Protein–RNA interactions for Protein: Q0VBD0

Itgb8, Integrin beta, mousemouse

Predictions only

Length 767 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Itgb8Q0VBD0 Rassf1-202ENSMUST00000093786 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Itgb8Q0VBD0 Phax-201ENSMUST00000008445 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Itgb8Q0VBD0 Tsc22d2-203ENSMUST00000199164 4659 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Itgb8Q0VBD0 Psmd6-201ENSMUST00000022256 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Itgb8Q0VBD0 Hnrnpul1-205ENSMUST00000206832 3784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Itgb8Q0VBD0 Atxn7l2-203ENSMUST00000117784 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Itgb8Q0VBD0 Cep57-201ENSMUST00000034398 2523 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Itgb8Q0VBD0 Rtkn-201ENSMUST00000065512 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Itgb8Q0VBD0 Pld2-203ENSMUST00000108557 3655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Itgb8Q0VBD0 Aurkb-201ENSMUST00000021277 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Itgb8Q0VBD0 Nup98-205ENSMUST00000211022 3132 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Itgb8Q0VBD0 Scamp3-201ENSMUST00000029684 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Itgb8Q0VBD0 2210408F21Rik-208ENSMUST00000144612 450 ntTSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Itgb8Q0VBD0 Serf1-205ENSMUST00000152286 465 ntTSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Itgb8Q0VBD0 Rcbtb2-217ENSMUST00000167401 868 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Itgb8Q0VBD0 Mir5122-201ENSMUST00000175004 89 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Itgb8Q0VBD0 Gm26829-201ENSMUST00000180581 934 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Itgb8Q0VBD0 Mir8112-201ENSMUST00000184382 131 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Itgb8Q0VBD0 Gm21362-201ENSMUST00000194272 928 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Itgb8Q0VBD0 Mpc2-201ENSMUST00000027853 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Itgb8Q0VBD0 Xpa-201ENSMUST00000030013 955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Itgb8Q0VBD0 Psmd4-201ENSMUST00000071664 1276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Itgb8Q0VBD0 Coro7-202ENSMUST00000090480 1147 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Itgb8Q0VBD0 Gm10819-201ENSMUST00000099988 561 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Itgb8Q0VBD0 Ttll3-201ENSMUST00000032414 3168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Itgb8Q0VBD0 Dcps-202ENSMUST00000119847 1445 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Itgb8Q0VBD0 2900052L18Rik-201ENSMUST00000139014 1588 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Itgb8Q0VBD0 Proc-201ENSMUST00000171765 1566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Itgb8Q0VBD0 Repin1-207ENSMUST00000163452 2959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Itgb8Q0VBD0 Coil-202ENSMUST00000107898 3120 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Itgb8Q0VBD0 Tax1bp3-201ENSMUST00000040687 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Itgb8Q0VBD0 Gm11620-201ENSMUST00000118770 1845 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Itgb8Q0VBD0 Rimbp3-201ENSMUST00000169803 5787 ntAPPRIS P1 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Itgb8Q0VBD0 Nr1h2-201ENSMUST00000073488 1999 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Itgb8Q0VBD0 Mfge8-201ENSMUST00000032825 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Itgb8Q0VBD0 Slc46a3-201ENSMUST00000031655 2434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Itgb8Q0VBD0 Errfi1-201ENSMUST00000030811 3043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Itgb8Q0VBD0 Mef2d-201ENSMUST00000001455 5401 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Itgb8Q0VBD0 Gm11190-201ENSMUST00000132487 3414 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Itgb8Q0VBD0 Zfp710-201ENSMUST00000049680 4721 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Itgb8Q0VBD0 Sox4-201ENSMUST00000067230 4795 ntAPPRIS P1 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Itgb8Q0VBD0 Smarcd1-201ENSMUST00000023759 3153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Itgb8Q0VBD0 Ephb4-201ENSMUST00000061244 4340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Itgb8Q0VBD0 Anks1-202ENSMUST00000088027 6781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Itgb8Q0VBD0 Ly6e-201ENSMUST00000051698 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Itgb8Q0VBD0 Gm10418-201ENSMUST00000100943 576 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Itgb8Q0VBD0 Arrdc4-202ENSMUST00000118110 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Itgb8Q0VBD0 B430219N15Rik-201ENSMUST00000147230 835 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Itgb8Q0VBD0 Arhgef4-208ENSMUST00000211073 171 