Protein–RNA interactions for Protein: Q09XV5

Chd8, Chromodomain-helicase-DNA-binding protein 8, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 2,582 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Chd8Q09XV5 Cdadc1-201ENSMUST00000022555 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Chd8Q09XV5 Gm9889-202ENSMUST00000206983 1577 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
Chd8Q09XV5 Thoc6-204ENSMUST00000115490 1157 ntTSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Chd8Q09XV5 Mir7684-201ENSMUST00000183858 60 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
Chd8Q09XV5 Gm4959-201ENSMUST00000197271 1044 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
Chd8Q09XV5 Atp5o-201ENSMUST00000023677 838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Chd8Q09XV5 Klk1-201ENSMUST00000075162 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Chd8Q09XV5 Npm1-201ENSMUST00000075641 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Chd8Q09XV5 Gm3739-201ENSMUST00000165744 2011 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Chd8Q09XV5 Psmd8-202ENSMUST00000182328 1391 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Chd8Q09XV5 Tmem55b-205ENSMUST00000160835 2755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Chd8Q09XV5 Tbc1d2b-201ENSMUST00000041767 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Chd8Q09XV5 Hexa-201ENSMUST00000026262 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Chd8Q09XV5 Etv4-201ENSMUST00000017868 2395 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Chd8Q09XV5 Abi2-206ENSMUST00000188594 1658 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Chd8Q09XV5 B020017C02Rik-201ENSMUST00000197444 1688 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
Chd8Q09XV5 Cd99l2-204ENSMUST00000114587 973 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Chd8Q09XV5 Gm12176-201ENSMUST00000121420 875 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
Chd8Q09XV5 Myl3-203ENSMUST00000136695 614 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Chd8Q09XV5 Gm17150-201ENSMUST00000165577 381 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
Chd8Q09XV5 Olfr1344-201ENSMUST00000168341 1061 ntAPPRIS P1 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Chd8Q09XV5 Gm7507-201ENSMUST00000183053 1008 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
Chd8Q09XV5 Gm20553-201ENSMUST00000204205 844 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
Chd8Q09XV5 AC147366.1-201ENSMUST00000227671 852 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
Chd8Q09XV5 Mzt2-201ENSMUST00000023351 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Chd8Q09XV5 Rhox6-201ENSMUST00000006362 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Chd8Q09XV5 Schip1-203ENSMUST00000170788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Chd8Q09XV5 Tubb4b-ps1-201ENSMUST00000179460 1336 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
Chd8Q09XV5 Psme4-201ENSMUST00000041231 6491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Chd8Q09XV5 Gm26634-201ENSMUST00000181146 1511 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Chd8Q09XV5 Gif-201ENSMUST00000025585 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Chd8Q09XV5 Gm7901-201ENSMUST00000120430 1597 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
Chd8Q09XV5 Atmin-201ENSMUST00000109099 4877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Chd8Q09XV5 Ttl-201ENSMUST00000035812 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Chd8Q09XV5 Otub1-202ENSMUST00000123594 1728 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Chd8Q09XV5 1700121C08Rik-201ENSMUST00000137546 677 ntTSL 3 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Chd8Q09XV5 Timm9-202ENSMUST00000166120 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Chd8Q09XV5 Gm37153-201ENSMUST00000193637 231 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
Chd8Q09XV5 Rpl32-202ENSMUST00000203816 906 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Chd8Q09XV5 4933405L10Rik-202ENSMUST00000211852 1097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Chd8Q09XV5 Timm9-207ENSMUST00000221559 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Chd8Q09XV5 Timm9-209ENSMUST00000221815 1193 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Chd8Q09XV5 Gm10073-201ENSMUST00000073722 496 ntAPPRIS P1 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Chd8Q09XV5 Rplp1-201ENSMUST00000008036 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Chd8Q09XV5 Kcnc3-202ENSMUST00000107907 5281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Chd8Q09XV5 1700113H08Rik-201ENSMUST00000169849 1332 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Chd8Q09XV5 Gm9917-202ENSMUST00000181099 1499 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Chd8Q09XV5 Abi1-215ENSMUST00000178908 2239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Chd8Q09XV5 Sh3yl1-202ENSMUST00000110880 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Chd8Q09XV5 Ric3-202ENSMUST00000120876 1633 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Chd8Q09XV5 Ybx1-201ENSMUST00000079644 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Chd8Q09XV5 Fyn-204ENSMUST00000126486 2495 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Chd8Q09XV5 Chmp7-201ENSMUST00000036381 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Chd8Q09XV5 Acbd4-203ENSMUST00000107040 1959 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Chd8Q09XV5 Rerg-203ENSMUST00000119610 890 ntTSL 3 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Chd8Q09XV5 D11Bhm181e-201ENSMUST00000122252 282 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
