Protein–RNA interactions for Protein: Q0P5V9

Slc45a4, Solute carrier family 45 member 4, mousemouse

Predictions only

Length 785 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slc45a4Q0P5V9 Dync1li2-201ENSMUST00000041769 4627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Slc45a4Q0P5V9 Kctd6-202ENSMUST00000170111 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Slc45a4Q0P5V9 Tnfaip2-202ENSMUST00000109792 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Slc45a4Q0P5V9 Pskh1-201ENSMUST00000049699 3255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Slc45a4Q0P5V9 Hoxb2-201ENSMUST00000100523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Slc45a4Q0P5V9 Trim67-202ENSMUST00000167588 8735 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Slc45a4Q0P5V9 Hif3a-201ENSMUST00000037762 2206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Slc45a4Q0P5V9 Cygb-201ENSMUST00000021166 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Slc45a4Q0P5V9 Drd2-201ENSMUST00000075764 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Slc45a4Q0P5V9 Kdelc2-201ENSMUST00000037853 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Slc45a4Q0P5V9 Zfp740-202ENSMUST00000119168 3932 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Slc45a4Q0P5V9 A830018L16Rik-208ENSMUST00000171690 6158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Slc45a4Q0P5V9 Zfp384-207ENSMUST00000112427 3072 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Slc45a4Q0P5V9 Zdhhc1-203ENSMUST00000212303 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Slc45a4Q0P5V9 Prmt2-202ENSMUST00000099571 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Slc45a4Q0P5V9 B4galt3-205ENSMUST00000126699 1758 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Slc45a4Q0P5V9 Mafg-202ENSMUST00000106180 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Slc45a4Q0P5V9 Mafg-204ENSMUST00000106182 1104 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Slc45a4Q0P5V9 Mzt2-202ENSMUST00000117136 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Slc45a4Q0P5V9 Cul4a-202ENSMUST00000121426 1044 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Slc45a4Q0P5V9 Asnsd1-202ENSMUST00000123519 983 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Slc45a4Q0P5V9 H2afz-207ENSMUST00000174561 810 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Slc45a4Q0P5V9 Gm9731-201ENSMUST00000209480 747 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Slc45a4Q0P5V9 Coq7-201ENSMUST00000032887 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Slc45a4Q0P5V9 Pldi-201ENSMUST00000036304 853 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Slc45a4Q0P5V9 Hoxa6-201ENSMUST00000062829 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Slc45a4Q0P5V9 Tbpl1-201ENSMUST00000095794 1195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Slc45a4Q0P5V9 Gm10819-201ENSMUST00000099988 561 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Slc45a4Q0P5V9 Adgrb2-204ENSMUST00000106015 4982 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Slc45a4Q0P5V9 Tmem150b-202ENSMUST00000086364 2822 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Slc45a4Q0P5V9 Arhgap39-202ENSMUST00000077821 4494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Slc45a4Q0P5V9 Fmnl3-203ENSMUST00000120633 4290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Slc45a4Q0P5V9 Agap1-204ENSMUST00000190096 4078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Slc45a4Q0P5V9 Tcp1-209ENSMUST00000151287 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Slc45a4Q0P5V9 Zfc3h1-201ENSMUST00000036044 6957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Slc45a4Q0P5V9 Lhx5-201ENSMUST00000031591 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Slc45a4Q0P5V9 Dpm1-209ENSMUST00000154111 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Slc45a4Q0P5V9 Auh-201ENSMUST00000021913 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Slc45a4Q0P5V9 Slc6a8-206ENSMUST00000164449 2151 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Slc45a4Q0P5V9 Mis18bp1-208ENSMUST00000222244 2053 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Slc45a4Q0P5V9 Htr3a-201ENSMUST00000003826 2082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Slc45a4Q0P5V9 Sgta-201ENSMUST00000005067 1969 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Slc45a4Q0P5V9 Lrp12-202ENSMUST00000110305 4244 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Slc45a4Q0P5V9 Lrriq3-201ENSMUST00000029833 2652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Slc45a4Q0P5V9 Ado-201ENSMUST00000075686 4445 ntAPPRIS P1 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Slc45a4Q0P5V9 Disc1-201ENSMUST00000074562 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Slc45a4Q0P5V9 Disc1-203ENSMUST00000098311 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Slc45a4Q0P5V9 Atp5a1-201ENSMUST00000026495 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Slc45a4Q0P5V9 Abhd16a-201ENSMUST00000007251 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Slc45a4Q0P5V9 