Protein–RNA interactions for Protein: Q0VF55

Atp2b3, Calcium-transporting ATPase, mousemouse

Predictions only

Length 1,220 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atp2b3Q0VF55 Gm28265-201ENSMUST00000188201 2319 ntBASIC19.92■□□□□ 0.78
Atp2b3Q0VF55 Pacsin3-202ENSMUST00000059566 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Atp2b3Q0VF55 Mier2-212ENSMUST00000172158 1400 ntTSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
Atp2b3Q0VF55 Tm6sf2-201ENSMUST00000049197 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Atp2b3Q0VF55 Atp5b-201ENSMUST00000026459 1916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Atp2b3Q0VF55 Guf1-202ENSMUST00000087228 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Atp2b3Q0VF55 G3bp2-202ENSMUST00000164378 3026 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Atp2b3Q0VF55 Gps1-207ENSMUST00000172809 2000 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Atp2b3Q0VF55 Gm26548-201ENSMUST00000181165 2029 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Atp2b3Q0VF55 Dph1-201ENSMUST00000044949 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Atp2b3Q0VF55 Map3k5-201ENSMUST00000095806 5450 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Atp2b3Q0VF55 Arntl-201ENSMUST00000047321 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Atp2b3Q0VF55 Bcam-201ENSMUST00000003061 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Atp2b3Q0VF55 Letm1-203ENSMUST00000148451 2478 ntTSL 2 BASIC19.91■□□□□ 0.78
Atp2b3Q0VF55 Sh2b3-201ENSMUST00000040308 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Atp2b3Q0VF55 Cldn7-203ENSMUST00000108596 664 ntTSL 3 BASIC19.91■□□□□ 0.78
Atp2b3Q0VF55 Zscan10-204ENSMUST00000118369 1006 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Atp2b3Q0VF55 Gm44930-202ENSMUST00000208733 689 ntTSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
Atp2b3Q0VF55 Itgb7-201ENSMUST00000001327 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Atp2b3Q0VF55 Cyr61-201ENSMUST00000029846 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Atp2b3Q0VF55 Wasf1-202ENSMUST00000105509 2719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
Atp2b3Q0VF55 Eif6-202ENSMUST00000109638 1382 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Atp2b3Q0VF55 Sema6c-214ENSMUST00000202315 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Atp2b3Q0VF55 Cfap206-201ENSMUST00000029971 2246 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
Atp2b3Q0VF55 Sdf4-203ENSMUST00000105578 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Atp2b3Q0VF55 Iqsec2-207ENSMUST00000168786 5993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Atp2b3Q0VF55 Fbxl19-204ENSMUST00000188580 2601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Atp2b3Q0VF55 4930447C04Rik-202ENSMUST00000110489 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
Atp2b3Q0VF55 Slc46a1-201ENSMUST00000001126 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Atp2b3Q0VF55 Mettl21a-202ENSMUST00000114079 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Atp2b3Q0VF55 Wipf1-201ENSMUST00000094681 4728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Atp2b3Q0VF55 Nrl-202ENSMUST00000111404 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Atp2b3Q0VF55 Hint3-203ENSMUST00000161074 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Atp2b3Q0VF55 Bex3-204ENSMUST00000178632 933 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
Atp2b3Q0VF55 Tecr-201ENSMUST00000019382 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Atp2b3Q0VF55 Ankrd23-204ENSMUST00000194853 1073 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Atp2b3Q0VF55 Rnf13-209ENSMUST00000199041 1062 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Atp2b3Q0VF55 Lmo1-203ENSMUST00000208136 772 ntTSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
Atp2b3Q0VF55 Piezo2-201ENSMUST00000046860 2849 ntTSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
Atp2b3Q0VF55 Hivep3-201ENSMUST00000084306 2973 ntBASIC19.9■□□□□ 0.78
Atp2b3Q0VF55 Phtf1-201ENSMUST00000055425 3060 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Atp2b3Q0VF55 Efemp2-204ENSMUST00000165485 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Atp2b3Q0VF55 Rgp1-203ENSMUST00000117140 1635 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Atp2b3Q0VF55 Hmbs-201ENSMUST00000077353 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Atp2b3Q0VF55 Crocc-203ENSMUST00000102491 6582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Atp2b3Q0VF55 Golga7b-201ENSMUST00000087123 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.78
Atp2b3Q0VF55 Rimbp3-201ENSMUST00000169803 5787 ntAPPRIS P1 BASIC19.89■□□□□ 0.78
Atp2b3Q0VF55 Frrs1l-201ENSMUST00000053681 6817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.78
Atp2b3Q0VF55 Zmynd19-201ENSMUST00000028350 3903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.78
