Protein–RNA interactions for Protein: Q08EE8

1700061G19Rik, RIKEN cDNA 1700061G19 gene, mousemouse

Predictions only

Length 705 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
1700061G19RikQ08EE8 Ankrd40-201ENSMUST00000021227 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
1700061G19RikQ08EE8 Gm18101-201ENSMUST00000215769 548 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
1700061G19RikQ08EE8 Gadd45b-203ENSMUST00000220246 732 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
1700061G19RikQ08EE8 Mpc2-201ENSMUST00000027853 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
1700061G19RikQ08EE8 Lce1h-201ENSMUST00000051521 706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
1700061G19RikQ08EE8 Nagk-203ENSMUST00000113851 1323 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
1700061G19RikQ08EE8 Gm43072-201ENSMUST00000200283 1671 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
1700061G19RikQ08EE8 Slc11a1-201ENSMUST00000027368 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
1700061G19RikQ08EE8 Prodh-201ENSMUST00000003620 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
1700061G19RikQ08EE8 Dusp4-201ENSMUST00000033930 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
1700061G19RikQ08EE8 Mgat1-201ENSMUST00000081794 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
1700061G19RikQ08EE8 Naa50-204ENSMUST00000161326 4487 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
1700061G19RikQ08EE8 Snx25-203ENSMUST00000110378 3445 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
1700061G19RikQ08EE8 Rnf103-201ENSMUST00000064637 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
1700061G19RikQ08EE8 Nudt4-201ENSMUST00000020217 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
1700061G19RikQ08EE8 Slc44a1-201ENSMUST00000102911 3102 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
1700061G19RikQ08EE8 Vegfa-201ENSMUST00000024747 2765 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
1700061G19RikQ08EE8 Neil3-201ENSMUST00000047768 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
1700061G19RikQ08EE8 Tmem214-201ENSMUST00000114716 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
1700061G19RikQ08EE8 Iqcd-202ENSMUST00000094391 1673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
1700061G19RikQ08EE8 Ocel1-201ENSMUST00000002469 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
1700061G19RikQ08EE8 Dnal4-201ENSMUST00000023055 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
1700061G19RikQ08EE8 Eml1-203ENSMUST00000109860 4160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
1700061G19RikQ08EE8 Dusp12-201ENSMUST00000027970 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
1700061G19RikQ08EE8 Gm1673-202ENSMUST00000114382 451 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
1700061G19RikQ08EE8 Serf1-205ENSMUST00000152286 465 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
1700061G19RikQ08EE8 Ccdc125-202ENSMUST00000170347 1216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
1700061G19RikQ08EE8 Pyy-201ENSMUST00000017455 555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
1700061G19RikQ08EE8 Gm22697-201ENSMUST00000175194 63 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
1700061G19RikQ08EE8 Gm26709-202ENSMUST00000223049 819 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
1700061G19RikQ08EE8 Xpa-201ENSMUST00000030013 955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
1700061G19RikQ08EE8 Abcc5-203ENSMUST00000096199 1136 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
1700061G19RikQ08EE8 Nadk2-203ENSMUST00000100790 3665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
1700061G19RikQ08EE8 Scrt1-202ENSMUST00000164703 3478 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
1700061G19RikQ08EE8 Chrna2-202ENSMUST00000206455 1933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
1700061G19RikQ08EE8 Smurf2-201ENSMUST00000092517 3125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
1700061G19RikQ08EE8 Bpifb3-201ENSMUST00000088950 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
1700061G19RikQ08EE8 4833445I07Rik-201ENSMUST00000193193 1642 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
1700061G19RikQ08EE8 Hipk2-206ENSMUST00000161779 7684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
1700061G19RikQ08EE8 Pde8b-214ENSMUST00000172104 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
1700061G19RikQ08EE8 Myo16-204ENSMUST00000208309 2462 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
1700061G19RikQ08EE8 Mrm2-201ENSMUST00000031536 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
1700061G19RikQ08EE8 Tspan9-201ENSMUST00000032503 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
1700061G19RikQ08EE8 Taf6l-212ENSMUST00000177216 2167 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
1700061G19RikQ08EE8 Hps5-202ENSMUST00000107653 4702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
1700061G19RikQ08EE8 1700024G13Rik-201ENSMUST00000100723 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
1700061G19RikQ08EE8 Fndc11-202ENSMUST00000108835 1154 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
1700061G19RikQ08EE8 Ndufab1-ps-201ENSMUST00000166096 468 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
1700061G19RikQ08EE8 4930515G01Rik-201ENSMUST00000173208 1247 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
