Protein–RNA interactions for Protein: Q0KL01

Ubxn2b, UBX domain-containing protein 2B, mousemouse

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Length 331 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ubxn2bQ0KL01 Ppt2-202ENSMUST00000166040 1139 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.68■□□□□ 0.74
Ubxn2bQ0KL01 Gm7787-201ENSMUST00000216858 688 ntBASIC19.68■□□□□ 0.74
Ubxn2bQ0KL01 Snx24-201ENSMUST00000025417 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Ubxn2bQ0KL01 Meox1-201ENSMUST00000057054 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Ubxn2bQ0KL01 Chst3-203ENSMUST00000167915 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Ubxn2bQ0KL01 Best4-ps-201ENSMUST00000129783 1380 ntBASIC19.68■□□□□ 0.74
Ubxn2bQ0KL01 Mrpl49-201ENSMUST00000007482 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Ubxn2bQ0KL01 Ubtf-213ENSMUST00000178839 4580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Ubxn2bQ0KL01 Gab1-202ENSMUST00000210676 4985 ntTSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Ubxn2bQ0KL01 Bin1-201ENSMUST00000025239 2451 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.67■□□□□ 0.74
Ubxn2bQ0KL01 Prkci-201ENSMUST00000108249 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Ubxn2bQ0KL01 Tpi1-205ENSMUST00000172132 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Ubxn2bQ0KL01 Wdr38-202ENSMUST00000112872 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Ubxn2bQ0KL01 Gm11185-201ENSMUST00000117732 1007 ntBASIC19.67■□□□□ 0.74
Ubxn2bQ0KL01 Slc39a1-ps-201ENSMUST00000120862 969 ntBASIC19.67■□□□□ 0.74
Ubxn2bQ0KL01 Igfbp4-204ENSMUST00000140772 742 ntTSL 2 BASIC19.67■□□□□ 0.74
Ubxn2bQ0KL01 Gm11201-201ENSMUST00000143473 701 ntTSL 3 BASIC19.67■□□□□ 0.74
Ubxn2bQ0KL01 Gm24158-201ENSMUST00000175263 71 ntBASIC19.67■□□□□ 0.74
Ubxn2bQ0KL01 Cyba-201ENSMUST00000017604 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Ubxn2bQ0KL01 Zfp930-203ENSMUST00000212312 493 ntTSL 2 BASIC19.67■□□□□ 0.74
Ubxn2bQ0KL01 Prss29-201ENSMUST00000024993 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Ubxn2bQ0KL01 Zfp804a-201ENSMUST00000047527 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Ubxn2bQ0KL01 Cmip-202ENSMUST00000166750 2408 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.67■□□□□ 0.74
Ubxn2bQ0KL01 Mmp15-201ENSMUST00000034243 5135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Ubxn2bQ0KL01 Chst12-201ENSMUST00000043050 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Ubxn2bQ0KL01 Lhx2-201ENSMUST00000000253 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Ubxn2bQ0KL01 Prmt6-201ENSMUST00000106567 2450 ntAPPRIS P1 BASIC19.66■□□□□ 0.74
Ubxn2bQ0KL01 Gstz1-205ENSMUST00000222885 1571 ntTSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Ubxn2bQ0KL01 Bend6-202ENSMUST00000115161 2231 ntTSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Ubxn2bQ0KL01 Gm22065-201ENSMUST00000103753 110 ntBASIC19.66■□□□□ 0.74
