Protein–RNA interactions for Protein: Q0VG85

Ccdc162p, Coiled-coil domain-containing protein 162, mousemouse

Predictions only

Length 912 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc162pQ0VG85 Rilpl1-201ENSMUST00000062153 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Ccdc162pQ0VG85 Mettl16-201ENSMUST00000010698 2073 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Ccdc162pQ0VG85 Hebp2-203ENSMUST00000214548 2083 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Ccdc162pQ0VG85 Haus3-201ENSMUST00000060049 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Ccdc162pQ0VG85 Isl2-201ENSMUST00000034869 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Ccdc162pQ0VG85 Gm12866-201ENSMUST00000128998 1671 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Ccdc162pQ0VG85 Stxbp6-201ENSMUST00000053768 4553 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Ccdc162pQ0VG85 Smox-208ENSMUST00000110188 1991 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Ccdc162pQ0VG85 Men1-204ENSMUST00000113500 2742 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Ccdc162pQ0VG85 Nectin2-201ENSMUST00000075447 2735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Ccdc162pQ0VG85 Med26-201ENSMUST00000058534 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Ccdc162pQ0VG85 Smarcc1-204ENSMUST00000197984 3538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Ccdc162pQ0VG85 Dok2-201ENSMUST00000022698 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Ccdc162pQ0VG85 Adamtsl5-202ENSMUST00000105352 989 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Ccdc162pQ0VG85 Prcd-201ENSMUST00000106381 724 ntTSL 3 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Ccdc162pQ0VG85 1110004F10Rik-202ENSMUST00000106607 1153 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Ccdc162pQ0VG85 Gm13647-201ENSMUST00000154654 622 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Ccdc162pQ0VG85 Cldn3-201ENSMUST00000094245 1259 ntAPPRIS P1 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Ccdc162pQ0VG85 D430001F17Rik-201ENSMUST00000141344 1858 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Ccdc162pQ0VG85 Rflnb-201ENSMUST00000021207 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Ccdc162pQ0VG85 Errfi1-201ENSMUST00000030811 3043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Ccdc162pQ0VG85 Khdc1c-201ENSMUST00000070223 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Ccdc162pQ0VG85 Tbc1d10b-201ENSMUST00000120705 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Ccdc162pQ0VG85 Ccdc158-204ENSMUST00000151180 3352 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Ccdc162pQ0VG85 1190002N15Rik-201ENSMUST00000113028 3950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Ccdc162pQ0VG85 Mmp17-201ENSMUST00000031390 6422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Ccdc162pQ0VG85 Zfp385b-202ENSMUST00000111829 2073 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Ccdc162pQ0VG85 Rsu1-201ENSMUST00000028059 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Ccdc162pQ0VG85 Cdc42se2-201ENSMUST00000064104 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Ccdc162pQ0VG85 Selplg-201ENSMUST00000100874 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Ccdc162pQ0VG85 Sox1ot-201ENSMUST00000080795 5064 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Ccdc162pQ0VG85 Pts-208ENSMUST00000215416 439 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Ccdc162pQ0VG85 Mau2-204ENSMUST00000212308 2887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Ccdc162pQ0VG85 Pcdhb22-201ENSMUST00000097609 2266 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Ccdc162pQ0VG85 Cnih3-201ENSMUST00000027795 2668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Ccdc162pQ0VG85 Mios-201ENSMUST00000040017 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Ccdc162pQ0VG85 Chn1-203ENSMUST00000112024 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Ccdc162pQ0VG85 Chn1-210ENSMUST00000180045 4050 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Ccdc162pQ0VG85 Sacs-204ENSMUST00000121091 4581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Ccdc162pQ0VG85 Sorbs1-213ENSMUST00000225153 3589 ntAPPRIS P4 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Ccdc162pQ0VG85 B3gat2-203ENSMUST00000144602 1488 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
Ccdc162pQ0VG85 Npdc1-202ENSMUST00000071442 1485 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
Ccdc162pQ0VG85 Mtmr12-201ENSMUST00000038172 6840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
Ccdc162pQ0VG85 Cd40-202ENSMUST00000073707 1596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Ccdc162pQ0VG85 Rnf14-203ENSMUST00000171461 3351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Ccdc162pQ0VG85 Ndufa12-204ENSMUST00000179990 566 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Ccdc162pQ0VG85 Gm27405-201ENSMUST00000184201 112 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
