Protein–RNA interactions for Protein: Q0VF76

Ttc39d, Tetratricopeptide repeat domain 39D, mousemouse

Predictions only

Length 604 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ttc39dQ0VF76 Prr23a1-201ENSMUST00000170349 883 ntAPPRIS P1 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Ttc39dQ0VF76 Mrpl21-202ENSMUST00000025745 1138 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Ttc39dQ0VF76 Krtcap3-201ENSMUST00000054829 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Ttc39dQ0VF76 Rpl27-201ENSMUST00000077856 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Ttc39dQ0VF76 Nagk-203ENSMUST00000113851 1323 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Ttc39dQ0VF76 Crhr2-203ENSMUST00000114374 1440 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Ttc39dQ0VF76 Fam83f-201ENSMUST00000023044 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Ttc39dQ0VF76 Gm15442-201ENSMUST00000117905 1527 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
Ttc39dQ0VF76 Kcnq5-203ENSMUST00000115300 6975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Ttc39dQ0VF76 Lrrc7-201ENSMUST00000106044 5918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Ttc39dQ0VF76 Atg7-215ENSMUST00000183165 2012 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Ttc39dQ0VF76 Vmn1r17-204ENSMUST00000228294 2084 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Ttc39dQ0VF76 Fars2-201ENSMUST00000021857 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Ttc39dQ0VF76 Taok3-202ENSMUST00000111975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Ttc39dQ0VF76 Fam46b-201ENSMUST00000051676 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Ttc39dQ0VF76 Rgs9-201ENSMUST00000020920 2434 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Ttc39dQ0VF76 Ptges2-201ENSMUST00000028162 4978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Ttc39dQ0VF76 Ngly1-201ENSMUST00000022310 2935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Ttc39dQ0VF76 Fndc11-202ENSMUST00000108835 1154 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Ttc39dQ0VF76 Atp6v1g2-203ENSMUST00000130992 524 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Ttc39dQ0VF76 Tbx3os2-201ENSMUST00000135385 1345 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Ttc39dQ0VF76 Rapgef3os1-201ENSMUST00000149373 483 ntTSL 3 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Ttc39dQ0VF76 Plxnd1-201ENSMUST00000015511 6907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Ttc39dQ0VF76 Abcg5-202ENSMUST00000163375 1613 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Ttc39dQ0VF76 Sctr-202ENSMUST00000189037 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Ttc39dQ0VF76 Gm13283-201ENSMUST00000191112 1463 ntAPPRIS P1 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Ttc39dQ0VF76 Tmem214-202ENSMUST00000201203 6110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Ttc39dQ0VF76 Xrcc1-205ENSMUST00000205573 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Ttc39dQ0VF76 Ttc32-203ENSMUST00000219488 768 ntTSL 3 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Ttc39dQ0VF76 Haus4-201ENSMUST00000022784 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Ttc39dQ0VF76 Mtx2-201ENSMUST00000028511 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Ttc39dQ0VF76 Srrd-201ENSMUST00000031289 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Ttc39dQ0VF76 Ctu1-201ENSMUST00000038332 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Ttc39dQ0VF76 Nfkbid-201ENSMUST00000046177 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Ttc39dQ0VF76 Lce1h-201ENSMUST00000051521 706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Ttc39dQ0VF76 Lgals7-201ENSMUST00000081457 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Ttc39dQ0VF76 Podnl1-201ENSMUST00000093380 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Ttc39dQ0VF76 Cdc25a-201ENSMUST00000094324 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Ttc39dQ0VF76 Plcl2-201ENSMUST00000043938 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Ttc39dQ0VF76 Rab11fip4-201ENSMUST00000017783 7156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Ttc39dQ0VF76 Stradb-201ENSMUST00000027185 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Ttc39dQ0VF76 Synpo-201ENSMUST00000097566 5060 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Ttc39dQ0VF76 Snx9-201ENSMUST00000002436 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Ttc39dQ0VF76 Tfeb-204ENSMUST00000113288 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Ttc39dQ0VF76 Tbrg4-212ENSMUST00000189268 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Ttc39dQ0VF76 Ephb4-203ENSMUST00000111055 4296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Ttc39dQ0VF76 Rgs7-203ENSMUST00000192227 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Ttc39dQ0VF76 Wdtc1-201ENSMUST00000043305 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Ttc39dQ0VF76 Eda-202ENSMUST00000113775 5088 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Ttc39dQ0VF76 Dok3-201ENSMUST00000047877 