Ubxn2bQ0KL01 Gm22066-201ENSMUST00000103761 110 ntBASIC19.66■□□□□ 0.74
Ubxn2bQ0KL01 Gm24932-201ENSMUST00000103763 110 ntBASIC19.66■□□□□ 0.74
Ubxn2bQ0KL01 Gm24115-201ENSMUST00000103799 110 ntBASIC19.66■□□□□ 0.74
Ubxn2bQ0KL01 Gm22190-201ENSMUST00000103827 110 ntBASIC19.66■□□□□ 0.74
Ubxn2bQ0KL01 Gm22191-201ENSMUST00000103831 110 ntBASIC19.66■□□□□ 0.74
Ubxn2bQ0KL01 Gm24721-201ENSMUST00000103849 110 ntBASIC19.66■□□□□ 0.74
Ubxn2bQ0KL01 Gm28018-201ENSMUST00000103869 110 ntBASIC19.66■□□□□ 0.74
Ubxn2bQ0KL01 Gm26399-201ENSMUST00000103937 110 ntBASIC19.66■□□□□ 0.74
Ubxn2bQ0KL01 Ghr-203ENSMUST00000110698 1171 ntTSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Ubxn2bQ0KL01 Gm25349-201ENSMUST00000177728 110 ntBASIC19.66■□□□□ 0.74
Ubxn2bQ0KL01 Gm23616-201ENSMUST00000177797 110 ntBASIC19.66■□□□□ 0.74
Ubxn2bQ0KL01 Gm25871-201ENSMUST00000177816 110 ntBASIC19.66■□□□□ 0.74
Ubxn2bQ0KL01 Gm24752-201ENSMUST00000178240 110 ntBASIC19.66■□□□□ 0.74
Ubxn2bQ0KL01 Gm24496-201ENSMUST00000178287 110 ntBASIC19.66■□□□□ 0.74
Ubxn2bQ0KL01 Gm25649-201ENSMUST00000178476 110 ntBASIC19.66■□□□□ 0.74
Ubxn2bQ0KL01 Gm25548-201ENSMUST00000178681 110 ntBASIC19.66■□□□□ 0.74
Ubxn2bQ0KL01 Gm23147-201ENSMUST00000178841 110 ntBASIC19.66■□□□□ 0.74
Ubxn2bQ0KL01 Gm26095-201ENSMUST00000179270 110 ntBASIC19.66■□□□□ 0.74
Ubxn2bQ0KL01 Gm22171-201ENSMUST00000179283 110 ntBASIC19.66■□□□□ 0.74
Ubxn2bQ0KL01 Gm23936-201ENSMUST00000179354 110 ntBASIC19.66■□□□□ 0.74
Ubxn2bQ0KL01 Gm22619-201ENSMUST00000179516 110 ntBASIC19.66■□□□□ 0.74
Ubxn2bQ0KL01 Gm25255-201ENSMUST00000179579 110 ntBASIC19.66■□□□□ 0.74
Ubxn2bQ0KL01 Gm24755-201ENSMUST00000179691 110 ntBASIC19.66■□□□□ 0.74
Ubxn2bQ0KL01 Gm26506-201ENSMUST00000179692 110 ntBASIC19.66■□□□□ 0.74
Ubxn2bQ0KL01 Gm25086-201ENSMUST00000179931 110 ntBASIC19.66■□□□□ 0.74
Ubxn2bQ0KL01 Gm23243-201ENSMUST00000180047 110 ntBASIC19.66■□□□□ 0.74
Ubxn2bQ0KL01 Gm24659-201ENSMUST00000180212 110 ntBASIC19.66■□□□□ 0.74
Ubxn2bQ0KL01 Gm24169-201ENSMUST00000180244 110 ntBASIC19.66■□□□□ 0.74
Ubxn2bQ0KL01 Gm23689-201ENSMUST00000180354 110 ntBASIC19.66■□□□□ 0.74
Ubxn2bQ0KL01 Gm27359-201ENSMUST00000184153 110 ntBASIC19.66■□□□□ 0.74
Ubxn2bQ0KL01 Gm27785-201ENSMUST00000184268 110 ntBASIC19.66■□□□□ 0.74
Ubxn2bQ0KL01 Gm27466-201ENSMUST00000184396 110 ntBASIC19.66■□□□□ 0.74
Ubxn2bQ0KL01 Gm27703-201ENSMUST00000184836 110 ntBASIC19.66■□□□□ 0.74
Ubxn2bQ0KL01 Aip-201ENSMUST00000025767 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Ubxn2bQ0KL01 Ppt1-202ENSMUST00000097902 1191 ntTSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Ubxn2bQ0KL01 Pgrmc1-201ENSMUST00000073339 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Ubxn2bQ0KL01 Fbxo30-201ENSMUST00000070300 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Ubxn2bQ0KL01 Agfg1-202ENSMUST00000113444 3142 ntTSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Ubxn2bQ0KL01 Nrip2-202ENSMUST00000120405 1468 ntTSL 2 BASIC19.66■□□□□ 0.74