1700061G19RikQ08EE8 Rpl13a-204ENSMUST00000209711 495 ntTSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
1700061G19RikQ08EE8 Efcab11-207ENSMUST00000223114 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
1700061G19RikQ08EE8 Vpreb1-201ENSMUST00000075017 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
1700061G19RikQ08EE8 Sept8-201ENSMUST00000108987 4436 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
1700061G19RikQ08EE8 Inpp5e-202ENSMUST00000114090 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
1700061G19RikQ08EE8 Fancg-201ENSMUST00000030165 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
1700061G19RikQ08EE8 Cdkn1a-201ENSMUST00000023829 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
1700061G19RikQ08EE8 Fbxl19-204ENSMUST00000188580 2601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
1700061G19RikQ08EE8 Klhdc8b-201ENSMUST00000035232 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
1700061G19RikQ08EE8 Sphk1-202ENSMUST00000063446 2527 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
1700061G19RikQ08EE8 Cul1-201ENSMUST00000031697 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
1700061G19RikQ08EE8 Mff-211ENSMUST00000161648 1715 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
1700061G19RikQ08EE8 Rgp1-203ENSMUST00000117140 1635 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
1700061G19RikQ08EE8 Plbd2-201ENSMUST00000031597 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
1700061G19RikQ08EE8 Evx1-201ENSMUST00000031787 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
1700061G19RikQ08EE8 Sik3-204ENSMUST00000126865 6287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
1700061G19RikQ08EE8 Bnip2-203ENSMUST00000117450 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
1700061G19RikQ08EE8 Gm17200-201ENSMUST00000170214 2022 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
1700061G19RikQ08EE8 Gm26795-201ENSMUST00000180993 1952 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
1700061G19RikQ08EE8 Slc30a10-201ENSMUST00000061093 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
1700061G19RikQ08EE8 Phf1-201ENSMUST00000073724 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
1700061G19RikQ08EE8 Hnrnpl-202ENSMUST00000172529 1898 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
1700061G19RikQ08EE8 Ruvbl2-201ENSMUST00000107771 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
1700061G19RikQ08EE8 Ptpdc1-201ENSMUST00000035824 4402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
1700061G19RikQ08EE8 Map2k5-201ENSMUST00000034920 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
1700061G19RikQ08EE8 Prickle4-201ENSMUST00000113299 990 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
1700061G19RikQ08EE8 Prickle4-202ENSMUST00000113300 1110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
1700061G19RikQ08EE8 Tmem80-202ENSMUST00000126510 959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
1700061G19RikQ08EE8 Gm9745-201ENSMUST00000021573 684 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
1700061G19RikQ08EE8 Slc35b2-202ENSMUST00000223987 1766 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
1700061G19RikQ08EE8 Slc6a1-204ENSMUST00000204074 1740 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
1700061G19RikQ08EE8 Slc25a39-201ENSMUST00000018821 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
1700061G19RikQ08EE8 Gprc5b-201ENSMUST00000008878 4518 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
1700061G19RikQ08EE8 Emc8-201ENSMUST00000034277 4942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
1700061G19RikQ08EE8 Acbd3-201ENSMUST00000027780 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
1700061G19RikQ08EE8 Haus4-201ENSMUST00000022784 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
1700061G19RikQ08EE8 Degs1-201ENSMUST00000035295 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
1700061G19RikQ08EE8 Ebf1-203ENSMUST00000109268 2864 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
1700061G19RikQ08EE8 Gm20628-201ENSMUST00000177363 3215 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
1700061G19RikQ08EE8 Hexb-201ENSMUST00000022169 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
1700061G19RikQ08EE8 Lmo4-202ENSMUST00000121112 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
1700061G19RikQ08EE8 Rbm47-203ENSMUST00000113724 2186 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
1700061G19RikQ08EE8 Nat8l-201ENSMUST00000056355 6529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
1700061G19RikQ08EE8 Tgfb2-201ENSMUST00000045288 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
1700061G19RikQ08EE8 Hebp2-203ENSMUST00000214548 2083 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
1700061G19RikQ08EE8 Stxbp3-201ENSMUST00000102621 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
1700061G19RikQ08EE8 Npb-202ENSMUST00000106194 530 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
1700061G19RikQ08EE8 Npb-203ENSMUST00000106195 542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
1700061G19RikQ08EE8 Gm11355-201ENSMUST00000121120 306 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
1700061G19RikQ08EE8 Atp6v1g2-203ENSMUST00000130992 524 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
1700061G19RikQ08EE8 Gm15545-203ENSMUST00000150613 1059 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 61.1 ms