Chd8Q09XV5 Atp5j2-202ENSMUST00000161741 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Chd8Q09XV5 Prr29-205ENSMUST00000190268 1141 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Chd8Q09XV5 Gm37277-201ENSMUST00000194052 1111 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
Chd8Q09XV5 Gm36236-201ENSMUST00000220780 701 ntTSL 3 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Chd8Q09XV5 Dapk1-202ENSMUST00000077453 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Chd8Q09XV5 Gale-202ENSMUST00000102541 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Chd8Q09XV5 Gm8131-201ENSMUST00000213783 1570 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
Chd8Q09XV5 Slc27a4-201ENSMUST00000080065 4054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Chd8Q09XV5 Sytl1-202ENSMUST00000105908 1730 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Chd8Q09XV5 Src-203ENSMUST00000109529 2020 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Chd8Q09XV5 Ppil3-203ENSMUST00000114348 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Chd8Q09XV5 Gm16000-201ENSMUST00000146657 447 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Chd8Q09XV5 Ccdc24-209ENSMUST00000171052 891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Chd8Q09XV5 9130230N09Rik-201ENSMUST00000174568 663 ntTSL 3 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Chd8Q09XV5 Gm26681-201ENSMUST00000180851 1440 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Chd8Q09XV5 Camsap3-206ENSMUST00000207533 2584 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Chd8Q09XV5 Camsap3-212ENSMUST00000208240 2572 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Chd8Q09XV5 Gzma-201ENSMUST00000023897 878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Chd8Q09XV5 Cort-201ENSMUST00000030815 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Chd8Q09XV5 Gm27029-202ENSMUST00000107259 1855 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Chd8Q09XV5 Gpn3-201ENSMUST00000031420 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Chd8Q09XV5 Myl4-203ENSMUST00000106957 943 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Chd8Q09XV5 Rps19-201ENSMUST00000108428 1284 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Chd8Q09XV5 Gm16215-201ENSMUST00000161990 637 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Chd8Q09XV5 Gm6473-201ENSMUST00000188572 1210 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Chd8Q09XV5 Lamtor2-201ENSMUST00000029698 668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Chd8Q09XV5 Lrrc75b-201ENSMUST00000051129 4601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Chd8Q09XV5 Polr3d-201ENSMUST00000000793 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Chd8Q09XV5 Bmpr1b-202ENSMUST00000098568 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Chd8Q09XV5 2810408A11Rik-203ENSMUST00000102580 1640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Chd8Q09XV5 Fntb-206ENSMUST00000137826 1442 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Chd8Q09XV5 Kcnj4-201ENSMUST00000057801 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Chd8Q09XV5 Tmem79-202ENSMUST00000107552 2063 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Chd8Q09XV5 Wdyhv1-201ENSMUST00000067563 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Chd8Q09XV5 Gm15317-201ENSMUST00000129569 699 ntTSL 3 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Chd8Q09XV5 Gstt4-202ENSMUST00000160211 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Chd8Q09XV5 Gm24158-201ENSMUST00000175263 71 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Chd8Q09XV5 AC166349.1-201ENSMUST00000220866 695 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Chd8Q09XV5 Wfdc6b-201ENSMUST00000094346 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Chd8Q09XV5 Baiap2-202ENSMUST00000075180 3518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Chd8Q09XV5 Chst3-203ENSMUST00000167915 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Chd8Q09XV5 Espn-203ENSMUST00000070018 1618 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Chd8Q09XV5 Ttc34-203ENSMUST00000207854 4733 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Chd8Q09XV5 Fzd2-201ENSMUST00000057893 3663 ntAPPRIS P1 BASIC14.63□□□□□ -0.07
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