ -0.15
Spatc1Q148B6 Gm11539-201ENSMUST00000119837 557 ntBASIC14.13□□□□□ -0.15
Spatc1Q148B6 Gm13436-201ENSMUST00000120418 567 ntBASIC14.13□□□□□ -0.15
Spatc1Q148B6 Gm13559-201ENSMUST00000120476 863 ntBASIC14.13□□□□□ -0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 135 ms