Protein–RNA interactions for Protein: Q0KL02

Trio, Triple functional domain protein, mousemouse

Predictions only

Length 3,102 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TrioQ0KL02 Gm39228-201ENSMUST00000212456 301 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
TrioQ0KL02 Gm9789-201ENSMUST00000062524 397 ntAPPRIS P1 BASIC16.68■□□□□ 0.26
TrioQ0KL02 Aifm2-202ENSMUST00000080099 1329 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
TrioQ0KL02 Serpine2-201ENSMUST00000027467 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
TrioQ0KL02 Gm13613-201ENSMUST00000126240 1444 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
TrioQ0KL02 Tsc22d1-208ENSMUST00000142683 797 ntTSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
TrioQ0KL02 2900055J20Rik-201ENSMUST00000096572 723 ntAPPRIS P1 BASIC16.68■□□□□ 0.26
TrioQ0KL02 Hbb-bt-201ENSMUST00000098192 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
TrioQ0KL02 Trib3-201ENSMUST00000040312 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
TrioQ0KL02 Ctnnbip1-201ENSMUST00000030839 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
TrioQ0KL02 Tuba1c-201ENSMUST00000058914 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
TrioQ0KL02 Suz12-206ENSMUST00000163272 4303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
TrioQ0KL02 Gm11515-201ENSMUST00000150818 701 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
TrioQ0KL02 Avpi1-201ENSMUST00000018965 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
TrioQ0KL02 Mprip-203ENSMUST00000108751 4021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
TrioQ0KL02 Mvk-201ENSMUST00000043760 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
TrioQ0KL02 Wnt10b-206ENSMUST00000228546 2709 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
TrioQ0KL02 Gm27300-201ENSMUST00000184085 97 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
TrioQ0KL02 Gm27335-201ENSMUST00000184758 97 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
TrioQ0KL02 Fezf1-201ENSMUST00000031709 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
TrioQ0KL02 Eral1-201ENSMUST00000021183 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
TrioQ0KL02 Rassf7-208ENSMUST00000209500 1560 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
TrioQ0KL02 Gm29514-202ENSMUST00000186665 2214 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
TrioQ0KL02 Mrto4-202ENSMUST00000102503 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
TrioQ0KL02 Prmt7-203ENSMUST00000109297 1094 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
TrioQ0KL02 Sfxn5-203ENSMUST00000113787 638 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
TrioQ0KL02 Rnf170-208ENSMUST00000153528 1026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
TrioQ0KL02 Gm7507-201ENSMUST00000183053 1008 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
TrioQ0KL02 Arfgap1-213ENSMUST00000184394 1209 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
TrioQ0KL02 Gm34397-203ENSMUST00000214991 630 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
TrioQ0KL02 AC130829.1-201ENSMUST00000221548 494 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
TrioQ0KL02 Syce1l-201ENSMUST00000034219 896 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
TrioQ0KL02 Batf-201ENSMUST00000040536 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
TrioQ0KL02 Syce1l-202ENSMUST00000095173 791 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
TrioQ0KL02 Casp3-204ENSMUST00000211115 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
TrioQ0KL02 Bfsp2-201ENSMUST00000124310 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
TrioQ0KL02 B3gnt9-202ENSMUST00000136822 2516 ntAPPRIS P1 BASIC16.66■□□□□ 0.26
TrioQ0KL02 Trmt11-201ENSMUST00000019927 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
TrioQ0KL02 Uso1-204ENSMUST00000202155 3707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
TrioQ0KL02 Rpl10-ps2-201ENSMUST00000098432 645 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
TrioQ0KL02 Ubp1-202ENSMUST00000084885 3850 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
TrioQ0KL02 Hexb-201ENSMUST00000022169 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
TrioQ0KL02 H2-Q10-201ENSMUST00000068291 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
TrioQ0KL02 Txndc11-201ENSMUST00000038424 3095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
TrioQ0KL02 Mettl27-202ENSMUST00000068617 1685 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
TrioQ0KL02 Nisch-208ENSMUST00000165981 2415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
TrioQ0KL02 Hist1h2ae-201ENSMUST00000102969 704 ntAPPRIS P1 BASIC16.65■□□□□ 0.26
TrioQ0KL02 Hist1h2ah-201ENSMUST00000091742 405 ntAPPRIS P1 BASIC16.65■□□□□ 0.26
TrioQ0KL02 Gm26718-201ENSMUST00000181048 1378 ntTSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