Atp2b3Q0VF55 Etnk2-203ENSMUST00000135222 2297 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Atp2b3Q0VF55 Rprl3-201ENSMUST00000157400 290 ntBASIC19.89■□□□□ 0.77
Atp2b3Q0VF55 Gm5091-201ENSMUST00000181658 1179 ntTSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Atp2b3Q0VF55 Coq6-201ENSMUST00000021661 1602 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Atp2b3Q0VF55 Cbr2-201ENSMUST00000026148 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Atp2b3Q0VF55 Birc2-201ENSMUST00000054878 378 ntBASIC19.89■□□□□ 0.77
Atp2b3Q0VF55 Nploc4-202ENSMUST00000103017 4025 ntTSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Atp2b3Q0VF55 Usp36-201ENSMUST00000092382 5609 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.77
Atp2b3Q0VF55 Ank1-207ENSMUST00000118733 8201 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Atp2b3Q0VF55 Hexb-201ENSMUST00000022169 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Atp2b3Q0VF55 Usp36-202ENSMUST00000106296 5655 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
Atp2b3Q0VF55 Wdr13-202ENSMUST00000115623 1749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
Atp2b3Q0VF55 Kcnn1-207ENSMUST00000212509 1608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
Atp2b3Q0VF55 Shd-201ENSMUST00000044216 1546 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Atp2b3Q0VF55 Mapk7-201ENSMUST00000079080 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Atp2b3Q0VF55 Asph-204ENSMUST00000084915 2884 ntTSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
Atp2b3Q0VF55 Ybx2-202ENSMUST00000108601 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Atp2b3Q0VF55 Fdps-203ENSMUST00000196709 1382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
Atp2b3Q0VF55 Kcnk10-203ENSMUST00000221305 1357 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Atp2b3Q0VF55 Gpr142-202ENSMUST00000106584 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Atp2b3Q0VF55 Gm12216-201ENSMUST00000117316 1152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Atp2b3Q0VF55 Fgf20-202ENSMUST00000118639 587 ntTSL 3 BASIC19.88■□□□□ 0.77
Atp2b3Q0VF55 Gm15372-201ENSMUST00000120729 834 ntBASIC19.88■□□□□ 0.77
Atp2b3Q0VF55 Rnf5-201ENSMUST00000015622 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Atp2b3Q0VF55 Gm26871-202ENSMUST00000180774 695 ntTSL 2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
Atp2b3Q0VF55 Gm26644-201ENSMUST00000181365 958 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Atp2b3Q0VF55 Gtf3c2-202ENSMUST00000200871 318 ntTSL 3 BASIC19.88■□□□□ 0.77
Atp2b3Q0VF55 Gzmm-201ENSMUST00000020549 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Atp2b3Q0VF55 Gpr142-201ENSMUST00000045319 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Atp2b3Q0VF55 Nfatc3-201ENSMUST00000109308 5984 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Atp2b3Q0VF55 Nt5dc3-201ENSMUST00000099396 5952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Atp2b3Q0VF55 Atf6b-202ENSMUST00000173984 2315 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
Atp2b3Q0VF55 Fam109a-203ENSMUST00000198271 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Atp2b3Q0VF55 Fbxl3-201ENSMUST00000022720 4309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Atp2b3Q0VF55 Dclk2-208ENSMUST00000194452 2066 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Atp2b3Q0VF55 Stradb-201ENSMUST00000027185 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Atp2b3Q0VF55 Mturn-203ENSMUST00000190641 5303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Atp2b3Q0VF55 Igsf11-201ENSMUST00000023478 3443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Atp2b3Q0VF55 Adprh-201ENSMUST00000002923 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Atp2b3Q0VF55 Prss53-201ENSMUST00000121394 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Atp2b3Q0VF55 Miga1-205ENSMUST00000199397 2842 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Atp2b3Q0VF55 Adgrl1-207ENSMUST00000141158 8181 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Atp2b3Q0VF55 Man1c1-202ENSMUST00000054096 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
Atp2b3Q0VF55 Rala-201ENSMUST00000009003 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Atp2b3Q0VF55 Matk-202ENSMUST00000117488 1980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Atp2b3Q0VF55 Gm12963-201ENSMUST00000131846 783 ntTSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
Atp2b3Q0VF55 Psma3-204ENSMUST00000160864 859 ntTSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
Atp2b3Q0VF55 Syngr2-206ENSMUST00000177131 935 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.87■□□□□ 0.77
Atp2b3Q0VF55 Olfr571-201ENSMUST00000061738 969 ntAPPRIS P1 BASIC19.87■□□□□ 0.77
Atp2b3Q0VF55 Manbal-201ENSMUST00000081202 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Atp2b3Q0VF55 Lad1-201ENSMUST00000038760 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.4 ms