Protein–RNA interactions for Protein: Q0HA38

Ttc21b, Tetratricopeptide repeat protein 21B, mousemouse

Predictions only

Length 1,315 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ttc21bQ0HA38 Gm10044-203ENSMUST00000166813 1471 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Ttc21bQ0HA38 Mdm1-204ENSMUST00000169817 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Ttc21bQ0HA38 Fam161a-205ENSMUST00000172602 1935 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Ttc21bQ0HA38 Gm20481-201ENSMUST00000173680 564 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Ttc21bQ0HA38 Mir3113-201ENSMUST00000175478 76 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
Ttc21bQ0HA38 Gm20680-201ENSMUST00000176881 789 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Ttc21bQ0HA38 Abhd10-201ENSMUST00000066983 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Ttc21bQ0HA38 Dtnb-222ENSMUST00000174479 3689 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Ttc21bQ0HA38 Elac2-202ENSMUST00000101049 2884 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Ttc21bQ0HA38 Stim2-201ENSMUST00000117661 4934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Ttc21bQ0HA38 Map3k9-201ENSMUST00000035987 4564 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Ttc21bQ0HA38 Ppp1r1b-201ENSMUST00000078694 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Ttc21bQ0HA38 Slc38a10-203ENSMUST00000076697 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Ttc21bQ0HA38 Ptpn2-201ENSMUST00000025420 1568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Ttc21bQ0HA38 Tubb4b-201ENSMUST00000043584 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Ttc21bQ0HA38 Gm11873-201ENSMUST00000117877 1304 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
Ttc21bQ0HA38 Cpt2-203ENSMUST00000106720 1015 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Ttc21bQ0HA38 AC151286.1-201ENSMUST00000198489 145 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
Ttc21bQ0HA38 Gm43661-201ENSMUST00000199099 687 ntTSL 3 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Ttc21bQ0HA38 Gm44662-201ENSMUST00000206970 412 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Ttc21bQ0HA38 Ndufaf2-202ENSMUST00000223734 556 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
Ttc21bQ0HA38 Psmb4-201ENSMUST00000005923 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Ttc21bQ0HA38 Ly6k-201ENSMUST00000060301 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Ttc21bQ0HA38 Chchd2-201ENSMUST00000094280 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Ttc21bQ0HA38 Fam72a-201ENSMUST00000068613 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Ttc21bQ0HA38 Cspg5-205ENSMUST00000199736 2107 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Ttc21bQ0HA38 Hs3st1-201ENSMUST00000053116 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Ttc21bQ0HA38 Igfbp1-201ENSMUST00000020704 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Ttc21bQ0HA38 Tox2-201ENSMUST00000099110 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Ttc21bQ0HA38 Tcf7l2-203ENSMUST00000111646 2839 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Ttc21bQ0HA38 Hcn4-201ENSMUST00000034889 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Ttc21bQ0HA38 Gm9821-201ENSMUST00000178895 1953 ntAPPRIS P1 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Ttc21bQ0HA38 Mir8117-201ENSMUST00000184773 107 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
Ttc21bQ0HA38 Ndufv3-202ENSMUST00000064798 485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Ttc21bQ0HA38 1110038F14Rik-201ENSMUST00000071792 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Ttc21bQ0HA38 Hunk-201ENSMUST00000065856 5009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Ttc21bQ0HA38 Dixdc1-207ENSMUST00000121634 2420 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Ttc21bQ0HA38 Dhx15-201ENSMUST00000031061 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Ttc21bQ0HA38 Spdef-205ENSMUST00000167489 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Ttc21bQ0HA38 Kcnb1-201ENSMUST00000059826 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Ttc21bQ0HA38 2810013P06Rik-201ENSMUST00000186531 2137 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
Ttc21bQ0HA38 Pdlim5-212ENSMUST00000200043 1581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Ttc21bQ0HA38 Ginm1-201ENSMUST00000039763 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Ttc21bQ0HA38 Gm38575-203ENSMUST00000215824 1490 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Ttc21bQ0HA38 Zbtb48-201ENSMUST00000066715 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Ttc21bQ0HA38 Gstm4-201ENSMUST00000029489 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Ttc21bQ0HA38 Scube1-202ENSMUST00000043634 5161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Ttc21bQ0HA38 Gm4609-201ENSMUST00000106443 1002 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
Ttc21bQ0HA38 Gm5138-201ENSMUST00000113842 1002 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
