Protein–RNA interactions for Protein: Q0GGX2

Znf541, Zinc finger protein 541, mousemouse

Predictions only

Length 1,363 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Znf541Q0GGX2 Bcl2l12-201ENSMUST00000003290 1075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Znf541Q0GGX2 Pigt-201ENSMUST00000103101 2562 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Znf541Q0GGX2 Mtfr1l-202ENSMUST00000116279 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Znf541Q0GGX2 Map3k9-201ENSMUST00000035987 4564 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Znf541Q0GGX2 Atp9a-203ENSMUST00000109176 3691 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Znf541Q0GGX2 Twf2-201ENSMUST00000024047 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Znf541Q0GGX2 Dtx2-202ENSMUST00000111142 2650 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Znf541Q0GGX2 Fam221a-201ENSMUST00000060561 2730 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Znf541Q0GGX2 Lrrc47-201ENSMUST00000030894 3395 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
Znf541Q0GGX2 Ift74-202ENSMUST00000107104 1713 ntTSL 2 BASIC20.83■□□□□ 0.92
Znf541Q0GGX2 Glis1-201ENSMUST00000046005 2906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
Znf541Q0GGX2 Bean1-201ENSMUST00000093245 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
Znf541Q0GGX2 Ascl2-202ENSMUST00000121862 814 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.83■□□□□ 0.92
Znf541Q0GGX2 Tsen15-201ENSMUST00000015124 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
Znf541Q0GGX2 Gm29629-201ENSMUST00000187926 386 ntTSL 3 BASIC20.83■□□□□ 0.92
Znf541Q0GGX2 Arhgap33-206ENSMUST00000208522 781 ntTSL 3 BASIC20.83■□□□□ 0.92
Znf541Q0GGX2 AC159301.1-201ENSMUST00000225130 1182 ntBASIC20.83■□□□□ 0.92
Znf541Q0GGX2 Ndufb9-201ENSMUST00000022980 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
Znf541Q0GGX2 Lrch3-203ENSMUST00000135193 2794 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.92
Znf541Q0GGX2 Rapgefl1-202ENSMUST00000107479 4855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.92
Znf541Q0GGX2 Pdk3-201ENSMUST00000045748 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Znf541Q0GGX2 Smad7-201ENSMUST00000026999 4278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Znf541Q0GGX2 Traf2-202ENSMUST00000114234 2151 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
Znf541Q0GGX2 Fbxo9-202ENSMUST00000085311 2155 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Znf541Q0GGX2 Senp2-201ENSMUST00000023561 4499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Znf541Q0GGX2 Ankrd10-201ENSMUST00000033905 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Znf541Q0GGX2 Irx4-202ENSMUST00000176684 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
Znf541Q0GGX2 Dlgap2-209ENSMUST00000152652 3842 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Znf541Q0GGX2 Zfp668-203ENSMUST00000106262 3169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Znf541Q0GGX2 Fars2-201ENSMUST00000021857 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Znf541Q0GGX2 Stk39-201ENSMUST00000102715 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Znf541Q0GGX2 Gm26646-202ENSMUST00000205705 439 ntTSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
Znf541Q0GGX2 Zfyve21-204ENSMUST00000221375 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Znf541Q0GGX2 Atg101-201ENSMUST00000048393 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Znf541Q0GGX2 Gm5617-201ENSMUST00000048824 531 ntAPPRIS P1 BASIC20.82■□□□□ 0.92
Znf541Q0GGX2 Olfr632-201ENSMUST00000098189 954 ntAPPRIS P1 BASIC20.82■□□□□ 0.92
Znf541Q0GGX2 Gm38392-202ENSMUST00000165196 1303 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
Znf541Q0GGX2 Gm5837-201ENSMUST00000191844 1369 ntBASIC20.82■□□□□ 0.92
Znf541Q0GGX2 Cpq-201ENSMUST00000042167 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Znf541Q0GGX2 Fbxl21-203ENSMUST00000121871 1963 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Znf541Q0GGX2 Gm28265-201ENSMUST00000188201 2319 ntBASIC20.81■□□□□ 0.92
Znf541Q0GGX2 Cbarp-201ENSMUST00000105369 3121 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
Znf541Q0GGX2 Rhoc-202ENSMUST00000106787 959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
Znf541Q0GGX2 Ckb-201ENSMUST00000001304 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Znf541Q0GGX2 Gm44930-202ENSMUST00000208733 689 ntTSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
Znf541Q0GGX2 Fars2-205ENSMUST00000224241 1665 ntAPPRIS P1 BASIC20.81■□□□□ 0.92