Ccdc162pQ0VG85 2310001K24Rik-202ENSMUST00000186760 740 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Ccdc162pQ0VG85 Gm36210-201ENSMUST00000210663 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Ccdc162pQ0VG85 Plekha4-207ENSMUST00000211227 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Ccdc162pQ0VG85 Olfr1232-201ENSMUST00000099785 936 ntAPPRIS P1 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Ccdc162pQ0VG85 Tacstd2-201ENSMUST00000058178 1735 ntAPPRIS P1 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Ccdc162pQ0VG85 Slc25a20-201ENSMUST00000035222 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Ccdc162pQ0VG85 Sctr-202ENSMUST00000189037 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Ccdc162pQ0VG85 Ankrd17-203ENSMUST00000168058 9311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Ccdc162pQ0VG85 Tbp-201ENSMUST00000014911 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Ccdc162pQ0VG85 Ntng1-204ENSMUST00000106571 1446 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Ccdc162pQ0VG85 Ntng1-210ENSMUST00000138953 1443 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Ccdc162pQ0VG85 Csf3-201ENSMUST00000038886 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Ccdc162pQ0VG85 Aifm2-201ENSMUST00000067857 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Ccdc162pQ0VG85 She-201ENSMUST00000050401 5733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Ccdc162pQ0VG85 Matn1-201ENSMUST00000102576 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Ccdc162pQ0VG85 Tead3-206ENSMUST00000156862 2573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Ccdc162pQ0VG85 Dffb-201ENSMUST00000030893 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Ccdc162pQ0VG85 Mfge8-201ENSMUST00000032825 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Ccdc162pQ0VG85 Brap-201ENSMUST00000031414 3744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Ccdc162pQ0VG85 Slc35c1-202ENSMUST00000125276 2668 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Ccdc162pQ0VG85 3110002H16Rik-201ENSMUST00000025276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Ccdc162pQ0VG85 Tox2-201ENSMUST00000099110 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Ccdc162pQ0VG85 Etnk2-203ENSMUST00000135222 2297 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Ccdc162pQ0VG85 Fbxl7-201ENSMUST00000059204 4632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Ccdc162pQ0VG85 Osbpl1a-206ENSMUST00000121774 2931 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Ccdc162pQ0VG85 Pde4b-208ENSMUST00000106911 3020 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Ccdc162pQ0VG85 Gtf2a2-204ENSMUST00000119905 622 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Ccdc162pQ0VG85 2900072N19Rik-201ENSMUST00000123840 806 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Ccdc162pQ0VG85 Tpsg1-204ENSMUST00000160920 867 ntTSL 3 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Ccdc162pQ0VG85 Hist2h3c2-201ENSMUST00000167403 1020 ntAPPRIS P1 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Ccdc162pQ0VG85 Gm20544-201ENSMUST00000174338 690 ntTSL 3 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Ccdc162pQ0VG85 Tspan2-203ENSMUST00000196611 682 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Ccdc162pQ0VG85 Mrpl52-204ENSMUST00000199195 463 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Ccdc162pQ0VG85 Ypel1-202ENSMUST00000090199 631 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Ccdc162pQ0VG85 Gm26560-201ENSMUST00000181240 2619 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Ccdc162pQ0VG85 Unc13b-201ENSMUST00000079978 6354 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Ccdc162pQ0VG85 Mmp23-201ENSMUST00000030937 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Ccdc162pQ0VG85 Mphosph8-201ENSMUST00000116468 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Ccdc162pQ0VG85 Safb-207ENSMUST00000182533 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Ccdc162pQ0VG85 Snx27-201ENSMUST00000029783 6261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Ccdc162pQ0VG85 Nrn1-201ENSMUST00000037623 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Ccdc162pQ0VG85 Nabp1-205ENSMUST00000186684 2677 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Ccdc162pQ0VG85 Mms22l-202ENSMUST00000108222 4478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Ccdc162pQ0VG85 Myb-203ENSMUST00000188495 3693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Ccdc162pQ0VG85 Cant1-204ENSMUST00000106288 2873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Ccdc162pQ0VG85 Casc3-201ENSMUST00000017384 3963 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Ccdc162pQ0VG85 Col13a1-203ENSMUST00000105452 3037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Ccdc162pQ0VG85 Hs3st5-201ENSMUST00000058738 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Ccdc162pQ0VG85 Itga5-201ENSMUST00000023128 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Ccdc162pQ0VG85 Stmn4-202ENSMUST00000118426 1281 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Ccdc162pQ0VG85 Tmem234-215ENSMUST00000173758 453 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Ccdc162pQ0VG85 Il3ra-202ENSMUST00000223589 738 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
Ccdc162pQ0VG85 Wasl-202ENSMUST00000041737 1298 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.7 ms