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Ttc39dQ0VF76 Tssc4-206ENSMUST00000177841 1364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Ttc39dQ0VF76 Zbtb46-202ENSMUST00000087409 2577 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Ttc39dQ0VF76 Gm13524-201ENSMUST00000125869 662 ntTSL 3 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Ttc39dQ0VF76 Gm16120-201ENSMUST00000127990 808 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Ttc39dQ0VF76 Gm12359-202ENSMUST00000141696 713 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Ttc39dQ0VF76 Gm12359-203ENSMUST00000153181 680 ntTSL 3 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Ttc39dQ0VF76 Slc2a8-204ENSMUST00000153484 1168 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Ttc39dQ0VF76 Ndufab1-ps-201ENSMUST00000166096 468 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
Ttc39dQ0VF76 Ccdc125-202ENSMUST00000170347 1216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Ttc39dQ0VF76 Tnnt2-212ENSMUST00000189732 1123 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Ttc39dQ0VF76 Ly6h-202ENSMUST00000065417 985 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Ttc39dQ0VF76 Ogfr-201ENSMUST00000029087 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Ttc39dQ0VF76 Ints8-201ENSMUST00000044616 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Ttc39dQ0VF76 Ccnyl1-202ENSMUST00000114077 3281 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Ttc39dQ0VF76 Il7-203ENSMUST00000192202 2057 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Ttc39dQ0VF76 Rab11fip5-202ENSMUST00000204087 6119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Ttc39dQ0VF76 Crtac1-201ENSMUST00000048630 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Ttc39dQ0VF76 Cend1-201ENSMUST00000084436 1672 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Ttc39dQ0VF76 Homer2-206ENSMUST00000207983 1634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Ttc39dQ0VF76 Rassf7-208ENSMUST00000209500 1560 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Ttc39dQ0VF76 Ogfod2-201ENSMUST00000024470 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Ttc39dQ0VF76 Adat2-201ENSMUST00000019944 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Ttc39dQ0VF76 Snapc3-201ENSMUST00000030206 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Ttc39dQ0VF76 Prss54-201ENSMUST00000052690 1438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Ttc39dQ0VF76 Fbrsl1-201ENSMUST00000056124 2700 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Ttc39dQ0VF76 Mief1-203ENSMUST00000228788 5352 ntAPPRIS P1 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Ttc39dQ0VF76 1700024G13Rik-201ENSMUST00000100723 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Ttc39dQ0VF76 Gm11355-201ENSMUST00000121120 306 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
Ttc39dQ0VF76 4930405A21Rik-202ENSMUST00000139042 994 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Ttc39dQ0VF76 Gm15545-203ENSMUST00000150613 1059 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Ttc39dQ0VF76 Gm3264-202ENSMUST00000166776 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Ttc39dQ0VF76 Gm22697-201ENSMUST00000175194 63 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
Ttc39dQ0VF76 Gm19553-201ENSMUST00000175723 494 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Ttc39dQ0VF76 Spata25-201ENSMUST00000017911 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Ttc39dQ0VF76 Gm26644-201ENSMUST00000181365 958 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Ttc39dQ0VF76 Gm28402-201ENSMUST00000188574 373 ntTSL 3 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Ttc39dQ0VF76 Gadd45b-203ENSMUST00000220246 732 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Ttc39dQ0VF76 Mrpl36-203ENSMUST00000222030 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Ttc39dQ0VF76 Sec11c-201ENSMUST00000025394 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Ttc39dQ0VF76 Etv6-201ENSMUST00000081028 5545 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Ttc39dQ0VF76 Rd3-203ENSMUST00000181512 1760 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Ttc39dQ0VF76 Epor-201ENSMUST00000006397 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Ttc39dQ0VF76 Tjp1-202ENSMUST00000102592 7049 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Ttc39dQ0VF76 Hs3st2-201ENSMUST00000084628 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Ttc39dQ0VF76 Ppp4r3a-201ENSMUST00000048305 4516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Ttc39dQ0VF76 Stxbp5l-202ENSMUST00000114775 1691 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Ttc39dQ0VF76 Trip6-201ENSMUST00000024119 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Ttc39dQ0VF76 Coq8b-201ENSMUST00000003860 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Ttc39dQ0VF76 Fcgrt-203ENSMUST00000210642 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Ttc39dQ0VF76 Ctsd-202ENSMUST00000151120 2127 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 6452.5 ms