Mir142hg-201ENSMUST00000123700 269 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Slc45a4Q0P5V9 Muc2-203ENSMUST00000179227 399 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Slc45a4Q0P5V9 Gm6345-202ENSMUST00000180900 204 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Slc45a4Q0P5V9 Gm27000-201ENSMUST00000182943 842 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Slc45a4Q0P5V9 Gm27389-201ENSMUST00000183622 195 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Slc45a4Q0P5V9 Pdxk-ps-203ENSMUST00000183934 680 ntTSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Slc45a4Q0P5V9 Fgf9-202ENSMUST00000074654 1198 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Slc45a4Q0P5V9 Men1-203ENSMUST00000079327 2639 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Slc45a4Q0P5V9 Casp3-201ENSMUST00000093517 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Slc45a4Q0P5V9 Sphk1-206ENSMUST00000106388 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Slc45a4Q0P5V9 Ankrd17-202ENSMUST00000081914 8057 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Slc45a4Q0P5V9 Myo5a-214ENSMUST00000155282 6372 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Slc45a4Q0P5V9 Usp27x-201ENSMUST00000115744 3240 ntAPPRIS P1 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Slc45a4Q0P5V9 Mid2-202ENSMUST00000112990 6271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Slc45a4Q0P5V9 Vim-201ENSMUST00000028062 2193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Slc45a4Q0P5V9 Sept11-205ENSMUST00000201700 3478 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Slc45a4Q0P5V9 Sybu-202ENSMUST00000110267 3127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Slc45a4Q0P5V9 Rgs3-203ENSMUST00000098031 2072 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Slc45a4Q0P5V9 Fam199x-201ENSMUST00000047852 8299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Slc45a4Q0P5V9 Spats2l-212ENSMUST00000170139 2315 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Slc45a4Q0P5V9 Slc15a3-201ENSMUST00000025646 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Slc45a4Q0P5V9 Nsfl1c-201ENSMUST00000028949 1364 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Slc45a4Q0P5V9 H2-Q10-202ENSMUST00000174525 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Slc45a4Q0P5V9 Zic1-202ENSMUST00000065360 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Slc45a4Q0P5V9 Nudt16-201ENSMUST00000035179 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Slc45a4Q0P5V9 Spint2-202ENSMUST00000108236 1211 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Slc45a4Q0P5V9 Eif4e2-205ENSMUST00000113232 1125 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Slc45a4Q0P5V9 Gm25016-201ENSMUST00000158399 131 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Slc45a4Q0P5V9 Gm33142-201ENSMUST00000193913 867 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Slc45a4Q0P5V9 Nbea-201ENSMUST00000029374 10986 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Slc45a4Q0P5V9 Tmem117-201ENSMUST00000080141 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Slc45a4Q0P5V9 Tor1b-201ENSMUST00000028199 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Slc45a4Q0P5V9 Gtf3a-201ENSMUST00000132102 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Slc45a4Q0P5V9 Tnfrsf25-201ENSMUST00000025706 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Slc45a4Q0P5V9 Mzf1-202ENSMUST00000182087 2197 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Slc45a4Q0P5V9 Lrrfip1-212ENSMUST00000189617 2155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Slc45a4Q0P5V9 Kdm5b-203ENSMUST00000112198 5413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Slc45a4Q0P5V9 Wscd2-201ENSMUST00000094452 4302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Slc45a4Q0P5V9 Tmem47-203ENSMUST00000171953 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Slc45a4Q0P5V9 Tmtc4-204ENSMUST00000126867 2952 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Slc45a4Q0P5V9 Dcaf17-203ENSMUST00000112159 2490 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Slc45a4Q0P5V9 Ttc6-203ENSMUST00000172939 5782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Slc45a4Q0P5V9 Cops7b-201ENSMUST00000027446 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Slc45a4Q0P5V9 Ptges3l-202ENSMUST00000103102 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Slc45a4Q0P5V9 Cask-201ENSMUST00000033321 4057 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Slc45a4Q0P5V9 Zkscan6-202ENSMUST00000071465 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Slc45a4Q0P5V9 Fam149b-216ENSMUST00000225942 2151 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Slc45a4Q0P5V9 Sorcs3-201ENSMUST00000078880 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Slc45a4Q0P5V9 Skap1-203ENSMUST00000100521 1539 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Slc45a4Q0P5V9 Skap1-204ENSMUST00000103154 1507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Slc45a4Q0P5V9 Atp5b-201ENSMUST00000026459 1916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.6 ms