Ttc21bQ0HA38 Gm15191-201ENSMUST00000117933 1000 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
Ttc21bQ0HA38 Gm12182-201ENSMUST00000118655 1008 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
Ttc21bQ0HA38 Gm13882-201ENSMUST00000120886 1002 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
Ttc21bQ0HA38 Gm16156-201ENSMUST00000141168 713 ntTSL 3 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Ttc21bQ0HA38 Gm10284-201ENSMUST00000145057 1005 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
Ttc21bQ0HA38 Haghl-211ENSMUST00000150324 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Ttc21bQ0HA38 Gm2308-201ENSMUST00000166539 1004 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
Ttc21bQ0HA38 Gm10481-201ENSMUST00000179228 1002 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
Ttc21bQ0HA38 Gapdh-ps15-201ENSMUST00000180966 1002 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
Ttc21bQ0HA38 Gm2574-201ENSMUST00000181051 1002 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
Ttc21bQ0HA38 Gm3200-201ENSMUST00000181493 1002 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
Ttc21bQ0HA38 Gm8825-201ENSMUST00000182565 998 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
Ttc21bQ0HA38 Gm4518-201ENSMUST00000182638 718 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
Ttc21bQ0HA38 Gm8330-201ENSMUST00000182754 1008 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
Ttc21bQ0HA38 Gm4575-201ENSMUST00000182991 1002 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
Ttc21bQ0HA38 Gm8709-201ENSMUST00000183230 1012 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
Ttc21bQ0HA38 Gm44945-201ENSMUST00000206764 1187 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
Ttc21bQ0HA38 Gm10293-201ENSMUST00000076317 1002 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
Ttc21bQ0HA38 Gm6316-201ENSMUST00000082064 1020 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
Ttc21bQ0HA38 Smu1-201ENSMUST00000030117 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Ttc21bQ0HA38 Mlxip-202ENSMUST00000111596 2653 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Ttc21bQ0HA38 Rhd-201ENSMUST00000030627 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Ttc21bQ0HA38 Chga-201ENSMUST00000021610 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Ttc21bQ0HA38 Klhl33-202ENSMUST00000170855 1422 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Ttc21bQ0HA38 Utp3-201ENSMUST00000090413 1629 ntAPPRIS P1 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Ttc21bQ0HA38 Gm13849-201ENSMUST00000153328 835 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Ttc21bQ0HA38 1110035H17Rik-202ENSMUST00000205672 1231 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
Ttc21bQ0HA38 Vsig2-206ENSMUST00000215957 851 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Ttc21bQ0HA38 Bloc1s5-203ENSMUST00000224902 612 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
Ttc21bQ0HA38 AC117588.1-201ENSMUST00000228510 999 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
Ttc21bQ0HA38 Crb3-201ENSMUST00000071826 1194 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Ttc21bQ0HA38 Tstd3-201ENSMUST00000029915 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Ttc21bQ0HA38 Rab1a-201ENSMUST00000020358 2827 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Ttc21bQ0HA38 Kctd9-205ENSMUST00000152243 2528 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Ttc21bQ0HA38 Krt28-201ENSMUST00000006963 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Ttc21bQ0HA38 1700029J07Rik-202ENSMUST00000098786 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Ttc21bQ0HA38 Gm5648-201ENSMUST00000122244 1587 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
Ttc21bQ0HA38 Cyb5rl-204ENSMUST00000106760 840 ntTSL 3 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Ttc21bQ0HA38 Gdap1l1-203ENSMUST00000109421 1206 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Ttc21bQ0HA38 Tmem9-205ENSMUST00000165125 901 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Ttc21bQ0HA38 BC022687-202ENSMUST00000177808 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Ttc21bQ0HA38 Fau-202ENSMUST00000178310 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Ttc21bQ0HA38 Zfp930-203ENSMUST00000212312 493 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Ttc21bQ0HA38 Timm9-205ENSMUST00000221178 529 ntTSL 3 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Ttc21bQ0HA38 Atp6v0b-201ENSMUST00000036380 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Ttc21bQ0HA38 1600017P15Rik-201ENSMUST00000083427 412 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
Ttc21bQ0HA38 Lypd1-205ENSMUST00000162899 1511 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Ttc21bQ0HA38 Il11ra1-204ENSMUST00000108042 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Ttc21bQ0HA38 Fam46b-201ENSMUST00000051676 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Ttc21bQ0HA38 Tbx21-201ENSMUST00000001484 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Ttc21bQ0HA38 Sema6d-204ENSMUST00000078621 6372 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.9 ms