Znf541Q0GGX2 Pdcd2l-201ENSMUST00000002710 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Znf541Q0GGX2 Adam33-201ENSMUST00000052104 2795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Znf541Q0GGX2 4931422A03Rik-201ENSMUST00000056170 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Znf541Q0GGX2 Ndufaf3-201ENSMUST00000074208 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Znf541Q0GGX2 T-201ENSMUST00000074667 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Znf541Q0GGX2 Prr14-201ENSMUST00000033095 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Znf541Q0GGX2 Wnt1-201ENSMUST00000023734 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Znf541Q0GGX2 Pigl-201ENSMUST00000014389 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Znf541Q0GGX2 Tpm2-201ENSMUST00000030184 2175 ntTSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
Znf541Q0GGX2 H2-Q4-201ENSMUST00000081435 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Znf541Q0GGX2 Npcd-202ENSMUST00000089299 1453 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Znf541Q0GGX2 Snupn-201ENSMUST00000068856 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Znf541Q0GGX2 Hey2-201ENSMUST00000019924 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Znf541Q0GGX2 Fam3a-203ENSMUST00000114139 931 ntTSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
Znf541Q0GGX2 Kxd1-202ENSMUST00000117580 696 ntTSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
Znf541Q0GGX2 4933405L10Rik-201ENSMUST00000013302 1214 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Znf541Q0GGX2 2010010A06Rik-202ENSMUST00000186356 694 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Znf541Q0GGX2 1700012D14Rik-201ENSMUST00000209597 605 ntTSL 3 BASIC20.8■□□□□ 0.92
Znf541Q0GGX2 AL669916.2-201ENSMUST00000213219 358 ntTSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
Znf541Q0GGX2 Pdcd6-201ENSMUST00000022060 1131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Znf541Q0GGX2 Prdx6-201ENSMUST00000051925 959 ntTSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
Znf541Q0GGX2 Lmtk3-204ENSMUST00000209617 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Znf541Q0GGX2 Pomgnt2-206ENSMUST00000216669 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Znf541Q0GGX2 Tmem8-201ENSMUST00000025010 3464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Znf541Q0GGX2 Fam78b-205ENSMUST00000165874 4986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Znf541Q0GGX2 Cyp11b2-201ENSMUST00000167634 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Znf541Q0GGX2 Eif2b5-201ENSMUST00000003320 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Znf541Q0GGX2 Grk6-201ENSMUST00000001115 2994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Znf541Q0GGX2 Papd7-202ENSMUST00000198607 4750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Znf541Q0GGX2 Gm27741-201ENSMUST00000185060 237 ntBASIC20.79■□□□□ 0.92
Znf541Q0GGX2 Gm7506-201ENSMUST00000207758 815 ntBASIC20.79■□□□□ 0.92
Znf541Q0GGX2 Rfc4-201ENSMUST00000023598 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Znf541Q0GGX2 Aurkaip1-201ENSMUST00000084097 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Znf541Q0GGX2 Gm45723-201ENSMUST00000212135 1783 ntTSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
Znf541Q0GGX2 Brd1-201ENSMUST00000088911 4702 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Znf541Q0GGX2 Plppr3-207ENSMUST00000167250 3063 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
Znf541Q0GGX2 Katnbl1-201ENSMUST00000028552 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Znf541Q0GGX2 Mycn-201ENSMUST00000043396 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Znf541Q0GGX2 Clvs2-203ENSMUST00000160299 2610 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Znf541Q0GGX2 Hsf4-201ENSMUST00000036127 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Znf541Q0GGX2 Prkcz-203ENSMUST00000105624 694 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Znf541Q0GGX2 H2-Q6-201ENSMUST00000113879 981 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
Znf541Q0GGX2 Magohb-201ENSMUST00000032307 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Znf541Q0GGX2 Cd300c-201ENSMUST00000061637 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
Znf541Q0GGX2 Cmtm7-202ENSMUST00000084867 874 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Znf541Q0GGX2 Cd300c-202ENSMUST00000092466 700 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
Znf541Q0GGX2 Kifc3-212ENSMUST00000213004 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Znf541Q0GGX2 Bnip2-201ENSMUST00000034754 2464 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Znf541Q0GGX2 Npdc1-202ENSMUST00000071442 1485 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Znf541Q0GGX2 Rcan3-201ENSMUST00000030606 5111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Znf541Q0GGX2 Dirc2-201ENSMUST00000023554 5395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Znf541Q0GGX2 Upf1-201ENSMUST00000075666 4618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Znf541Q0GGX2 Ldha-201ENSMUST00000005051 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Znf541Q0GGX2 Nhlrc4-201ENSMUST00000085027 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.2 ms