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Itgb8Q0VBD0 Tomm20-202ENSMUST00000212771 458 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Itgb8Q0VBD0 Flywch2-201ENSMUST00000024704 694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Itgb8Q0VBD0 Gm9987-201ENSMUST00000069768 567 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Itgb8Q0VBD0 Phyhip-201ENSMUST00000003561 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Itgb8Q0VBD0 L3hypdh-201ENSMUST00000019862 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Itgb8Q0VBD0 Tgds-201ENSMUST00000022727 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Itgb8Q0VBD0 Lrch3-210ENSMUST00000170201 2902 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Itgb8Q0VBD0 Dcdc2c-206ENSMUST00000221349 2209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Itgb8Q0VBD0 Scrt1-202ENSMUST00000164703 3478 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Itgb8Q0VBD0 AC154412.1-201ENSMUST00000226540 2786 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Itgb8Q0VBD0 Klhdc8b-214ENSMUST00000195435 1612 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.02
Itgb8Q0VBD0 Cdkn1b-201ENSMUST00000003115 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Itgb8Q0VBD0 Rbpms2-201ENSMUST00000055844 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Itgb8Q0VBD0 Wdr12-202ENSMUST00000117438 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Itgb8Q0VBD0 Pspc1-202ENSMUST00000163924 2863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Itgb8Q0VBD0 Txnrd2-215ENSMUST00000206151 2874 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Itgb8Q0VBD0 Tpd52-205ENSMUST00000120143 6317 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Itgb8Q0VBD0 Matk-203ENSMUST00000119547 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Itgb8Q0VBD0 Kcnj6-202ENSMUST00000099508 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Itgb8Q0VBD0 Tjap1-214ENSMUST00000225413 2189 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Itgb8Q0VBD0 E2f2-201ENSMUST00000061721 4739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Itgb8Q0VBD0 Echdc2-204ENSMUST00000116309 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Itgb8Q0VBD0 Ccl27a-219ENSMUST00000173865 657 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Itgb8Q0VBD0 Gm4974-201ENSMUST00000209974 875 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Itgb8Q0VBD0 Kif12-201ENSMUST00000030042 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Itgb8Q0VBD0 Cacna1b-204ENSMUST00000102939 9736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Itgb8Q0VBD0 Gm16759-201ENSMUST00000126238 1393 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Itgb8Q0VBD0 Gpr180-201ENSMUST00000022728 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Itgb8Q0VBD0 Dph1-201ENSMUST00000044949 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Itgb8Q0VBD0 Pgm2-201ENSMUST00000058351 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Itgb8Q0VBD0 Mydgf-201ENSMUST00000019723 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Itgb8Q0VBD0 Hhat-201ENSMUST00000044190 2839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Itgb8Q0VBD0 Kcnn1-201ENSMUST00000110078 4047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Itgb8Q0VBD0 Kcnn1-202ENSMUST00000110081 4045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Itgb8Q0VBD0 Gm16279-201ENSMUST00000149452 2945 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Itgb8Q0VBD0 Tmed3-201ENSMUST00000058488 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Itgb8Q0VBD0 Stx7-201ENSMUST00000020174 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Itgb8Q0VBD0 Pmpca-201ENSMUST00000076431 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Itgb8Q0VBD0 Zic5-201ENSMUST00000039118 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Itgb8Q0VBD0 4933428G20Rik-201ENSMUST00000056955 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Itgb8Q0VBD0 Atp6v1g2-201ENSMUST00000068261 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Itgb8Q0VBD0 Ablim2-205ENSMUST00000114205 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Itgb8Q0VBD0 Vangl2-203ENSMUST00000111264 2349 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Itgb8Q0VBD0 Ppp2r2a-204ENSMUST00000225380 1988 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Itgb8Q0VBD0 Epo-203ENSMUST00000111039 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Itgb8Q0VBD0 Sct-202ENSMUST00000167790 507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Itgb8Q0VBD0 Gm28914-201ENSMUST00000188115 667 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Itgb8Q0VBD0 AC156016.1-201ENSMUST00000227190 1035 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Itgb8Q0VBD0 Tpsg1-201ENSMUST00000024999 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Itgb8Q0VBD0 Sct-201ENSMUST00000046156 534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Itgb8Q0VBD0 Odf1-201ENSMUST00000081966 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.6 ms