Ubxn2bQ0KL01 Mycbpap-201ENSMUST00000040692 1512 ntTSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Ubxn2bQ0KL01 D730003I15Rik-202ENSMUST00000194375 1667 ntBASIC19.65■□□□□ 0.74
Ubxn2bQ0KL01 Scube1-202ENSMUST00000043634 5161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Ubxn2bQ0KL01 9330154J02Rik-202ENSMUST00000185960 2557 ntTSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Ubxn2bQ0KL01 Cyp21a1-201ENSMUST00000025223 2058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Ubxn2bQ0KL01 Trav3-1-201ENSMUST00000103569 385 ntAPPRIS P1 BASIC19.65■□□□□ 0.74
Ubxn2bQ0KL01 Trav3-4-201ENSMUST00000103670 458 ntAPPRIS P1 BASIC19.65■□□□□ 0.74
Ubxn2bQ0KL01 Romo1-203ENSMUST00000109598 362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.65■□□□□ 0.74
Ubxn2bQ0KL01 Etfrf1-206ENSMUST00000111725 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.65■□□□□ 0.74
Ubxn2bQ0KL01 Dusp3-205ENSMUST00000143177 391 ntTSL 3 BASIC19.65■□□□□ 0.74
Ubxn2bQ0KL01 Hoxb8-203ENSMUST00000168043 1141 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.65■□□□□ 0.74
Ubxn2bQ0KL01 Gltpd2-202ENSMUST00000179000 794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.65■□□□□ 0.74
Ubxn2bQ0KL01 Mir8102-201ENSMUST00000184148 139 ntBASIC19.65■□□□□ 0.74
Ubxn2bQ0KL01 Gm27989-201ENSMUST00000184721 107 ntBASIC19.65■□□□□ 0.74
Ubxn2bQ0KL01 Gm37277-201ENSMUST00000194052 1111 ntBASIC19.65■□□□□ 0.74
Ubxn2bQ0KL01 Atf5-203ENSMUST00000209072 595 ntTSL 5 BASIC19.65■□□□□ 0.74
Ubxn2bQ0KL01 AC151828.1-201ENSMUST00000219552 661 ntTSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Ubxn2bQ0KL01 Gpr146-202ENSMUST00000053120 1040 ntBASIC19.65■□□□□ 0.74
Ubxn2bQ0KL01 Sorcs2-201ENSMUST00000037370 5707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Ubxn2bQ0KL01 Cabp1-201ENSMUST00000031519 1370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Ubxn2bQ0KL01 Fam133b-201ENSMUST00000115527 1491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Ubxn2bQ0KL01 Gm6858-201ENSMUST00000208582 1468 ntBASIC19.65■□□□□ 0.74
Ubxn2bQ0KL01 Cnpy1-201ENSMUST00000117098 2661 ntTSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Ubxn2bQ0KL01 Fam170b-201ENSMUST00000104926 1694 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.65■□□□□ 0.74
Ubxn2bQ0KL01 Grk6-206ENSMUST00000224995 2971 ntBASIC19.65■□□□□ 0.74
Ubxn2bQ0KL01 St8sia5-201ENSMUST00000075290 1841 ntTSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Ubxn2bQ0KL01 Neil2-201ENSMUST00000038229 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.74
Ubxn2bQ0KL01 Crocc-211ENSMUST00000168157 6244 ntTSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.74
Ubxn2bQ0KL01 Crocc-201ENSMUST00000040222 6248 ntTSL 5 BASIC19.64■□□□□ 0.74
Ubxn2bQ0KL01 4930417O22Rik-201ENSMUST00000123249 1184 ntTSL 2 BASIC19.64■□□□□ 0.73
Ubxn2bQ0KL01 Gm15494-202ENSMUST00000171665 451 ntTSL 2 BASIC19.64■□□□□ 0.73
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.1 ms