TrioQ0KL02 Irf3-202ENSMUST00000107834 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
TrioQ0KL02 Gm26917-202ENSMUST00000192833 3329 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
TrioQ0KL02 Mag-201ENSMUST00000040548 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
TrioQ0KL02 Hist1h3e-201ENSMUST00000105107 836 ntAPPRIS P1 BASIC16.65■□□□□ 0.26
TrioQ0KL02 Pfn2-203ENSMUST00000120289 905 ntTSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
TrioQ0KL02 Gm15222-202ENSMUST00000228667 1726 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
TrioQ0KL02 Bcl11b-203ENSMUST00000109891 2888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
TrioQ0KL02 Gm38392-202ENSMUST00000165196 1303 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
TrioQ0KL02 Bcl2l12-201ENSMUST00000003290 1075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
TrioQ0KL02 Crym-201ENSMUST00000033198 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
TrioQ0KL02 Ndufv3-202ENSMUST00000064798 485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
TrioQ0KL02 Abhd16a-201ENSMUST00000007251 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
TrioQ0KL02 Zdhhc6-201ENSMUST00000076891 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.26
TrioQ0KL02 Mst1-204ENSMUST00000162886 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.26
TrioQ0KL02 Abhd8-201ENSMUST00000008094 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
TrioQ0KL02 Slc35c2-203ENSMUST00000109299 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
TrioQ0KL02 Ppp2r1b-209ENSMUST00000176349 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
TrioQ0KL02 Pex11b-207ENSMUST00000165842 1562 ntTSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
TrioQ0KL02 Gfra2-202ENSMUST00000227633 1480 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
TrioQ0KL02 Mdk-204ENSMUST00000111309 771 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
TrioQ0KL02 Gm13597-201ENSMUST00000121239 375 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
TrioQ0KL02 Ifng-201ENSMUST00000068592 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
TrioQ0KL02 Tmem107-201ENSMUST00000075980 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
TrioQ0KL02 Fam107a-202ENSMUST00000120411 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
TrioQ0KL02 Casp2-201ENSMUST00000031895 3529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
TrioQ0KL02 Pam16-201ENSMUST00000014445 596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
TrioQ0KL02 Haglr-202ENSMUST00000152462 443 ntTSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
TrioQ0KL02 Gm8349-201ENSMUST00000182720 1003 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
TrioQ0KL02 AC155252.2-201ENSMUST00000226946 680 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
TrioQ0KL02 Gm16835-201ENSMUST00000140488 2809 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
TrioQ0KL02 Prdm6-203ENSMUST00000115399 2227 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
TrioQ0KL02 Klf14-201ENSMUST00000101589 3056 ntAPPRIS P1 BASIC16.64■□□□□ 0.25
TrioQ0KL02 Atat1-202ENSMUST00000061052 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
TrioQ0KL02 Gm27301-201ENSMUST00000184012 127 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
TrioQ0KL02 Hrasls5-201ENSMUST00000025929 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
TrioQ0KL02 Smim4-202ENSMUST00000064032 791 ntTSL 3 BASIC16.63■□□□□ 0.25
TrioQ0KL02 Gm43006-201ENSMUST00000197702 1602 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
TrioQ0KL02 Fcho2-208ENSMUST00000224992 2964 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
TrioQ0KL02 Dok4-201ENSMUST00000046461 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
TrioQ0KL02 Eomes-202ENSMUST00000111763 2869 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
TrioQ0KL02 Sulf2-201ENSMUST00000088086 3927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
TrioQ0KL02 4930544D05Rik-203ENSMUST00000144960 624 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
TrioQ0KL02 1700086L19Rik-202ENSMUST00000185822 1028 ntTSL 3 BASIC16.63■□□□□ 0.25
TrioQ0KL02 Frmd3-202ENSMUST00000098006 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
TrioQ0KL02 Layn-204ENSMUST00000217212 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
TrioQ0KL02 1700026D11Rik-201ENSMUST00000126910 2033 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
TrioQ0KL02 Lrrc47-201ENSMUST00000030894 3395 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
TrioQ0KL02 Zpbp2-203ENSMUST00000107509 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
TrioQ0KL02 Zfp637-202ENSMUST00000112859 421 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
TrioQ0KL02 Gm27622-201ENSMUST00000183779 60 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
TrioQ0KL02 Tex12-201ENSMUST00000034568 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.6 ms